| Predicted mutation | ||||||
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| RA | CP009974 | 3,756,930 | A→T | L392H (CTT→CAT) | RPPX_16780 ← | phospho‑2‑dehydro‑3‑deoxyheptonate aldolase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009974 | 3,756,930 | 0 | A | T | 99.3% | 1039.5 / ‑1.6 | 278 | L392H (CTT→CAT) | RPPX_16780 | phospho‑2‑dehydro‑3‑deoxyheptonate aldolase |
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Only 100 of 278 total aligned reads displayed.
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cagTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCTCATCCAGAATCTGCGCAAAATCGCGGGTCTTGTAACCGCTGCTGGCCTTGATGGTGTTGCCGTGCATCGGATCGGAACt < 2:2757056/149‑1 (MQ=255) agTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCTCATCCAGAATCTGCGCAAAATCGCGGGTCTTGTAACCGCTGCTGGCCTTGATGGTGTTGCCGTGCATCGGATCGGAACTc < 2:5299190/150‑1 (MQ=255) gTCATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCTCATCCAGAATCTGCGCAAAATCGCGGGTCTTGTAACCGCTGCTGGCCTTGATGGTGTTGCCGTGCATCGGATCGGAACTcc > 2:2330080/1‑151 (MQ=255) cATCTCGATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCTCATCCAGAATCTGCGCAAAATCGCGGGTCTTGTAACCGCTGCTGGCCTTGATGGTGTTGCCGTGCATCGGATCGGAACTCcac > 2:1228941/1‑151 (MQ=255) ctcgATATGGATACCGCCGGCGTGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCTCATCCAGAATCTGCGCAAAATCGCGGGTCTTGTAACCGCTGCTGGCCTTGATGGTGTTGCCGTGCATCGGATCGGAACTCCACAGc < 2:1836216/148‑1 (MQ=255) ctcgATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCTCATCCAGAATCTGCGCAAAATCGCGGGTCTTGTAACCGCTGCTGGCCTTGATGGTGTTGCCGTGCATCGGATCGGAACTCCTCAGc < 2:5369109/148‑1 (MQ=255) ctcgATATGGATACCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCTCATCCAGAATCTGCGCAAAATCGCGGGTCTTGTAACCGCTGCTGGCCTTGATGGTGTTGCCGTGCATCGGATCGGAACTCCACAGc > 2:5977218/4‑151 (MQ=255) | TCGGCAATCAGGAATGCCAACTCCAGCGACTGATCGGCATTCATCCGCGGATCACAATGGGTGTGATACCGGTCAGACAACGCATCCTCGGTGATCGGCCGGGCACCGCCGATGCATTCGGTGAGGTTCTGCCCGGTCATCTGGATAAGGATATCGCCGGCATGGCTGCCCTCGGCCTGGTGTACTTGGAAGAACTGCTTCACCTCATCCAGAATCTGCGCAAAATCGCGGGTCTTGTAACCGCTGCTGGCCTTGATGGTGTTGCCGTGCATCGGATCGGAACTCCACAGCAC > CP009974/3756783‑3757075 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |