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Only 100 of 286 total aligned reads displayed.
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> 1:1428145/4‑99 (MQ=17) taccACCCGCCGTT‑CACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGC‑GGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCACACCCCGTGCaa > 2:3826082/3‑151 (MQ=17) ccccacgccgGT‑CACCTTTGCCGCCGCTACCGCAAGCGCGGGTAATCCCGCTCCTACGCCGGATCGAGGATGGACACAGTTCGGTGGC‑GGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAAACCCCGTGCaaaa < 1:1034141/146‑1 (MQ=18) cACCCGCCGTT‑CACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGC‑GGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAAACCCCGTGCaaaaa > 1:2771815/1‑151 (MQ=255) cACCCGCCGTT‑CACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGC‑GGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAAACCCCGTGCaaaaa < 1:2259809/151‑1 (MQ=255) cACCCGCCGTT‑CACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGC‑GGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAAACCCCGTGCaaaaa > 1:4699923/1‑151 (MQ=255) ccccGCCGTT‑CACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGC‑GGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAAACCCCGTGCaaaaaa < 1:2368582/150‑1 (MQ=255) cccGCCGTT‑CACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGC‑GGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAAACCCCGTGCAAAAAAc < 2:2570781/151‑1 (MQ=255) gTT‑CACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGC‑GGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGTCCATCAAACCCCGTGCAAAAAACAAAttt > 1:4514227/1‑151 (MQ=255) t‑CACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATCGAGGACGGACACAGGTCGGTGGC‑GGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGCTCGTGTTTACACGCGAAGAGGACATCAAACTCCGTGCAAAAAACAAAtattt > 2:4517041/1‑151 (MQ=18) cccGTTGCCCCTGCTACCTTATCCGCGGGTAACCCCGCTCCACCGCCGGATGGAGGTTGAACACAGGCGGGTGGC‑GGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAAACCCCGTGCAAAAAACAAATTTTTTc < 1:4105115/150‑1 (MQ=18) 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GATCACTCGGTTGCTGGGGGTAGAGGCTCAAGCCTTGGAGGCTTGCGTCGCCTGAACAGGCCTCTGGTACTGCACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAG‑GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTT‑CACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGCGGGGCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAAACCCCGTGCAAAAAACAAATTTTTTCTAACTACCCCT > CP009974/3847433‑3847732 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |