| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP009974 | 3,614,972 | A→G | T438A (ACC→GCC) | RPPX_16160 → | pilus assembly protein PapC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009974 | 3,614,972 | 0 | A | G | 99.7% | 1086.3 / NA | 304 | T438A (ACC→GCC) | RPPX_16160 | pilus assembly protein PapC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/1); new base G (143/158); total (144/160) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 319 total aligned reads displayed.
GGTGCTGGGGTTGTCAGTGCAACAGGTCGATGCTGACCTGCAGTTGGGTACCTCGCTGGACTGGGACGTGCATGAACGGTTCAAGCTTTACGCCAGCCTCAATCAGACCCAGGGCCTGGGCAACGGCGGCGATCTGCAGTTGACCTATACCCACCCTTGGGGCTCGTTGTTGCTGAGCCACAACCAGACCTGGCTGGAGCCTGGCAGTAGCGGTCGCGACGATACTTCACAGCGCCAGGTGCGCAGCCGTACCGCCTTTTCGATCAACCAGCGGGTAACCTCGCGCAGTTCAGCGA > CP009974/3614824‑3615119 | tGCTGGGGTTGTCAGTGCAACAGGTCGATGCTGACCTGCAGTTGGGTACCTCGCTGGACTGGGACGTGCATGAACGGTTCAAGCTTTACGCCAGCCTCAATCAGACCCAGGGCCTGGGCAACGGCGGCGATCTGCAGTTGACCTATgccca < 1:6023687/151‑1 (MQ=255) gggTTGTCAGTGCAACAGGTCGATGCTGACCTGCAGTTGGGTACCTCGCTGGACTGGGACGTGCATGAACGGTTCAAGCTTTACGCCAGCCTCAATCAGACCCAGGGCCTGGGCAACGGCGGCGATCTGCAGTTGACCTATGCCCACCCtt > 1:5868295/1‑151 (MQ=255) ggTTGTCAGTGCAACAGGTCGATGCTGACCTGCAGTTGGGTACCTCGCTGGACTGGGACGTGCATGAACGGTTCAAGCTTTACGCCAGCCTCAATCAGACCCAGGGCCTGGGCAACGGCGGCGATCTGCAGTTGACCTATGCCCACCCTTg > 1:6452406/1‑151 (MQ=255) ggTTGCCAGTGCAACAGGTCGATGCTGACCTGCAGTTGGGTACCTCGCTGGACTGAGACGTGCATGAACGGTTCAAGCTTTACGCCAGCCTCAAGCAGACCCAGGGCCTGGGCAACGGCGGCGATCTGCAGTTGACCTATGCCCACCCTTg < 1:6195680/151‑1 (MQ=255) tGTCAGTGCAACAGGTCGATGCTGACCTGCAGTTGGGTACCTCGCTGGACTGGGACGTGCATGAACGGTTCAAGCTTTACGCCAGCCTCAATCAGACCCAGGGCCTGGGCAACGGCGGCGATCTGCAGTTGACCTATGCCCACCCTTgggg < 1:3344158/151‑1 (MQ=255) gTCAGTGCAACAGGTCGATGCTGACCTGCAGTTGGGTACCTCGCTGGACTGGGACGTGCATGAACGGTTCAAGCTTTACGCCAGCCTCAATCAGACCCAGGGCCTGGGCAACGGCGGCGATCTGCAGTTGACCTATGCCCACCCTTGGGGc < 1:4897842/151‑1 (MQ=255) gTGCAACAGGTCGATGCTGACCTGCAGTTGGGTACCTCGCTGGACTGGGACGTGCATGAACGGTTCAAGCTTTACGCCAGCCTCAATCAGACCCAGGGCCTGGGCAACGGCGGCGATCTGCAGTTGACCTATGCCCACCCTTGGGGCTCgt < 1:5357469/151‑1 (MQ=255) gCAACAGGTCGATGCTGACCTGCAGTTGGGTACCTCGCTGGACTGGGACGTGCATGAACGGTTCAAGCTTTACGCCAGCCTCAATCAGACCCAGGGCCTGGGCAACGGCGGCGATCTGCAGTTGACCTATGCCCACCCTTGGGGCTCgttg < 1:1848577/151‑1 (MQ=255) cAACAGGTCGATGCTGACCTGCAGTTGGGTACCTCGCTGGACTGGGACGTGCATGAACGGTTCAAGCTTTACGCCAGCCTCAATCAGACCCAGGGCCTGGGCAACGGCGGCGATCTGCAGTTGACCTATGCCCACCCTTGGGGCTCgttgt < 1:1132153/151‑1 (MQ=255) aCAGGTCGATGCTGACCTGCAGTTGGGTACCTCGCTGGACTGGGACGTGCATGAACGGTTCAAGCTTTACGCCAGCCTCAATCAGACCCAGGGCCTGGGCAACGGCGGCGATCTGCAGTTGACCTATGCCCTCCCTTGGGGCTCGttgttg > 2:3024945/1‑151 (MQ=255) cAGGTCGATGCTGACCTGCAGTTGGGTACCTCGCTGGACTGGGACGTGCATGAACGGTTCAAGCTTTACGCCAGCCTCAATCAGACCCAGGGCCTGGGCAACGGCGGCGATCTGCAGTTGACCTATGCCCACCCTTGGGGCTCGTTGTTGc < 2:451206/151‑1 (MQ=255) aGGTCGATGCTGACCTGCAGTTGGGTACCTCGCTGGACTGGGACGTGCATGAACGGTTCAAGCTTTACGCCAGCCTCAATCAGACCCAGGGCCTGGGCAACGGCGGCGATCTGCAGTTGACCTATGCCCACCCCTCGGCCTCCTTGTTGcc > 2:3618196/1‑150 (MQ=255) ggTCGATGCTGACCTGCAGTTGGGTACCTCGCTGGACTGGGACGTGCATGAACGGTTCAAGCTTTACGCCAGCCTCAATCAGACCCAGGGCCTGGGCAACGGCGGCGATCTGCAGTTGACCTATGCCCACCCTTGGGGCTCGTTGTTGCTg > 2:2569909/1‑151 (MQ=255) gATGCTGACCTGCAGTTGGGTACCTCGCTGGACTGGGACGTGCATGAACGGTTCAAGCTTTACGCCAGCCTCAATCAGACCCAGGGCCTGGGCAACGGCGGCGATCTGCAGTTGACCTATGCCCACCCTTGGGGCTCGTTGTTGCTGAGcc > 2:2371059/1‑151 (MQ=255) gATGCTGACCTGCAGTTGGGTACCTCGCTGGACTGGGACGTGCATGAACGGTTCAAGCTTTACGCCAGCCTCAATCAGACCCAGGGCCTGGGCAACGGCGGCGATCTGCAGTTGACCTATGCCCACCCTTGGCGCTCGTTGTTGCTGAGcc > 2:2022551/1‑151 (MQ=255) tGCTGACCTGCAGGTGGGTACCTCGCTGGACTGGGACGTGCATGAACGGTTCAAGCTTTACGCCAGCCTCAATCAGACCCAGGGCCTGGGCAACGGCGGCGATCTGCAGTTGACCTATGCCCACCCTTGGGGCTCGTTGTTGCTGAGCcac < 2:6345047/151‑1 (MQ=255) cTGACCTGCAGTTGGGTACCTCGCTGGACTGGGACGTGCATGAACGGTTCAAGCTTTACGCCAGCCTCAATCAGACCCAGGGCCTGGGCAACGGCGGCGATCTGCAGTTGACCTATGCCCACCCTTGGGGCTCGTTGTTGCTGAGCCACaa > 2:2951615/1‑151 (MQ=255) tGACCTGCAGTTGGGTACCTCGCTGGACTGGGACGTGCATGAACGGTTCAAGCTTTACGCCAGCCTCAATCAGACCCAGGGCCTGGGCAACGGCGGCGATCTGCAGTTGACCTATGCCCACCCTTGGGGCTCGTTGTTGCTGAGCCACAAc > 2:1930290/1‑151 (MQ=255) tGACCTGCAGTTGGGTACCTCGCTGGACTGGGACGTGCATGAACGGTTCAAGCTTTACGCCAGCCTCAATCAGACCCAGGGCCTGGGCAACGGCGGCGATCTGCAGTTGACCTATGCCCACCCTTGGGGCTCGTTGTTGCTGAGCCACAAc > 1:5191552/1‑151 (MQ=255) cccTGCAGTTGGGTGCCTGGCTGGGCTGGGACGGGCATGAACGGTTCAAGCTTTACGCCAGCCTTAATCAGACCCAGGGCCTGGGCAACGGCGGCGATCTGCAGTTGACCTATGCCCACCCTTGGGGCTCGTTGTTGCTGAGCCACAACCa < 2:6255075/150‑1 (MQ=255) ccTGCAGTTGGGTACCTCGCTGGACTGGGACGTGCATGAACGGTTCAAGCTTTACGCCAGCCTCAATCAGACCCAGGGCCTGGGCAACGGCGGCGATCTGCAGTTGACCTATGCCCACCCTTGGGGCTCGTTGTTGCTGAGCCACAACCAg < 2:2740281/151‑1 (MQ=255) cAGTTGGGTACCTCGCTGGACTGGGACGTGCATGAACGGTTCAAGCTTTACGCCAGCCTCAATCAGACCCAGGGCCTGGGCAACGGCGGCGATCTGCAGTTGACCTATGCCCACCCTTGGGGCTCGTTGTTGCTGAGCCACAACCAGACct > 1:1030987/1‑151 (MQ=255) gTTGGGTACCTCGCTGGACTGGGACGTGCATGAACGGTTCAAGCTTTACGCCAGCCTCAATCAGACCCAGGGCCTGGGCAACGGCGGCGATCTGCAGTTGACCTATGCCCACCCTTGGGGCTCGTTGTTGCTGAGCCACAACCAGACctgg > 1:107596/1‑151 (MQ=255) tGGGTACCTCGCTGGACTGGGACGTGCATGAACGGTTCAAGCTTTACGCCAGCCTCAATCAGACCCAGGGCCTGGGCAACGGCGGCGATCTGCAGTTGACCTATGCCCACCCTTGGGGCTCGTTGTTGCTGAGCCACAACCAGACctggct < 1:892259/151‑1 (MQ=255) cTCGCTGGACTGGGACGTGCATGAACGGTTCAAGCTTTACGCCAGCCTCAATCAGACCCAGGGCCTGGGCAACGGCGGCGATCTGCAGTTGACCTATGCCCACCCTTGGGGCTCGTTGTTGCTGAGCCACAACCAGACCTGGCTGGAGCCt > 1:5765010/1‑151 (MQ=255) cTCGCTGGACTGGGACGTGCATGAACGGTTCAAGCTTTACGCCAGCCTCAATCAGACCCAGGCCCTGGGCAACGGCGGCGATCCGCAGTTGACCTACCCCCACCCCTCGGGCCCGTTGTTGCTAACCCCCACCCCTACctggccggccccc > 2:6528273/1‑146 (MQ=255) tCGCTGGACTGGGACGTGCATGGACGGTTCAAGCTTTACGCCAGCCTCAATCAGACCCAGGGCCTGGGCAACGGCGGCGATCTGCAGTTGACCTATGCCCACCCTTGGGGCTCGTTGTTGCTGAGCCACAACCAGACCTGGCTGGAGCCTg < 2:3190462/151‑1 (MQ=255) tCGCTGGACTGGGACGTGCATGAACGGTTCAAGCTTTACGCCAGCCTCAATCAGACCCAGGGCCTGGGCAACGGCGGCGATCTGCAGTTGACCTATGCCCACCCTTGGGGCTCGTTGTTGCTGAGCCACAACCAGACCTGGCTGGAGCCTg > 2:1138880/1‑151 (MQ=255) gCTGGACTGGGACGTGCATGAACGGTTCAAGCTTTACGCCAGCCTCAATCAGACCCAGGGCCTGGGCAACGGCGGCGATCTGCAGTTGACCTATGCCCACCCTTGGGGCTCGTTGTTGCTGCGCCACCACCAGACCTGCCTGGCGCCTgac > 2:3666048/1‑149 (MQ=255) gCTGGACTGGGACGTGCATGAACGGTTCAAGCTTTACGCCAGCCTCAATCAGACCCAGGGCCTGGGCAACGGCGGCGATCTGCAGTTGACCTATGCCCACCCTTGGGGCTCGTTGTTGCTGAGCCACAACCAGACCTGGCTGGAGCCTGGc < 2:4397456/151‑1 (MQ=255) tGGACTGGGACGTGCATGAACGGTTCAAGCTTTACGCCAGCCTCAATCAGACCCAGGGCCTGGGCAACGGCGGCGATCTGCAGTTGACCTATGCCCACCCTTGGGGCTCGTTGTTGCTGAGCCACAACCAGACCTGGCTGGAGCCTGGCAg < 2:2208417/151‑1 (MQ=255) ggACTGGGACGTGCATGAACGGTTCAAGCTTTACGCCAGCCTCAATCAGACCCAGGGCCTGGGCAACGGCGGCGATCTGCAGTTGACCTATGCCCACCCTTGGGGCTCGTTGTTGCTGAGCCACAACCAGACCTGGCTGGAGCCTGGCAGt < 2:5928153/151‑1 (MQ=255) ggACTGGGACGTGCATGAACGGTTCAAGCTTTACGCCAGCCTCAATCAGACCCAGGGCCTGGGCAACGGCGGCGATCTGCAGTTGACCTATGCCCACCCTTGGGGCTCGTTGTTGCTGAGCCACAACCAGACCTGGCTGGAGCCTGGCAGt > 1:5473640/1‑151 (MQ=255) ggACTGGGACGTGCATGAACGGTTCAAGCTTTACGCCAGCCTCAATCAGACCCAGGGCCTGGGCAACGGCGGCGATCTGCAGTTGACCTATGCCCACCCTTGGGGCTCGTTGTTGCTGAGCCACAACCAGACCTGGCTGGAGCCTGGCAGt > 2:5326778/1‑151 (MQ=255) aCTGGGACGTGCATGAACGGTTCAAGCTTTACGCCAGCCTCAATCAGACCCAGGGCCTGGGCAACGGCGGCGATCTGCAGTTGACCTATGCCCACCCTTGGGGCTCGTTGTTGCTGAGCCACAACCAGACCTGGCTGGAGCCTGGCAGTAg > 2:1547608/1‑151 (MQ=255) cTGGGACGTGCATGAACGGTTCAAGCTTTACGCCAGCCTCAATCAGACCCAGGGCCTGGGCAACGGCGGCGATCTGCAGTTGACCTATGCCCACCCTTGGGGCTCGTTGTTGCTGAGCCACAACCAGACCTGGCTGGAGCCTGGCAGTAGc > 1:2006848/1‑151 (MQ=255) tGGGACGTGCATGAACGGTTCAAGCTTTACGCCAGCCTCAATCAGACCCAGGGCCTGGGCAACGGCGGCGATCTGCAGTTGACCTATGCCCACCCTTGGGGCTCGTTGTTGCTGAGCCACAACCAGACCTGGCTGGAGCCTGGCAGTAGCg > 1:4750640/1‑151 (MQ=255) tGGGACGTGCATGAACGGTTCAAGCTTTACGCCAGCCTCAATCAGACCCAGGGCCTGGGCAACGGCGGCGATCTGCAGTTGACCTATGCCCACCCTTGGGGCTCGTTGTTGCTGAGCCACAACCAGACCTGGCTGGAGCCTGGCAGTAGCg < 1:2427460/151‑1 (MQ=255) 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gAACGGTTCAAGCTTTACGCCAGCCTCAATCAGACCCAGGGCCTGGGCAACGGCGGCGATCTGCAGTTGACCTATGCCCACCCTTGGGGCTCGTTGTTGCTGAGCCACAACCAGACCTGGCTGGAGCCTGGCAGTAGCGGTCGCGACGATa < 2:4463715/151‑1 (MQ=255) aaCGGTTCAAGCTTTACGCCAGCCTCAATCAGACCCAGGGCCTGGGCAACGGCGGCGATCTGCAGTTGACCTATGCCCACCCTTGGGGCTCGTTGTTGCTGAGCCACAACCAGACCTGGCTGGAGCCTGGCAGTAGCGGTCGCGACGATAc > 1:258109/1‑151 (MQ=255) cGGTTCAAGCTTTACTCCAGCCTCAATCAGACCCAGGGCCTGGGCAACGGCGGCGATCTGCAGTTGACCTATGCCCACCCTTGTGGCTCGTTGTTGCTTAGCCACAACCAGACCTGGCTGCAGCCTGGCACTAGCGATCCCGCCTATACtt > 2:3351351/1‑151 (MQ=255) gTTCAAGCTTTACGCCAGCCTCAATCAGACCCAGGGCCTGGGCAACGGCGGCGATCTGCAGTTGACCTATGCCCACCCTTGGGGCTCGTTGTTGCTGAGCCACAACCAGACCTGGCTGGAGCCTGGCAGTAGCGGTCGCGACGATACTTca < 1:5377000/151‑1 (MQ=255) ttCAAGCTTTACGCCAGCCTCAATCAGACCCAGGGCCTGGGCAACGGCGGCGATCTGCAGTTGACCTATGCCCACCCTTGGGGCTCGTTGTTGCTGAGCCACAACCAGACCTGGCTGGAGCCTGGCAGTAGCGGTCGCGACGATACTTcac > 1:5921764/1‑151 (MQ=255) tccaGCTTTACGCCAGCCTCAATCAGACCCAGGGCCTGGGCAACGGCGGCGATCTGCAGTTGACCTATGCCCACCCTTGGGGCTCGTTGTTGCTGAGCCACAACCAGACCTGGCTGCAGCCTGGCAGTTGGGGTGCCGACGATACTTctca > 2:263178/4‑151 (MQ=255) cAAGCTTTACGCCAGCCTCAATCAGACCCAGGGCCTGGGCAACGGCGGCGATCTGCAGTTGACCTATGCCCACCCTTGGGGCTCGTTGTTGCTGAGCCACAACCAGACCTGGCTGGAGCCTGGCAGTAGCGGTCGCGACGATACTTCACAg < 1:6096646/151‑1 (MQ=255) cTTTACGCCAGCCTCAATCAGACCCAGGGCCTGGGCAACGGCGGCGATCTGCAGTTGACCTATGCCCACCCTTGGGGCTCGTTGTTGCTGAGCCACAACCAGACCTGGCTGGAGCCTGGCAGTAGCGGTCGCGACGATACTTCACAGCGcc < 2:1367849/151‑1 (MQ=255) ttACGCCAGCCTCAATCAGACCCAGGGCCTGGGCAACGGCGGCGATCTGCAGTTGACCTATGCCCACCCTTGGGGCTCGTTGTTGCTGAGCCACAACCAGACCTGGCTGGAGCCTGGCAGTAGCGGTCGCGACGATACTTCACAGCGCCAg < 2:5160546/151‑1 (MQ=255) ttACGCCAGCCTCAATCAGACCCAGGGCCTGGGCAACGGCGGCGATCTGCAGTTGACCTATGCCCACCCTTGGGGCTCGTTGTTGCTGAGCCACAACCAGACCTGGCTGGAGCCTGGCAGTAGCGGTCGCGACGATACTTCACAGCGCCAg > 2:1292871/1‑151 (MQ=255) 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aGACCCAGGGCCTGGGCAACGGCGGCGATCTGCAGTTGACCTATGCCCACCCTTGGGGCTCGTTGTTGCTGAGCCACAACCAGACCTGGCTGGAGCCTGGCAGTAGCGGTCGCGACGATACTTCACAGCGCCAGGTGCGCAGCCGTACCGc < 1:6143487/151‑1 (MQ=255) gccccAGGGCCTGGGCAACGGCGGCGATCTGCAGTTGACCTATGCCCACCCTTGGGGCTCGTTGTTGCTGAGCCACAACCAGACCTGGCTGGAGCCTGGCAGTAGCGGTCGCGACGATACTTCACAGCGCCAGGTGCGCAGCCGTACCGcc < 1:5909059/149‑1 (MQ=255) cccAGGGCCTGGGCAACGGCGGCGATCTGCAGTTGACCTATGCCCACCCTTGGGGCTCGTTGTTGCTGAGCCACAACCAGACCTGGCTGGAGCCTGGCAGTAGCGGTCGCGACGATACTTCACAGCGCCAGGTGCGCAGCCGTACCGCCtt > 1:2604589/1‑151 (MQ=255) ccAGGGCCTGGGCAACGGCGGCGATCTGCCGTTGACCTCTGCCCACCCTTGGGGCTCGTTGTTGCTGAGCCACACCCAGCCCTGGCTGGAGCCTGCCAGTAGCGGCCGCGACGATACTCCACCGCCCCCGGTGCGCCCCCGTCCCGCCctt > 2:3844828/1‑151 (MQ=255) ccAGGGCCTGGGCAACGGCGGCGATCTGCAGTTGACCTATGCCCACCCTTGGGGCCCGTTGTTGCTGAGCCACAACCAGACCTGGCGGGAGCCTGGCAGTAGCGGTCGCGACGATACCTCACGGCGCCAGGTGCGCAGCCCTACCGcccct > 2:6085746/1‑148 (MQ=255) aGGGCCTGGGCAACGGCGGCGATCTGCAGTTGACCTATGCCCACCCTTGGGGCTCGTTGTTGCTGAGCCACAACCAGACCTGGCTGGAGCCTGGCAGTAGCGGTCGCGACGATACTTCACAGCGCCAGGTGCGCAGCCGTACCGCCTTTTc > 1:4038485/1‑151 (MQ=255) ccTGGGCAACGGCGGCGATCTGCAGTTGACCTATGCCCACCCTTGGGGCTCGTTGTTGCTGAGCCACAACCAGACCTGGCTGGAGCCTGGCAGTAGCGGTCGCGACGATACTTCACAGCGCCAGGTGCGCAGCCGTACCGCCTTTTCGATc > 2:347718/1‑151 (MQ=255) tGGGCAACGGCGGCGATCTGCAGTTGACCTATGCCCACCCTTGGGGCTCGTTGTTGCTGAGCCACAACCAGACCTGGCTGGAGCCTGGCAGTAGCGGTCGCGACGATACTTCACAGCGCCAGGt > 1:3402281/1‑124 (MQ=255) gggCAAGGGCGGCGATCTGCAGTTGACCTATGCCCACCCTTGGGGCTCGTTGTTGCTGAGCCACAACCAGACCTGGCTGGAGCCTGGCAGTAGCGGTCGCGACGATACTTCACAGCGCCAGGCGCGCAGCCGTACCGCCTTTTCGATCAAc < 1:6536193/151‑1 (MQ=255) cAACGGCGGCGATCTGCAGTTGACCTATGCCCACCCTTGGGGCTCGTTGTTGCTGAGCCACAACCAGACCTGGCTGGAGCCTGGCAGTAGCGGTCGCGACGATACTTCACAGCGCCAGGTGCGCAGCCGTACCGCCTTTTCGATCAACCAg < 1:1675758/151‑1 (MQ=255) cAACGGCGGCGATCTGCAGTTGACCTATGCCCACCCTTGGGGCTCGTTGTTGCTGAGCCACAACCAGACCTGGCTGGAGCCTGGCAGTAGCGGTCGCGACGATACTTCACAGCGCCAGGTGCGCAGCCGTACCGCCTTTTCGATCAACCAg < 1:274283/151‑1 (MQ=255) ggcggcGATCTGCAGTTGACCTATGCCCACCCTTGGGGCTCGTTGTTGCTGAGCCACAACCAGACCTGGCTGGAGCCTGGCAGTAGCGGTCGCGACGATACTTCACAGCGCCAGGTGCGCAGCCGTACCGCCTTTTCGATCAACCAGCggg < 1:3549951/151‑1 (MQ=255) ggcggcGATCTGCAGTTGACCTATGCCCACCCTTGGGGCTCGTTGTTGCTGAGCCACAACCAGACCTGGCTGGAGCCTGGCAGTAGCGGTCGCGACGATACTTCACAGCGCCAGGTGCGCAGCCGTACCGCCTTTTCGATCAACCAGCggg > 2:3123169/1‑151 (MQ=255) cggcgATCTGCAGTTGACCTATGCCCACCCTTGGGGCTCGTTGTTGCTGAGCCACAACCAGACCTGGCTGGAGCCTGGCAGTAGCGGTCGCGACGATACTTCACAGCGCCAGGTGCGCAGCCGTACCGCCTTTTCGATCAACCAGCGGGTa < 2:2111744/151‑1 (MQ=255) cggcgATCTGCAGTTGACCTATGCCCACCCTTGGGGCTCGTTGTTGCTGAGCCACAACCAGACCTGGCTGGAGCCTGGCAGTAGCGGTCGCGACGATACTTCACAGCGCCAGGTGCGCAGCCGTACCGCCTTTTCGATCAACCAGCGGGTa > 2:4049208/1‑151 (MQ=255) ggcgATCTGCAGTTGACCTATGCCCACCCTTGGGGCTCGTTGTTGCTGAGCCACAACCAGACCTGGCTGGAGCCTGGCAGTAGCGGTCGCGACGATACTTCACAGCGCCAGGTGCGCAGCCGTACCGCCTTTTCGATCAACCAGCGGGTaa > 1:5543610/1‑151 (MQ=255) gcgATCTGCAGTTGACCTATGCCCACCCTTGGGGCTCGTTGTTGCTGAGCCACAACCAGACCTGGCTGGAGCCTGGCAGTAGCGGTCGCGACGATACTTCACGGCGCCAGGTGCGCAGCCGTACCGCCTTTTCGATCAACCAGCGGGTAAc < 1:6512501/151‑1 (MQ=255) gcgATCTGCAGTTGACCTATGCCCACCCTTGGGGCTCGTTGTTGCTGAGCCACAACCAGACCTGGCTGGAGCCTGGCAGTAGCGGTCGCGACGATACTTCACAGCGCCAGGTGCGCAGCCGTACCGCCTTTTCGATCAACCAGCGGGTAAc < 2:4213196/151‑1 (MQ=255) gcgATCTGCAGTTGACCTATGCCCACCCTTGGGGCTCGTTGTTGCTGAGCCACAACCAGACCTGGCTGGAGCCTGGCAGTAGCGGTCGCGACGATACTTCACAGCGCCAGGTGCGCAGCCGTACCGCCTTTTCGATCAACCAGCGGGTAAc > 1:3075435/1‑151 (MQ=255) gcgATCTGAAGTTGACCTATGCCCACCCTTGGGGCTCGTTGTTGCTGAGCCAGAAACAGACCTGGCTGGAGCCTGGCAGTAGCGGTCGCGACGTTACTTAACAGCGCCAGGTGCGCAGCCGTACCGCCTTTTCGATCAACCAGCGGGTAAc < 1:1361793/151‑1 (MQ=255) gATCTGCAGTTGACCTATGCCCACCCTTGGGGCTCGTTGTTGCTGAGCCACAACCAGACCTGGCTGGAGCCTGGCAGTAGCGGTCGCGACGATACTTCACAGCGCCAGGTGCGCAGCCGTACCGCCTTTTCGATCAACCAGCGGGTAACCt < 1:2371059/151‑1 (MQ=255) aTCTGCAGTTGACCTATGCCCACCCTTGGGGCTCGTTGTTGCTGAGCCACAACCAGACCTGGCTGGAGCCTGGCAGTAGCGGTCGCGACGATACTTCACAGCGCCAGGTGCGCAGCCGTACCGCCTTTTCGATCAACCAGCGGGTAACCTc > 1:5975426/1‑151 (MQ=255) tCTGCAGTTGACCTATGCCCACCCTTGGGGCTCGTTGTTGCTGAGCCACAACCAGACCTGGCTGGAGCCTGGCAGTAGCGGTCGCGACGATACTTCACAGCGCCAGGTGCGCAGCCGTACCGCCTTTTCGATCAACCAGCGGGTAACCTcc > 2:4959424/1‑150 (MQ=255) tGCAGTTGACCTATGCCCACCCTTGGGGCTCGTTGTTGCTGAGCCACAACCAGACCTGGCTGGAGCCTGGCAGTAGCGGTCGCGACGATACTTCACAGCGCCAGGTGCGCAGCCGTACCGCCTTTTCGATCAACCAGCGGGTAACCTcgcg < 2:5191552/151‑1 (MQ=255) tGCAGTTGACCTATGCCCACCCTTGGGGCTCGTTGTTGCTGAGCCACAACCAGACCTGGCTGGAGCCTGGCAGTAGCGGTCGCGACGATACTTCACAGCGCCAGGTGCGCAGCCGTACCGCCTTTTCGATCAACCAGCGGGTAACCTcgcg > 1:209524/1‑151 (MQ=255) gtggACCTATGCCCACCCTTGGGGCTCGTTGTTGCTGAGCCACAACCAGACCTGGCTGGAGCCTGGCAGTAGCGGTCGCGACGATACTTCACAGCGCCAGGTGCGCAGCCGTACCGCCTTTTCGATCAACCAGCGGGTAACCTCGCGCAGt < 1:6075819/148‑1 (MQ=255) ccTATGCCCACCCTTGGGGCTCGTTGTTGCTGAGCCACAACCAGACCTGGCTGGAGCCTGGCAGTAGCGGTCGCGACGATACTTCACAGCGCCAGGTGCGCAGCCGTACCGCCTTTTCGATCAACCAGCGGGTAACCTCGCGCAGTTCAGc > 2:1398848/1‑151 (MQ=255) | GGTGCTGGGGTTGTCAGTGCAACAGGTCGATGCTGACCTGCAGTTGGGTACCTCGCTGGACTGGGACGTGCATGAACGGTTCAAGCTTTACGCCAGCCTCAATCAGACCCAGGGCCTGGGCAACGGCGGCGATCTGCAGTTGACCTATACCCACCCTTGGGGCTCGTTGTTGCTGAGCCACAACCAGACCTGGCTGGAGCCTGGCAGTAGCGGTCGCGACGATACTTCACAGCGCCAGGTGCGCAGCCGTACCGCCTTTTCGATCAACCAGCGGGTAACCTCGCGCAGTTCAGCGA > CP009974/3614824‑3615119 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |