Predicted mutation | ||||||
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RA | CP009974 | 3,756,907 | G→C | L400V (CTC→GTC) | RPPX_16780 ← | phospho‑2‑dehydro‑3‑deoxyheptonate aldolase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP009974 | 3,756,907 | 0 | G | C | 99.2% | 952.9 / ‑2.3 | 262 | L400V (CTC→GTC) | RPPX_16780 | phospho‑2‑dehydro‑3‑deoxyheptonate aldolase |
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Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.78e-01 |
Only 100 of 262 total aligned reads displayed.
CAGCGCCGCACCTGCTTGAGGGTTTCGGCAATCAGGAATGCCAACTCCAGCGACTGATCGGCATTCATCCGCGGATCACAATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGAGGTTCTGCCCGGTCATCTGGATAAGGATATCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCTCATCCAGAATCTGCGCAAAATCGCGGGTCTTGTAACCGCTGCTGGCCTTGATGGTGTTGCCGTGCA > CP009974/3756759‑3757053 | gccgcACCTGCTTGAGGGTTTCGGCAATCAGGAATGCCAACTCCAGCGACTGATCGGCATTCATCCGCGGATCACAATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGTCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCtc > 1:4968687/1‑150 (MQ=255) gccgcACCTGCTTGAGGGTTTCGGCAATCAGGAATGCCAACTCCAGCGACTGATCGGCATTCATCCGCGGATCACAATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGACGTTCTg < 2:4476523/151‑1 (MQ=255) gcACCTGCTTGAGGGTTTCGGCAATCAGGAATGCCAACTCCAGCGACTGATCGGCATTCATCCGCGGATCACAATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCTATGCATTCGGTGACGTTCTGccc > 1:489698/1‑151 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |