| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP009974 | 3,530,581 | C→T | G54S (GGC→AGC) | RPPX_15770 ← | phosphoribosylaminoimidazole synthetase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009974 | 3,530,581 | 0 | C | T | 99.7% | 1174.0 / NA | 308 | G54S (GGC→AGC) | RPPX_15770 | phosphoribosylaminoimidazole synthetase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (141/166); minor base G (0/1); total (141/167) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 324 total aligned reads displayed.
AGCGGCTCGGCGCCGCACACGACCAGGTCGTTGACGCACATGGCGACCAGGTCCTGGCCGATGCTGTCGTGCTTGTTCAGGTTCAGCGCCAGGCGCAGCTTGGTGCCGACGCCGTCGGTGCCGGAGACCAGCACCGGCTGCTTGTAGCCGGCCGGGATCTCGCAGAGGGCGCCGAAGCCGCCCAGGCCACCCATGACTTCAGGGCGTGCGGTGCGTTTTGCCACGCCCTTGATGCGTTCGACCAGTGCTTCGCCGGCGTCGATGTCTACACCGGCGTCCTTGTAGCTCAGGGAGGG > CP009974/3530433‑3530728 | aGCGGCTCGGCGCCGCACACGACCAGGTCGTTGACGCACATGGCGACCAGGTCCTGGCCGATGCTGTCGTGCTTGTTCAGGTTCAGCGCCAGGCGCAGCTTGGTGCCGACGCCGTCGGTGCCGGAGACCAGCACCGGCTGCTTGTAgctgg < 1:5273461/151‑1 (MQ=255) gCGGCTCGGCGCCGCACACGACCAGGTCGTTGACGCACATGGCGACCAGGTCCTGGCCGATGCTGTCGTGCTTGTTCAGGTTCAGCGCCAGGCGCAGCTTGGTGCCGACGCCGTCGGTGCCGGAGACCAGCACCGGCTGCTTGTAgctggc > 1:511751/1‑151 (MQ=255) ggCTCGGCGCCGCACACGACCAGGTCGTTGACGCACATGGCGACCAGGTCCTGGCCGATGCTGTCGTGCTTGTTCAGGTTCAGCGCCAGGCGCAGCTTGGTGCCGACGCCGTCGGTGCCGGAGACCAGCACCGGCTGCTTGTAgctggccg > 1:5494794/1‑151 (MQ=255) ggCTCGGCGCCGCACACGACCAGGTCGTTGACGCACATGGCGACCAGGTCCTGGCCGATGCTGTCGTGCTTGTTCAGGTTCAGCGCCAGGCGCAGCTTGGTGCCGACGCCGTCGGTGCCGGAGACCAGCACCGGCTGCTTGTAgctggccg > 1:2636747/1‑151 (MQ=255) ggCTCGGCGCCGCACACGACCAGGTCGTTGACGCACATGGCGACCAGGTCCTGGCCGATGCTGTCGTGCTTGTTCAGGTTCAGCGCCAGGCGCAGCTTGGTGCCGACGCCGTCGGTGCCGGAGACCAGCACCGGCTGCTTGTAgctggccg > 1:6092146/1‑151 (MQ=255) gCTCGGCGCCGCACACGACCAGGTCGTTGACGAACCTGGCGACCAGGTCCTGGCCGATGCTGTCGTACTTGGTCAGGTTCAGAGCCAGGCGCAGCTTGGTGCCGACGCCGTCGGTGCCGGAGACCAGCACCGGCTGCTTGTAGctggccgg < 2:2970685/151‑1 (MQ=255) cTCGGCGCCGCACACGACCAGGTCGTTGACGCACATGGCGACCAGGTCCTGGCCGATGCTGTCGTGCTTGTTCAGGTTCAGCGCCAGGCGCAGCTTGGTGCCGACGCCGTCGGTGCCGGAGACCAGCACCGGCTGCTTGTAGCTGGCCggg < 1:4283918/151‑1 (MQ=255) cTCGGCGCCGCACACGACCAGGTCGTTGACGCACATGGCGACCAGGTCCTGGCCGATGCTGTCGTGCTTGTTCAGGTTCAGCGCCAGGCGCAGCTTGGTGCCGACGCCGTCGGTGCCGGAGACCAGCACCGGCTGCTTGTAGCTGGCCggg > 1:5246514/1‑151 (MQ=255) tCGGCGCCGCACACGACCAGGTCGTTGACGCACATGGCGACCAGGTCCTGGCCGATGCTGTCGTGCTTGTTCAGGTTCAGCGCCAGGCGCAGCTTGGTGCCGACGCCGTCGGTGCCGGAGACCAGCACCGGCTGCTTGTAGCTGGCTGGGa > 1:6073859/1‑151 (MQ=255) ggCGCCGCACACGACCAGGTCGTTGACGCACATGGCGACCAGGTCCTGGCCGATGCTGTCGTGCTTGTTCAGGTTCAGCGCCAGGCGCAGCTTGGTGCCGACGCCGTCGGTGCCGGAGACCAGCACCGGCTGCTTGTAGCTGGCCGGGAtc < 1:4980502/151‑1 (MQ=255) cgccgcACACGACCAGGTCGTTGACGCACATGGCGACCAGGTCCTGGCCGATGCTGTCGTGCTTGTTCAGGTTCAGCGCCAGGCGCAGCTTGGTGCCGACGCCGTCGGTGCCGGAGACCAGCACCGGCTGCTTGTAGCTGGCCGGGAtctc < 1:1597112/151‑1 (MQ=255) cgccgcACACGACCAGGTCGTTGACGCACATGGCGACCAGGTCCTGGCCGATGCTGTCGTGCTTGTTCAGGTTCAGCGCCAGGCGCAGCTTGGTGCCGACGCCGTCGGTGCCGGAGACCAGCACCGGCTGCTTGTAGCTGGCCGGGAtctc > 1:5596273/1‑151 (MQ=255) ccgcACACGACCAGGTCGTTGACGCACATGGCGACCAGGTCCTGGCCGATGCTGTCGTGCTTGTTCAGGTTCAGCGCCAGGCGCAGCTTGGTGCCGACGCCGTCGGTGCCGGAGACCAGCACCGGCTGCTTGTAGCTGGCCGGGATCTCGc < 1:3525100/151‑1 (MQ=255) gcACACGACCAGGTCGTTGACGCACATGGCGACCAGGTCCTGGCCGATGCTGTCGTGCTTGTTCAGGTTCAGCGCCAGGCGCAGCTTGGTGCCGACGCCGTCGGTGCCGGAGACCAGCACCGGCTGCTTGTAGCTGGCCGGGATCTCGCag < 1:5039570/151‑1 (MQ=255) acacGACCAGGTCGTTGACGCACATGGCGACCAGGTCCTGGCCGATGCTGTCGTGCTTGTTCAGGTTCAGCGCCAGGCGCAGCTTGGTGCCGACGCCGTCGGTGCCGGAGACCAGCACCGGCTGCTTGTAGCTGGCCGGGATCTCGCagag < 1:3646263/151‑1 (MQ=255) cGACCAGGTCGTTGACGCACATGGCGACCAGGTCCTGGCCGATGCTGTCGTGCTTGTTCAGGTTCAGCGCCAGGCGCAGCTTGGTGCCGACGCCGTCGGTGCCGGAGACCAGCACCGGCTGCTTGTAGCTGGCCGGGATCTCGCAGAGGgc < 2:3150084/151‑1 (MQ=255) ccAGGTCGTTGACGCACATGGCGACCAGGTCCTGGCCGATGCTGTCGTGCTTGTTCAGGTTCAGCGCCAGGCGCAGCTTGGTGCCGACGCCGTCGGTGCCGGAGACCAGCACCGGCTGCTTGTAGCTGGCCGGGATCTCGCAGAGGGCGcc < 1:543487/151‑1 (MQ=255) cAGGTCGTTGACGCACATGGCGACCAGGCCCTGGCCGCTGCTGTCGTGCTTGTTCAGGTTCAGCGCCAGGCGCAGCTTGGTGCCGACGCCGTCGGTGCCGGAGACCAGCACCGGCTGCTTGTAGCTGGCCGGGATCTCGCAGAGGGCGCCg < 2:854817/151‑1 (MQ=255) ggTCGTTGACGCACATGGCGACCAGGTCCTGGCCGATGCTGTCGTGCTTGTTCAGGTTCAGCGCCAGGCGCAGCTTGGTGCCGACGCCGTCGGTGCCGGAGACCAGCACCGGCTGCTTGTAGCTGGCCGGGATCTCGCAGAGGGCGCCGaa < 1:3184623/151‑1 (MQ=255) gTCGTTGACGCACATGGCGACCAGGTCCTGGCCGATGCTGTCGTGCTTGTTCAGGTTCAGCGCCAGGCGCAGCTTGGTGCCGACGCCGTCGGTGCCGGAGACCAGCACCGGCTGCTTGTAGCTGGCCGGGATCTCGCAGAGGGCGCCGAAg < 1:4506236/151‑1 (MQ=255) tCGTTGACGCACATGGCGACCAGGTCCTGGCCGATGCTGTCGTGCTTGTTCAGGTTCAGCGCCAGGCGCAGCTTGGTGCCGACGCCGTCGGTGCCGGAGACCAGCACCGGCTGCTTGTAGCTGGCCGGGATCTCGCAGAGGGCGCCGAAgc < 1:3425536/151‑1 (MQ=255) cGTTGACGCACATGGCGACCAGGTCCTGGCCGATGCTGTCGTGCTTGTTCAGGTTCAGCGCCAGGCGCAGCTTGGTGCCGACGCCGTCGGTGCCGGAGACCAGCACCGGCTGCTTGTAGCTGGCCGGGATCTCGCAGAGGGCGCCGAAgcc < 2:602983/151‑1 (MQ=255) gTTGACGCACATGGCGACCAGGTCCTGGCCGATGCTGTCGTGCTTGTTCAGGTTCAGCGCCAGGCGCAGCTTGGTGCCGACGCCGTCGGTGCCGGAGACCAGCACCGGCTGCTTGTAGCTGGCCGGGATCTCGCAGAGGGCGCCGAAgccg > 1:4650621/1‑151 (MQ=255) gACGCACCTGGCGACCAGGTCCGGGCCGATGCTGTCGTGCTTGTTCAGGTTCAGCGCCAGGCGCAGCTTGGTGCCGACGCCGTCGGTGCCGGAGACCAGCACCGGCTGCTTGTAGCTGGCCGGGATCTCGCAGAGGGCGCCGAAGCCGccc < 2:3820040/151‑1 (MQ=255) gACGCACATGGCGACCAGGTCCTGGCCGATGCTGTCGTGCTTGTTCAGGTTCAGCGCCAGGCGCAGCTTGGTGCCGACGCCGTCGGTGCCGGAGACCAGCACCGGCTGCTTGTAGCTGGCCGGGATCTCGCAGAGGGCGCCGAAGCCGccc < 1:1919720/151‑1 (MQ=255) ggCACGTGGGGACCAGGTCCTGGCCGATGCTGTCGTGCTTGTTCAGGTTCAGCGCCAGGCGCAGCTTGGTGCCGACGCCGTCGGTGCCGGAGACCAGCACCGGCTGCTTGTAGCTGGCCGGGATCTCGCAGAGGGCGCCGAAGCCGCCCAg < 2:1986486/150‑1 (MQ=255) cGCACATGGCGACCAGGTCCTGGCCGATGCTGTCGTGCTTGTTCAGGTTCAGCGCCAGGCGCAGCTTGGTGCCGACGCCGTCGGTGCCGGAGACCAGCACCGGCTGCTTGTAGCTGGCCGGGATCTCGCAGAGGGCGCCGAAGCCGCCCAg < 2:3307982/151‑1 (MQ=255) cacaTGGCGACCAGGTCCTGGCCGATGCTGTCGTGCTTGTTCAGGTTCAGCGCCAGGCGCAGCTTGGTGCCGACGCCGTCGGTGCCGGAGACCAGCACCGGCTGCTTGTAGCTGGCCGGGATCTCGCAGAGGGCGCCGAAGCCGCCCAGGc < 1:1832141/151‑1 (MQ=255) caTGGCGACCAGGTCCTGGCCGATGCTGTCGTGCTTGTTCAGGTTCAGCGCCAGGCGCAGCTTGGTGCCGACGCCGTCGGTGCCGGAGACCAGCACCGGCTGCTTGTAGCTGGCCGGGATCTCGCAGAGGGCGCCGAAGCCGCCCAGGCCa < 1:1777059/151‑1 (MQ=255) ggCGACCAGGTCCTGGCCGATGCTGTCGTGCTTGTTCAGGTTCAGCGCCAGGCGCAGCTTGGTGCCGACGCCGTCGGTGCCGGAGACCAGCACCGGCTGCTTGTAGCTGGCCGGGATCTCGCAGAGGGCGCCGAAGCCGCCCAGGCCAccc < 1:5763464/151‑1 (MQ=255) cGACCAGGTCCTGGCCGATGCTGTCGTGCTTGTTCAGGTTCAGCGCCAGGCGCAGCTTGGTGCCGACGCCGTCGGTGCCGGAGACCAGCACCGGCTGCTTGTAGCTGGCCGGGATCTCGCAGAGGGCGCCGAAGCCGCCCAGGCCACCCAt < 2:5246514/151‑1 (MQ=255) gACCAGGTCCTGGCCGATGCTGTCGTGCTTGTTCAGGTTCAGCGCCAGGCGCAGCTTGGTGCCGACGCCGTCGGTGCCGGAGACCAGCACCGGCTGCTTGTAGCTGGCCGGGATCTCGCAGAGGGCGCCGAAGCCGCCCAGGCCACCCATg < 1:6378540/151‑1 (MQ=255) ggTCCTGGCCGATGCTGTCGTGCTTGTTCAGGTTCAGCGCCAGGCGCAGCTTGGTGCCGACGCCGTCGGTGCCGGAGACCAGCACCGGCTGCTTGTAGCTGGCCGGGATCTCGCAGAGGGCGCCGAAGCCGCCCAGGCCACCCATGACTTc < 1:3996805/151‑1 (MQ=255) gTCCTGGCCGATGCTGTCGTGCTTGTTCAGGTTCAGCGCCAGGCGCAGCTTGGTGCCGACGCCGTCGGTGCCGGAGACCAGCACCGGCTGCTTGTAGCTGGCCGGGATCTCGCAGAGGGCGCCGAAGCCGCCCAGGCCACCCATGACTTCa > 2:931966/1‑151 (MQ=255) ggCCGATGCTGTCGTGCTTGTTCAGGTTCAGCGCCAGGCGCAGCTTGGTGCCGACGCCGTCGGTGCCGGAGACCAGCACCGGCTGCTTGTAGCTGGCCGGGATCTCGCAGAGGGCGCCGAAGCCGCCCAGGCCACCCATGACTTCAGGGCg < 1:4391635/151‑1 (MQ=255) ggCCGATGCTGTCGTGCTTGTTCAGGTTCAGCGCCAGGCGCAGCTTGGTGCCGACGCCGTCGGTGCCGGAGACCAGCACCGGCTGCTTGTAGCTGGCCGGGATCTCGCAGAGGGCGCCGAAGCCGCCCAGGCCACCCATGACTTCAGGGCg < 1:2342468/151‑1 (MQ=255) gCCGATGCTGTCGTGCTTGTTCAGGTTCAGCGCCAGGCGCAGCTTGGTGCCGACGCCGTCGGTGCCGGAGACCAGCACCGGCTGCTTGTAGCTGGCCGGGATCTCGCAGAGGGCGCCGAAGCCGCCCAGGCCACCCATGACTTCAGGGCgt < 1:6514977/151‑1 (MQ=255) ccGATGCTGTCGTGCTTGTTCAGGTTCAGCGCCAGGCGCAGCTTGGTGCCGACGCCGTCGGTGCCGGAGACCAGCACCGGCTGCTTGTAGCTGGCCGGGATCTCGCAGAGGGCGCCGAAGCCGCCCAGGCCACCCATGACTTCAGGGCgtg > 2:2178045/1‑151 (MQ=255) ccGATGCTGTCGTGCTTGTTCAGGTTCAGCGCCAGGCGCAGCTTGGTGCCGACGCCGTCGGTGCCGGAGACCAGCACCGGCTGCTTGTAGCTGGCCGGGATCTCGCAGAGGGCGCCGAAGCCGCCCAGGCCACCCATGACTTCAGGGCgtg > 1:1970444/1‑151 (MQ=255) gATGCTGTCGTGCTTGTTCAGGTTCAGCGCCAGGCGCAGCTTGGTGCCGACGCCGTCGGTGCCGGAGACCAGCACCGGCTGCTTGTAGCTGGCCGGGATCTCGCAGAGGGCGCCGAAGCCGCCCAGGCCACCCATGACTTCAGGGCgtgcg > 1:1136852/1‑151 (MQ=255) aTGCTGTCGTGCTTGTTCAGGTTCAGCGCCAGGCGCAGCTTGGTGCCGACGCCGTCGGTGCCGGAGACCAGCACCGGCTGCTTGTAGCTGGCCGGGATCTCGCAGAGGGCGCCGAAGCCGCCCAGGCCACCCATGACTTCAGGGCgtgcgg > 1:765201/1‑151 (MQ=255) tGCTGTCGTGCTTGTTCAGGTTCAGCGCCAGGCGCAGCTTGGTGCCGACGCCGTCGGTGCCGGAGACCAGCACCGGCTGCTTGTAGCTGGCCGGGATCTCGCAGAGGGCGCCGAAGCCGCCCAGGCCACCCATGACTTCAGGGCgtgcggt > 1:5966935/1‑151 (MQ=255) gTCGTGCTTGTTCAGGTTCAGCGCCAGGCGCAGCTTGGTGCCGACGCCGTCGGTGCCGGAGACCAGCACCGGCTGCTTGTAGCTGGCCGGGATCTCGCAGAGGGCGCCGAAGCCGCCCAGGCCACCCATGACTTCAGGGCGTGCGGTGCGt > 2:1680455/1‑151 (MQ=255) gTGCTTGTTCAGGTTCAGCGCCAGGCGCAGCTTGGTGCCGACGCCGTCGGTGCCGGAGACCAGCACCGGCTGCTTGTAGCTGGCCGGGATCTCGCAGAGGGCGCCGAAGCCGCCCAGGCCACCCATGACTTCAGGGCGTGCGGTGCGtttt > 2:4287415/1‑151 (MQ=255) gCTTGTTCAGGTTCAGCGCCAGGCGCAGCTTGGTGCCGACGCCGTCGGTGCCGGAGACCAGCACCGGCTGCTTGTAGCTGGCCGGGATCTCGCAGAGGGCGCCGAAGCCGCCCAGGCCACCCATGACTTCAGGGCGTGCGGTGCGTTTTGc < 1:4641174/151‑1 (MQ=255) gCTTGTTCAGGTTCAGCGCCAGGCGCAGCTTGGTGCCGACGCCGTCGGTGCCGGAGACCAGCACCGGCTGCTTGTAGCTGGCCGGGATCTCGCAGAGGGCGCCGAAGCCGCCCAGGCCACCCATGACTTCAGGGCGTGCGGTGCGTTTTGc > 2:4920233/1‑151 (MQ=255) cTTGTTCAGGTTCAGCGCCAGGCGCAGCTTGGTGCCGACGCCGTCGGTGCCGGAGACCAGCACCGGCTGCTTGTAGCTGGCCGGGATCTCGCAGAGGGCGCCGAAg > 2:5612306/1‑106 (MQ=255) ttGTTCAGGTTCAGCGCCAGGCGCAGCTTGGTGCCGACGCCGTCGGTGCCGGAGACCAGCACCGGCTGCTTGTAGCTGGCCGGGATCTCGCAGAGGGCGCCGAAGCCGCCCAGGCCACCCATGACTTCAGGGCGTGCGGTGCGTTTTGCCa > 2:673184/1‑151 (MQ=255) tGTTCAGGTTCAGCGCCAGGCGCAGCTTGGTGCCGACGCCGTCGGTGCCGGAGACCAGCACCGGCTGCTTGTAGCTGGCCGGGATCTCGCAGAGGGCGCCGAAGCCGCCCAGGCCACCCATGACTTCAGGGCGTGCGGTGCGTTTTGCCAc > 1:799268/1‑151 (MQ=255) gttcaggttcagCGCCAGGCGCAGCTTGGTGCCGACGCCGTCGGTGCCGGAGACCAGCACCGGCTGCTTGTAGCTGGCCGGGATCTCGCAGAGGGCGCCGAAGCCGCCCCGGCCACCCATGACTTCAGGGCGTGCGGTGCGTTTTGCCACg > 2:1760418/1‑151 (MQ=255) gttcaggttcagCGCCAGGCGCAGCTTGGTGCCGACGCCGTCGGTGCCGGAGACCAGCACCGGCTGCTTGTAGCTGGCCGGGATCTCGCAGAGGGCGCCGAAGCCGCCCAGGCCACCCATGACTTCAGGGCGTGCGGTGCGTTTTGCCACg > 1:1527560/1‑151 (MQ=255) tcaggttcagCGCCAGGCGCAGCTTGGTGCCGACGCCGTCGGTGCCGGAGACCAGCACCGGCTGCTTGTAGCTGGCCGGGATCTCGCAGAGGGCGCCGAAGCCGCCCAGGCCACCCATGACTTCAGGGCGTGCGGTGCGTATTGCCACGcc > 2:644845/1‑151 (MQ=255) caggttcagCGCCAGGCGCAGCTTGGTGCCGACGCCGTCGGTGCCGGAGACCAGCACCGGCTGCTTGTAGCTGGCCGGGATCTCGCAGAGGGCGCCGAAGCCGCCCAGGCCACCCATGACTTCAGGGCGTGCGGTGCGTTTTGCCACGccc < 1:1264686/151‑1 (MQ=255) caggttcagCGCCAGGCGCAGCTTGGTGCCGACGCCGTCGGTGCCGGAGACCAGCACCGGCTGCTTGTAGCTGGCCGGGATCTCGCAGAGGGCGCCGAAGCCGCCCAGGCCACCCATGACTTCAGGGCGTGCGGTGCGTTTTGCCACGccc < 1:872057/151‑1 (MQ=255) agCGCCAGGCGCAGCTTGGTGCCGACGCCGTCGGTGCCGGAGACCAGCACCGGCTGCTTGTAGCTGGCCGGGATCTCGCAGAGGGCGCCGAAGCCGCCCAGGCCACCCATGACTTCAGGGCGTGCGGTGCGTTTTGCCACGCCCTTGATGc < 2:5805375/151‑1 (MQ=255) gtgcCAGGCGCAGCTTGGGGCCGACGCCGTCGGTGCCGGAGACCAGCACCGGCTGCTTGTAGCTGGCCGGGATCTCGCAGAGGGCGCCGAAGCCGCCCAGGCCACCCATGACTTCAGGGCGTGCGGTGCGTTTTGCCACGCCCTTGATGCg < 2:4504337/149‑1 (MQ=255) gcCAGGCGCAGCTTGGTGCCGACGCCGTCGGTGCCGGAGACCAGCACCGGCTGCTTGTAGCTGGCCGGGATCTCGCAGAGGGCGCCGAAGCCGCCCAGGCCACCCATGACTTCAGGGCGTGCGGTGCGTTTTGCCACGCCCTTGATGCGtt < 2:5494794/151‑1 (MQ=255) cAGGCGCAGCTTGGTGCCGACGCCGTCGGTGCCGGAGACCAGCACCGGCTGGGTGTAGCTGGCCGGGATCTCGCAGAGGGCGCCGAAGCCGCCCAGGCCACCCATGACGTCAGGGCGTGCGGTGCGATTTGCCACGCCCTTGATGCGTTCg > 2:5255636/1‑151 (MQ=255) cAGGCGCAGCTTGGTGCCGACGCCGTCGGTGCCGGAGACCAGCACCGGCTGCTTGTAGCTGGCCGGGATCTCGCAGAGGGCGCCGAAGCCGCCCAGGCCACCCATGACTTCAGGGCGTGCGGTGCGTTTTGCCACGCCCTTGATGCGTTCg < 1:2110865/151‑1 (MQ=255) aGGCGCAGCTTGGTGCCGACGCCGTCGGTGCCGGAGACCAGCACCGGCTGCTTGTAGCTGGCCGGGATCTCGCAGAGGGCGCCGAAGCCGCCCAGGCCACCCATGACTTCAGGGCGTGCGGTGCGTTTTGCCACGCCCTTGATGCGTTCgc > 2:5755119/1‑150 (MQ=255) gtggaggttGGTGCCGACGCCGTCGGTGCCGGAGGTCAGCAGTGGCTGCTTGTAGCGGGCCGGGATCTCGGAGAGGGCGCCGAAGCCGCCCAGGCCGCCCATGACTTCAGGGCGTGCGGTGCGTTTGGCCACGCCCTTGATGCGTTCGAcc < 2:3528912/144‑1 (MQ=255) gcAGCTTGGTGCCGACGCCGTCGGTGCCGGAGACCAGCACCGGCTGCTTGTAGCTGGCCGGGATCTCGCAGAGGGCGCCGAAGCCGCCCAGGCCACCCATGACTTCAGGGCGTGCGGTGCGTTTTGCCACGCCCTTGATGCGTTCGACCAg > 2:4720247/1‑151 (MQ=255) gCTTGGTGCCGACGCCGTCGGTGCCGGAGACCAGCACCGGCTGCTTGTAGCTGGCCGGGATCTCGCAGAGGGCGCCGAAGCCGCCCAGGCCACCCATGACTTCAGGGCGTGCGGTGCGTTTTGCCACGCCCTTGATGCGTTCGACCAGTGc > 1:1639550/1‑151 (MQ=255) ttGGTGCCGACGCCGTCGGTGCCGGAGACCAGCACCGGCTGCTTGTAGCTGGCCGGGATCTCGCAGAGGGCGCCGAAGCCGCCCAGGCCACCCATGACTTCAGGGCGTGCGGTGCGTTTTGCCACGCCCTTGATGCGTTCGACCAGTGCtt < 2:511751/151‑1 (MQ=255) ggTGCCGACGCCGTCGGTGCCGGAGACCAGCACCGGCTGCTTGTAGCTGGCCGGGATCTCGCAGAGGGCGCCGAAGCCGCCCAGGCCACCCATGACTTCAGGGCGTGCGGTGCGTTTTGCCACGCCCTTGATGCGTTCGACCAGTGCTTCg < 2:2672294/151‑1 (MQ=255) cGACGCTGTCGGTGCCGGAGACCAGCACCGGCTGCTTGTAGCTGGCCGGGATCTCGCAGAGGGCGCCGAAGCCGCCCAGGCCACCCATGACTTCAGGGCGTGCGGTGCGTTTTGCCACGCCCTTGATGCGTTCGACCAGTGCTTCGCCGGc < 2:2244241/151‑1 (MQ=255) cGCCGTCGGTGCCGGAGACCAGCACCGGCTGCTTGTAGCTGGCCGGGATCTCGCAGAGGGCGCCGAAGCCGCCCAGGCCACCCATGACTTCAGGGCGTGCGGTGCGTTTTGCCACGCCCTTGATGCGTTCGACCAGTGCTTCGCCGGCGTc > 2:4000685/1‑151 (MQ=255) gCCGTCGGTGCCGGAGACCAGCACCGGCTGCTTGTAGCTGGCCGGGATCTCGCAGAGGGCGCCGAAGCCGCCCAGGCCACCCATGACTTCAGGGCGTGCGGTGCGTTTTGCCACGCCCTTGATGCGTTCGACCAGTGCTTCGCCGGCGTCg > 1:1042665/1‑151 (MQ=255) ccGTCGGTGCCGGAGACCAGCACCGGCTGCTTGTAGCTGGCCGGGATCTCGCAGAGGGCGCCGAAGCCGCCCAGGCCACCCATGACTTCAGGGCGTGCGGTGCGTTTTGCCACGCCCTTGATGCGTTCGACCAGTGCTTCGCCGGCGTCGa > 2:1362353/1‑151 (MQ=255) tCGGTGCCGGAGACCAGCACCGGCTGCTTGTAGCTGGCCGGGATCTCGCAGAGGGCGCCGAAGCCGCCCAGGCCACCCATGACTTCAGGGCGTGCGGTGCCTTTTGCCACGCCCTTGATGCGTTCGACCAGTGCTTCGCCGGCGTCGATGt > 2:6281308/1‑151 (MQ=255) cGGTGCCGGAGACCAGCACCGGCTGCTTGTAGCTGGCCGGGATCTCGCAGAGGGCGCCGAAGCCGCCCAGGCCACCCATGACTTCAGGGCGTGCGGTGCGTTTTGCCACGCCCTTGATGCGTTCGACCAGTGCTTCGCCGGCGTCGATGTc < 1:30911/151‑1 (MQ=255) ggTGCCGGAGACCAGCACCGGCTGCTTGTAGCTGGCCGGGATCTCGCAGAGGGCGCCGAAGCCGCCCAGGCCACCCATGACTTCAGGGCGTGCGGTGCGTTTTGCCACGCCCTTGATGCGTTCGACCAGTGCTTCGCCGGCGTCGATGTCt < 1:2437281/151‑1 (MQ=255) ggTGCCGGAGACCAGCACCGGCTGCTTGTAGCTGGCCGGGATCTCGCAGAGGGCGCCGAAGCCGCCCAGGCCACCCATGACTTCAGGGCGTGCGGTGCGTTTTGCCACGCCCTTGATGCGTTCGACCAGTGCTTCGCCGGCGTCGATGTCt > 2:5900543/1‑151 (MQ=255) gTGCCGGAGACCAGCACCGGCTGCTTGTAGCTGGCCGGGATCTCGCAGAGGGCGCCGAAGCCGCCCAGGCCACCCATGACTTCAGGGCGTGCGGTGCGTTTTGCCACGCCCTTGATGCGTTCGACCAGTGCTTCGCCGGCGTCGATGTCtc > 2:5196917/1‑150 (MQ=255) gTGCCGGAGACCAGCACCGGCTGCTTGTAGCTGGCCGGGATCTCGCAGAGGGCGCCGAAGCCGCCCAGGCCACCCATGACTTCAGGGCGTGCGGTGCGTTTTGCCACGCCCTTGATGCGTTCGACCAGTGCTTCGCCGGCGTCGATGTCTa < 2:2604130/151‑1 (MQ=255) gTGCCGGAGACCAGCACCGGCTGCTTGTAGCTGGCCGGGATCTCGCAGAGGGCGCCGAAGCCGCCCAGGCCACCCATGACTTCAGGGCGTGCGGTGCGTTTTGCCACGCCCTTGATGCGTTCGACCAGTGCTTCGCCGGCGTCGATGTCTa > 1:2843601/1‑151 (MQ=255) gCCGGAGACCAGCACCGGCTGCTTGTAGCTGGCCGGGATCTCGCAGAGGGCGCCGAAGCCGCCCAGGCCACCCATGACTTCAGGGCGTGCGGTGCGTTTTGCCACGCCCTTGATGCGTTCGACCAGTGCTTCGCCGGCGTCGATGTCTaca < 2:2067802/151‑1 (MQ=255) gCCGGAGACCAGCACCGGCTGCTTGTAGCTGGCCGGGATCTCGCAGAGGGCGCCGAAGCCGCCCAGGCCACCCATGACTTCAGGGCGTGCGGTGCGTTTTGCCACGCCCTTGATGCGTTCGACCAGTGCTTCGCCGGCGTCGATGTCTaca > 1:3834415/1‑151 (MQ=255) ccGGAGACCAGCACCGGCTGCTTGTAGCTGGCCGGGATCTCGCAGAGGGCGCCGAAGCCGCCCAGGCCACCCATGACTTCAGGGCGTGCGGTGCGTTTTGCCACGCCCTTGATGCGTTCGACCAGTGCTTCGCCGGCGTCGATGTCTacac < 1:4933279/151‑1 (MQ=255) ccGGAGACCAGCACCGGCTGCTTGTAGCTGGCCGGGATCTCGCAGAGGGCGCCGAAGCCGCCCAGGCCACCCATGACTTCAGGGCGTGCGGTGCGTTTTGCCACGCCCTTGACGCGTTCGTCCAGTGCTTCGCCGGCGTCGAGGTCTactc > 2:506322/1‑149 (MQ=255) cGGAGACGAGCCCCGGCGTGTTGTAGCTGGCCGGGATCGCGCGGAGGGCGCCGAAGCCGCGCGGGTGACCGATGACTTCAGGGCGTGCGGTGCGTTTTGCCACGGCCTTGATGCGTTCGACCAGTGCTTCGCCGGCGTCGATGTCTACAcc < 2:4227342/151‑1 (MQ=255) ggAGACCAGCACCGGCTGCTTGTAGCTGGCCGGGATCTCGCAGAGGGCGCCGAAGCCGCCCAGGCCACCCATGACTTCAGGGCGTGCGGTGCGTTTTGCCACGCCCTTGATGCGTTCGACCAGTGCTTCGCCGGCGTCGATGTCTACACCg < 1:1003717/151‑1 (MQ=255) ggAGACCAGCACCGGCTGCTTGTAGCTGGCCGGGATCTCGCAGAGGGCGCCGAAGCCGCCCAGGCCACCCATGACTTCAGGGCGTGCGGTGCGTTTTGCCACGCCCTTGATGCGTTCGACCAGTGCTTCGCCGGCGTCGATGTCTACACCg > 2:3746206/1‑151 (MQ=255) ggAGACCAGCACCGGCTGCTTGTAGCTGGCCGGGATCTCGCAGAGGGCGCCGAAGCCGCCCAGGCCACCCATGACTTCAGGGCGTGCGGTGCGTTTTGCCACGCCCTTGATGCGTTCGACCAGTGCTTCGCCGGCGTCGATGTCTACACCg > 1:4629145/1‑151 (MQ=255) ggAGACCAGCACCGGCTGCTTGTAGCTGGCCGGGATCTCGCAGAGGGCGCCGAAGCCGCCCAGGCCACCCATGACTTCAGGGCGTGCGGTGCGTTTTGCCACGCCCTTGATGCGTTCGACCAGTGCTTCGCCGGCGTCGATGTCTACACCg > 1:25126/1‑151 (MQ=255) ggAGACCAGCACCGGCTGCTTGTAGCTGGCCGGGATCTCGCAGAGGGCGCCGAAGCCGCCCAGGCCACCCATGACTTCAGGGCGGGCGGTGCGTTTTGCCACGCCCTTGATGCGTTCGACCAGTGCTTCGCCGGCGTCGCTGTCGACACCg > 1:4899042/1‑151 (MQ=255) aCCAGCACCGGCTGCTTGTAGCTGGCCGGGATCTCGCAGAGGGCGCCGAAGCCGCCCAGGCCACCCATGACTTCAGGGCGTGCGGTGCGTTTTGCCACGCCCTTGATGCGTTCGACCAGTGCTTCGCCGGCGTCGATGTCTACACCGGCGt > 1:2285340/1‑151 (MQ=255) ccAGCACCGGCTGCTTGTAGCTGGCCGGGATCTCGCAGAGGGCGCCGAAGCCGCCCAGGCCACCCATGACTTCAGGGCGTGCGGTGCGTTTTGCCACGCCCTTGATGCGTTCGACCAGTGCTTCGCCGGCGTCGATGTCTACACCGGCGTc < 2:4155348/151‑1 (MQ=255) ccAGCACCGGCTGCTTGTAGCTGGCCGGGATCTCGCAGAGGGCGCCGAAGCCGCCCAGGCCACCCATGACTTCAGGGCGTGCGGTGCGTTTTGCCACGCCCTTGACGCGTTCGACCAGTGCTTCGCCGGCGTCGATGTCTACACCGGCGTc > 2:4632432/1‑151 (MQ=255) cACCGGCTGCTTGTAGCTGGCCGGGATCTCGCAGAGGGCGCCGAAGCCGCCCAGGCCACCCATGACTTCAGGGCGTGCGGTGCGTTTTGCCACGCCCTTGATGCGTTCGACCAGTGCTTCGCCGGCGTCGATGTCTACACCGGCGTCCTTg > 2:5721857/1‑151 (MQ=255) aCCGGCTGCTTGTAGCTGGCCGGGATCTCGCAGAGGGCGCCGAAGCCGCCCAGGCCACCCATGACTTCAGGGCGTGCGGTGCGTTTTGCCACGCCCTTGATGCGTTCGACCAGTGCTCCGCCGGCGTCGATGTCTACACCGGCGTCCTTGt < 2:4427079/151‑1 (MQ=255) ggCTGCTTGTAGATGGCCGGGATCTCGCAGAGGGCGCCGAAGCCGCCCAGGCCACCCATGACGTCAGGGCGTGCGGTGCGTTTTGCCACGCCCTTGATGCGTTCGACCAGTGCTTCGCCGGCGTCGATGTCTACACCGGCGTCCTTGTAGc < 1:5671962/151‑1 (MQ=255) ggCTGCTGGTAGCTGGCCGGGATCTCGCAGAGGGCGCCGAAGCCGCCCAGGCCACCCATGACTTCAGGGCGTGCGGTGCGTTTTGCCACGCCCTTGATGCGTTCGACCAGTGCTTCGCCGGCGTCGATGTCTACACCGGCGTCCTTGTAGc < 2:147932/151‑1 (MQ=255) ctTGTAGCTGGGCGGGATCTCGCAGAGGGCGCCGAAGCCGCCCAGGCCACCCATGACTTCAGGGCGTGCGGTGCGTTTTGCAACGCCCTTGATGCGTTCGACCAGTGCTTCGCCGGCGTCGATGTCTACACCGGCGTCCTTGTAGCTCagg < 2:1543948/151‑1 (MQ=255) ctTGTAGCTGGCCGGGATCTCGCAGAGGGCGCCGAAGCCGCCCAGGCCACCCATGACTTCAGGGCGTGCGGTGCGTTTTGCCACGCCCTTGATGCGTTCGACCAGTGCTTCGCCGGCGTCGATGTCTACACCGGCGTCCTTGTAGCTCagg > 2:1257349/1‑151 (MQ=255) ctTGTAGCTGGCCGGGATCTCGCAGAGGGCGCCGAAGCCGCCCAGGCCACCCATGACTTCAGGGCGTGCGGTGCGTTTTGCCACGCCCTTGATGCGTTCGACCAGTGCTTCGCCGGCGTCGATGTCTACACCGGCGTCCTTGTAGCTCagg < 1:295084/151‑1 (MQ=255) tGTAGCTGGCCGGGATCTCGCAGAGGGCGCCGAAGCCGCCCAGGCCACCCATGACTTCAGGGCGTGCGGTGCGTTTTGCCACGCCCTTGATGCGTTCGACCAGTGCTTCGCCGGCGTCGATGTCTACACCGGCGTCCTTGTAGCTCaggga < 1:6257020/151‑1 (MQ=255) tGTAGCTGGCCGGGATCTCGCAGAGGGCGCCGAAGCCGCCCAGGCCACCCATGACTTCAGGGCGTGCGGTGCGTTTTGCCACGCCCTTGATGCGTTCGACCAGTGCTTCGCCGGCGTCGATGTCTACACCGGCGTCCTTGTAGCTCaggga < 1:3265707/151‑1 (MQ=255) tGTAGCTGGCCGGGATCTCGCAGAGGGCGCCGAAGCCGCCCAGGCCACCCATGACTTCAGGGCGTGCGGTGCGTTTTGCCACGCCCTTGATGCGTTCGACCAGTGCTTCGCCGGCGTCGATGTCTACACCGGCGTCCTTGTAGCTCaggga < 2:1826314/151‑1 (MQ=255) tAGCTGGCCGGGATCTCGCAGAGGGCGCCGAAGCCGCCCAGGCCACCCATGACTTCAGGGCGTGCGGTGCGTTTTGCCACGCCCTTGATGCGTTCGACCAGTGCTTCGCCGGCGTCGATGTCTACACCGGCGTCCTTGTAGCTCagggagg < 1:2983070/151‑1 (MQ=255) | AGCGGCTCGGCGCCGCACACGACCAGGTCGTTGACGCACATGGCGACCAGGTCCTGGCCGATGCTGTCGTGCTTGTTCAGGTTCAGCGCCAGGCGCAGCTTGGTGCCGACGCCGTCGGTGCCGGAGACCAGCACCGGCTGCTTGTAGCCGGCCGGGATCTCGCAGAGGGCGCCGAAGCCGCCCAGGCCACCCATGACTTCAGGGCGTGCGGTGCGTTTTGCCACGCCCTTGATGCGTTCGACCAGTGCTTCGCCGGCGTCGATGTCTACACCGGCGTCCTTGTAGCTCAGGGAGGG > CP009974/3530433‑3530728 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |