| Predicted mutation | ||||||
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| MC JC | U00096 | 1,978,503 | Δ776 bp | insB5–insA5 | insB5, insA5 | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
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| * | * | ÷ | U00096 | 1978503–1979270 | 1979278 | 9–776 | 120 [0] | [0] 123 | insB5–insA5 | insB5,insA5 |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | U00096 | = 1978502 | 0 (0.000) | 112 (1.220) | 85/276 | 0.1 | 100% | intergenic (‑305/+16) | flhD/insB5 | DNA‑binding transcriptional dual regulator FlhD/IS1 family protein InsB |
| ? | U00096 | 1979279 = | 0 (0.000) | intergenic (‑64/‑474) | insA5/uspC | IS1 family protein InsA/universal stress protein C | |||||
Only 100 of 120 total aligned reads displayed.
AATGGGTCTTTACACTTATCTAAGATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAA > U00096/1978358‑1978648 | aaTGGGTCTTTACACTTATCTAAGATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtata < 1:634973‑M1/149‑5 (MQ=255) aTGGGTCTTTACACTTATCTAAGATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataa < 1:1405763‑M1/149‑6 (MQ=255) aTGGGTCTTTACACTTATCTAAGATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataa < 1:634974‑M1/149‑6 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |