New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | U00096 | = 2560972 | 80 (0.420) | 4 (0.020) | 4/252 | 23.0 | 5.1% | intergenic (+74/‑396) | yffL/yffM | uncharacterized protein YffL/uncharacterized protein YffM |
? | U00096 | 2561043 = | 79 (0.480) | intergenic (+145/‑325) | yffL/yffM | uncharacterized protein YffL/uncharacterized protein YffM | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
GGCTATATACCAGGATCGGCAGAAAGGGAGTGCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAG > U00096/2560824‑2561119 | ggCTATATACCAGGATCGGCAGAAAGGGAGTGCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCg < 2:1607784/149‑1 (MQ=255) gCTATATACCAGGATCGGCAGAAAGGGAGTGCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGt > 2:1607884/1‑149 (MQ=255) tatataCCAGGATCGGCAGAAAGGGAGTGCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGtga > 2:1607897/1‑147 (MQ=255) tatataCCAGGATCGGCAGAAAGGGAGTGCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCAGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTa > 2:1607875/1‑149 (MQ=255) atataCCAGGATCGGCAGAAAGGGAGTGCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCg > 1:1607901/1‑145 (MQ=255) atataCCAGGATCGGCAGAAAGGGAGTGCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCg > 1:1607899/1‑145 (MQ=255) atataCCAGGATCGGCAGAAAGGGAGTGCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCg > 1:1607849/1‑145 (MQ=255) atataCCAGGATCGGCAGAAAGGGAGTGCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAg < 2:1607785/149‑1 (MQ=255) tataCCAGGATCGGCAGAAAGGGAGTGCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAgt < 1:1607786/149‑1 (MQ=255) aCCAGGATCGGCAGAAAGGGAGTGCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAttgtg > 2:1607893/1‑147 (MQ=255) aCCAGGATCGGCAGAAAGGGAGTGCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAgtggt < 1:1607787/149‑1 (MQ=255) aCCAGGATCGGCAGAAAGGGAGTGCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAgtggt < 1:1607788/149‑1 (MQ=255) ccAGGATCGGCAGAAAGGGAGTGCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTatggttg > 2:1607878/1‑143 (MQ=255) ccAGGATCGGCAGAAAGGGAGTGCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTTatggtg > 2:1607903/1‑149 (MQ=255) ccAGGATCGGCAGAAAGGGAGTGCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAgtggtg > 2:1607935/1‑149 (MQ=255) cAGGATCGGCAGAAAGGGAGTGCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCg > 1:1607862/1‑139 (MQ=255) cAGGATCGGCAGAAAGGGAGTGCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGtggtgg < 1:1607789/149‑1 (MQ=255) tCGGCAGAAAGGGAGTGCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCaa < 2:1607790/149‑1 (MQ=255) tCGGCAGAAAGGGAGTGCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCaa < 2:1607791/149‑1 (MQ=255) cGGCAGAAAGGGAGTGCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCaaa < 2:1607792/149‑1 (MQ=255) ggCAGAAAGGGAGGGCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGGACAACAAGAAATAACGGAATCAGGCTGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAACAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTGaaaa < 1:1607793/149‑1 (MQ=255) gCAGAAAGGGAGTGCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCg > 1:1607827/1‑131 (MQ=255) aGAAAGGGAGTGCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATCACGGAATCCGGCGGGCAATCTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGtt < 2:1607794/149‑1 (MQ=255) gAAAGGGAGTGCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTATTGGTGGGTCaaattttg > 2:1607902/1‑144 (MQ=255) gAAAGGGAGTGCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCaaattttg > 2:1607898/1‑144 (MQ=255) aaaGGGAGTGCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGc < 2:1607795/149‑1 (MQ=255) aaGGGAGTGCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGcc < 1:1607796/149‑1 (MQ=255) aGGGAGTGCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCg < 1:1607797/149‑1 (MQ=255) aGTGCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTaa < 2:1607799/149‑1 (MQ=255) aGTGCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAAGCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTaa < 1:1607798/149‑1 (MQ=255) gTGCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTa > 1:1607838/1‑123 (MQ=255) aaCGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCg > 1:1607857/1‑116 (MQ=255) aaCGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAATGTTGCCGTTAAggag > 1:1607820/1‑146 (MQ=255) aaCGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCACGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGGCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTTCCGTTAAGGTgg < 1:1607800/149‑1 (MQ=255) aCGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTa > 1:1607859/1‑118 (MQ=255) aCGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTggg < 1:1607801/149‑1 (MQ=255) aaTACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGt > 1:1607847/1‑113 (MQ=255) aaTACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGt > 1:1607941/1‑113 (MQ=255) aTACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCaa < 1:1607802/149‑1 (MQ=255) tACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCaaa < 1:1607803/149‑1 (MQ=255) tACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTGAATGTTGGGTCAAAAGATGCATTTAAGGAGGGTCaaa > 2:1607936/1‑149 (MQ=255) cAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCg > 1:1607896/1‑107 (MQ=255) cAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTAAAAAGTTGCCTTTAAGGAGTGTCaatatt > 1:1607925/1‑145 (MQ=255) gTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCg > 1:1607823/1‑105 (MQ=255) ttattaTTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGTCGTGCAATTTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGc < 2:1607805/149‑1 (MQ=255) ttattaTTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGc < 2:1607804/149‑1 (MQ=255) tattatTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCg > 1:1607836/1‑103 (MQ=255) tattatTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGt > 1:1607864/1‑104 (MQ=255) tattatTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGcc < 2:1607806/149‑1 (MQ=255) tattCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGtt < 1:1607807/149‑1 (MQ=255) attCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCg > 1:1607887/1‑99 (MQ=255) attCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTa < 1:1607808/149‑1 (MQ=255) tCAAGCCGTACAACATGAAATAAAGGAATCAGTAGTGCAATTTTCACGCATTTTCTTTGCCTTTATTCCATGAATTCAGGTGGGTAAAAAGTTGCCGTTATTTGTGGGTCAAAAGTTGCCTTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAg < 2:1607809/149‑1 (MQ=25) cAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCg > 1:1607822/1‑96 (MQ=255) aaGCCGTACAACATGAAATATCGGAATCAGGCGGGAAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGGCGTTATTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGt < 2:1607810/149‑1 (MQ=255) aGCCGTACCCCCAGAAATCAAGGCATCAGTCTCGCACTTTTCCCGCCATTTCTTTTCCTTTAATCCATGCATTCAGGTGGGGCATAAGTTCCCGTTAGCTTTGGGTCAAAAGTTGCCTTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTg < 2:1607817/149‑1 (MQ=16) gTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCg > 1:1607908/1‑90 (MQ=255) agaacaTGAAATAACGGAATCCGCAGGGCATTGTTCCCGCCATTGGTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGGGGGCCAAAAGGTGGCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCaa < 1:1607812/147‑1 (MQ=25) acaacaTGAAATTACGGACTCAGGCTGGCACTGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCATAATTCCATGAATTCAGGGGGGGCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCaa < 1:1607811/149‑1 (MQ=38) aacaTGATATTAAGTAATCAGTTGGGCATTTATTCAGCCTTTTGTTTTCCTTAATTAAATGAATTCAGGTGGGTTTTAATTTGCCCTTATTGGTGGGTAATTTGTTGCCTTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCaaaa < 2:1607835/149‑1 (MQ=16) caTGAAATAACGGAATCAGGCTTGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGCCAAAAGGTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCTTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGTGTCaaa < 1:1607813/146‑1 (MQ=39) aTGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCg > 1:1607829/1‑83 (MQ=255) aTGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGt > 1:1607868/1‑84 (MQ=255) ttaaaTAAAGTAATCCGTCGGGCAATTTTCCCGCATTTTTTTTTCCATAAATCCATGAATTCAGGTGGGAAAAAATTTGCCTTTATTGGTGGGTAAAAAGTTGCCTTTAAGGTGGGTAAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTg < 2:1607815/147‑1 (MQ=21) tGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGGGGGGGAAAAGTTGACGTTAAGGTGGGTGTAATGTTg > 1:1607960/1‑149 (MQ=39) aaaTAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCg > 1:1607855/1‑80 (MQ=255) aaaTAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCg > 1:1607881/1‑80 (MQ=255) aaTAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGt > 1:1607951/1‑80 (MQ=255) cccGGAATCCGCTGGGCACTGTTGCCGCCTTTTCTTTTCCTTATATCCATGAATTCAGGTGGCTCAAAAGTAGGCGTTATTGTTGGGTCAATAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGt < 2:1607816/147‑1 (MQ=21) aaTCCGCCGGGCACTTTTCCCGCCTTATGTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGATGCCGTTAGTGGTGGGTCAATAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGaa < 2:1607814/149‑1 (MQ=37) tCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCg > 1:1607880/1‑69 (MQ=255) ggCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTa > 1:1607972/1‑69 (MQ=255) catttttCCAGCCTTCCGTTTTCCTTAATTAAATGAATCCCGGTTGCTATAAATAAGGCTTTATTGGGGGGTAATAAGTTGCCTTTACGGTGGGTAAAATGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTa < 2:1607832/144‑1 (MQ=12) ttCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTATTGGTGGGTCAAAATTTGCCTTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGAAGTTAAGGTGGCGCAAATTTTGACTAGTAAGAATTGAACAATTAAGAAt > 2:1607863/1‑149 (MQ=25) tCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTAAAGGAGTGTCAAAAGTTGCCGTAAAGGTGGCTCAAAATTAGACGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAAt > 1:1607978/1‑148 (MQ=38) tCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGATAATGGAGGGTAAAAAGATGCCTTTAAGGAGGGGAAAAAGTTGCAGGAAACCGGAGGCAAAAATAGACGAGAAAGCATTGGACTATTAAGatta > 2:1607874/1‑146 (MQ=255) ccGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCTTTAAGGAGGGTCAAAATTTGAAGTAAAGGTGGGGGAAAATTTGACGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAAttat > 2:1607937/1‑147 (MQ=37) ccGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAATGGTGGGTAAAAATTTGCCTTTAAGGAGGGTCAAAATTTGAAGTTAAGGTGTCTGAAATTTTGACTAGAAAGAATTATAAAATTAAAAAtaat > 2:1607920/1‑146 (MQ=16) ccTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGAGGGGAAAAAGTTGCAGTTAACGTGGGTCAAAAGTTGACTAGTAAGAATTCTAATATTAAGAATTCTAgg > 1:1607844/1‑149 (MQ=37) cTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTa > 1:1607980/1‑51 (MQ=255) tttCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCg > 1:1607923/1‑46 (MQ=255) tCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGtt > 1:1607929/1‑46 (MQ=255) tCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTAAAGGAGGGTCAAAAGTTGCCGATAAGGTGTGTCAAAATTTTCCTAGTAAGAATTCTACAATTAAGAATTATAGGCGCCg > 2:1607989/1‑149 (MQ=37) cTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTGAGTGGTGGGTCAAATGTTGCCGTTAAGGGGGGGCAAAAGTTGGCGATAAGCGGGCGGAAATGTTGACGAGGAAGGAGTGTAATATTAAGATTTGTAGGCGACgg > 2:1607939/1‑149 (MQ=19) tttGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGtt > 1:1607845/1‑44 (MQ=255) tGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGt > 1:1607948/1‑41 (MQ=255) ccTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCg > 1:1607994/1‑38 (MQ=255) ccTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTAAAAATTTGCCGTTTAGGAGGCTCAAAAGTTTACGTATAGGTGGCTCAAATTTTGACGAGAAAGGATTGTACAATTATGATTTATACGCGTCggg > 2:1607990/1‑145 (MQ=16) tAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCg > 1:1607938/1‑35 (MQ=255) atttcattGAATTCAGTTGTCTTAAAAGATGCCTTTAGTGTTGGCTCATATCCAGCCTTTAATGTGGGTAAAAAGTTGCCCTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGtttttt < 2:1607860/142‑1 (MQ=19) tCCATGAATTCCTGTGGGTCAAAATACGCCCTTACTGGTGGGTAAAATGTCGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCTTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGc < 2:1607819/149‑1 (MQ=37) tCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTATTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTACCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGc < 2:1607818/149‑1 (MQ=255) aGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGGGGGGCAAATGTTGTCGAGTAAGGGTTGTACTATTATGATTTCTAGGCGGCGGGAGTTTTTTAGCGTCCcggtcgg > 2:1608010/1‑149 (MQ=25) gTCAAAATAAGCCCTTACGGGGGGGTAAAAAGCTGCCTTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATag < 2:1607829/149‑1 (MQ=37) tCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTTGGTCAAAATTTGCCGTTAAGGTGGGGCAAAATTTGACTAGTAAGAATTCTACAATTAAGAATTCTAGGCGACGTGAGTTTTTTAGACTAACGCTCCGTCAt > 2:1607944/1‑146 (MQ=25) gTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTTAAGAGAAAGAATTCTACAATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGAATCACGGACGGTCATAGAGAGTCg > 2:1607907/1‑149 (MQ=37) ccGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAg > 1:1608000/1‑120 (MQ=255) cGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTAATATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTag > 1:1607965/1‑149 (MQ=255) gTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCt > 1:1608013/1‑146 (MQ=255) gTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTGAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTc > 1:1608019/1‑142 (MQ=255) | GGCTATATACCAGGATCGGCAGAAAGGGAGTGCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAG > U00096/2560824‑2561119 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |