| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | AP012306 | 746,309 | (TAATGTAA)1→2 | intergenic (‑188/‑97) | ybjG ← / → cmr | undecaprenyl pyrophosphate phosphatase/multidrug efflux system protein |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | AP012306 | = 746297 | 0 (0.000) | 334 (1.100) +GTAATAAT |
181/258 | 0.1 | 100% | intergenic (‑176/‑109) | ybjG/cmr | undecaprenyl pyrophosphate phosphatase/multidrug efflux system protein |
| ? | AP012306 | 746298 = | 0 (0.000) | intergenic (‑177/‑108) | ybjG/cmr | undecaprenyl pyrophosphate phosphatase/multidrug efflux system protein | |||||
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GAGCCAATACAGGCAAGTCGTTGAGAATAAAGTGCAGGTTAAACTGGGTAAAGCGGCATCGTCTTATTTCCCTCAAGCGGCCTGTTTACGGTGGGTGATTGTAACGGGCATAGGTTAAATAAAACTTAAAGAAAGCGTAGCTATACTCGTAATAATGTAAGAATGTGCTTAACCGTGGTTTCAGCTACAAAATTCGCTTTCTCGTTAGCTGCGCTTTTATTAAACTCTGCGCGATTATTATTGGCGAAGAAATTGCATGCAAAATAAATTAGCTTCCGGTGCCAGGCTTGGACGTCAG > AP012306/746150‑746447 | acaggcaagtcgttgagaataaagtgcaggttaaactgggtaaagcggcatcgtcttatttccctcaagcggcctgtttacggtgggtgattgtaacgggcataggttaaataaaacttaaagaaagcgtagctatactcgtaataatgt < 1:299569‑M2/2‑1 (MQ=255)acaggcaagtcgttgagaataaagtgcaggttaaactgggtaaagcggcatcgtcttatttccctcaagcggcctgtttacggtgggtgattgtaacgggcataggttaaataaaacttaaagaaagcgtagctatactcgtaataatgt < 2:1070576‑M2/2‑1 (MQ=255)acaggcaagtcgttgagaataaagtgcaggttaaactgggtaaagcggcatcgtcttatttccctcaagcggcctgtttacggtgggtgattgtaacgggcataggttaaataaaacttaaagaaagcgtagctatactcgtaataatgt > 2:3272146‑M2/149‑150 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |