| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | U00096 | = 1287084 | 60 (0.270) | 15 (0.080) | 8/254 | 24.6 | 9.9% | noncoding (153/171 nt) | rttR | small RNA RttR |
| ? | U00096 | = 4175537 | 221 (1.140) | noncoding (66/85 nt) | tyrU | tRNA‑Tyr | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
GCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > U00096/1286919‑1287084‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCTGTGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCGGACTTGATGGTGCCGACTACCGGAATCGAACTGGTGACCTACTGATTACAAGTCAGTTGCTCTACCTACTGAGCTAAGTCG < U00096/4175537‑4175390 GCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGATAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATG > 2:959793/1‑149 GCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGT > 2:983299/1‑149 CCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTTATTGCGGATTCGATTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGG > 2:959805/1‑149 GGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTGGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGG > 2:959798/1‑149 GGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGCCGCTCGAGCCGAACCTTTGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGG < 1:959691/141‑1 TCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGG < 2:959692/133‑1 TCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGG > 1:959692/1‑133 CAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTTATTGCGGATTCGATTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGG > 2:959803/1‑123 AACGCTCTCTCGCTGTCGCTCGAGCCGAACCTTCGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTTATTGCGGATTCGTTTGTAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGG < 1:959806/128‑1 AACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGGTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCATCGAcgg > 2:959836/1‑146 ACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGA > 2:959806/1‑128 CGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGATTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTAGAAACATCGAAGacc > 2:959823/1‑146 CGCTCCAGCCGAACCTTCGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCCGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGA < 1:959702/113‑1 GCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGATTGAAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGT > 2:959814/1‑103 GCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGG < 1:959703/108‑1 CTCAAGGCGAACCTTCGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTG < 1:959705/106‑1 GAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATT > 1:959846/1‑114 CGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGA < 1:959708/108‑1 AACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATT > 1:959874/1‑108 CCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTGGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGG > 2:959827/1‑93 ttgGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGTCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGG < 2:959711/98‑1 GTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGAT > 1:959712/1‑83 GTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGAT < 2:959712/83‑1 GAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATT > 1:959830/1‑98 GAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATT > 1:959875/1‑98 GAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGG > 1:959862/1‑91 GCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATT > 1:959834/1‑95 TTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGA > 1:959718/1‑91 TTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGA < 2:959718/91‑1 CTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATT > 1:959872/1‑91 TCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGGTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTC > 1:959888/1‑91 TCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGAT > 1:959899/1‑89 CATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTCATTGCGGATTCGGTTGGCAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTC < 1:959838/90‑1 ATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCG > 2:959838/1‑90 CCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATT > 1:959841/1‑86 TCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGT < 2:959723/71‑1 TCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATT > 1:959843/1‑83 CCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGG > 2:959844/1‑72 CGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTC > 1:959850/1‑80 CGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATT > 1:959847/1‑79 ATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATT > 1:959852/1‑76 GAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATT > 1:959858/1‑69 ATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGA < 1:959737/59‑1 ATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGA > 2:959737/1‑59 TTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATT > 1:959863/1‑64 TTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGA > 2:959738/1‑62 TTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGA < 1:959738/62‑1 TGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTC < 1:959739/63‑1 TGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTC > 2:959739/1‑63 GATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATT > 1:959892/1‑61 GATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTG > 1:959741/1‑50 ATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATT > 1:959883/1‑60 GGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATG > 1:959742/1‑38 TTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATT > 1:959886/1‑47 TGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAA > 2:959893/1‑58 TGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAAC > 2:959890/1‑51 TGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAAC < 1:959890/51‑1 GAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAA < 2:959742/38‑1 AGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGT < 1:959887/56‑1 GTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATT > 1:959891/1‑41 AGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTC > 2:959896/1‑52 AGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTC < 1:959896/52‑1 GGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATT > 1:959998/1‑36 GGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATT > 1:959881/1‑35 TTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGA > 1:960087/1‑40 TGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCTGTGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCGGACTTGATGGTGCCGACTACCGGAATCGAACTGGTGACCTACTGATTACAAGTCAGTTGCTCT > 2:3238358/1‑149 GTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCTGTGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCGGACTTGATGGTGCCGACTACCGGAATCGAACTGGTGACCTACTGATTACAAGTCAGTTGCTCTAC < 2:3238506/149‑1 GTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCTGTGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCGGACTTGATGGTGCCGACTACCGGAATCGAACTGGTGACCTACTGATTACAAGTCAGTTGCTCTACCTA > 2:3238357/1‑149 GGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCTGTGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCGGACTTGATGGTGCCGACTACCGGAATCGAACTGGTGACCTACTGATTACAAGTCAGTTGCTCTACCTACT < 2:3238507/149‑1 GGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCTGTGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCGGACTTGATGGTGCCGACTACCGGAATCGAACTGGT < 1:3238531/113‑1 GGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCTGTGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCGGACTTGATGGTGCCGACTACCGGAATCGAACTGGTGACCTACTGATTACAAGTCAGTTGCTCTACCTACTGAG > 2:3238356/1‑149 GAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCTGTGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCGGACTTGATGGTGCCGACTACCGGAATCGAACTGGTGACCTACTGATTACAAGTCAGTTGCTCTACCTACTGAGC > 2:3238355/1‑149 AAGGATTCGAACCTTCGAAGTCTGTGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCGGACTTGATGGTGCCGACTACCGGAATCGAACTGGTGACCTACTGATTACAAGTCAGTTGCTCTACCTACTGAGCT > 1:3238351/1‑149 AAGGATTCGAACCTTCGAAGTCTGTGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCGGACTTGATGGTGCCGACTACCGGAATCGAACTGGTGACCTACTGATTACAAGTCAGTTGCTCTACCTACTGAGCT > 1:3238353/1‑149 AAGGATTCGAACCTTCGAAGTCTGTGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCGGACTTGATGGTGCCGACTACCGGAATCGAACTGGTGACCTACTGATTACAAGTCAGTTGCTCTACCTACTGAGCT > 1:3238352/1‑149 AAGGATTCGAACCTTCGAAGTCTGTGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCGGACTTGATGGTGCCGACTACCGGAATCGAACTGGTGACCTACTGATTACAAGTCAGTTGCTCTACCTACTGAGCT < 1:3238491/149‑1 AGGATTCGAACCTTCGAAGTCTGTGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCGGCCTTGATGGTGCCGACTACCGGAATCGAACTGGTGACCTACTGATTACAAGTCAGTTGCTCTACCTACTGAGCTA > 2:3238350/1‑149 AGGATTCGAACCTTCGAAGTCTGTGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCGGACTTGATGGTGCCGACTACCGGAATCGAACTGGTGACCTACTGATTACAAGTCAGTTGCTCTACCTACTGAGCT > 1:3238354/1‑148 GGATTCGAACCTTCGAAGTCTGTGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCGGACTTGATGGTGCCGACTACCGGAATCGAACTGGTGACCTACTGATTACAAGTCAGTTGCTCTACCTACTGAGCTAA < 1:3238424/149‑1 GGATTCGAACCTTCGAAGTCTGTGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCGGACTTGATGGTGCCGACTACCGGAATCGAACTGGTGACCTACTGATTACAAGTCAGTTGCTCTACCTACTGAGCTAA > 1:3238349/1‑149 GATTCGAACCTTCGAAGTCTGTGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCGGACTTGATGGTGCCGACTACCGGAATCGAACTGGTGACCTACTGATTACAAGTCAGTTGCTCTACCTACTGAGCTAAG > 2:3238347/1‑149 GATTCGAACCTTCGAAGTCTGTGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCGGACTTGATGGTGACGACTACCGGAATCGAACTGGTGACCTACTGATTACAAGTCAGTTGCTCTACCTACTGAGCTAAG > 2:3238348/1‑149 TTCGAACCTTCGAAGTCTGTGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCGGACTTGATGGTGCCGACTACCGGAATCGAACTGGTGACCTACTGATTACAAGTCAGTTGCTCTACCTACTGAGCTAAGTC > 1:3238346/1‑149 TTCGAACCTTCGAAGTCTGTGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCGGACTTGATGGTGCCGACTACCGGAATCGAACTGGTGACCTACTGATTACAAGTCAGTTGCTCTACCTACTGAGCTAAGTC < 1:3238470/149‑1 TTCGAACCTTCGAAGTCTGTGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCGGACTTGATGGTGCCGACTACCGGAATCGAACTGGTGACCTACTGATTACAAGTCAGTTGCTCTACCTACTGAGCTAAGTC < 2:3238503/149‑1 TCGAACCTTCGAAGTCTGTGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCGGACTTGATGGTGCCGACTACCGGAATCGAACTGGTGACCTACTGATTACAAGTCAGTTGCTCTACCTACTGAGCTAAGTCG < 1:3238344/149‑1 TCGAACCTTCGAAGTCTGTGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCGGACTTGATGGTGCCGACTACCGGAATCGAACTGGTGACCTACTGATTACAAGTCAGTTGCTCTACCTACTGAGCTAAGTCG > 1:3238345/1‑149 TCGAACCTTCGAAGTCTGTGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCGGACTTGATGGTGCCGACTACCGGAATCGAACTGGTGACCTACTGATTACAAGTCAGTTGCTCTACCTACTGAGCTAAGT < 1:3238404/147‑1 GCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > U00096/1286919‑1287084‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCTGTGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCGGACTTGATGGTGCCGACTACCGGAATCGAACTGGTGACCTACTGATTACAAGTCAGTTGCTCTACCTACTGAGCTAAGTCG < U00096/4175537‑4175390 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |