| Predicted mutation | ||||||
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| RA | CP009974 | 1,159,719 | T→A | intergenic (+3242/‑12041) | RPPX_05120 → / → RPPX_05130 | hypothetical protein/channel protein TolC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009974 | 1,159,719 | 0 | T | A | 99.4% | 1232.5 / NA | 333 | intergenic (+3242/‑12041) | RPPX_05120/RPPX_05130 | hypothetical protein/channel protein TolC |
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Only 100 of 333 total aligned reads displayed.
CTCAACCCGGCCCAGGCCAATGGCGAACTGCTGGACGTGGTGGCTATCGACGGCAGCGGTGCTACTTCGCTACCCGCGCAGGTCACCGCACCGGATATCACCCCACCGGTCACCCCAGGCGAGCTGGCGATCAGTGCCAACGGCAGCGTGGTCACCGGCCGCGCCGAAGTGGGCAGCACCGTGCGTGTGGTGGCCGCCGATGGCACCACCGTGCTGGGTAGTGTGGTGGTCGACGCCACTGGCAGTTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAGGTAAACGGCGAGGAACTGCAAG > CP009974/1159571‑1159865 | cccGGCCCAGGCCAATGGCGAACTGCTGGACGTGGTGGCTATCGACGGCAGCGGTGCTACTTCGCTACCCGCGCAGGTCACCGCACCGGATATCACCCCACCGGTCACCCCAGGCGAGCTGGCGATCAGTGCCAACGGCAGCGAGGTCAcc > 1:4623535/1‑151 (MQ=255) ccGGCCCAGGCCAATGGCGAACTGCTGGACGTGGTGGCTATCGACGGCAGCGGTGCTACTTCGCTACCCGCGCAGGTCACCGCACCGGATATCACCCCACCGGTCACCCCAGGCGAGCTGGCGATCAGTGCCAACGGCAGCGAGGTCACCg > 1:5979393/1‑151 (MQ=255) gcgcAGGACAATGGCGAACTGCTGGACGTGGTGGCTATCGACGGCAGCGGTGCTACTTCGCTACCCGCGCAGGTCACCGCACCGGATATCACCCCACCGGTCACCCCAGGCGAGCTGGCGATCAGTGCCAACGGCAGCGAGGTCACCGGcc < 2:1463885/148‑1 (MQ=255) 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aGCGAGGTCACCGGCCGCGCCGAAGTGGGCAGCACCGTGCGTGTGGTGGCCGCCGATGGCACCACCGTGCTGGGTAGTGTGGTGGTCGACGCCACTGGCAGTTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAGGTAAACGGCGAGGAACTGCAAg > 2:2148618/1‑151 (MQ=255) | CTCAACCCGGCCCAGGCCAATGGCGAACTGCTGGACGTGGTGGCTATCGACGGCAGCGGTGCTACTTCGCTACCCGCGCAGGTCACCGCACCGGATATCACCCCACCGGTCACCCCAGGCGAGCTGGCGATCAGTGCCAACGGCAGCGTGGTCACCGGCCGCGCCGAAGTGGGCAGCACCGTGCGTGTGGTGGCCGCCGATGGCACCACCGTGCTGGGTAGTGTGGTGGTCGACGCCACTGGCAGTTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAGGTAAACGGCGAGGAACTGCAAG > CP009974/1159571‑1159865 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |