| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | U00096 | = 1287262 | 145 (0.530) | 9 (0.040) | 8/250 | 30.3 | 7.4% | noncoding (67/85 nt) | tyrV | tRNA‑Tyr |
| ? | U00096 | 1287382 = | 102 (0.430) | intergenic (‑54/+156) | tyrV/tyrT | tRNA‑Tyr/tRNA‑Tyr | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 160 total aligned reads displayed.
TCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGATGGTGGTGGGGGAAGGATTATTCGTCGCTTCGCTCCTCACCCTTCGG > U00096/1287114‑1287409 | gTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCACCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTAAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCg > 2:1181053/1‑149 (MQ=255) gTTGCCTGCGGCAACGCGCTCTCGCTGTCGCTCGAGGCGAACCTTTGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGTAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCg < 1:1180938/149‑1 (MQ=14) ttGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCg > 1:1181040/1‑148 (MQ=255) ccTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGTCGCTCGAGTCGAACCTTTGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTTATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCg < 1:1180940/145‑1 (MQ=255) cAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAg > 2:1181031/1‑149 (MQ=255) gCTCTCTCGCTGTCGCTCGAGTCGAACCTTTGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTTATTGCGGATTCGTTGGTTAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGACGGATTCGAACCTTCGAAGTCg < 1:1180946/148‑1 (MQ=17) ctctctCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGAt < 2:1180947/149‑1 (MQ=255) ctctctCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGAt > 1:1181057/1‑149 (MQ=255) gCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCa < 2:1213872/149‑1 (MQ=255) ggCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGAt < 1:1180953/149‑1 (MQ=255) gcTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGAtt > 1:1181121/1‑118 (MQ=255) tttgTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCtt < 1:1180968/146‑1 (MQ=255) ttGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGAtt > 1:1181072/1‑104 (MQ=255) cGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCttt < 1:1180972/145‑1 (MQ=255) cGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCGTCGAAGTCGATGCCGGCAGATTTACAGTCTGCTGCCTTTgggc > 1:1181186/1‑147 (MQ=255) ttCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGAtt > 1:1181089/1‑93 (MQ=255) tctcATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCggg > 2:1180974/1‑149 (MQ=255) ctcATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTTATTGCGGATTCGATGGGCAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGa < 1:1180979/149‑1 (MQ=255) ctcATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGa < 2:1180978/149‑1 (MQ=255) tcATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGaa > 1:1181017/1‑149 (MQ=255) tcATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACAGTCGAAGTCGTGGACTCCAGATTTGGAGTCTGCTCCCTTTGTACGCTCTGGaa > 2:1180977/1‑149 (MQ=18) cctCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTTCGGATTCGTTGGGAAGTTCCGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCggg < 1:1180981/144‑1 (MQ=255) cATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGGCGATGACGGCAGATTAACAGTCTGCTCCCTATGGCCGCTCGGGAAc > 2:1181130/1‑149 (MQ=255) aTCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTTATTGCGGATTCGTTGGTTAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTc < 2:1180967/103‑1 (MQ=255) tCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTTATTGCGGATTCGTTTGTTAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGaa < 1:1180987/146‑1 (MQ=255) tCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTCATTGCGGATTCGCTGGGCAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAAccc < 2:1180989/149‑1 (MQ=255) ccTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCCAACCTTCGAAGTCCATGACGGATGATTTACAGTCTGCTGCCTTTGCACGCTCgctgac > 2:1180987/1‑141 (MQ=14) cTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGTAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGa < 1:1180990/143‑1 (MQ=255) ttCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGATTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCATCGAAGACGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCACCCTTAGGACTCTCGGGaa > 2:1180990/1‑143 (MQ=17) ttCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTAGTCCAGTCGTAGGAGATGACGGATCATTACCAGTCTGCTCGCTTAGGGCTCTCGGGatcgcacc > 2:1181176/1‑142 (MQ=9) tCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCccacc < 2:1180993/149‑1 (MQ=255) ccccGCATGGGCAGAATATTTTATTGCGGATTCGCTGGTTAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACgg < 2:1180994/105‑1 (MQ=17) ccccGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGAtt > 1:1181090/1‑82 (MQ=255) ccccGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCccacca < 1:1180995/149‑1 (MQ=255) cccGCATGGGCAGACTATTTCATTGCGGATTCGTGGGGACGTGCCGGGCCTTGTGAACGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTGCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTGGGCCGCGCGGGAACCCCACCAg < 1:1180996/149‑1 (MQ=18) cGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCGTCGAAGACGATGACGGGAGATTTACAGTCTGCAGCCTTAGGACGCTCGGGAACCCCACCAggg > 2:1181013/1‑149 (MQ=17) cGCATGGGCAGAATATTTCATTGCGGATTCGGTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAggg < 2:1180997/149‑1 (MQ=255) cGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCTAACAGTCGTCGTGGCTCACGGGTGTGTAAGATTCTTCTCCCTATGGACTCTCGGGATCCccacaatcg > 1:1181105/1‑144 (MQ=9) cATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAgggg > 1:1181022/1‑148 (MQ=255) gCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGt > 1:1181002/1‑144 (MQ=255) gCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGt < 2:1181002/144‑1 (MQ=255) gCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAAtt < 1:1181004/148‑1 (MQ=255) gCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTc < 2:1181003/149‑1 (MQ=255) cAGAATATTTAATTGCGGATTCGCTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCa < 1:1181006/149‑1 (MQ=255) gAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAGAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGAtt > 1:1181167/1‑69 (MQ=255) aaTATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAAt < 2:1181010/149‑1 (MQ=18) atatTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGa < 2:1181009/84‑1 (MQ=255) atatTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGa > 1:1181009/1‑84 (MQ=255) atatTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAAtt < 1:1181011/149‑1 (MQ=255) atTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGAtta > 1:1181100/1‑65 (MQ=255) tttCATTGCGGATTCGCTGGTTAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAggg < 1:1181015/134‑1 (MQ=255) tttAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTg < 2:1181018/149‑1 (MQ=255) tttaTTGCGGATTCGTTTGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGa < 1:1181020/146‑1 (MQ=255) ttAATTGCGGATTCGTGGGGAAGTGCAGGGTCTTTTGACAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCtt < 2:1181019/71‑1 (MQ=21) tgaTTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCATCTAAGACGATCGCGGCAGATTTACATTCATCACCCTTAGCACTCTCGGGAACCCCCCCAGGGGTAATTCAAAtattcat > 2:1181039/3‑146 (MQ=12) tAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGAtt > 1:1181084/1‑62 (MQ=255) tAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAg < 2:1181022/149‑1 (MQ=255) ttGCGGATTCGTTTGTTAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTa < 2:1181024/149‑1 (MQ=255) ttGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACAATCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGACGCTCGGGAACCCCCCCAGCGGTAATTCAAATTTTGAGGTa > 1:1181098/1‑149 (MQ=25) ttGCGGATTCGCTGGCTAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTAc < 1:1181023/91‑1 (MQ=255) tGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTaa < 1:1181026/149‑1 (MQ=255) tGCGGATTCGCTTGTTAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTTATTCAAATTTTGAGGTaa < 1:1181027/149‑1 (MQ=21) ggATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGAtt > 1:1181114/1‑55 (MQ=255) ggATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGc < 2:1181028/149‑1 (MQ=255) ggATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTATAACATTCTAAGACGATCACGGCAGATTTACATTCTTGTCCCTATGGACTCTCGGGAACCCCACCATCGGAAATTAAAAAATTGAGGTaaaac > 2:1181153/1‑146 (MQ=18) gATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCt < 1:1181030/149‑1 (MQ=255) tCGTTGGCTAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTga < 2:1181032/149‑1 (MQ=255) cggtGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTga < 1:1181033/145‑1 (MQ=255) 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aGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACAACCATCGGAGGCGATCGCGGCAGGTTTCGAGTCTTCGGCCTAGGCCCTCTCGGGAACCCCAGCAGGGGTAAt > 2:1181056/1‑112 (MQ=12) gACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGACCATTCGAAGTGGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTGGGCCGCTCGGGAACCCCCCCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGATGGGGGTGGGGGAAg > 1:1181081/1‑149 (MQ=21) gACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGATGGTGGTGGGGGAAg < 2:1181059/149‑1 (MQ=255) cTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAAt < 1:1181061/113‑1 (MQ=255) tttGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTa < 1:1181063/61‑1 (MQ=255) ttGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGt < 1:1181065/64‑1 (MQ=255) aaaGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGt < 1:1181285/40‑1 (MQ=255) aaGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGa < 2:1181067/52‑1 (MQ=40) aaGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTa < 2:1181066/56‑1 (MQ=40) aaGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGATGGTGGTGGGGGAAGGATTATtcg > 2:1181185/1‑149 (MQ=255) aaGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGACGATGACGGCAGa > 1:1181067/1‑52 (MQ=255) gTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCa < 1:1181068/48‑1 (MQ=38) gATGGTGGTGGGGGAAGGATTCTAACAGTCGAAGTCGATCACGGCAGATTTACAGTCTGCTCGCTTAGGCCTCTCGGGAACCCCCCCATCGGTAATTCAAATTTTGAGGTAAGGCTTGAGATGGTGGTGGGGGATGGATAATTCGtagc > 2:1181177/1‑149 (MQ=18) gtggGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGATGGTGGTGGGGGAAGGATTATTCGTCGCTTCGctc > 2:1181157/1‑149 (MQ=255) gAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGATGGTGGTGGGGGAAGGATTATTCGTCGCTTCGCTCCTCAcc > 2:1181080/1‑149 (MQ=255) gATTCGATCGTTCCTAGCCGATGTCGCCCGTTTTACTGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGTACCCCAGCAGGGGTAATGCAATTCATGCCGTAATGAAAGAGATGGTGGTGGGGGAAGGATTATTCGTCGCTTCGCTCCTCACCCTTc < 2:1181077/149‑1 (MQ=19) aTTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGATGGTGGTGGGGGAAGGATTATTCGTCGCTTCGCTCCTCACCCTTCg > 2:1181182/1‑149 (MQ=255) ttCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGATGGTGGTGGGGGAAGGATTATTCGTCGCTTCGCTCCTCACCCTTCgg > 1:1181162/1‑149 (MQ=255) ttCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGATGGTGGTGGGGGAAGGATTATTCGTCGCTTCGCTCCTCACCCTTCgg > 2:1181173/1‑149 (MQ=255) | TCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGATGGTGGTGGGGGAAGGATTATTCGTCGCTTCGCTCCTCACCCTTCGG > U00096/1287114‑1287409 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |