| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | U00096 | = 781446 | 127 (0.620) | 55 (0.310) | 9/250 | 18.9 | 30.7% | intergenic (+2/‑131) | lysZ/lysQ | tRNA‑Lys/tRNA‑Lys |
| ? | U00096 | 2521487 = | 139 (0.790) | intergenic (+159/+106) | lysV/xapR | tRNA‑Lys/DNA‑binding transcriptional activator XapR | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Only 100 of 130 total aligned reads displayed.
AGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGT‑CGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGCAAGGGGTCGTTAGCTCAGTT > U00096/781299‑781593 | cATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGG‑CGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTa < 2:520878/148‑1 (MQ=255) gCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGT‑CGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAggtg > 1:520952/1‑148 (MQ=255) gCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGT‑CGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAggtg < 2:520879/148‑1 (MQ=255) gCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGT‑CGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAggtg > 2:520944/1‑148 (MQ=255) gACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGT‑CGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTa < 1:520880/148‑1 (MQ=255) aaTCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGT‑CGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGt > 2:520961/1‑145 (MQ=255) tAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCGCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTATTCAATTGGG‑CGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACg < 2:520881/148‑1 (MQ=255) aacgATTGGCCCCGAGTAATAATCTTTCATGTAACCCCCGTATGTGTCGTTATCTCAGTTGGTAGAGCAGTTTAC‑TTTAATTCTTTGGTGCGCAGGGTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGt < 2:520882/145‑1 (MQ=21) aaaGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGT‑CGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGt > 2:520951/1‑148 (MQ=255) aaGATTGGCCCCTAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCTTTATCTCAGTTGGTAGAGCAGTTTACTTTTAATCAATTGTT‑CGAAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTg < 1:520884/148‑1 (MQ=25) aaGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGT‑CGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTg > 2:520969/1‑148 (MQ=255) aGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGT‑CGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGa > 1:520945/1‑148 (MQ=255) aTTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGT‑CGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAg > 2:2919689/1‑148 (MQ=255) ggCCCCGAGCAAAAATCTTTGAGGTAACACCCGTTTGGTTCGTTAGATCAGTTGGTAGAGCAGTTTACTTTTAATCAATTGTT‑CGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGAt < 2:520888/148‑1 (MQ=25) gCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGT‑CGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGAt < 1:520889/147‑1 (MQ=255) gCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGT‑CGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATa < 2:520890/148‑1 (MQ=255) cGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGT‑CGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGt < 1:520892/148‑1 (MQ=255) cGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGGTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGT‑CGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACgc < 2:2068057/148‑2 (MQ=255) aGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGT‑CGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTg > 1:520958/1‑148 (MQ=255) tAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGT‑CGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGa > 1:520965/1‑138 (MQ=255) aaaaaTCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATAGGT‑CGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCAACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGt > 2:520979/1‑148 (MQ=255) aaaaTCTTTCACGCAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGGAGACTTTTAATCAATTGGT‑CGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGtt < 2:520893/148‑1 (MQ=255) aaaTCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGT‑CGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTa > 2:520975/1‑148 (MQ=255) cTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGT‑CGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTa > 1:520950/1‑144 (MQ=255) ttCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTTACTTTTAATCAATTGGT‑CGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGc < 1:520897/144‑1 (MQ=255) ttCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCTATTGGT‑CGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGTTTACTGGTAGATAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGc < 2:520899/144‑1 (MQ=255) ttCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGT‑CGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCa < 1:2888493/145‑1 (MQ=255) ttCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGT‑CGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTaaa > 1:521037/1‑101 (MQ=255) ctcccGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGTTACAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGT‑CGCAGGTTCTAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAgg < 2:1370083/146‑1 (MQ=255) cccGTATGGGTCGTTAGCTAAGTTGGTAGAGCAGTAGACTTTTAATCAATTGGT‑CGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTACAGACCGTGAAGGATAACGTTGCGTTACCAACGGCCCGAAGGGc > 2:520974/1‑148 (MQ=21) cccctcgggTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGT‑CGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCg < 1:520925/142‑1 (MQ=255) ccactcgggTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGT‑CGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAAGGTGGTTACGGGTTGTGAACGTGAAGGATAACGGTGCGTGAGCAACCGCCCGCAGGGcc > 2:520925/7‑147 (MQ=17) ccGTATGGGTCTTTATCTCAGTTGGTTGAGCAGTTGACTTTTAATCATTTTTG‑CGAAGTTTCGTATCCTGCACGACCCACCAATTTAAATGTTGTTACTGTTAGATATCGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCg < 2:520905/148‑1 (MQ=18) cgggTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGT‑CGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACg < 2:520909/147‑1 (MQ=255) gggTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGT‑CGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTa < 1:520920/81‑1 (MQ=33) gggTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGT‑CGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGtt < 2:520915/90‑1 (MQ=255) gggTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGT‑CGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTAc < 1:520923/92‑1 (MQ=255) gTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGT‑CGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGaa < 1:520928/100‑1 (MQ=255) tCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGT‑CGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAgg < 2:564829/148‑2 (MQ=255) cGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGT‑CGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTgg < 1:520930/91‑1 (MQ=255) cGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGT‑CGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGtt < 1:520929/119‑1 (MQ=255) gTTAGCTCAGTTGGTAGAGCCGTTGACTTTTACTCAATTGGT‑CGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAAGTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCg < 2:520932/148‑1 (MQ=255) tAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTT‑ATCAATTGGT‑CGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGt > 1:520980/1‑148 (MQ=255) cTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGT‑CGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGa > 1:520934/1‑97 (MQ=255) aGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGT‑CGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAg < 2:520935/71‑1 (MQ=35) ttGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGT‑CGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAgg > 2:520936/1‑70 (MQ=39) ttGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGT‑CGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAgg < 1:520936/70‑1 (MQ=39) tGGTAGAGCAGTTGATTTTTATTCTATGGGG‑CGCAGCTTGTAATCCTGCACTACCCACCAATTTTATGGTGGTTTCTGGTTGATACCGTGATGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGACGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGc < 2:520937/148‑1 (MQ=17) gagCAGTTGACTTTTAATCAATTGGT‑CGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTaaa > 1:521059/1‑62 (MQ=35) agCAGTTGACTTTTAATCAATTGGT‑CGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTaaa > 1:521063/1‑61 (MQ=35) gCAGTTGACTTTTAATCAATTGGT‑CGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTg < 2:520917/96‑1 (MQ=255) aCTTTTAATCAATTGGT‑CGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATcc > 1:520982/1‑148 (MQ=255) cTTTTAATCAATTGGT‑CGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATcc < 1:520944/147‑1 (MQ=255) ttttAATCAATTGGT‑CGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTg < 2:520945/148‑1 (MQ=255) ttAATCAATTGGT‑CGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGaa < 2:520950/148‑1 (MQ=255) tAATCAATTGGT‑CGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTaaa > 1:521083/1‑48 (MQ=38) aaTCAATTGGT‑CGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATg < 1:520951/148‑1 (MQ=255) aaTCAATTGGT‑CGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATg < 2:520952/148‑1 (MQ=255) aTCAATTGGT‑CGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGa < 2:520953/148‑1 (MQ=255) tCAATTGGT‑CGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGAt < 1:520955/148‑1 (MQ=255) cAATTGGT‑CGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTaa > 2:521084/1‑43 (MQ=38) aaTTGGT‑CGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAAttt < 1:520956/40‑1 (MQ=37) aaTTGGT‑CGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAAttt > 2:520956/1‑40 (MQ=37) tGGT‑CGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAgg > 2:2116563/1‑148 (MQ=255) cccagcctCGAATCCCGCACGACCAACCAATTTAAATGATCTAACTGTTATTTAACGTGAAGGATAACTTTGCGCTAGCAACTGCCCGAAGTGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGgcagc < 2:520983/141‑1 (MQ=18) cGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGgcagc < 2:520958/148‑1 (MQ=255) gCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTaaa > 1:521092/1‑35 (MQ=40) cagggTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGgcagca < 1:1044411/145‑1 (MQ=255) gTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTg > 1:520959/1‑54 (MQ=255) gTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTg < 2:520959/54‑1 (MQ=255) gTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGAGCGGACTGGTAGAGATCGTGAAGGATAACGTAGCCTGAGCACCGGCCCGAAGCGAGTGACGAATTCGAGTAATGCTGCGCGGCCCACCATGCAGTAAAATTAAGGCAGCAGAAt > 2:521096/1‑148 (MQ=12) ttCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGt < 1:520963/52‑1 (MQ=255) ttCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATc < 2:520965/148‑1 (MQ=255) ttCGAACCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGt < 1:520962/52‑1 (MQ=255) cGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGAc < 1:520967/91‑1 (MQ=255) aaTCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCg < 1:520969/147‑1 (MQ=255) aTCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGACGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGCa < 1:520970/148‑1 (MQ=255) aTCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGCa > 2:521161/1‑148 (MQ=255) ccTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCCCCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGCAAg > 1:521077/1‑148 (MQ=255) gCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCa < 1:520973/102‑1 (MQ=255) gCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGCAAgggg < 1:520972/148‑1 (MQ=255) cACGACCCACCAATTTAATGGTGGTTACTGGTAGAGATCGTGAAGGATATCGTTGCGTTAGCAACGGCGCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGCAAggggg < 1:520974/148‑2 (MQ=255) cGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGCAAGGGGt < 1:520975/146‑1 (MQ=255) gACCTACCAATTTAAACTCGGTTACTGTTAGTTATCGGGAAGTATAAGGTTGCGTTAGCAACGGCCCGATTGGCGAGACTAATTCGAGTCATCCTGCACGAACCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGCAAGGGGTCGt < 2:520990/148‑1 (MQ=255) aCCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATACTGCACGCCCCCCCATGATAAAAGAGGAAGGCAGAGGGATCCGGCTAGGGATCGtg > 2:521209/1‑147 (MQ=18) accaATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGCAAGGGGTCGTTAGc > 1:521006/1‑147 (MQ=255) accaATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGCAAGGGGTCGTTAGCt < 2:520977/148‑1 (MQ=255) accaATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGCAAGGGGTCGTTAGCt > 2:521012/1‑148 (MQ=255) accaATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGCAAGGGGTCGTTAGCt > 2:521007/1‑148 (MQ=255) accaATTTAAAGGTGGTTACGGTTAGAGAACGTGATGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCACGAAGGGCGAGACGAATTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGCAAGGGGTCGTTAGCt < 2:520976/148‑1 (MQ=37) ccaATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCACCGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTc > 1:521015/1‑79 (MQ=255) ccaATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGCAAGGGGTCGTTAtctc > 2:521066/1‑148 (MQ=255) ccaATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGAAAGGGGTCGTTAGCTc > 2:521087/1‑148 (MQ=255) caATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGt > 1:521183/1‑82 (MQ=255) aTTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGTCCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGCAAGGGGTCGTTAGCTCAGt < 1:520979/148‑1 (MQ=255) aTTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGCAAGGGGTCGTTAGCTCAGt > 2:521093/1‑148 (MQ=255) aTTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGCAAGGGGTCGTTAGCTCAGt > 2:521097/1‑148 (MQ=255) tttAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGtt < 2:520946/46‑1 (MQ=255) tttAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGCAAGGGGTCGTTAGCTCAGtt > 2:521011/1‑148 (MQ=255) tttAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGCAAGGGGTCGTTAGCTCAGtt > 2:521062/1‑148 (MQ=255) | AGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGT‑CGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGCAAGGGGTCGTTAGCTCAGTT > U00096/781299‑781593 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |