Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP009974 | 382,164 | T→C | intergenic (+300/+229) | RPPX_01535 → / ← RPPX_01540 | guanine permease/5‑hydroxyisourate hydrolase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009974 | 382,164 | 0 | T | C | 98.2% | 909.3 / 3.0 | 339 | intergenic (+300/+229) | RPPX_01535/RPPX_01540 | guanine permease/5‑hydroxyisourate hydrolase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (3/3); new base C (158/174); total (161/178) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.97e-01 |
Only 100 of 340 total aligned reads displayed.
GCGCCAAGGCATTCACGCGCAAATCCCACTGCGTCAAATGGCCCGAAACAGACGTAGGAGCCACTATCTTGCTTAACATTGGAAAGGCCTGCGCGGTCCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCTGATCGGTGGTGGACACACATGTCGGGGGTTGGGCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCA > CP009974/382016‑382311 | aaGGCATTCACGCGCAAATCCCACTGCGTCAAATGGCCCGAAACAGACGTAGGAGCCACTATCTTGCTTAACATTGGAAAGGCCTGCGCGGTCCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCAccc < 1:4241519/151‑1 (MQ=255) aaGGCATTCACGCGCAAATCCCACTGCGTCAAATGGCCCGAAACAGACGTAGGAGCCACTATCTTGCTTAACATTGGAAAGGCCTGCGCGGTCCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCAccc > 1:4894849/1‑151 (MQ=255) aaGGCATTCACGCGCAAATCCCACTGCGTCAAATGGCCCGAAACAGACGTAGGAGCCACTATCTTGCTTAACATTGGAAAGGCCTGCGCGGTCCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCAccc < 1:4417983/151‑1 (MQ=255) ggCATTCACGCGCAAATCCCACTGCGTCAAATGGCCCGAAACAGACGTAGGAGCCACTATCTTGCTTAACATTGGAAAGGCCTGCGCGGTCCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACccgc < 2:4358304/151‑1 (MQ=255) aTTCACGCGCAAATCCCACTGCGTCAAATGGCCCGAAACAGACGTAGGAGCCACTATCTTGCTTAACATTGGAAAGGCCTGCGCGGTCCCCCCGGAGGAGCGGGCTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACccgcccc > 2:6072672/1‑149 (MQ=255) cACGCGCAAATCCCACTGCGTCAAATGGCCCGAAACAGACGTAGGAGCCACTATCTTGCTTAACATTGGAAAGGCCTGCGCGGTCCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCa < 1:5067716/151‑1 (MQ=255) aCGCGCAAATCCCACTGCGTCAAATGGCCCGAAACAGACGTAGGAGCCACTATCTTGCTTAACATTGGAAAGGCCTGCGCGGTCCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCTCGAAGAGGCCGTCCCTGCTGTCCAATCTCCACCCGCCGATCAc > 1:196470/1‑151 (MQ=255) cgcgCAAATCCACCTGCGTCAAATGGCCCGAAACAGACGTAGGAGCCACTATCTTGCTTAACATTGGAAAGGCCTGCGCGGTCCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCAcc < 2:845285/151‑2 (MQ=255) cgcAAATCCCACTGCGTCAAATGGCCCGAAACAGACGTAGGAGCCACTATCTTGCTTAACATTGGAAAGGCCTGCGCGGTCCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGt < 1:3515220/151‑1 (MQ=255) gcAAATCCCACTGCGTCAAATGGCCCGAAACAGACGTAGGAGCCACTATCTTGCTTAACATTGGAAAGGCCTGCGCGGTCCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGtt > 1:2481872/1‑151 (MQ=255) cAAATCCCACTGCGTCAAATGGCCCGAAACAGACGTAGGAGCCACTATCTTGCTTAACATTGGAAAGGCCTGCGCGGTCCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGtt < 1:6438065/143‑1 (MQ=255) aaaTCCCACTGCGTCAAATGGCCCGAAACAGACGTAGGAGCCACTATCTTGCTTAACATTGGAAAGGCCTGCGCGGTCCCCTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGATgc > 2:3889972/1‑151 (MQ=255) aaaTCCCACTGCGTCAAATGGCCCGAAACAGACGTAGGAGCCACTATCTTGCTTAACATTGGAAAGGCCTGCGCGGTCCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTgc < 2:2615885/151‑1 (MQ=255) cccACTGCGTCAAATGGCCCGAAACAGACGTAGGAGCCACTATCTTGCTTAACATTGGAAAGGCCTGCGCGGTCCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTgctgcc < 1:6126301/151‑1 (MQ=255) cccACTGCGTCAAATGGCCCGAAACAGACGTAGGAGCCACTATCTTGCTTAACATTGGAAAGGCCTGCGCGGTCCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTgctgcc < 1:4312690/151‑1 (MQ=255) aCTGCGTCAAATGGCCCGAAACAGACGTAGGAGCCACTATCTTGCTTAACATTGGAAAGGCCTGCGCGGTCCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCtgccgcc < 2:4287651/151‑2 (MQ=255) cTGCGTCAAATGGCCCGAAACAGACGTAGGAGCCACTATCTTGCTTAACATTGGAAAGGCCTGCGCGGTCCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCtgccgccc > 1:463427/1‑149 (MQ=255) cTGCGGCAAATGGCCCGAAACAGACGTAGGAGCCACTATCTTGCTTAACATTGGAAAGGCCTGCGCGGTCCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCtgccgcca < 2:1549641/151‑3 (MQ=21) gCGTCAAATGGCCCGAAACAGACGTAGGAGCCACTATCTTGCTTAACATTGGAAAGGCCTGCGCGGTCCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCAcc > 1:5679950/1‑151 (MQ=255) gTCAAATGGCCCGAAACAGACGTAGGAGCCACTATCTTGCTTAACATTGGAAAGGCCTGCGCGGTCCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGt < 1:3610054/151‑1 (MQ=21) tGGCCCGAAACAGACGTAGGAGCCACTATCTTGCTTAACATTGGAAAGGCCTGCGCGGTCCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTcgc < 1:1014408/151‑1 (MQ=21) tGGCCCGAAACAGACGTAGGAGCCACTATCTTGCTTAACATTGGAAAGGCCTGCGCGGTCCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTcgc < 2:3796618/151‑1 (MQ=21) cccGAAACAGACGTAGGAGCCACTATCTTGCTTAACATTGGAAAGGCCTGCGCGGTCCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAACCTCCACCCGCCGTTCACCGCTCCTCCCGCCACCGTCTCCGCggc > 2:4835708/1‑150 (MQ=18) ccGAAACAGACGTAGGAGCCACCATCTTGCTTAACATTGGAAAGGCCTGCGCGGTCCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGGATTCGCgggg > 2:5808973/1‑150 (MQ=18) cGAAACAGACGTAGGAGCCACTATCTTGCTTAACATTGGAAAGGCCTGCGCGGTCCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTa < 2:1638422/151‑1 (MQ=18) cAGACGTAGGAGCCACTATCTTGCTTAACATTGGAAAGGCCTGCGCGGTCCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAAccc > 2:3375458/1‑151 (MQ=255) cAGACGTAGGAGCCACTATCTTGCTTAACATTGGAAAGGCCTGCGCGGTCCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAAccc < 1:5203257/151‑1 (MQ=18) gACGTAGGAGCCACTATCTTGCTTAACATTGGAAAGGCCTGCGCGGTCCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTa > 2:5027404/1‑144 (MQ=18) gACGTAGGAGCCACTATCTTGCTTAACATTGGAAAGGCCTGCGCGGTCCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGc < 1:3120634/151‑1 (MQ=18) gACGTAGGAGCCACTATCTTGCTTAACATTGGAAAGGCCTGCGCGGTCCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGGATTCGCGGGTAAACCCGc > 1:1585040/1‑151 (MQ=18) aCGTAGGAGCCACTATCTTGCTTAACATTGGAAAGGCCTGCGCGGTCCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCt < 2:3731732/151‑1 (MQ=255) tAGGAGCCACTATCTTGCTTAACATTGGAAAGGCCTGCGCGGTCCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCt > 2:646370/1‑151 (MQ=255) tAGGAGCCACTATCTTGCTTAACATTGGAAAGGCCTGCGCGGTCCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCt < 2:5093263/151‑1 (MQ=17) aGGAGCCACTATCTTGCTTAACATTGGAAAGGCCTGCGCGGTCCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTa > 1:74610/1‑151 (MQ=17) gggCCACTATCTTGCTTAACATTGGAAAGGCCTGCGCGGTCCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTaca < 2:1128221/149‑1 (MQ=14) ccACTATCGTGCGGAGCAGTGGAAATGCCTGCGCGGTCCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCGCTGGGGGCCAATCTCCACCGGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGAGGGTAAACCCGCTCCTACACCt < 2:5516199/151‑1 (MQ=14) aCTATCTTGCTTAACATTGGAAAGGCCTGCGCGGTCCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCTGa > 1:4143604/1‑151 (MQ=17) tATCTTGCTTAACATTGGAAAGGCCTGCGCGGTCCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCTGATc < 2:1071571/151‑1 (MQ=255) aTCTTGCTTAACATTGGAAAGGCCTGCGCGGTCCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCTGATCg > 1:4986601/1‑151 (MQ=17) ttGCTTAACATTGGAAAGGCCTGCGCGGTCCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCTGATCggtg < 1:2365151/151‑1 (MQ=17) gCTTAACATTGGAAAGGCCTGCGCGGTCCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCTGATCggtggt < 2:2588357/151‑1 (MQ=255) gCTTAACATTGGAAAGGCCTGCGCGGTCCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCTGATCggtggt < 1:3788574/151‑1 (MQ=255) cTTAACATTGGAAAGGCCTGCGCGGTCCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCGAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTGGTCGGAAAACCCGCGCCTACGCCTGAAGGgtggtg > 2:1939489/1‑151 (MQ=17) tAACATTGGAAAGGCCTGCGCGGTCCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCTGCTCGGTGGTGGa > 2:4435504/1‑151 (MQ=17) aaCATTGGAAAGGCCTGCGCGGTCCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCTGATCGGTGGTGGac > 2:1310313/1‑151 (MQ=17) aTTGGAAAGGCCTGCGCGGTCCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCTGATCGGTGGTGGacaca > 2:4542344/1‑151 (MQ=17) ggAAAGGCCTGCGCGGTCCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCTGATCGGTGGTGGACACACAt < 2:4143604/151‑1 (MQ=17) gaaGGCCTGCGCGGTCCCGCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTGCACCCGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGTGGGTAAGCCCGCTCCTACACCTGATCGGTGGTGGACACACATGt < 2:4598810/150‑1 (MQ=17) aaGGCCTGCGCGGTCCCCCCGTGGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCCCCCGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAACCCCGCTCCTACACCTGATCGGTGGTGGACACACATGTc < 2:3194730/151‑1 (MQ=17) aGGCCTGCGCGGTCCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCTGATCGGTGGTGGACACACATGTCg > 2:426207/1‑151 (MQ=255) ggCCTGCGCGGTCCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCTGATCGGTGGTGGACACACATGTCgg < 2:3036041/151‑1 (MQ=255) gCCTGCGCGGTCCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCTGATCGGTGGTGGACACACATGTCggg < 1:6522169/151‑1 (MQ=17) ccTGCGCGGTCCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCTGATCGGTGGTGGACACACATGTCgggg > 1:6259766/1‑151 (MQ=17) tGCGCGGTCCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCTGATCGGTGGTGGACACCCATGTCGGGGGt > 2:1193067/1‑151 (MQ=17) gcgcGGTCCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCTGATCGGTGGTGGACACACATGTCGGGGGtt > 1:3973972/1‑151 (MQ=255) gcgcGGTCCCCCAGTAGGAGAGGGTTTCCCCGCGAAGCGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCTGATCGGTGGTGGACACACATGTCGGGGGtt < 1:4071877/151‑1 (MQ=17) gcgcGGGCCCCCCGTAGGAGCGGGGTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGACCAAGCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCTGATCGGTGGTGGACACACATGTCGGGGGtt < 2:4102476/151‑1 (MQ=17) cgcgGTCCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCTGATCGGTGGTGGACACACATGTCGGGGGTTg < 1:5727795/151‑1 (MQ=255) gcgGTCCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCTGATCGGTGGTGGACACACATGTCGGGGGTTgg < 2:1985819/151‑1 (MQ=17) gTCCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCTGATCGGTGGTGGACACACATGTCGGGGGTTGGGca < 1:858515/151‑1 (MQ=17) cccccccGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCTGATCGGTGGTGGACACACATGTCGGGGGTTGGGcac < 1:1655789/150‑1 (MQ=255) cccccGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCTGATCGGTGGTGGACACACATGTCGGGGGTTGGGCACAg > 1:2550838/1‑151 (MQ=17) cccccGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCTGATCGGTGGTGGACACACATGTCGGGGGTTGGGCACAg < 1:4708856/151‑1 (MQ=17) ccccGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGCTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCTGATCGGTGGTGGACACACATGCCGGGGGCTGGGCACAgg > 1:3266422/1‑151 (MQ=17) cccGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCTGATCGGTGGTGGACACACATGTCGGGGGTTGGGCACAGGc > 1:4965663/1‑151 (MQ=17) gTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGGTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCCCGGGTAAACTCGCGCCTACCCCGGATCGCCGGTAGACACACATGCCGGGGGTTGCGCACCGGCcgc > 2:1767207/1‑150 (MQ=14) ggAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACTGTTgacgcc < 2:916688/69‑1 (MQ=255) gCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCTGATCGGTGGTGGACACACATGTCGGGGGTTGGGCACAGGCCGTCGTGTa < 1:154422/151‑1 (MQ=17) gTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCTGATCGGTGGTGGACACACATGTCGGGGGTTGGGCACAGGCCGTCGTGTAGGAg < 2:2239478/151‑1 (MQ=255) tttACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCTGATCGGTGGTGGACACACATGTCGGGGGTTGGGCACAGGCCGTCGTGTAGGAGc < 1:4205462/151‑1 (MQ=255) tttACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCTGATCGGTGGTGGACACACATGCCGGGGGTTGGGCACAGGCCGTCGTGTCGGatc > 2:2340722/1‑149 (MQ=17) ttgcccGGGAAGAGGCGGGCCCGGCGGGGCCAGCGCAGCGCGCCGTTCTCCGTTGCTGCCGCCCCCGGATTCGCGGGTAAGCCGGCTCCTCCACCTGCTCGGTGGTGGACACCCCTGTCGGGGGTTGGGCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCg < 2:5411830/148‑1 (MQ=9) ttACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCGCCCGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCTGATCGGTGGTGGACACACATGTCGGGGGTTGGGCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCg < 2:153017/151‑1 (MQ=255) ttACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCTGATCGGTGGTGGACACACATGTCGGGGGTTGGGCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCg > 1:3322978/1‑151 (MQ=255) tACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCTGATCGGTGGTGGACACACATGTCGGGGGTTGGGCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCgg > 1:5865604/1‑151 (MQ=17) cccGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCTGATCGGTGGTGGACACACATGTCGGGGGTTGGGCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCgggg > 1:2250651/1‑150 (MQ=17) cgcgAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCTGATCGGTGGTGGACACACATGTCGGGGGTTGGGCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGttt < 1:2280933/151‑1 (MQ=17) gcgAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCTGATCGGTGGTGGACACACATGTCGGGGGTTGGGCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTa > 1:6011299/1‑151 (MQ=17) cgAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCTGATCGGTGGTGGACACACATGTCGGGGGTTGGGCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTAc < 2:6294471/151‑1 (MQ=255) gAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCTGATCGGTGGTGGACACACATGTCGGGGGTTGGGCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTAcc > 1:5285799/1‑151 (MQ=17) gAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCTGATCGGTGGTGGACACACATGTCGGGGGTTGGGCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTAcc > 2:3313883/1‑151 (MQ=17) aaGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCTGATCGGTGGTGGACACACATGTCGGGGGTTGGGCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTAccc < 1:1434965/151‑1 (MQ=17) aaGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCTGATCGGTGGTGGACACACATGTCGGGGGTTGGGCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTAccc < 1:2802810/151‑1 (MQ=255) aaGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCTGATCGGTGGTGGACACACATGTCGGGGGTTGGGCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTAccc < 1:2613653/151‑1 (MQ=255) gagGCCGGCCCTGCTGGCCCATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCTGATCGGTGGTGGACACACATGTCGGGGGTTGGGCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCcgc < 2:212640/151‑1 (MQ=17) gagGCCGGCCCTGCTGGCCACTCCCCACCCGCCGTTCCCCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCTGATCGGTGGTGGACACACATGTCGGGGGTTGGGCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCcgc < 2:5682320/151‑1 (MQ=17) gagCCCGGCCCGGCTGGCCAATCTGCCCCCGCCGTGCGCCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAGCCCGCTCCTACACCTGATCGGTGGTGGACACACATGTCGGGGGTTGGGCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCcgc < 2:1021643/151‑1 (MQ=14) ccggccCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCTGATCGGTGGTGGACACACATGTCGGGGGTTGGGCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAag > 2:278595/1‑151 (MQ=14) ccggccCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCTGATCGGTGGTGGACACACATGTCGGGGGTTGGGCACAGGCCGTCGTGCAGGAGCGGGTTTACCCGCGAag < 1:2907278/151‑1 (MQ=255) cggccCTGCTGGCTATTCTCCACCCGCCGTTCTCCGTTGCTGCCGCCACCGTGTTGGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCTGATCGGTGGTGGACACACATGTCGGGGGTTGGGCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAaga < 1:5385276/151‑1 (MQ=14) gggtgggctgGTCAATGGCCAGCCGCCGTTCGCCGCTGCTGCCGGCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACACCTGAGCGGTGGTGGACACACGTGTCGGGGGTTGGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTCCCCGCGAagag < 2:2488168/145‑1 (MQ=14) ggccCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGt < 1:6318032/61‑1 (MQ=35) ggccCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGt > 2:6318032/1‑61 (MQ=37) gccCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCTGATCGGTGGTGGACACACATGTCGGGGGTTGGGCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAgg < 1:3561344/151‑1 (MQ=255) ctgctgGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCTGATCGGTGGTGGACACACATGTCGGGGGTTGGGCACAGGCCGTCGTGTATGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCg > 1:2062150/1‑151 (MQ=14) tgctgGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCTGATCGGTGGTGGACACACATGTCGGGGGTTGGGCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCgg > 1:6280197/1‑151 (MQ=14) tgctgGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCTGATCGGTGGTGGACACACATGTCGGGGGTTGGGCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCgg > 2:4688995/1‑151 (MQ=14) tgGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCTGATCGGTGGTGGACACACATGTCGGGGGTTGGGCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGcac > 1:2103502/1‑151 (MQ=255) ggCCCATCTCCACCCGCCGTGCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAGCCCGCTCCTACACCTGAGCGGTGGTGGACACACATGTCGGGGGTGGGGCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGcaca < 1:1302581/151‑1 (MQ=17) aaTCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCTGATCGGTGGTGGACACACATGTCGGTGGTTGGGCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCa < 1:646370/151‑1 (MQ=14) | GCGCCAAGGCATTCACGCGCAAATCCCACTGCGTCAAATGGCCCGAAACAGACGTAGGAGCCACTATCTTGCTTAACATTGGAAAGGCCTGCGCGGTCCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCTGATCGGTGGTGGACACACATGTCGGGGGTTGGGCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCA > CP009974/382016‑382311 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |