Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | U00096 | 935,584 | 0 | A | T | 20.9% | 164.4 / 17.5 | 89 | P787P (CCA→CCT) | ftsK | cell division DNA translocase FtsK |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (42/26); new base T (9/9); total (51/38) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.24e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. |
GCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACAACCGCAGGATACCCTGCTTCATCCGCTGTTGATGCGTAATGGCGACAGCCGTCCGTTGCATAAACC > U00096/935443‑935730 | gcagcCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCACagcagc > 1:650651/1‑149 (MQ=255) cagcCGCCACAACCGGATGCTCAGCAGCAGCATTATCAGCATCCTCAACAACCTCATCCGCCGCAGCAGCAGTATCCCCAGCCACACCAGCCTGTTCCTACGCAGCAACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCACAgcagca < 2:650505/149‑1 (MQ=17) agcCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCACAGCAGCaa < 1:650506/149‑1 (MQ=255) gcCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCGCAGCCACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCACAGCAGCAat < 1:650507/149‑1 (MQ=255) cctccacaacaGGTCGCTCCGCAGCAGCATGATCAGCAGCCTCAACAACCCCATCCGCCGCAGCAGGAGTCTCAGCAGCCACCCCAGCCGCCGGCTCCGCAGCCACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCACAGCAGCAata < 2:650509/144‑1 (MQ=16) cGCAACTACAGGTTGCTGCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCATCTTCCAGTTCCGCTGCTGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCACAGCAGCAatat < 2:1944861/149‑1 (MQ=21) tcaacaaCCGTATGCTCCGCAGCAGCTATATCATCACCCTCAACAAACTCTTCCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACATCAGCCGGCTGCTCCGCAGCCACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCACAGCAGCAATATc < 2:650520/148‑1 (MQ=18) cttaaacCTGTTGCACCGCAGCTTGATTATCAGCAGCCGCATCAACGATTTCCTACGCAGCCTCATTTTCATCAGCAACAACTGCCGTTGGCTACGCAGCAACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCACAGCAGCAATATca < 2:650535/145‑1 (MQ=12) gcagcagcaATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAATATCCGCAGCAGCAACAACCGGTTCCGCCACAGCAGCAAAATCATCAGCAGCAACAGCCgg > 2:650629/1‑149 (MQ=25) gcagcagcaATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATAAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAACCCCAGTATCAGCAGAAGCATCAACAGTTTTCGCCACAGCCTCAAAATCAGCAGCAGCAACCACCga > 2:650664/1‑148 (MQ=18) gcagcaATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCCCACTATCCGCAGCATCATCCACCGGTGACGCCTCATCCGGAAAGGCATCAGATGCAACAACCga > 2:650626/1‑145 (MQ=12) gcagcaATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTGGCGCCTCATCCCCAAGATCAGCAGCAGCATCAACCGGAGACGCCTCAGCCGGAAATGCATCAGCTGCAACAGCCgccga > 2:650622/1‑145 (MQ=12) cagcaATAACATCATCCGCACCCTCCGCTTCCGCTGGAGGAGCATTATCTTCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAATTTCAGCAGCCTCAACTACCTGTTGCTCTACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTgc < 2:650528/149‑1 (MQ=12) agcaATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCACAGCAGCAATATCAGCAGCAGCAACAACCGCATgcg > 1:650656/1‑149 (MQ=255) gcaATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCCCACTATCCGCAGCAGCAACAACCGGTTACGCCTCATCCGCAAAAGCCGCAGCAGCATCAACCgcagacgc > 2:650640/1‑142 (MQ=18) tatCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCATCCACAATATCAGCAGCAGCATCAACAGGTTACGCCTCATCCCCAATAGCATCAGCAGCAACAACCGAATAcgccgct > 2:650620/1‑148 (MQ=21) atCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCCCAATATCAGCAGCAGCAACAACCGGTTCCGCCTCAGCCGCAAAATCATCAGCAGCAACAACCGCATACGCCgcag > 1:650657/1‑149 (MQ=21) cagcacCCGCCACCACCCCTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCATCAGCCACCTCAGACGTTTGCTCTGCTGGAACAATATCAGCAGCCTCAACAACCGGTTGCTCCACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCgcagca < 2:650519/149‑1 (MQ=18) gcCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAGTATCAGCAGCAGCAACAACCGGTTGCGCCACAGCAGCAATAACAGCAGCAGCATCAACCGAGTGCGCCGCAGCAGCAGt > 2:650612/1‑149 (MQ=37) ccGCATCAACCTTTTCCGCTGCAGCCGCATGATCAGCAGCCACATCAGCTGTTTGCGCCGCAGCCACAATTTCAGCAGCCGCATCATCCGGTTGCGCCACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTa < 2:650516/149‑1 (MQ=18) ccGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAATATCCGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTa < 2:650515/149‑1 (MQ=255) ccGCAACAACCAGTTACGACGCAGCAGCATTATCAGCAGCAACAATATCCGTTTGCGACGCAGCAACTATATCAGCAGCCGCAACAACCGTTTGCTCCTCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTa < 2:650514/149‑1 (MQ=18) acaacCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCGCAATATCCGCAGCCGCAACAGCCGGTTGCGCCTCATCCCCACTGTCATCCGCAGCATCAACCGGATGCGccgcagccgcagatgcagc > 2:650671/1‑142 (MQ=21) acaacCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAAGATCACCAGCCTCAACCGCCGGTTGAGCCACAGGACCACTAACAGCCGCAGCAAAAACCGCTTGCGCCGCAGCAGGAGTATc > 1:650630/1‑146 (MQ=25) aacCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCGCAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCGCAAGATCAGCAGCCGCAACAGCAGGTTGCGCGACATCAGGAATATCAGCCGCCGCATCAACCGGTTGCGCCGCAGCCGAAGGATcagctg > 1:650644/1‑147 (MQ=255) aacCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCGCAATATCAGCAGCATCAACAGCAGGTTGCGCCTCATCAGCAAAAACATCAGAAGCAACAACCGGATGCGCCGCTGCAGCAGGATcagaag > 2:650665/1‑149 (MQ=25) acCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCGCAATATACGCAGCCGCAACAGCCGGTGGCGCCACATCAGCACTATCCTCAGCAGCATCAACCGGCGGCGCCGCAGCCGGAGCTTCagcagc > 1:650632/1‑149 (MQ=21) cctgTTGCGCCTCTGCCTAAGTATCAGCAGCGTAAACAGCCGGCTGGGCCTCATGCTTATTATCAGCTGTCTCAACTTGCGGTTGCGACACAGTTGAAATATGAGCAGCCTGAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGcc < 2:1663850/146‑1 (MQ=255) cagccgcagTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCGCAACCGCCGGTGGAGCCTCAGCAGCACAGACGGCAGCCGCATCAACCGGATGCGCCGCAGCCGGCGAATCAGGAGCCGCCACCGccgca > 2:650680/1‑146 (MQ=9) agcctcagTATCAGCAGCCACATCAGCTGTTTGCTCCGCAGCAACATTATCAGCAGCCTCAACAACCGGTTGCGCCACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGtt < 2:650522/149‑1 (MQ=21) gccgcagTATCAGCAGCCACAACAGCCTGTTGCGCCGCAGCCACAATATCAGCAGCAGCAACAACCGGTTGAGCCACAGCAGCAAAAACAGCAGAAGCATCAACCGGTTGCGCCGCAGCCGCAGAATCAGCAGCCTCAACAGCCAGATg > 2:650643/1‑149 (MQ=255) gccgcagTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAGGATCACCAGCAGCATCAGCCGGTTGAGCCTCATCGCCAAAAACGGCCGACGCATCAACCGAATACGCCGCAGCCGACGGAGCAGAAGCCGCTACAGCGAGATg > 2:650621/1‑149 (MQ=255) gccgcagTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCACAGCAGCAAAATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGAATCAGCAGCCACAACAGCCacatg > 2:650642/1‑145 (MQ=255) aTCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCcac < 1:650525/69‑1 (MQ=255) tCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGATGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACCACAGCCACATGCGCCACAAc > 2:650641/1‑149 (MQ=255) cagcAACATCAGCCGGTTGCGCCGCAGGCACATTATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCTCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACAACCGCa < 2:650529/149‑1 (MQ=21) gcCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCACAGCAGCAATATCAGCAGCAGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGACGCAACAACAGCCAGTTGCGCCACAACCGCCgg > 2:650666/1‑149 (MQ=25) aacaGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCACAGCCGCAATATCCGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCATCAGCCACAACAGCCAGATACGCCACAACCGCAGGATAcc > 2:650653/1‑149 (MQ=21) acttccGGTACCGACGCTGCCCCCATCTCAGCCTCCGCAACATCCGTTTTCGCCCCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACAACCGCAGGATAccc < 2:650556/145‑1 (MQ=18) gCCGGTTGCGCCGCAGCCACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACAACCGCAGGATACCCTGc > 2:650615/1‑149 (MQ=255) gCCGGTTGCGCCGCAGCCACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACAACCGCAGGATACCCTGc < 2:650530/149‑1 (MQ=255) gCCGGTTGCGCCGCAGCCACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAG‑CAGTTGCGCCACAACCGCAGGATACCCTGCt > 1:650685/1‑149 (MQ=255) ggTTGCGCCGCAGCCACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCcaca > 2:650531/1‑129 (MQ=255) ggTTGCGCCGCAGCCACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCcaca < 1:650531/129‑1 (MQ=255) ggTTGCGCCGCAGCCACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACAACCGCAGGATACCCTGCTTc > 1:1739922/1‑149 (MQ=255) ggTTGCGCCGCAGCCACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACAACCGCAGGATACCCTGCTTc > 2:650647/1‑149 (MQ=255) ggTTGCGCAGCAGCCACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAAcc > 1:1739923/1‑78 (MQ=255) gTTGCGCCGCAGCCACAATATCAGCATCCGCAACAACCGGTTGCGCCACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACAACCGCAGGATACCCTGCTTCa < 1:2507274/149‑1 (MQ=255) gTTGCGCCGCAGCCACAATATCAGCAGCCGCAACAACCTGTTGCGCCACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCCGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCATCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACAACCGCAGCATACCCTGCTTCa > 1:650678/1‑149 (MQ=255) gTTGCGCCGCAGCCACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCACAGCAGCACTATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACACCCGAAGGATACCCTGCTTCa > 1:650648/1‑149 (MQ=255) gTTGCGCCGCAGCCACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACAGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACAACCGCAGGATACCCTGCTTCa > 2:2585390/1‑149 (MQ=255) ctcgcgcCGCAGGAACATTCTCAGCACCAGCAACAACCGGTTGCTCCTCAGCATCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCTCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACAACCGCAGGATACCCTGCTTCa < 2:650559/146‑1 (MQ=18) ccgcAGCCACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCACAGCAGCAATATcagc < 1:650534/58‑1 (MQ=255) gcAGCCACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACAACCGCAGGATACCCTGCTTCATCCGc > 1:650645/1‑146 (MQ=255) gcAGCCACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACAACCGCAGGATACCCTGCTTCATCCGCTGt > 2:650659/1‑149 (MQ=255) cAGCCACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCTCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCcac < 1:650537/118‑1 (MQ=255) aGCCACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACAACCGCAGGATACCCTGCTTCATCCGCTGTTg > 1:650679/1‑149 (MQ=255) ccACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACAACCGCAGGATACCCTGCTTCATCCGCTGTTGAt > 1:2334107/1‑149 (MQ=255) cacaATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACAACCGCAGGATACCCTGCTTCATCCGCTGTTGATg > 1:650662/1‑149 (MQ=255) cacaATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACAACCGCAGGATACCCTGCTTCATCCGCTGTTGATg > 1:650638/1‑149 (MQ=255) cacaATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACAACCGCAGGATACCCTGCTTCATCCGCTGTTGATg > 1:650646/1‑149 (MQ=255) acaATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCACAGCAGCAATATcagc < 1:650539/50‑1 (MQ=255) caATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACAACCGCAGGATACCCAGCTTCATCCGCTGTTGATGCg > 2:1682494/1‑149 (MQ=255) atatCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACAACCGCAGGATACCCTGCTTCATCCGCTGTTGATGCGTa > 1:3177325/1‑149 (MQ=255) agatCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCTCCTCAGCATCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACAACCGCAGGATACCCTGCTTCATCCGCTGTTGATGCGTa < 2:650540/147‑1 (MQ=255) atCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACAACCGCAGGATACCCTGCTTCATCCGCTGTTGATGCGTAAt > 1:650661/1‑149 (MQ=255) atCAGAAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACAACCGCAGGATACCCTGCTTCATCAGCTGATGATGCGTAAt > 1:650693/1‑149 (MQ=255) tCAGCAGCCGCAACAACCGGTACCGCCACAGAAGCAATATCAGCAGCAGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATAAGCAGCCACAAAAGACAGTTGCGCCACAACCGCAGGATACCCTGCATCATCCGCTGTAGATGCCTaaac > 2:650684/1‑147 (MQ=37) cagcagCCGCAACAACCGGTTGCTCCACAGCAGCAATATCAGCAGCCGcaac < 1:650553/52‑1 (MQ=255) cagcagCCGCAACAACCGGTTGCTCCACAGCAGCAATATCAGCAGCCGcaac < 1:650554/52‑1 (MQ=255) gcagcCGCAACAACCGGGTGCGCCACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGcgccgc < 1:650555/65‑1 (MQ=255) cagcCGCAACAACCGGTTGCTCCTCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTgc < 1:1982428/59‑1 (MQ=14) agcagcAACTACCGTTTGCTCATCAGCATCATTATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACAACCGCAGGATACCCTGCTTCATCCGCTGTTGATGCGTAATGGCGAc < 2:650585/149‑1 (MQ=25) ccGCAACAACCGGTTGCGCCACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACAACCGCAGGATACCCTGCTTCATCCGCTGTTGATGCGTAATGGCGACAg < 2:650557/149‑1 (MQ=255) gCAACAACCGGTTGCGCCACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACAACCGCAGGGTACCCGGCTTCATCCGCTGTTGATGCGTAATGGCGACAGc > 1:650698/1‑148 (MQ=255) gCAACAACCGGTTGCGCCACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACAACCGCAGGATACCCTGCTTCATCCGCTGTTGATGCGTAATGGCGACAGcc < 1:650558/149‑1 (MQ=255) aacaacCGGTTGCGCCACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACAACCGCAGGATACCCTGCTTCATCCGCTGTTGATGCGTAATGGCGACAGccgt > 1:650634/1‑149 (MQ=255) 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cGGTTGCGCCACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACAACCGCAGGATACCCTGCTTCATCCGCTGTTGATGCGTAATGGCGACAGCCGTCCGTTg < 1:3294297/149‑1 (MQ=255) ggTTGCGCCACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACCGCCAGTTGCGCCACAACCGCAGGATACCCTGCTTCATCCGCTGTTGATGCGTAATGGCGACAGCCGTCCGTTGc > 2:650660/1‑149 (MQ=255) gTTGCGCCACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACAACCGCAGGATACCCTGCTTCATCCGCTGTTGATGCGTAATGGCGACAGCCGTCCGTTGc > 1:650712/1‑148 (MQ=255) gTTGCGCCACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACAACCGCAGGATACCCTGCTTCATCCGCTGTTGATGCGTAATGGCGACAGCCGTCCGTTGCa > 2:650690/1‑149 (MQ=255) tcgcgcCCCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGTTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACAACCGCAGGATACCCTGCTTCATCCGCTGTTGATGCGTAATGGCGACAGCCGTCCGTTGCAt < 2:650564/147‑1 (MQ=255) cgcCCCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACAACCGCAGGATACCCTGCTTCATCCGCTGTTGATGCGTAATGGCGACAGCCGTCCGTTGCATaaa < 2:650565/149‑1 (MQ=255) ccACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACAACCGCAGGATACCCTGCGTCATCCGCTGTTGATGCGTAATGGCGACAGCCGTCCGTTGCATAAAcc > 2:650669/1‑149 (MQ=255) cacaGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACAACCGCAGGATACCCTGCTTCATCCGCTGTTGATGCGTAATGGCGACAGCCGTCCGTTGCATAAAcc > 1:650655/1‑148 (MQ=255) | GCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCAGTTCCGCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAACAGCCAGTTGCGCCACAACCGCAGGATACCCTGCTTCATCCGCTGTTGATGCGTAATGGCGACAGCCGTCCGTTGCATAAACC > U00096/935443‑935730 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |