| Predicted mutation | ||||||
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| RA | CP009974 | 1,160,785 | T→C | intergenic (+4308/‑10975) | RPPX_05120 → / → RPPX_05130 | hypothetical protein/channel protein TolC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009974 | 1,160,785 | 0 | T | C | 99.7% | 1130.9 / NA | 316 | intergenic (+4308/‑10975) | RPPX_05120/RPPX_05130 | hypothetical protein/channel protein TolC |
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Only 100 of 321 total aligned reads displayed.
GAGCCTGGTACAGACCGACCAGAGCGGCAACGCCTCTGAAGTGCTGACCTACGACGTGCCACTGGTGGTCACCCCGACCAGCCCGAGCGAACTGGTCGTCGCCGCCGATGGCAGCAGCATCAGCGGTTCTGCTCCTGCTGGCAGCCGTGTGGAAGTGCATGATGCCAACGGCACGCTGGTCGGTAGCATCGTGGTGGGTGCCGAGGGCACCTTCACCGTGGTGCTTACACCGGCCCAGGCCAATGGCGAGTTGCTGGACGTTGTGGCGATCGACAACAACGGCACCTCGTCGTTG > CP009974/1160638‑1160932 | gAGCCTGGTACAGACCGACCAGAGCGGCAACGCCTCTGAAGTGCTGACCTACGACGTGCCACTGGTGGTCACCCCGACCAGCCCGAGCGAACTGGTCGTCGCCGCCGATGGCAGCAGCATCAGCGGTTCTGCTCCTGCTGGTAGCCGcgtg > 1:1588762/1‑151 (MQ=255)gAGCCTGGTACAGACCGACCAGAGCGGCAACGCCTCTGAAGTGCTGACCTACGACGTGCCACTGGTGGTCACCCCGACCAGCCCGAGCGAACTGGTCGTCGCCGCCGATGGCAGCAGCATCAGCGGTTCTGCTCCTGCTGGTAGCCGcgtg < 1:2290499/151‑1 (MQ=255) gCCTGGTACAGACCGACCAGAGCGGCAACGCCTCTGAAGTGCTGACCTACGACGTGCCACTGGTGGTCACCCCGACCAGCCCGAGCGAACTGGTCGTCGCCGCCGATGGCAGCAGCATCAGCGGTTCTGCTCCTGCTGGTAGCCGCGTGGa < 2:5642334/151‑1 (MQ=255) 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aGCCGCGTGGAAGTGCATGATGCCAACGGCACGCTGGTCGGTAGCATCGTGGTGGGCGCCGAGGGCACCTTCACCGTGGTGCTTACACCGGCCCAGGCCAATGGCGAGTTGCTGGACGTTGTGGCGATCGACAACAACGGCACCTcgtcgt > 2:3131619/1‑151 (MQ=255) ccGCGTGGAAGTGCATGATGCCAACGGCACGCTGGTCGGTAGCATCGTGGTGGGTGCCGAGGGCACCTTCACCGTGGTGCTTACACCGGCCCAGGCCAATGGCGAGTTGCTGGACGTTGTGGCGATCGACAACAACGGCACCTCGTCGTTg > 2:3741989/1‑151 (MQ=255) | GAGCCTGGTACAGACCGACCAGAGCGGCAACGCCTCTGAAGTGCTGACCTACGACGTGCCACTGGTGGTCACCCCGACCAGCCCGAGCGAACTGGTCGTCGCCGCCGATGGCAGCAGCATCAGCGGTTCTGCTCCTGCTGGCAGCCGTGTGGAAGTGCATGATGCCAACGGCACGCTGGTCGGTAGCATCGTGGTGGGTGCCGAGGGCACCTTCACCGTGGTGCTTACACCGGCCCAGGCCAATGGCGAGTTGCTGGACGTTGTGGCGATCGACAACAACGGCACCTCGTCGTTG > CP009974/1160638‑1160932 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |