| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP009974 | 3,288,855 | G→A | G198R (GGG→AGG) | RPPX_14650 → | TetR family transcriptional regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009974 | 3,288,855 | 0 | G | A | 99.7% | 1221.1 / NA | 316 | G198R (GGG→AGG) | RPPX_14650 | TetR family transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base A (159/156); minor base C (1/0); total (160/156) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 317 total aligned reads displayed.
CGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGGATGTGGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATTGCTGCCTGACAGTGTCGATCTGTTGGGCGATGTCGAAAAATGGGTCGACACCGGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCTGCTCTGCGCAAATGACACTTTGTTAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGCATTAAGGGGCGTGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCG > CP009974/3288707‑3289002 | cGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGGATGTGGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATTGCTGCCTGACAGTGTCGATCTGTTGGGCGATGTCGAAAAATGGGTCGACACCAGGCTgg < 1:6219911/151‑1 (MQ=255) gCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGGATGTGGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATTGCTGCCTGACAGTGTCGATCTGTTGGGCGATGTCGAAAAATGGGTCGACACCAGGCTGGa < 1:2942541/151‑1 (MQ=255) gCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGGATGTGGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATTGCTGCCTGACAGTGTCGATCTGTTGGGCGATGTCGAAAAATGGGTCGACACCAGGCTGGa < 1:2049007/151‑1 (MQ=255) ccGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGGATGTGGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATTGCTGCCTGACAGTGTCGATCTGTTGGGCGATGTCGAAAAATGGGTCGACACCAGGCTGGat < 2:4243532/151‑1 (MQ=255) ggggCCAGTTGCCTGGCGAGCTGGATGTGGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATTGCTGCCTGACAGTGTCGATCTGTTGGGCGATGTCGAAAAATGGGTCGACACCAGGCTGGatat > 2:912663/1‑151 (MQ=255) ggggCCAGTTGCCTGGCGAGCTGGATGTGGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATTGCTGCCTGACAGTGTCGATCTGTTGGGCGATGTCGAAAAATGGGTCGACACCAGGCTGGatat > 2:1190991/1‑151 (MQ=255) gggCCAGTTGCCTGGCGAGCTGGATGTGGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATTGCTGCCTGACAGTGTCGATCTGTTGGGCGATGTCGAAAAATGGGTCGACACCAGGCTGGATAtg < 2:6022570/151‑1 (MQ=255) gggCCAGTTGCCTGGCGAGCTGGATGTGGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATTGCTGCCTGACAGTGTCGATCTGTTGGGCGATGTCGAAAAATGGGTCGACACCAGGCTGGATAtg < 1:278874/151‑1 (MQ=255) ccAGTTGCCTGGCGAGCTGGGTGTGGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATTGCTGCCTGACAGTGTCGATCTGTTGGGCGATGTCGAAAAATGGGTCGACACCAGGCTGGATAtgctg < 1:1143174/151‑1 (MQ=255) cAGTTGCCTGGCGAGCTGGATGTGGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATTGCTGCCTGACAGTGTCGATCTGTTGGGCGATGTCGAAAAATGGGTCGACACCAGGCTGGATAtgctgc < 1:443058/151‑1 (MQ=255) aGTTGCCTGGCGGGCTGGATGTGGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATTGCTGCCTGACAGTGTCGATCTGTTGAAAAAAAAAGAAAAATGGGTCGACACCAGGCTGGATATGCTgcg < 2:1715590/151‑1 (MQ=255) aGTTGCCTGGCGAGCTGGAAGTGGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATTGCTGCCTGACAGTGTCGATCTGTTGGGCGATGTCGAAAAATGGGTCGACACCAGGCTGGATATGCTgcg > 1:3918769/1‑151 (MQ=255) ttGCCTGGCGAGCTGGATGTGGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATTGCTGCCTGACAGTGTCGATCTGTTGGGCGATGTCGAAAAATGGGTCGACACCAGGCTGGATATGCTGCGCt > 1:769840/1‑151 (MQ=255) tGCCTGGCGAGCTGGATGTGGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATTGCTGCCTGACAGTGTCGATCTGTTGGGCGATGTCGAAAAATGGGTCGACACCAGGCTGGATATGCTGCGCtt < 1:92893/151‑1 (MQ=255) gCCTGGCGAGCTGGATGTGGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATTGCTGCCTGACAGTGTCGATCTGTTGGGCGATGTCGAAAAATGGGTCGACACCAGGCTGGATATGCTGCGCTTg > 2:1992598/1‑151 (MQ=255) cTGGCGAGCTGGATGTGGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATTGCTGCCTGACAGTGTCGATCTGTTGGGCGATGTCGAAAAATGGGTCGACACCAGGCTGGATATGCTGCGCTTGAg > 1:2211330/1‑151 (MQ=255) cTGGCGAGCTGGATGTGGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATTGCTGCCTGACAGTGTCGATCTGTTGGGCGATGTCGAAAAATGGGTCGACACCAGGCTGGATATGCTGCGCTTGAg < 2:2550602/151‑1 (MQ=255) ggCGAGCTGGATGTGGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATTGCTGCCTGACAGTGTCGATCTGTTGGGCGATGTCGAAAAATGGGTCGACACCAGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGcc > 1:1606161/1‑151 (MQ=255) ggCGAGCTGGATGTGGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATTGCTGCCTGACAGTGTCGATCTGTTGGGCGATGTCGAAAAATGGGTCGACACCAGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGcc > 1:3588841/1‑151 (MQ=255) gAGCTGGATGTGGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATTGCTGCCTGACAGTGTCGATCTGTTGGGCGATGTCGAAAAATGGGTCGACACCAGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCTg < 1:5727183/151‑1 (MQ=255) gCTGGATGTGGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATTGCTGCCTGACAGTGTCGATCTGTTGGGCGATGTCGAAAAATGGGTCGACACCAGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCTGct > 1:3491763/1‑151 (MQ=255) tGGATGTGGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATTGCTGCCTGACAGTGTCGATCTGTTGGGCGATGTCGAAAAATGGGTCGACACCAGGCTGGGTATGCTGCGCTTGAGCCCTGcgct > 2:2756244/1‑151 (MQ=255) gATGTGGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATTGCTGCCTGACAGTGTCGATCTGTTGGGCGATGTCGAAAAATGGGTCGACACCAGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCTGCTCTgc < 1:1337386/151‑1 (MQ=255) gATGTGGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATTGCTGCCTGACAGTGTCGATCTGTTGGGCGATGTCGAAAAATGGGTCGACACCAGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCTGCTCTgc > 1:412432/1‑151 (MQ=255) tgtgGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATTGCTGCCTGACAGTGTCGATCTGTTGGGCGATGTCGAAAAATGGGTCGACACCAGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCTGCTCTgcgc < 2:5314892/151‑1 (MQ=255) tgGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATTGCTGCCTGACAGTGTCGATCTGTTGGGCGATGTCGAAAAATGGGTCGACACCAGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCTGCTCTGCGCaa > 2:841414/1‑151 (MQ=255) gAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATTGCTGCCTGACAGTGTCGATCTGTTGGGCGATGTCGAAAAATGGGTCGACACCAGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCTGCTCTGCGCAAAt < 2:3544396/151‑1 (MQ=255) gAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATTGCTGCCTGACAGTGTCGATCTGTTGGGCGATGTCGAAAAATGGGTCGACACCAGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCTGCTCTGCGCAAAt > 2:2939617/1‑151 (MQ=255) cggcggTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATTGCTGCCTGACAGTGTCGATCTGTTGGGCGATGTCGAAAAATGGGTCGACACCAGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCTGCTCTGCGCCAATGACACtt > 1:4098518/1‑151 (MQ=255) cggTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATTGCTGCCTGACAGTGTCGATCTGTTGGGCGATGTCGAAAAATGGGTCGACACCAGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCTGCTCTGCGCAAATGACACTTTGt > 1:2534522/1‑151 (MQ=255) ggTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATTGCTGCCTGACAGTGTCGATCTGTTGGGCGATGTCGAAAAATGGGTCGACACCAGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCTGCTCTGCGCAAATGACACTTTGtt > 1:3081848/1‑151 (MQ=255) ggTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATTGCTGCCTGACAGTGTCGATCTGTTGGGCGATGTCGAAAAATGGGTCGACACCAGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCTGCTCTGCGCAAATGACACTTTGtt < 1:2565738/151‑1 (MQ=255) gTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATTGCTGCCTGACAGTGTCGATCTGTTGGGCGATGTCGAAACATGGGTCGACACCAGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCTGCTCCGCGCAAATGACACTTTGTTa > 1:5654216/1‑151 (MQ=255) ggCCATGTTGGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATTGCTGCCTGACAGTGTCGATCTGTTGGGCGATGTCGAAAAATGGGTCGACACCAGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCTGCTCTGCGCAAATGACACTTTGTTAAg < 1:6092845/151‑1 (MQ=255) aTGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATTGCTGCCTGACAGTGTCGATCTGTTGGGCGATGTCGAAAAATGGGTCGACACCAGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCTGCTCTGCGCAAATGACACTTTGTTAAGGAtt > 2:6479263/1‑151 (MQ=255) aTGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATTGCTGCCTGACAGTGTCGATCTGTTGGGCGATGTCGAAAAATGGGTCGACACCAGGCTGGATATGCTGCGCTTGACCCCTGCTCTGCGCAAATGACACTTTGTTCAGGAtt > 1:1555794/1‑151 (MQ=255) tGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATTGCTGCCTGACAGTGTCGATCTGTTGGGCGATGTCGAAAAATGGGTCGACACCAGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCTGCTCTGCGCAAATGACACTTTGTTAAGGATtg < 1:3354762/151‑1 (MQ=255) tGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATTGCTGCCTGACAGTGTCGATCTGTTGGGCGATGTCGAAAAATGGGTCGACACCAGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCTGCTCTGCGCAAATGACACTTTGTTAAGGATtg > 2:4839845/1‑151 (MQ=255) tttGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATTGCTGCCTGACAGTGTCGATCTGTTGGGCGATGTCGAAAAATGGGTCGACACCAGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCTGCTCTGCGCAAATGACACTTTGTTAAGGATtgtg < 2:2493148/151‑1 (MQ=255) ttGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATTGCTGCCTGACAGTGTCGATCTGTTGGGCGATGTCGAAAAATGGGTCGACACCAGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCTGCTCTGCGCAAATGACACTTTGTTAAGGATTGTGa < 1:4785315/151‑1 (MQ=255) ttGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATTGCTGCCTGACAGTGTCGATCTGTTGGGCGATGTCGAAAAATGGGTCGACACCAGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCTGCTCTGCGCAAATGACACTTTGTTAAGGATTGTGa < 1:4521915/151‑1 (MQ=255) tGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATTGCTGCCTGACAGTGTCGATCTGTTGGGCGATGTCGAAAAATGGGTCGACACCAGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCTGCTCTGCGCAAATGACACTTTGTTAAGGATTGTGAGGGAgtg > 2:2271656/1‑151 (MQ=255) tGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATTGCTGCCTGACAGTGTCGATCTGTTGGGCGATGTCGAAAAATGGGTCGACACCAGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCTGCTCTGCGCAAATGACACTTTGTTAAGAATTGTGAGGGAgtg > 2:1574765/1‑151 (MQ=255) cGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATTGCTGCCTGACAGTGTCGATCTGTTGGGCGATGTCGAAAAATGGGTCGACACCAGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCTGCTCTGCGCAAATGACACTTTGTTAAGGATTGTGAGGGAGTGttt > 1:6367339/1‑151 (MQ=255) cGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATTGCTGCCTGACAGTGTCGATCTGTTGGGCGATGTCGAAAAATGGGTCGACACCAGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCTGCTCTGCGCAAATGACACTTTGTTAAGGATTGTGAGGGAGTGttt < 1:3706062/151‑1 (MQ=255) gATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATTGCTGCCTGACCGTGTCGATCTGTTGGGCGATGTCGAAAAATGGGTCGACACCAGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCTGCTCTGCGCAAATGACACTTTGTTAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTc < 2:5893593/151‑1 (MQ=255) gATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATTGCTGCCTGACAGTGTCGATCTGTTGGGCGATGTCGAAAAATGGGTCGACACCAGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCTGCTCTGCGCAAATGACACTTTGTTAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTc > 1:3179706/1‑151 (MQ=255) gATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATTGCTGCCTGACAGTGTCGATCTGTTGGGCGATGTCGAAAAATGGGTCGACACCAGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCTGCTCTGCGCAAATGACACTTTGTTAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTc > 1:4002536/1‑151 (MQ=255) gATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATTGCTGCCTGACAGTGTCGATCTGTTGGGCGATGTCGAAAAATGGGTCGACACCAGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCTGCTCTGCGCAAATGACACTTTGTTAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTc < 1:5842162/151‑1 (MQ=255) aTGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATTGCTGCCTGACAGTGTCGATCTGTTGGGCGATGTCGAAAAATGGGTCGACACCAGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCTGCTCTGCGCAAATGACACTTTGTTAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTcc > 1:6267958/1‑151 (MQ=255) ggCCTGATCGGGCGCTGGCTATTGCTGCCTGACAGTGTCGATCTGTTGGGCGATGTCGAAAAATGGGTCGACACCAGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCTGCTCTGCGCAAATGACACTTTGTTAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTcccc > 2:4969104/1‑151 (MQ=255) gCCTGATCGGGCGCTGAGTATTGCTGCCTGACAGTGTGGATCTGTTGGGCGATGGCGTAAAATGGGTCGACAGCAGGCTGTGTATGCTGCGCTTGAGGCCTGCTCTGCGCAAAAAACAAATAATTAAAGAATGTGAGGGAGTGTTTCCCCt < 2:2928525/151‑1 (MQ=255) ccTGATCGGGCGCTGGCTATTGCTGCCTGACAGTGTCGATCTGTTGGGCGATGTCGAAAAATGGGTCGACACCAGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCTGCTCTGCGCAAATGACACTTTGTTAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCtt < 1:5755678/151‑1 (MQ=255) ccTGAGCGGGCGCTGGCTATTGGTGCCTGACAGTGTCGATCTGTTGGGCGATGTCGAAAAATGGGTCGACACCAGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCTGCTCTGCGCAAATGACACTTTGTTAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCtt < 2:4752171/151‑1 (MQ=255) aTCGGGCGCTGGCTATTGCTGCCTGACAGTGTCGATCTGTTGGGCGATGTCGAAAAATGGGTCGACACCAGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCTGCTCTGCGCAAATGACACTTTGTTAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCTTtgtg < 2:4637602/151‑1 (MQ=255) cTGGCTATTGCTGCCTGACAGTGTCGATCTGTTGGGCGATGTCGAAAAATGGGTCGACACCAGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCTGCTCTGCGCAAATGACACTTTGTTAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAgggg > 1:2393962/1‑151 (MQ=255) tGGCTATTGCTGCCTGACAGTGTCGATCTGTTGGGCGATGTCGAAAAATGGGTCGACACCAGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCTGCTCTGCGCAAATGACACTTTGTTAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAggggg > 2:3392816/1‑151 (MQ=255) gCTATTGCTGCCTGACAGTGTCGATCTGTTGGGCGATGTCGAAAAATGGGTCGACACCAGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCTGCTCTGCGCAAATGACACTTTGTTAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGCa > 1:4262193/1‑151 (MQ=255) cTATTGCTGCCTGACAGTGTCGATCTGTTGGGCGATGTCGAAAAATGGGTCGACACCAGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCTGCTCTGCGCAAATGACACTTTGTTAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGCAt > 2:3022932/1‑151 (MQ=255) tATTGCTGCCTGACAGTGTCGATCTGTTGGGCGATGTCGAAAAATGGGTCGACACCAGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCTGCTCTGCGCAAATGACACTTTGTTAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGCAtt > 2:5479922/1‑151 (MQ=255) aTTGCTGCCTGACAGTGTCGATCTGTTGGGCGATGTCGAAAAATGGGTCGACACCAGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCTGCTCTGCGCAAATGACACTTTGTTAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGCATTa < 2:443353/151‑1 (MQ=255) ttGCTGCCTGACAGTGTCGATCTGTTGGGCGATGTCGAAAAATGGGTCGACACCAGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCTGCTCTGCGCAAATGACACTTTGTTAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGCATTaa < 2:6379655/151‑1 (MQ=255) ttGCTGCCTGACAGTGTCGATCTGTTGGGCGATGTCGAAAAATGGGTCGACACCAGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCTGCTCTGCGCAAATGACACTTTGTTAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGCATCaa > 2:1247914/1‑151 (MQ=255) tgctgcCTGACGGTGTCGATCTGTTGGGCGATGTCGAAAAATGGGTCGACACCAGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCTGCTCTGCGCAAATGACACTTTGTTAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGCATTAAg < 2:3796100/151‑1 (MQ=255) gctgcCTGACAGTGTCGATCTGTTGGGCGATGTCGAAAAATGGGTCGACACCAGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCTGCTCTGCGCAAATGACACTTTGTTAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGCATTAAgg < 1:5419839/151‑1 (MQ=255) tgcCTGACAGTGTCGATCTGTTGGGCGATGTCGAAAAATGGGTCGACACCAGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCTGCTCTGCGCAAATGACACTTTGTTAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGCATTAAgggg > 2:2412271/1‑151 (MQ=255) tgcCTGACAGTGTCGATCTGTTGGGCGATGTCGAAAAATGGGTCGACACCAGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCTGCTCTGCGCAAATGACACTTTGTTAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGCATTAAgggg < 1:5030183/151‑1 (MQ=255) gcCTGACAGTGTCGATCTGTTGGGCGATGTCGAAAAATGGGTCGACACCAGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCTGCTCTGCGCAAATGACACTTTGTTAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGCATTAAGGGGc < 1:3281436/151‑1 (MQ=255) aCAGTGTCGATCTGTTGGGCGATGTCGAAAAATGGGTCGACACCAGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCTGCTCTGCGCAAATGACACTTTGTTAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGCATTAAGGGGCGTGgc > 2:1851696/1‑151 (MQ=255) aCAGTGTCGATCTGTTGGGCGATGTCGAAAAATGGGTCGACACCAGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCTGCTCTGCGCAAATGACACTTTGTTAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGCATTAAGGGGCGTGgc < 1:6454240/151‑1 (MQ=255) gtgtCGATCTGTTGGGCGATGTCGAAAAATGGGTCGACACCAGGCTTGATATGCTGCGCTTGAGCCCTGCTCTGCGCAAATGACACTTTGTTAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGCATGAAGGGGCGTGgccgc > 2:56897/1‑151 (MQ=255) gtgtCGATCTGTTGGGCGATGTCGAAAAATGGGTCGACACCAGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCTGCTCTGCGCAAATGACACTTTGTTAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGCATTAAGGGGCGTGgccgc > 1:3058697/1‑151 (MQ=255) tgtCGATCTGTTGGGCGATGTCGAAAAATGGGTCGACACCAGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCTGCTCTGCGCAAATGACACTTTGTTAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGCATTAAGGGGCGTGgccgcc < 1:2158539/151‑1 (MQ=255) gATCTGTTGGGCGATGTCGAAAAATGGGTCGACACCAGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCTGCTCTGCGCAAATGACACTTTGTTAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGCATTAAGGGGCGTGGCCGCCCTGc < 1:3408639/151‑1 (MQ=255) tCTGTTGGGCGATGTCGAAAAATGGGTCGACACCAGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCTGCTCTGCGCAAATGACACTTTGTTAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGCATTAAGGGGCGTGGCCGCCCTGCgg > 1:5190659/1‑151 (MQ=255) cTGTTGGGCGATGTCGAAAAATGGGTCGACACCAGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCTGCTCTGCGCAAATGACACTTTGTTAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGCATTAAGGGGCGTGGCCGCCCTGCGGc > 2:3277112/1‑151 (MQ=255) tGTTGGGCGATGAAGAAAAATGGGTCGACACCAGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCTGCTCTGCGCAAATGACACTTTGTTAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGCATTAAGGGGCGTGGCCGCCCTGCGGCt < 2:3092644/151‑1 (MQ=255) gTTGGGCGATGTCGAAAAATGGGTCGACACCAGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCTGCTCTGCGCAAATGACACTTTGTTAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGCATTAAGGGGCGTGGCCGCCCTGCGGCTg > 2:3570271/1‑151 (MQ=255) ttGGGCGATGTCGAAAAATGGGTCGACACCAGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCTGCTCTGCGCAAATGACACTTTGTTAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGCATTAAGGGGCGTGGCCGCCCTGGGGCTGt > 1:1084237/1‑151 (MQ=255) gggCGATGTCGAAAAATGGGTCGACACCAGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCTGCTCTGCGCAAATGACACTTTGTTAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGCATTAAGGGGCGTGGCCGCCCTGCGGCTGTTc < 2:1647476/151‑1 (MQ=255) ggCGATGTCGAAAAATGGGTCGACACCAGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCTGCTCTGCGCAAATGACACTTTGTTAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGCATTAAGGGGCGTGGCCGCCCTGCGGCTGTTCg < 2:936242/151‑1 (MQ=255) ggCGATGTCGAAAAATGGGTCGACACCAGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCTGCTCTGCGCAAATGACACTTTGTTAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGCATTAAGGGGCGTGGCCGCCCTGCGGCTGTTCg < 1:4875216/151‑1 (MQ=255) agATGTCGAAAAATGGGTCGACACCAGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCTGCTCTGCGCAAATGACACTTTGTTAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGCATTAAGGGGCGTGGCCGCCCTGCGGCTGTTCgca < 1:2859798/150‑1 (MQ=255) gTCGAAAAATGGGTCGACACCAGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCTGCTCTGCGCAAATGACACTTTGTTAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGCATTAAGGGGCGTGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGcac > 1:3828536/1‑151 (MQ=255) tCGAAAAATGGGTCGACACCAGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCTGCTCTGCGCAAATGACACTTTGTTAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGCATTAAGGGGCGTGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGcaca > 2:2151696/1‑151 (MQ=255) cGAAAAATGGGTCGACACCAGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCTGCTCTGCGCAAATGACACTTTGTTAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGCATTAAGGGGCGTGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACaa > 2:4274760/1‑151 (MQ=255) gAAAAATGGGTCGACACCAGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCTGCTCTGCGCAAATGACACTTTGTTAAGGATTGTGAGTGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGCGGCATTAAGGCGCG‑CGCCCCCCTGCGCCTGTTCGCCGCACAAgc > 1:5228505/1‑150 (MQ=255) gAAAAATGGGTCGACACCAGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCTGCTCTGCGCAAATGACACTTTGTTAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGCATTAAGGGGCGTGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAg > 2:1394985/1‑151 (MQ=255) aaaaaTGGGTCGACACCAGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCTGCTCTGCGCAAATGACACTTTGTTAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGCATTAAGGGGCGTGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAgg > 1:2443164/1‑151 (MQ=255) aaaaaTGGGTCGACACCAGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCTGCTCTGCGCAAATGACACTTTGTTAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGCATTAAGGGGCGTGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAgg < 1:1423527/151‑1 (MQ=255) aaaaaTGGGTCGACACCAGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCTGCTCTGCGCAAATGACACTTTGTTAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGCATTAAGGGGCGTGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAgg > 1:6191868/1‑151 (MQ=255) acaTGGGTCGACACCAGGCTGGATATGCTGCGCTTCAGCCCTGCTCTGCGCAAATGACACTTTGTTAAGGATTGTGAGCGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGCATTAAGGGGCGTGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAggcg < 2:3919367/149‑1 (MQ=255) aaaTGGGTCGACACCAGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCTGCTCTGCGCAAATGACACTTTGTTAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGCATTAAGGGGCGTGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAggcg < 2:751563/151‑1 (MQ=255) aaaTGGGTCGACACCAGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCTGCTCTGCGCAAATGACACTTTGTTAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGCATTAAGGGGCGTGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAggcg < 1:2936810/151‑1 (MQ=255) aTGGGTCGACACCAGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCTGCTCTGCGCAAATGACACTTTGTTAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGCATTAAGGGGCGTGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAggcggc > 1:4735358/1‑151 (MQ=255) ggggTGGACACGAGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCTGCGCTGCGCAAATGACACTTTGTTAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGCATTAAGGGGCGTGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGct < 2:3690123/150‑1 (MQ=255) gTCGACGCCAGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCTGCTCTGCGCAAATGACACTTTGTTAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGCATTAAGGGGCGTGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCtt < 1:1905031/151‑1 (MQ=255) gACACCAGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCTGCTCTGCGCAAATGACACTTTGTTAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGCATTAAGGGGCGTGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCa < 1:912663/151‑1 (MQ=255) cacCAGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCTGCTCTGCGCAAATGACACTTTGTTAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGCATTAAGGGGCGTGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGc > 1:4457285/1‑151 (MQ=255) acCAGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCTGCTCTGCGCAAATGACACTTTGTTAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGCATTAAGGGGCGTGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCg > 1:5278013/1‑151 (MQ=255) | CGTACGCCGGGGCCAGTTGCCTGGCGAGCTGGATGTGGAGCGCGCGGCGGTGGCCATGTTTGCCTATGTCGATGGCCTGATCGGGCGCTGGCTATTGCTGCCTGACAGTGTCGATCTGTTGGGCGATGTCGAAAAATGGGTCGACACCGGGCTGGATATGCTGCGCTTGAGCCCTGCTCTGCGCAAATGACACTTTGTTAAGGATTGTGAGGGAGTGTTTCCCCTTTGTGTTAAGGGGGCATTAAGGGGCGTGGCCGCCCTGCGGCTGTTCGCAGCACAAGGCGGCTCTTGCAGCG > CP009974/3288707‑3289002 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |