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MC JC | U00096 | 1,978,503 | Δ776 bp | insB5–insA5 | insB5, insA5 |
Missing coverage evidence... | ||||||||||
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* | * | ÷ | U00096 | 1978503–1979270 | 1979278 | 9–776 | 334 [0] | [0] 338 | insB5–insA5 | insB5,insA5 |
New junction evidence | |||||||||||
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* | ? | U00096 | = 1978502 | 0 (0.000) | 309 (1.190) | 166/276 | 0.1 | 100% | intergenic (‑305/+16) | flhD/insB5 | DNA‑binding transcriptional dual regulator FlhD/IS1 family protein InsB |
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Only 100 of 338 total aligned reads displayed.
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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |