New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | U00096 | = 2560972 | 51 (0.490) | 4 (0.040) | 4/252 | 13.1 | 9.0% | intergenic (+74/‑396) | yffL/yffM | uncharacterized protein YffL/uncharacterized protein YffM |
? | U00096 | 2561043 = | 37 (0.420) | intergenic (+145/‑325) | yffL/yffM | uncharacterized protein YffL/uncharacterized protein YffM | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
GAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGCCTGATAGGTCGGCTGGTTGCGAGCATTAACCATGCTGATTAGCG > U00096/2560901‑2561190 | gAATCCGCCCGGCATTTTTCCAGACTTTTGTTTGCCTTAATTACATGAATTCAGCGGGGTCAAAAGATGGCTTTATTGGGGGGTCAATAGTTGCCTTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGa < 2:883154/149‑1 (MQ=21) gCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCCGGTGGGTCAAAAGTAGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTAtt < 1:883151/149‑1 (MQ=255) atttttCCAGCCTTTCGTTTTCCTTAAATCCATGAATTCCGGTGGGTCAAAATTTGCCTTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCTTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTaa < 2:883156/145‑1 (MQ=25) aTGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCTAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTaa > 1:1435400/1‑148 (MQ=255) tGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGAGGGTCAAAATTTGCCGTTAAGGGGGGTCTAATTTTGACGACAAAGAATTCTACAATTa > 1:883207/1‑146 (MQ=37) tGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAACTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTATTGATGTGTCAAAAGTTGCATTAAAGGAGGCTCAAAAGTTGAAGAAAAGCTGGGTCTAATATAGAGGAGAAAGAATTCTACAAtaa > 2:883213/1‑144 (MQ=255) tttCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTTGGTCAAATGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAATTTGAAGTGTAGGTGGGTGAAAAATTGCCTAGAAAGGATTGTACAATTAAGAATTATAcgcgt > 2:883217/1‑148 (MQ=21) cTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGACGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATAATAGGCGACgg > 2:883241/1‑149 (MQ=255) ccTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGTGTCAAAAGTTGCCTTAAAGGAGGGTCAAAAGTTGCAGTGTAGGTGGCTCAAATATTGACGAGTAATAATTATAAAATTAAAAATAATAGGCGGCGGGAGtt > 2:883206/1‑149 (MQ=21) ttCAGTTGGGTTTAATGTTGCCGTTACTGGTGGGTAAATAGTTGCCTTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCcggn < 2:883157/149‑2 (MQ=37) gcttaaaaTTAGCCTTTACTGGTGGGTCAAAACTAGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATa < 2:883158/145‑1 (MQ=37) gTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTTCCGAGTAAGAATTCTACTATTTAGAATTCTAGGCGACGGTAGTTTTTTAGACTCCCGCTCGGTCATAGAGAGTCg > 2:883218/1‑149 (MQ=38) cGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTag > 1:883256/1‑149 (MQ=255) ttAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTagag > 1:883222/1‑149 (MQ=255) gtggtgGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCAGTTAAGGTGGGACAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCACGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTa > 2:883223/1‑149 (MQ=255) tggtggGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCGACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGTGAGGCGCCTAGAGTTaa > 1:883239/1‑149 (MQ=255) gtggGTAATTAGTTGCCTTTTAGGTGGGTTAAATGTTTCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAAc < 2:883163/149‑1 (MQ=255) tggGTAAAATGTGGCCTTTTAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACa < 2:883172/149‑1 (MQ=39) gggTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACag < 1:883160/149‑1 (MQ=255) ggTCAAATGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACaga < 2:883162/149‑1 (MQ=255) aaaGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAat > 1:883233/1‑149 (MQ=255) gCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTc > 1:883221/1‑149 (MQ=255) gTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTctcc > 2:883227/1‑149 (MQ=255) gTGGGTAAAATGTTGCCTTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCgccgcc < 2:883175/146‑1 (MQ=255) ggTCAAAAGTTTCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGCCTg < 1:883181/145‑1 (MQ=255) tCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGCCTGATAGGt > 2:883226/1‑149 (MQ=255) tCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGCCTGATAGGt < 1:883182/149‑1 (MQ=255) cAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGCCTGATAgg > 1:883252/1‑147 (MQ=255) tgTTGCCGTTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGCCTGATAGGTCGGCt < 2:883183/148‑1 (MQ=255) aGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGCCTGATAGGTCGGCt > 1:883243/1‑149 (MQ=255) gTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCAGAGTAAGAATTCTACTATAAAGAATTCTAGGACACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATATCGCCGCCTGATAGGTCGGCTg > 1:883228/1‑149 (MQ=255) gCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTa < 1:883185/109‑1 (MQ=255) ccGTTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCcggt < 1:883186/82‑1 (MQ=255) cGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATag > 1:883251/1‑90 (MQ=255) atttAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGCCTGATAGGTCGGCTGGTTGc < 2:883190/147‑1 (MQ=255) gTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTctac < 1:883187/38‑1 (MQ=255) gTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGCCTGATAGGTCGGCTGGTTGCg < 2:883188/149‑1 (MQ=255) tAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGCCTGATAGGTCGGCTGGTTGCGAg < 1:883192/149‑1 (MQ=255) aGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCggtcggtc < 1:883201/81‑1 (MQ=255) aGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCa < 1:883200/82‑1 (MQ=255) aGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTaa < 1:883199/103‑1 (MQ=255) aGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGCCTGATAGGTCGGCTGGTTGCGAGCa < 2:883193/149‑1 (MQ=255) ggTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAAc < 1:883202/104‑1 (MQ=255) gTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGCCTGATAGGTCGGCTGGTTGCGAGc > 1:883240/1‑146 (MQ=255) gggTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGCCGGGTGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGCTTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGCGTGAGTGGTCGGCTGGTTGCGAGCATTaa > 2:883254/1‑149 (MQ=255) gggTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAAc < 1:883203/101‑1 (MQ=255) ggTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTa < 1:883204/97‑1 (MQ=255) gTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTa < 1:883205/60‑1 (MQ=255) gTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGCCTGATAGGTCGGc < 1:883206/131‑1 (MQ=255) aGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGCCTGATAGGTCGGCTGGTTGCGAGCATTAACCATGCTg < 2:883207/149‑1 (MQ=255) gTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGCCTGATAGGTCGGCTGGTTGCGAGCATTAACCATGCTGa < 1:883208/149‑1 (MQ=255) gTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGCCTGATAGGTCGGCTGATTGCGAGCATTAACCATGCTGa > 1:883247/1‑149 (MQ=255) gCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGCCTGATAGGTCGGCTGGTTGCGAGCATTAACCATGCTGATTa < 2:883209/149‑1 (MQ=255) cGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGCCTGATAGGTCGGCTGGTTGCGAGCATTAACCATGCTGATTAgg < 2:883210/149‑2 (MQ=255) cGAGGAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGGTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTc < 1:883211/73‑1 (MQ=255) gAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGCCTGATAGGTCGGCTGGTTGCGAGCATTAACCATGCTGATTAgcg > 2:883237/1‑149 (MQ=255) | GAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAATTATTTCGCCGCCTGATAGGTCGGCTGGTTGCGAGCATTAACCATGCTGATTAGCG > U00096/2560901‑2561190 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |