Predicted mutation | ||||||
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MC JC | CP009974 | 2,767,372 | Δ2,604 bp | RPPX_12300–RPPX_12305 | RPPX_12300, RPPX_12305 |
Missing coverage evidence... | ||||||||||
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* | * | ÷ | CP009974 | 2767372–2769970 | 2769975 | 6–2604 | 283 [1] | [0] 281 | RPPX_12300–RPPX_12305 | RPPX_12300,RPPX_12305 |
New junction evidence | |||||||||||
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* | ? | CP009974 | = 2767371 | 1 (0.000) | 255 (0.820) | 157/282 | 1.1 | 99.8% | intergenic (+446/+106) | RPPX_12295/RPPX_12300 | serine/threonine protein phosphatase/ATPase AAA |
? | CP009974 | 2769976 = | 0 (0.000) | intergenic (‑212/‑224) | RPPX_12305/RPPX_12310 | integrase/seryl‑tRNA synthetase |
Only 100 of 281 total aligned reads displayed.
CCTGCGTGGCTGCCTGCCAGAAAAGTGTCCGGATGACCGTGGAGTCGGTGTCCGGATGCTCGTGGAATGAGTGTCCGGATCAGCGTGGAATCACTGTCCGGATGCGCGTGGAATGGGTGTCCGAGTCAGCGTGGAATCCGCACATACGAGCGTGCCAGCACTGTTGGCATTGGACAGATTGAGCTGAAAATTGTCGGTGGCAGCAACCTCCTTGCAAGTGGACAGAGTATGCCACCGCTTACACATCCACCTGATCCAACACTCAATGGCGACAGAGCCGTTGCTGGAGGCATACCTCGCC > CP009974/2769826‑2770126 | cgctcgcaaaattctgttcgacagtcgctgccttggagcacgaatgggtgcacttagatctgggttccagcgttcccatgattcagcggcattcgaaacgccggacgtgatttatctactggctggcccaggtcagcgtaaacatacgagc < 1:3810097‑M2/1‑1 (MQ=255) caaaattctgttcgacagtcgctgccttggagcacgaatgggtgcacttagatctgggttccagcgttcccatgattcagcggcattcgaaacgccggacgtgatttatctactggctggcccaggtcagcgtaaacatacgagCGTGCCa > 1:3188162‑M2/145‑151 (MQ=255) aaaattctgttcgacagtcgctgccttggagcacgaatgggtgcacttagatctgggttccagcgttcccatgattcagcggcattcgaaacgccggacgtgatttatctactggctggcccaggtcagcgtaaacatacgagCGTGCCAg > 1:4018278‑M2/144‑151 (MQ=255) ttctgttcgacagtcgctgccttggagcacgaatgggtgcacttagatctgggttccagcgttcccatgattcagcggcattcgaaacgccggacgtgatttatctactggctggcccaggtcagcgtaaacatacgagCGTGCCAGCACt < 1:101795‑M2/12‑1 (MQ=255) ttctgttcgacagtcgctgccgtggagcacgaatgggtgcacttagatctgggttccagcgttcccatgattcagcggcattcgaaacgccggacgtgatttatctactggctggcccaggtcagcgtaaacatacgagCGTGCCAGCACt < 2:6090274‑M2/12‑1 (MQ=255) tctgttcgacagtcgctgccttggagcacgaatgggtgcacttagatctgggttccagcgttcccatgattcagcggcattcgaaacgccggacgtgatttatctactggctggcccaggtcagcgtaaacatacgagCGTGCCAGCACTg < 1:5221559‑M2/13‑1 (MQ=255) gttcgacagtcgctgccttggagcacgaatgggtgcacttagatctgggttccagcgttcccatgattcagcggcattcgaaacgccggacgtgatttatctactggctggcccaggtcagcgtaaacatacgagCGTGCCAGCACTGTTg < 2:2578201‑M2/16‑1 (MQ=255) cgacagtcgctgccttggagcacgaatgggtgcacttagatctgggttccagcgttcccatgattcagcggcattcgaaacgccggacgtgatttatctactggctggcccaggtcagcgtaaacatacgagCGTGCCAGCACTGTTGGCa < 2:730719‑M2/19‑1 (MQ=255) cgacagtcgctgccttggagcacgaatgggtgcacttagatctgggttccagcgttcccatgattcagcggcattcgaaacgccggacgtgatttatctactggctggcccaggtcagcgtaaacatacgagCGTGCCAGCACTGTTGGCa > 2:817328‑M2/133‑151 (MQ=255) cagtcgctgccttggagcacgaatgggtgcacttagatctgggttccagcgttcccatgattcagcggcattcgaaacgccggacgtgatttatctactggctggcccaggtcagcgtaaacatacgagCGTGCCAGCACTGTTGGCATTg > 2:6381008‑M2/130‑151 (MQ=255) agtcgctgccttggagcacgaatgggtgcacttagatctgggttccagcgttcccatgattcagcggcattcgaaacgccggacgtgatttatctactggctggcccaggtcagcgtaaacatacgagCGTGCCAGCACTGTTGGCATTgg > 2:455217‑M2/129‑151 (MQ=255) tcgctgccttggagcacgaatgggtgcacttagatctgggttccagcgttcccctgattcagcggcattcgaaacgccggacgtgatttatctactggctggcccaggtcagcgtaaacacaggagCGTGCCAGCCCTGTTGGCATGGGAc > 2:4238825‑M2/127‑151 (MQ=255) gctgccttggagcacgaatgggtgcacttagatctgggttccagcgttcccatgattcagcggcattcgaaacgccggacgtgatttatctactggctggcccaggtcagcgtaaacatacgagCGTGCCAGCACTGTTGGCATTGGACAg < 2:2952118‑M2/27‑1 (MQ=255) tgccttggagcacgaatgggtgcacttagatctgggttccagcgttcccatgattcagcggcattcgaaacgccggacgtgatttatctactggctggcccaggtcagcgtaaacatacgagCGTGCCAGCACTGTTGGCATTGGACAGAt > 1:6159970‑M2/123‑151 (MQ=255) ccttggagcacgaatgggtgcacttagatctgggttccagcgttcccatgattcagcggcattcgaaacgccggacgtgatttatctactggctggcccaggtcagcgtaaacatacgagCGTGCCAGCACTGTTGGCATTGGACAGATTg > 1:2240910‑M2/121‑151 (MQ=255) cttggagcacgaatgggtgcacttagatctgggttccagcgttcccatgattcagcggcattcgaaacgccggacgtgatttatctactggctggcccaggtcagcgtaaacatacgagCGTGCCAGCACTGTTGGCATTGGACAGATTGa > 2:5711045‑M2/120‑151 (MQ=255) tggagcacgaatgggtgcacttagatctgggttccagcgttcccatgattcagcggcattcgaaacgccggacgtgatttatctactggctggcccaggtcagcgtaaacatacgagCGTGCCAGCACTGTTGGCATTGGACAGATTGAGc > 1:529661‑M2/118‑151 (MQ=255) ggagcacgaatgggtgcacttagatctgggttccagcgttcccatgattcagcggcattcgaaacgccggacgtgatttatctactggctggcccaggtcagcgtaaacatacgagCGTGCCAGCACTGTTGGCATTGGACAGATTGAGCt < 1:449981‑M2/35‑1 (MQ=255) 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atgggtgcacttagatctgggttccagcgttcccatgattcagcggcattcgaaacgccggacgtgatttatctactggctggcccaggtcagcgtaaacatacgagCGTGCCAGCACTGTTGGCATTGGACAGATTGAGCTGAAAATTGt < 1:3058936‑M2/44‑1 (MQ=255) tgggtgcacttagatctggtttccagcgttcccatgattcagcggcattcgaaacgccggacgtgatttatctactggctggcccaggtcagcgtaaacatacgagCGTGCCAGCACTGTTGGCATTGGACAGATTGAGCTGAAAATTGTc > 1:2551090‑M2/107‑151 (MQ=255) tgggtgcacttagatctgggttccagcgttcccatgattcagcggcattcgaaacgccggacgtgatttatctactggctggcccaggtcagcgtaaacatacgagCGTGCCAGCACTGTTGGCATTGGACAGATTGAGCTGAAAATTGTc < 2:2238535‑M2/45‑1 (MQ=255) tgcacttagatctgggttccagcgttcccatgattcagcggcattcgaaacgccggacgtgatttatctactggctggcccaggtcagcgtaaacatacgagCGTGCCAGCACTGTTGGCATTGGACAGATTGAGCTGAAAATTGTCGGTg > 2:6403699‑M2/103‑151 (MQ=255) acttagatctgggttccagcgttcccatgattcagcggcattcgaaacggcggacgtgatttatctactggctggcccaggtcagcgtaaacatacgagCGTGCCAGCACTGTTGGCATTGGACAGATTGAGCTGAAAATTGTCGGTGgca < 2:4457342‑M2/52‑1 (MQ=255) 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tagatctgggttccagcgttcccatgattcagcggcattcgaaacgccggacgtgatttatctactggctggcccaggtcagcgtaaacatacgagCGTGCCAGCACTGTTGGCATTGGACAGATTGAGCTGAAAATTGTCGGTGgcagca < 2:1092318‑M2/55‑1 (MQ=255) agatctgggttccagcgttcccatgattcagcggcattcgaaacgccggacgtgatttatctactggctggcccaggtcagcgtaaacatacgagCGTGCCAGCACTGTTGGCATTGGACAGATTGAGCTGAAAATTGTCGGTGGCAGCaa > 1:3907611‑M2/96‑151 (MQ=255) agatctgggttccagcgttcccatgattcagcggcattcgaaacgccggacgtgatttatctactggctggcccaggtcagcgtaaacatacgagCGTGCCAGCACTGTTGGCATTGGACAGATTGAGCTGAAAATTGTCGGTGGCAGCaa > 2:5487790‑M2/96‑151 (MQ=255) atctgggttccagcgttcccatgattcagcggcattcgaaacgccggacgtgatttatctactggctggcccaggtcagcgtaaacatacgagCGTGCCAGCACTGTTGGCATTGGACAGATTGAGCTGAAAATTGTCGGTGGCAGCAAcc > 2:1213743‑M2/94‑151 (MQ=255) ctgggttccagcgttcccatgattcagcggcattcgaaacgccggacgtgatttatctactggctggcccaggtcagcgtaaacatacgagCGTGCCAGCACTGTTGGCATTGGACAGATTGAGCTGAAAATTGTCGGTGGCAGCAAcctc < 1:3031185‑M2/60‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |