New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | U00096 | 781369 = | 119 (0.530) | 43 (0.190) +G |
11/290 | 24.6 | 33.0% | noncoding (1/76 nt) | lysZ | tRNA‑Lys |
? | U00096 | = 2521128 | 57 (0.250) | intergenic (+2/‑45) | valX/valY | tRNA‑Val/tRNA‑Val | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. |
GCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < U00096/781494‑781369 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACC < U00096/2521128‑2521052 | GCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGAGAGGTTGGTGAat > 2:581841/1‑139 ATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCC > 2:581846/1‑149 TTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCC < 1:581846/149‑1 TCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAAC < 2:581843/126‑1 TCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAAC > 1:581843/1‑126 AGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGAGTGGT < 2:581844/100‑1 TTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGAGTGGTGGGTGATGACGG > 2:581700/1‑101 AAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGAGTGGTGGGTGATGACGGGA < 1:581700/101‑1 AAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGAGTGGTGGGTGAT < 1:581841/94‑1 AATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTT < 1:581681/122‑1 AATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTT > 2:581681/1‑122 TGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAA < 2:581747/149‑1 TGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGAGTGGTGGGTGATGACG < 2:581833/94‑1 TGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGAGTGGTGGGTGATGAC < 1:581856/93‑1 GGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAAT > 2:581662/1‑149 GGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTAAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAAT > 2:581660/1‑149 GTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATC < 1:581739/149‑1 TGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCA < 2:581762/149‑1 TGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCA < 2:581715/149‑1 GGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCAC < 2:1246068/149‑1 GGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCAC < 2:581712/149‑1 GGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACC < 2:581730/149‑1 GGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACC < 2:581677/149‑1 TCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCA < 1:581670/132‑1 TCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCT > 2:581679/1‑108 GTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGACTGGTGGTTGAGGGCGGGATCGAACCTCCGACCCACTCATTATAAGTGAGGTGAACTCCCAG > 2:581670/1‑131 CAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTG < 1:581679/108‑1 CGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAA < 2:581839/83‑1 TGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCAC > 1:581659/1‑128 CGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCC < 2:581834/85‑1 CGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGAG < 1:581832/52‑1 CGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGAG > 2:581832/1‑52 ACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAA < 1:581706/94‑1 CCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCG < 2:581838/78‑1 AATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCG > 1:581718/1‑45 ATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAAGTGAGCTAACGACCCGAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAAC < 1:581842/70‑1 TTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGAGTGGTGG > 2:581840/1‑51 TTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGAGTGGTGG < 1:581840/51‑1 TTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCG > 1:581716/1‑43 AAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGAGAGGTGGTTGAAGAAGGGATCTAACCTCCGACCCACTCa > 2:581845/1‑75 GTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGAGTGGTGGGTGATGACGGGA < 2:581837/53‑1 AACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAA > 1:581695/1‑55 CTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGAGTGGTGGGTGAT < 1:581831/41‑1 AACGACCCGAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGA > 2:581661/1‑76 CCCGAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAA < 1:581661/76‑1 GAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGC > 2:581664/1‑70 GAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGC < 1:581664/70‑1 | GCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < U00096/781494‑781369 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACC < U00096/2521128‑2521052 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |