| Predicted mutation | ||||||
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| MC JC | U00096 | 3,153,487 | Δ15 bp | intergenic (+64/‑62) | metC → / → yghB | cystathionine beta‑lyase/L‑cysteine desulfhydrase/alanine racemase/DedA family protein YghB |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
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| * | * | ÷ | U00096 | 3153487 | 3153501 | 15 | 242 [0] | [0] 240 | metC/yghB | cystathionine beta‑lyase/L‑cysteine desulfhydrase/alanine racemase/DedA family protein YghB |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | U00096 | = 3153486 | 0 (0.000) | 230 (1.220) | 150/280 | 0.0 | 100% | intergenic (+63/‑77) | metC/yghB | cystathionine beta‑lyase/L‑cysteine desulfhydrase/alanine racemase/DedA family protein YghB |
| ? | U00096 | 3153502 = | 0 (0.000) | intergenic (+79/‑61) | metC/yghB | cystathionine beta‑lyase/L‑cysteine desulfhydrase/alanine racemase/DedA family protein YghB | |||||
Only 100 of 240 total aligned reads displayed.
ATATTGGTCTGGAAGATGTCGACGATCTGATTGCCGATCTGGACGCCGGTTTTGCGCGAATTGTATAACATTGCCACTTTTGGACAATTTTGCAGACATTTTATTGTGAAAAGTCTTAAATTGTTGCGTCCGGGATCAAGGCGTCCCGGACGATTCAGGAGTACAATAGGCAGATAAAGGCTTAAACGCTGTTCCACAGGAAAGTCCATGGCTGTTATTCAAGATATCATCGCTGCGCTCTGGCAACACGACTTTGCCGCGCTGGCGGATCCTCATATTGTTAGCGTTGTTTAC > U00096/3153356‑3153649 | ccttgattcgcctgcatattggtctggaagatgtcgacgatctgattgccgatctggacgccggttttgcgcgaattgtataacattgccacttttggacaattttgcagacattttattgtgaaaagtcttaaattgttgcgtccCgg < 2:2106664‑M2/3‑1 (MQ=255) cttgattcgcctgcatattggtctggaagatgtcgacgatctgattgccgatctggacgccggttttgcgcgaattgtataacattgccacttttggacaattttgcagacattttattgtgaaaagtcttaaattgttgcgtccCGGa > 2:2106792‑M2/146‑149 (MQ=255) ttcgcctgcatattggtcttgaagatgtcgacgatctgattgccgatctggacgccggttttgcgcgaattgtataacattgccacttttggacaattttgcagacattttattgtgaaaagtcttaaattgttgcgtccCGGacgtt < 1:2106666‑M2/8‑3 (MQ=255) ttcgcctgcatattggtctggaagatgtcgacgatctgattgccgatctggacgccggttttgcgcgaattgtataacattgccacttttggacaattttgcagacattttattgtgaaaagtcttaaattgttgcgtccCGGACGAtt > 1:2106774‑M2/141‑149 (MQ=255) cgcctgcatattggtctggaagatgtcgacgatctgattgccgatctggacgccggttttgcgcgaattgtataacattgccactttggacaattttgcagacattttattgtgaaaagtcttaaattgttgcgtccCGGACGATTCAg > 2:2106739‑M2/138‑149 (MQ=255) ctgcatattggtctggaagatgtcgacgatctgattgccgatctggacgccggttttgcgcgaattgtataacattgccacttttggacaattttgcagacattttattgtgaaaagtcttaaattgttgcgtccCGGACGATTCAGGa < 1:2106670‑M2/14‑1 (MQ=255) ctgcatattggtctggaagatgtcgacgatctgattgccgatctggacgccggttttgcgcgaattgtataacattgccacttttggacaattttgcagacattttattgtgaaaagtcttaaattgttgcgtccCGGACGATTCAGGa < 2:2106669‑M2/14‑1 (MQ=255) attggtctggaagatgtcgacgatctgattgccgatctggacgccggttttgcgcgaattgtataacattgccacttttggacaattttgcagacattttattgtgaaaagtcttaaattgttgcgtccCGGACGATTCAGGAGTACaa > 2:2106708‑M2/130‑149 (MQ=255) 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2:2106690‑M2/1‑1 (MQ=255) tgattgccgatctggacgccggttttgcgcgaattgtataacattgccacttttggacaattttgcagacattttattgtgaaaagtcttaaattgttgcgtccCGGACGATTCAGGAGTACAATAGGCAGATAAAGGCTTGAACGCTg > 2:2106799‑M2/105‑149 (MQ=255) attgccgatctggacgccggttttgcgcgaattgtataacattgccacttttggacaattttgcagacattttattgtgaaaagtcttaaattgttgcgtccCGGACGATTCAGGAGTACAATAGGCAGATAAAGGCTTaaa < 1:2106693‑M2/40‑1 (MQ=255) atctggacgccggttttgcgcgaattgtataacattgccacttttggacaattttgcagacattttattgtgaaaagtcttaaattgttgcgtccCGGACGATTCAGGAGTACAATAGGCAGATAAAGGCTTAAACGCTGTTCCACAgg > 2:2106778‑M2/96‑149 (MQ=255) ctggacgccggttttgcgcgaattgtataacattgccacttttggacaattttgcagacattttattgtgaaaagtcttaaattgttgcgtccCGGACGATTCAGGAGTACAATAGGCAGATAAAGGCTTAAACGCTGTTCCACAGGaa < 1:2106695‑M2/56‑1 (MQ=255) tggacgccggttttgcgcgaattgtataacattgccacttttggacaattttgcagacattttattgtgaaaagtcttaaattgttgcgtccCGGACGATTCAGGAGTACAATAGGCAGATAAAGGCTTAAACGCTGTTCCACAGGaaa > 1:2106752‑M2/93‑149 (MQ=255) 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cttaaattgttgcgtccCGGACGATTCAGGAGTACAATAGGCAGATAAAGGCTTAAACGCTGTTCCACAGGAAAGTCCATGGCTGTTATTCAAGATATCATCGCTGCGCTCTGGCAACACGACTTTGCCGCGCTGGCGGATCCTCatat < 1:2106771‑M2/132‑1 (MQ=255) ttaaattgttgcgtccCGGACGATTCAGGAGTACAATAGGCAGATAAAGGCTTAAACGCTGTTCCACAGGAAAGTCCATGGCTGTTATTCAAGATATCATCGCTGCGCTCTGGCAACACGACTTTGCCGCGCTGGCGGATCCTCATAtt < 2:2106769‑M2/133‑1 (MQ=255) ttaaattgttgcgtccCGGACGATTCAGGAGTACAATAGGCAGATAAAGGCTTAAACGCTGTTCCACAGGAAAGTCCATGGCTGTTATTCAAGATATCATCGCTGCGCTCTGGCAACACGACTTTGCCGCGCTGGCGGATCCTCATAtt > 2:2106755‑M2/17‑149 (MQ=255) ttaaattgttgcgtccCGGACGATTCAGGAGTACAATAGGCAGATAAAGGCTTAAACGCTGTTCCACAGGAAAGTCCATGGCTGTTATTCAAGATATCATCGCTGCGCTCTGGCAACACGACTTTGCCGCGCTGGCGGATCCTCATAtt > 2:2106862‑M2/17‑149 (MQ=255) aattgttgcgtccCGGACGATTCAGGAGTACAATAgg < 1:2106765‑M2/24‑1 (MQ=255) aattgttgcgtccCGGACGATTCAGGAGTACAATAGGCAGATAAAGGCTTAAACGCTGTTCCACAGGAAAGTCCATGGCTGTTATTCAAGATATCATCGCTGCGCTCTGGCAACACGACTTTGCCGCGCTGGCGGATCCTCATATTGtt > 1:2106838‑M2/14‑149 (MQ=255) 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tgttgcgtccCGGACGATTCAGGAGTACAATAGGCAGATAAAGGCTTAAACGCTGTTCCACAGGAAAGTCCATGGCTGTTATTCAAGATATCATCGCTGCGCTCTGGCAACACGAATTTGACGCGCTGGCGGATCCTCTTATTGTTAGc > 2:2106840‑M2/11‑149 (MQ=255) tgcgtccCGGACGATTCAGGAGTACAATAGGCAGATAAAGGCTTAAACGCTGTTCCACAGGAAAGTCCATGGCTGTTATTCAAGATATCATCGCTGCGCTCTGGCAACACGACTTTGCCGCGCTGGCGGATCCTCATATTGTTAGCgtt < 1:2106754‑M2/142‑1 (MQ=255) tgcgtccCGGACGATTCAGGAGTACAATAGGCAGATAAAGGCTTAAACGCTGTTCCACAGGAAAGTCCATGGCTGTTATTCAAGATATCATCGCTGCGCTCTGGCAACACGACTTTGCCGCGCTGGCGGATCCTCATATTGTTAGCgt > 1:2106827‑M2/8‑148 (MQ=255) cCGGACGATTCAGGAGTACAATAGGCAGATAAAGGCTTAAACGCTGTTCCACAGGAAAGTCCATGGCTGTTAATCAAGATATCATCGCTGCGCTCTGGCAACACGACTTTGCCGCGCAGGCGGATCCTCATATTGTTAGCGTTGTTTAc > 2:2106887‑M2/2‑149 (MQ=255) | ATATTGGTCTGGAAGATGTCGACGATCTGATTGCCGATCTGGACGCCGGTTTTGCGCGAATTGTATAACATTGCCACTTTTGGACAATTTTGCAGACATTTTATTGTGAAAAGTCTTAAATTGTTGCGTCCGGGATCAAGGCGTCCCGGACGATTCAGGAGTACAATAGGCAGATAAAGGCTTAAACGCTGTTCCACAGGAAAGTCCATGGCTGTTATTCAAGATATCATCGCTGCGCTCTGGCAACACGACTTTGCCGCGCTGGCGGATCCTCATATTGTTAGCGTTGTTTAC > U00096/3153356‑3153649 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |