New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | U00096 | 1783442 = | 198 (1.070) | 3 (0.020) | 3/290 | 25.5 | 1.5% | coding (466/1701 nt) | fadK | short chain acyl‑CoA synthetase |
? | U00096 | = 3785367 | 187 (1.010) | coding (108/1545 nt) | gpmM | 2,3‑bisphosphoglycerate‑independent phosphoglycerate mutase | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 188 total aligned reads displayed.
AAATTACGCAAATTTTGACTCTTGAGTATGAGGTTGTCGCAATGTTGGTTTCTAAAAAACCTATGGTACTGGTGATTCTGGATGGCTATGGCTATCGCGAAGAACAGCAGGATAACGCCATTTTTAGTGCTAAAACCCCGGTAATGGATGCACTGTGGGCCAATCGTCCGCATACCCTAATCGACGCTTCCGGTCTGGAAGTCGGTCTGCCTGACCGTCAGATGGGTAACTCCGAAGTAGGCCACGTTAACCTGGGTGCCGGCCGCATCGTGTATCAGGACCTGACTCGTCTGGAC > U00096/3785219‑3785514 | aaaTTACGCAAATTTTGACTCTTGAGTATGAGGTTGTCGCAATGTTGGTTTCTAAAAAACCTATGGTACTGGTGATTCTGGATGGCTATGGCTATCGCGAAGAACAGCAGGATAACGCCATTTTTAGTGCTAAAACCCCGGTAATGGAt < 1:2417184/149‑1 (MQ=255) ttACGCAAATTTTGACTCTTGAGTATGAGGTTGTCGCAATGTTGGTTTCTAAAAAACCTATGGTACTGGTGATTCTGGATGGCTATGGCTATCGCGAAGAACAGCAGGATAACGCCATTTTTAGTGCTAAAACCCCGGTAATGGATGc < 1:2417186/148‑1 (MQ=255) aCGCAAATTTTGACTCTTGAGTATGAGGTTGTCGCAATGTTGGTTTCTAAAAAACCTATGGTACTGGTGATTCTGGATGGCTATGGCTATCGCGAAGAACAGCAGGATAACGCCATTTTTAGTGCTAAAACCCCGGTAATGGATGCACt > 2:2417240/1‑149 (MQ=255) gCAAATTTTGACTCTTGAGTATGAGGTTGTCGCAATGTTGGTTTCTAAAAAACCTATGGTACTGGTGATTCTGGATGGCTATGGCTATCGCGAAGAACAGCAGGATAACGCCATTTTTAGTGCTAAAACCCCGGTAATGGATGCACtgt < 2:2417187/149‑1 (MQ=255) aaTTTTGACTCTTGAGTATGAGGTTGTCGCAATGTTGGTTTCTAAAAAACCTATGGTACTGGTGATTCTGGATGGCTATGGCTATCGCGAAGAACAGCAGGATAACGCCATTTTTAGTGCTAAAACCCCGGTAATGGATGCACTGTggg < 2:2417189/149‑1 (MQ=255) aTTTTGACTCTTGAGTATGAGGTTGTCGCAATGTTGGTTTCTAAAAAACCTATGGTACTGGTGATTCTGGATGGCTATGGCTATCGCGAAGAACAGCAGGATAACGCCATTTTTAGTGCTAAAACCCCGGTAATGGATGCACTGTGGGc > 2:2417258/1‑149 (MQ=255) ttttGACTCTTGAGTATGAGGTTGTCGCAATGTTGGTTTCTAAAAAACCTATGGTACTGGTGATTCTGGATGGCTATGGCTATCGCGAAGAACAGCAGGATAACGCCATTTTTAGTGCTAAAACCCCGGTAATGGATGCACTGTGGGcc > 2:2417312/1‑149 (MQ=255) ttttGACTCTTGAGTATGAGGTTGTCGCAATGTTGGTTTCTAAAAAACCTATGGTACTGGTGATTCTGGATGGCTATGGCTATCGCGAAGAACAGCAGGATAACGCCATTTTTAGTGCTAAAACCCCGGTAATGGATGCACTGTGGGcc > 1:2417263/1‑149 (MQ=255) tttGACTCTTGAGTATGAGGTTGTCGCAATGTTGGTTTCTAAAAAACCTATGGTACTGGTGATTCTGGATGGCTATGGCTATCGCGAAGAACAGCAGGATAACGCCATTTTTAGTGCTAAAACCCCGGTAATGGATGCACTGTGGGCCa > 2:2417242/1‑149 (MQ=255) ttGACTCTTGAGTATGAGGTTGTCGCAATGTTGGTTTCTAAAAAACCTATGGTACTGGTGATTCTGGATGGCTATGGCTATCGCGAAGAACAGCAGGATAACGCCATTTTTAGTGCTAAAACCCCGGTAATGGATGCACTGTGGGCCaa > 2:2417237/1‑149 (MQ=255) tGACTCTTGAGTATGAGGTTGTCGCAATGTTGGTTTCTAAAAAACCTATGGTACTGGTGATTCTGGATGGCTATGGCTATCGCGAAGAACAGCAGGATAACGCCATTTTTAGTGCTAAAACCCCGGTAATGGATGCACTGTGGGCCAAt < 2:2417193/149‑1 (MQ=255) tGACTCTTGAGTATGAGGTTGTCGCAATGTTGGTTTCTAAAAAACCTATGGTACTGGTGATTCTGGATGGCTATGGCTATCGCGAAGAACAGCAGGATAACGCCATTTTTAGTGCTAAAACCCCGGTAATGGATGCACTGTGGGCCAAt < 1:2417192/149‑1 (MQ=255) gACTCTTGAGTATGAGGTTGTCGCAATGTTGGTTTCTAAAAAACCTATGGTACTGGTGATTCTGGATGGCTATGGCTATCGCGAAGAACAGCAGGATAACGCCATTTTTAGTGCTAAAACCCCGGTAATGGATGCACTGTGGGCCAATc < 1:2417196/149‑1 (MQ=255) gACTCTTGAGTATGAGGTTGTCGCAATGTTGGTATCTAAAAAACCTATGGTACTGGTGATTCTGGATGGCTATGGCTATCGCGAAGAACAGCAGGATAACGCCATTTTTAGTGCTAAAACCCCGGTAATGGATGCACTGTGGGCCAATc < 2:2417194/149‑1 (MQ=255) ctctTGAGTATGAGGTTGTCGCAATGTTGGTTTCTAAAAAACCTATGGTACTGGTGATTCTGGATGGCTATGGCTATCGCGAAGAACAGCAGGATAACGCCATTTTTAGTGCTAAAACCCCGGTAATGGATGCACTGTGGGCCAATCGt > 2:2417245/1‑149 (MQ=255) tctTGAGTATGAGGTTGTCGCAATGTTGGTTTCTAAAAAACCTATGGTACTGGTGATTCTGGATGGCTATGGCTATCGCGAAGAACAGCAGGATAACGCCATTTTTAGTGCTAAAACCCCGGTAATGGATGCACTGTGGGCCAATCGTc < 2:2417198/149‑1 (MQ=255) ttGAGTATGAGGTTGTCGCAATGTTGGTTTCTAAAAAACCTATGGTACTGGTGATTCTGGATGGCTATGGCTATCGCGAAGAACAGCAGGATAACGCCATTTTTAGTGCTAAAACCCCGGTAATGGATGCACTGTGGGCCAATCGt > 1:2417299/1‑146 (MQ=255) tGAGTATGAGGTTGTCGCAATGTTGGTTTCTAAAAAACCTATGGTACTGGTGATTCTGGATGGCTATGGCTATCGCGAAGAACAGCAGGATAACGCCATTTTTAGTGCTAAAACCCCGGTAATGGATGCACTGTGGGCCAATCGTc < 1:2417200/146‑1 (MQ=255) 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cAATGTTGGTTTCTAAAAAACCTATGGTACTGGTGATTCTGGATGGCTATGGCTATCGCGAAGAACAGCAGGATAACGCCATTTTTAGTGCTAAAACCCCGGTAATGGATGCACTGTGGGCCAATCGTCCGCATACCCTAATCGACg > 1:2417222/1‑147 (MQ=255) aaTGTTGGTTTCTAAAAAACCTATGGTACTGGTGATTCTGGATGGCTATGGCTATCGCGAAGAACAGCAGGATAACGCCATTTTTAGTGCTAAAACCCCGGTAATGGATGCACTGTGGGCCAATCGTCCGCATACCCTAATCGACGCtt > 2:2417265/1‑149 (MQ=255) aTGTTGGTTTCTAAAAAACCTATGGTACTGGTGATTCTGGATGGCTATGGCTATCGCGAAGAACAGCAGGATAACGCCATTTTTAGTGCTAAAACCCCGGTAATGGATGCACTGTGGGCCAATCGTCCGCATACCCTAATCGACGc < 1:2417208/146‑1 (MQ=255) aTGTTGGTTTCTAAAAAACCTATGGTACTGGTGATTCTGGATGGCTATGGCTATCGCGAAGAACAGCAGGATAACGCCATTTTTAGTGCTAAAACCCCGGTAATGGATGCACTGTGGGCCAATCGTCCGCATACCCTAATCGACGCtt > 1:2417251/1‑148 (MQ=255) tGTTGGTTTCTAAAAAACCTATGGTACTGGTGATTCTGGATGGCTATGGCTATCGCGAAGAACAGCAGGATAACGCCATTTTTAGTGCTAAAACCCCGGTAATGGATGCACTGTGGGCCAATCGTCCGCATACCCTAATCGACGCTTcc < 2:2417210/149‑1 (MQ=255) 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tATGGTACTGGTGATTCTGGATGGCTATGGCTATCGCGAAGAACAGCAGGATAACGCCATTTTTAGTGCTAAAACCCCGGTAATGGATGCACTGTGGGCCAATCGTCCGCATACCCTAATCGACGCTTCCGGTCTGGAAGTCGGTCTGc > 1:2417316/1‑149 (MQ=255) tATGGTACTGGTGATTCTGGATGGCTATGGCTATCGCGAAGAACAGCAGGATAACGCCATTTTTAGTGCTAAAACCCCGGTAATGGATGCACTGTGGGCCAATCGTCCGCATACCCTAATCGACGCTTCCGGTCTGGAAGTCGGTCTGc > 2:2417288/1‑149 (MQ=255) tATGGTACTGGTGATTCTGGATGGCTATGGCTATCGCGAAGAACAGCAGGATAACGCCATTTTTAGTGCTAAAACCCCGGTAATGGATGCACTGTGGGCCAATCGTCCGCATACCCTAATCGACGCTTCCGGTCTGGAAGTCGGTCTGc > 2:2417274/1‑149 (MQ=255) tGGTACTGGTGATTCTGGATGGCTATGGCTATCGCGAAGAACAGCAGGATAACGCCATTTTTAGTGCTAAAACCCCGGTAATGGCTGCACTGTGGGCCAATCGTCCGCATACCCTAATCGACGCTTCCGGTCTGGAAGTCGGTCTGCCt > 2:2417323/1‑149 (MQ=255) aCTGGTGATTCTGGATGGCTATGGCTATCGCGAAGAACAGCAGGATAACGCCATTTTTAGTGCTAAAACCCCGGTAATGGATGCACTGTGGGCCAATCGTCCGCATACCCAAATCGACGCTTCCGGTCTGGAAGTCGGTCTGCCTGAcc > 2:2417270/1‑149 (MQ=255) 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tttttAGTGCTAAACCCCCGGTAATGGATGCACTGTGGGCCAATCGTCCGCATACCCTAATAGACGCTTCCGGTCTGGAAGTCGGTCTGCCTGACCGTCAGATGGGTAACTCCGAAGTAGGCCACGTTAACCTGGGTgccggc > 1:2417327/1‑143 (MQ=255) ttttAGTGCTAAAACCCCGGTAATGGATGCACTGTGGGCCAATCGTCCGCATACCCTAATCGACGCTTCCGGGCTGGAAGTCGGTCTGCCTGACCGTCAGATGGGTAACTCCGAAGTAGGCCACGTTAACCTGGGTGCCGGCCGCATCg < 1:2417260/149‑1 (MQ=255) tttAGTGCTAAAACCCCGGTAATGGATGCACTGTGGGCCAATCGTCCGCATACCCTAATCGACGCTTCCGGTCTGGAAGTCGGTCTGCCTGACCGTCAGATGGGTAACTCCGAAGTAGGCCACGTTAACCTGGGTGCCGGCCGCATCgt < 2:2417261/149‑1 (MQ=255) ttAGTGCTAAAACCCCGGTAATGGATGCACTGTGGGCCAATCGTCCGCATACCCTAATCGACGATTCCGGTCTGGAAGTCGGTCTGCCTGACCGTCAGATGGGTAACTCCGAAGTAGGCCACGTTAACCTGGGTGACGGCCGCATCgtg > 2:2417349/1‑149 (MQ=255) gCTAAAACCCCGGTAATGGATGCACTGTGGGCCAATCGTCCGCATACCCTAATCGACGCTTCCGGTCTGGAAGTCGGTCTGCCTGACCGTCAGATGGGTAACTCCGAAGTAGGCCACGTTAACCTGGGTGCCGGCCGCATCGTGTATCa < 2:2417263/149‑1 (MQ=255) cTAAAACCCCGGTAATGGATGCACTGTGGGCCAATCGTCCGCATACCCTAATCGACGCTTCCGGTCTGGAAGTCGGTCTGCCTGACCGTCAGATGGGTAACTCCGAAGTAGGACACGTTAACCTGGGTGCCGGCCGCATCGTGTATc > 1:2417329/1‑147 (MQ=255) aaaaCCCCGGTAATGGATGCACTGTGGGCCAATCGTCCGCATACCCTAATCGACGCTTCCGGTCTGGAAGTCGGTCTGCCTGACCGTCAGATGGGTAACTCCGAAGTAGGCCACGTTAACCTGGGTGCCGGCCGCATCGTGTATCAGGa < 1:2417265/149‑1 (MQ=255) aaaaCCCCGGTAATGGATGCACTGTGGGCCAATCGTCCGCATACCCTAATCGACGCTTCCGGTCTGGAAGTCGGTCTGCCTGACCGTCAGATGGGTAACTCCGAAGTAGGCCACGTTAACCTGGGTGCCGGCCGCATCGTGTATCAGGa < 1:2417266/149‑1 (MQ=255) aaCCCCGGTAATGGATGCACTGTGGGCCAATCGTCCGCATACCCTAATCGACGCTTCCGGTCTGGAAGTCGGTCTGCCTGACCGTCAGATGGGTAACTCCGAAGTAGGCCACGTTAACCTGGGTGCCGGCCGCATCGTGTATCAGGAcc > 1:2417337/1‑149 (MQ=255) ccccGGTAATGGATGCACTGTGGGCCAATCGTCCGCATACCCTAATCGACGCTTCCGGTCTGGAAGTCGGTCTGCCTGACCGTCAGATGGGTAACTCCGAAGTAGGCCACGTTAACCTGGGTGCCGGCCGCATCGTGTATCAGGACCTg > 2:2417307/1‑149 (MQ=255) ccccGGTAATGGATGCACTGTGGGCCAATCGTCCGCATACCCTAATCGACGCTTCCGGTCTGGAAGTCGGTCTGCCTGACCGTCAGATGGGTAACTCCGAAGTAGGCCACGTTAACCTGGGTGCCGGCCGCATCGTGTATCAGGACCTg > 2:2417309/1‑149 (MQ=255) cccGGTAATGGATGCACTGTGGGCCAATCGTCCGCATACCCTAATCGACGCTTCCGGTCTGGAAGTCGGTCTGCCTGACCGTCAGATGGGTAACTCCGAAGTAGGCCACGTTAACCTGGGTGCCGGCCGCATCGTGTATCAGGACCTGa > 1:2417341/1‑149 (MQ=255) ccGGTAATGGATGCACTGTGGGCCAATCGTCCGCATACCCTAATCGACGCTTCCGGTCTGGAAGTCGGTCTGCCTGACCGTCAGATGGGTAACTCCGAAGTAGGCCACGTTAACCTGGGTGCCGGCCGCATCGTGTATCAGGACCTGAc < 2:2417268/149‑1 (MQ=255) ccGGTAATGGATGCACTGTGGGCCAATCGTCCGCATACCCTAATCGACGCTTCCGGTCTGGAAGTCGGTCTGCCTGACCGTCAGATGGGTAACTCCGAAGTAGGCCACGTTAACCTGGGTGCCGGCCGCATCGTGTATCAGGACCTGAc < 2:2417267/149‑1 (MQ=255) cGGTAATGGATGCACTGTGGGCCAATCGTCCGCATACCCTAATCGACGCTTCCGGTCTGGAAGTCGGTCTGCCTGACCGTCAGATGGGTAACTCCGAAGTAGGCCACGTTACCCTGGGTGCCGGCCGCATCGTGTATCAGGACCTGACt > 2:2417384/1‑149 (MQ=255) gTAATGGATGCACTGTGGGCCAATCGTCCGCATACCCTAATCGACGCTTCCGGTCTGGAAGTCGGTCTGCCTGACCGTCAGATGGGTAACTCCGAAGTAGGCCACGTTAACCTGGGTGCCGGCCGCATCGTGTATCAGGACCTGACTc < 1:2417270/148‑1 (MQ=255) gTAATGGATGCACTGTGGGCCAATCGTCCGCATACCCTAATCGACGCTTCCGGTCTGGAAGTCGGTCTGCCTGACCGTCAGATGGGTAACTCCGAAGTAGGCCACGTTAACCTGGGTGCCGGCCGCATCGTGTATCAGGACCTGACTCg > 2:2417374/1‑149 (MQ=255) aaTGGATGCACTGTGGGCCAATCGTCCGCATACCCTAATCGACGCTTCCGGTCTGGAAGTCGGTCTGCCTGACCGTCAGATGGGTAACTCCGAAGTAGGCCACGTTAACCTGGGTGCCGGCCGCATCGTGTATCAGGACCTGACTCGTc > 2:2417362/1‑149 (MQ=255) aTGGATGCACTGTGGGCCAATCGTCCGCATACCCTAATCGACGCTTCCGGTCTGGAAGTCGGTCTGCCTGACCGTCAGATGGGTAACTCCGAAGTAGGCCACGTTAACCTGGGTGCCGGCCGCATCGTGTATCAGGACCTGACTCGTCt < 1:2417274/149‑1 (MQ=255) aTGGATGCACTGTGGGCCAATCGTCCGCATACCCTAATCGACGCTTCCGGTCTGGAAGTCGGTCTGCCTGACCGTCAGATGGGTAACTCCGAAGTAGGCCACGTTAACCTGGGTGCCGGCCGCATCGTGTATCAGGACCTGACTCGTCt < 2:2417272/149‑1 (MQ=255) tGGATGCACTGTGGGCCAATCGTCCGCATACCCTAATCGACGCTTCCGGTCTGGAAGTCGGTCTGCCTGACCGTCAGATGGGTAACTCCGAAGTAGGCCACGTTAACCTGGGTGCCGGCCGCATCGTGTATCAGGACCTGACTCGTCTg < 2:2417277/149‑1 (MQ=255) aTGCACTGTGGGCCAATCGTCCGCATACCCTAATCGACGCTTCCGGTCTGGAAGTCGGTCTGCCTGACCGTCAGATGGGTAACTCCGAAGTAGGCCACGTTAACCTGGGTGCCGGCCGCATCGTGTATCAGGACCTGACTCGTCTGGAc > 1:2417351/1‑149 (MQ=255) | AAATTACGCAAATTTTGACTCTTGAGTATGAGGTTGTCGCAATGTTGGTTTCTAAAAAACCTATGGTACTGGTGATTCTGGATGGCTATGGCTATCGCGAAGAACAGCAGGATAACGCCATTTTTAGTGCTAAAACCCCGGTAATGGATGCACTGTGGGCCAATCGTCCGCATACCCTAATCGACGCTTCCGGTCTGGAAGTCGGTCTGCCTGACCGTCAGATGGGTAACTCCGAAGTAGGCCACGTTAACCTGGGTGCCGGCCGCATCGTGTATCAGGACCTGACTCGTCTGGAC > U00096/3785219‑3785514 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |