| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | AP012306 | 2,326,979 | 0 | A | C | 24.3% | 522.8 / 14.5 | 214 | intergenic (‑5/+68) | gshA/yqaA | gamma‑glutamate‑cysteine ligase/conserved inner membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (86/76); new base C (0/52); total (86/128) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.44e-14 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 272 total aligned reads displayed.
CTAATGCTTCAGGATGACCTGTTGTTGCCAGTGTGCCATCAGCATTAACACGCAAAGTTTCGCGCTCCAGCCCACGCTGTATCCCCTTTAACGCCTGAGGATGTTTTTCCAGCCAGGCCA‑GCGCCTGTGATACGTCCGGGATCAAATTGACCTCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAATTAGCATAACTGTAATGGTGACCATATGTGCAGGCCTACAATTAGTGCCACCACATCATGCCCTGAACGGTCGCTGCTGCAACTGCAACATAGCGTAACGCTTTACCAAGGCACAAAAAAAAG > AP012306/2326830‑2327128 | aTGCTTCAGGATGACCTGTTGTTGCCAGTGTGCCATCAGCATTAACACGCAAAGTTTCGCGCTCCAGCCCACGCTGTATCCCCTTTAACGCCTGAGGATGTTTTTCCAGCCAGGCCA‑GCGCCTGTGATACGTCCGGGATCAAATTGACCt < 2:289198/150‑1 (MQ=255) ttCAGGATGACCTGTTGTTGCCAGTGTGCCATCAGCATTAACACGCAAAGTTTCGCGCTCCAGCCCACGCTGTATCCCCTTTAACGCCTGAGGATGTTTTTCCAGCCAGGCCA‑GCGCCTGTGATACGTCCGGGATCAAATTGACCTCCCg < 2:504865/150‑1 (MQ=255) tCAGGATGACCTGTTGTTGCCAGTGTGCCATCAGCATTAACACGCAAAGTTTCGCGCTCCAGCCCACGCTGTATCCCCTTTAACGCCTGAGGATGTTTTTCCAGCCAGGCCA‑GCGCCTGTGATACGTCCGGGATCAAATTGACCTCCCGc < 1:769586/150‑1 (MQ=255) gATGACCTGTTGTTGCCAGTGTGCCATCAGCATTAACACGCAAAGTTTCGCGCTCCAGCCCACGCTGTATCCCCTTTAACGCCTGAGGATGTTTTTCCAGCCAGGCCA‑GCGCCTGTGATACGTCCGGGATCAAATTGACCTCCCGCCTGt > 1:3649853/1‑150 (MQ=255) cTGTTGTTGCCAGTGTGCCATCAGCATTAACACGCAAAGTTTCGCGCTCCAGCCCACGCTGTATCCCCTTTAACGCCTGAGGATGTTTTTCCAGCCAGGCCA‑GCGCCTGTGATACGTCCGGGATCAAATTGACCTCCCGCCTGTCAAAAt > 2:1735591/1‑150 (MQ=255) cTGTTGTGGCCAGTGTGCCATCAGCATTAACACGCAAAGTTTCGCGCTCCAGCCCACGCTGTATCCCCTTAAACGCCTGAGGATGTTTTCCCAGCCAGGCCA‑GCGCCTGTGATACGTCCGGGATCAAATTGCCCTCCCGCCTGTCAAAAt < 1:3665522/150‑1 (MQ=255) tgttgtTGCCAGTGTGCCATCAGCATTAACACGCAAAGTTTCGCGCTCCAGCCCACGCTGTATCCCCTTTAACGCCTGAGGATGTTTTTCCAGCCAGGCCA‑GCGCCTGTGATACGTCCGGGATCAAATTGACCTCCCGCCTGTCACAATc > 2:3475888/1‑150 (MQ=255) gttgttCCCAGTGTGCACCCAGCATTACCACCCAAATTTTCGCCCCCCACCCCACGCTGTACCCCTTTTAACGCCTGAGGATGTTTTTCCACCCGGGCCA‑GGGCTTGTGATACTCCCGGGATAAAATTGCCCTCCCGCCTGTCAAAATCg < 2:2156000/150‑1 (MQ=255) ttgttgCCAGTGTGCCATCAGCATTAACACGCAAAGTTTCGCGCTCCAGCCCACGCTGTATCCCCTTTAACGCCTGAGGATGTTTTTCCAGCCAGGCCA‑GCGCCTGTGATACGTCCGGGATCAAATTGACCTCCCGCCTGTCAAAATCGt < 1:3261140/150‑1 (MQ=255) tttgcccAGTGTCCCATCAGCATTAACACGCAATGTGTCGCGTTCCACCCCGCGCTCTACCCCTTTTAACCCCTAAGTTTTTTTTTCCCTCCGGCCGG‑GCGCCTGTGATCCGTCCGGGATCAAATTCACCTCCCGCCTGTCAAAATCGtt < 2:2120001/145‑1 (MQ=255) tgttgCCAGTGTGCCATCAGCATTAACACGCAAAGTTTCGCGCTCCAGCCCACGCTGTATCCCCTTTAACGCCTGAGGATGTTTTTCCAGCCAGGCCA‑GCGCCTGTGATACGTCCGGGATCAAATTGACCTCCCGCCTGTCAAAATCGtt > 1:3736474/1‑150 (MQ=255) tgCCAGTGTGCCATCAGCATTAACACGCAAAGTTTCGCGCTCCAGCCCACGCTGTATCCCCTTTAACGCCTGAGGATGTTTTTCCAGCCAGGCCA‑GCGCCTGTGATACGTCCGGGATCAAATTGACCTCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTa < 1:679997/150‑1 (MQ=255) ccgaGTGTGCCACCAGCATTAACACGCAAAGTTTCGCGCGCCACCCCCCGCTGTATCCCTTTAACCCCCTGAGGATTTTTTTCCAGCCAGCCCA‑GCCCCTTTGATACGCCCGGGATAAAATTGACCCCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTaa < 2:667929/147‑1 (MQ=255) aGTGTGCCATCAGCATTAACACGCAAAGTTTCGCGCTCCAGCCCACGCTGTATCCCCTTTAACGCCTGAGGATGTTTTTCCAGCCAGGCCA‑GCGCCTGTGATACGTCCGGGATCAAATTGACCTCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAATTa > 2:3088266/1‑150 (MQ=255) aGTGTGCCATCAGCATTAACACGCAAAGTTTCGCGCTCCAGCCCACGCTGTATCCCCTTTAACGCCTGAGGATGTTTTTCCAGCCAGGCCA‑GCGCCTGTGATACGTCCGGGATCAAATTGACCTCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAATTa > 1:2920674/1‑150 (MQ=255) aGTGTGCCAGCAGCATTACCCCGCAAAGTTTCGCGCTCCAGCCCCCGCTGTACCCCCTTAAACGCCTGAGGATTTTTTCCCAGCCAGGCCA‑GCGCCTGTGATACGTCGGGGATAAAATTGCCCTCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAATTa < 2:2351000/150‑1 (MQ=255) tcccATCACAATTAACACGAAAAGTTTCGCGCTCCAGCCCACGCTGTATCCCTTTTAACCCCTGAGGATTTTTTCCCAGCAAGGCCA‑GCGCTTGTGATACGTCCGGGATAAAATGGACCCCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAATTAGCAt < 2:945213/148‑1 (MQ=255) aTCAGCATTAACACGCAAAGTTTCGCGCTCCAGCCCACGCTGTATCCCCTTTAACGCCTGAGGATGTTTTTCCAGCCAGGCCA‑GCGCCTGTGATACGTCCGGGATCAAATTGACCTCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAATTAGCATAACt < 1:3018930/150‑1 (MQ=255) gCATTAACACGCAAAGTTTCGCGCTCCAGCCCACGCTGTATCCCCTTTAACGCCTGAGGATGTTTTTCCAGCCAGGCCA‑GCGCCTGTGATACGTCCGGGATCAAATTGACCTCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAATTAGCATAACTGTaa > 2:1374132/1‑150 (MQ=255) cATTAACCCGCAAAGTTTCCCCCTCCACCCCACGCTGTACCCCTTTTAACGCCGGAGGATGTTTTTCCAGCCAGGCCA‑GCGCTTGTGATACGTCCGGGATAAAATTGACCCCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAATTAGCATAACTGTAAt < 2:2753933/150‑1 (MQ=255) tAACACGCAAAGTTTCGCGCTCCAGCCCACGCTGTATCCCCTTTAACGCCTGAGGATGTTTTTCCAGCCAGGCCA‑GCGCCTGTGATACGTCCGGGATCAAATTGACCTCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAATTAGCATAACTGTAATGGt > 2:879231/1‑150 (MQ=255) tAACACGCAAAGTTTCGCGCTCCAGCCCACGCTGTATCCCCTTTAACGCCTGAGGATGTTTTTCCAGCCAGGCCA‑GCGCCTGTGATACGTCCGGGATCAAATTGACCTCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAATTAGCATAACTGTAATGGt > 2:3999363/1‑150 (MQ=255) cacGCAAAGTTTCGCGCTCCAGCCCACGCTGTATCCCCTTTAACGCCTGAGGATGTTTTTCCAGCCAGGCCA‑GCGCCTGTGATACGTCCGGGATCAAATTGCCCTCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAATTAGCATAACTGTAATGGTGAc < 1:1574498/150‑1 (MQ=255) cGCAAAGTTTCGCGCTCCAGCCCACGCTGTATCCCCTTTAACGCCTGAGGATGTTTTTCCAGCCAGGCCA‑GCGCCTGTGATACGTCCGGGATCAAATTGACCTCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAATTAGCATAACTGTAATGGTGACCa > 1:1201771/1‑150 (MQ=255) gCAAAGTTTCGCGCTCCAGCCCACGCTGTATCCCCTTTAACGCCTGAGGATGTTTTTCCAGCCAGGCCA‑GCGCCTGTGATACGTCCGGGATAAAATTGCCCTCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAATTAGCATAACTGTAATGGTGACCat < 1:532321/150‑1 (MQ=255) aaaGTTTCCCGCCCCACCCCACGCTGTATCCCCTTTAACGCCTGAGGATGTTTTTCCAGCCAGGCCA‑GCGCCTGTGATCCGTCCGGTATCAAATTGCCCTCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAATTAGCATAACTGTAATGGTGACCatat < 2:4299718/150‑1 (MQ=255) aaGTTTCGCGCTCCAGCCCCCGCTGTACCCCTTTTAACGCCTGAGGATTTTTTTCCAGCCAGGCCA‑GCGCCTGTGATACGTCCGGGATCAAATTGCCCTCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAATTAGCATAACTGTAATGGTGACCATAtg < 2:3126689/150‑1 (MQ=255) aGTTTCGCGCTCCAGCCCACGCTGTACCCCCTTTAACGCCTGAGGATGTTTTTCCAGCCAGGCCA‑GCGCCTGTGATACGTCCGGGATCAAATTGCCCCCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAATTAGCATAACTGTAATGGTGACCATAtgt < 2:2987663/150‑1 (MQ=255) gTTTCGCGCTCCAGCCCACGCTGTATCCCCTTTAACGCCTGAGGATTTTTTCCCAGCCAGGCCA‑GCGCCTGTGATACGTCCGGGATCAAATTGCCCTCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAATTAGCATAACTGTAATGGTGACCATAtgtg < 2:2010152/150‑1 (MQ=255) tttCGCGCTCCAGCCCACGCTGTATCCCCTTTAACGCCTGAGGATGTTTTTCCAGCCAGGCCA‑GCGCCTGTGATACGTCCGGGATCAAATTGCCCTCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAATTAGCATAACTGTAATGGTGACCATATGTGc < 2:1856007/150‑1 (MQ=255) tttCGCGCTCCAGCCCACGCTGTATCCCCTTTAACGCCTGAGGATGTTTTTCCAGCCAGGCCA‑GCGCCTGTGATACGTCCGGGATCAAATTGACCTCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAATTAGCATAACTGTAATGGTGACCATATGTGc < 1:2344092/150‑1 (MQ=255) tttCGCGCCCCAGCCCACGCTGTATCCCCTTTACCGCCTGAGGATGTTTTCCCAGCCAGGCCA‑GCGCCTGTGATACGTCCGGGATCAAATTGACCTCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAATTAGCATAACTGTAATGGTGACCATATGTGc < 1:2458240/150‑1 (MQ=255) tCGCGTTCCGGCCCACTGTGTACCCCCTTAAACGCTTGAGAATGTTTTTCCAGCCGGGCCA‑GCGCCTGTGATACGTCCGGGATAAAATTGCCCTCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAATTAGCATAACTGTAATGGTGACCATATGTGCAg < 2:3328224/150‑1 (MQ=255) gcccTCCAGCCCACGCTGTATCCCCTTTAACGCCTGAGGATGTTTTTCCAGCCAGGCCA‑GCGCCTGTGATACGTCCGGGATCAAATTGACCCCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAATTAGCATAACTGTAATGGTGACCATATGTGCAGGc < 1:2352694/147‑1 (MQ=255) cgcTCCAGCCCACGCTGTCTCCCTTTTACCGCCTGAGGATTTTTTTCCAGCCAGGCCA‑GCGCCTGTGATACGTCGGGGATAAAATTGACCTCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAATTAGCATAACTGTAATGGTGACCATATGTGCAGGcc < 2:4113839/150‑1 (MQ=255) cTCCAGCCCACGCTGTATCCCCTTTAACGCCTGAGGATGTTTTTCCAGCCAGGCCA‑GCGCCTGTGATACGTCCGGGATCAAATTGACCTCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAATTAGCATAACTGTAATGGTGACCATATGTGCAGGCCTa > 2:3564239/1‑150 (MQ=255) cAGCCCACGCTGTATCCCCTTTAACGCCTGAGGATGTTTTTCCAGCCGGGCCC‑GCGCCTGTGATACGTCCGGGATCAAATTGCCCTCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAATTAGCATAACTGTAATGGTGACCATATGTGCAGGCCTACaa < 1:4044755/150‑1 (MQ=255) gCCCACGCTGTATCCCCTTTAACGCCTGAGGATGTTTTTCCAGCCAGGCCA‑GCGCCTGTGATACGTCCGGGATCAAATTGACCTCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAATTAGCATAACTGTAATGGTGACCATATGTGCAGGCCTACAAtt > 1:140101/1‑150 (MQ=255) cccACGCTGTATCCCCTTTAACGCCTGAGGATGTTTTTCCAGCCAGGCCA‑GCGCCTGTGATACGTCCGGGATCAAATTGACCTCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAATTAGCATAACTGTAATGGTGACCATATGTGCAGGCCTACAATTa > 1:3812078/1‑150 (MQ=255) aCGCTGTCTCCCCTTTACCGCCTGAGGATGTTTTCCCAGCCAGGCCA‑GCGCTTGTGATACGTCCGGGATCAAATTGCCCTCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAATTAGCATAACTGTAATGGTGACCATATGTGCAGGCCTACAATTAGTg < 2:2178738/150‑1 (MQ=255) gCTGTATCCCCTTTAACGCCTGAGGATGTTTTTCCAGCCAGGCCA‑GCGCCTGTGATACGTCCGGGATCAAATTGACCTCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAATTAGCATAACTGTAATGGTGACCATATGTGCAGGCCTACAATTAGTGcc > 1:2651987/1‑150 (MQ=255) gTATCCCCTTTAACGCCTGAGGATGTTTTTCCAGCCAGGCCA‑GCGCCTGTGATACGTCCGGGATCAAATTGACCTCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAATTAGCATAACTGTAATGGTGACCATATGTGCAGGCCTACAATTAGTGccacc < 2:1071354/150‑1 (MQ=255) tATCCCCTTTAACGCCTGAGGATGTTTTTCCAGCCAGGCCA‑GCGCCTGTGATACGTCCGGGATCAAATTGACCTCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAATTAGCATAACTGTAATGGTGACCATATGTGCAGGCCTACAATTAGTGccacca > 2:3707883/1‑150 (MQ=255) ccccctTTTAACGCTTGAGGATGTTTTCCCGGCCGGGCCA‑GCGCCTGTGATCCGTCCGGAATCAAATGGACCCCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAATTAGCATAACTGTAATGGTGACCATATGTGCAGGCCTACAATTAGTGCcaccac < 2:419957/148‑1 (MQ=255) tCCCCTTTAACGCCTGAGGATGTTTTTCCAGCCAGGCCA‑GCGCCTGTGATACGTCCGGGATCAAATTGACCTCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAATTAGCATAACTGTAATGGTGACCATATGTGCAGGCCTACAATTAGTGCCACcaca > 1:2552584/1‑150 (MQ=255) cTTTAACGCCTGAGGATGTTTTTCCAGCCAGGCCA‑GCGCTTGTGATACGTCCGGGATCAAATTGACCTCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAATTAGCATAACTGTAATGGTGACCATATGTGCAGGCCTACAATTAGTGCCACCAcatcat < 1:2696520/150‑1 (MQ=255) ttAACGCCTGAGGATGTTTTTCCAGCCAGGCCA‑GCGCCTGTGATACGTCCGGGATCAAATTGACCTCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAATTAGCATAACTGTAATGGTGACCATATGTGCAGGCCTACAATTAGTGCCACCACATCATGc > 2:3615484/1‑150 (MQ=255) tAACGCCTGAGGATGTTTTTCCAGCCAGGCCG‑GCGCCTGTGATACGTCCGGGATCAAATTGACCTCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAATTAGCATAACTGTAATGGTGACCATATGTGCAGGCCTACAATTAGTGCCACCACATCATGcc < 1:3529374/150‑1 (MQ=255) aaCGCCTGAGGATGTTTTTCCAGCCAGGCCA‑GCGCCTGTGATACGTCCGGGATCAAATTGACCTCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAATTAGCATAACTGTAATGGTGACCATATGTGCAGGCCTACAATTAGTGCCACCACATCATGccc < 1:1733809/150‑1 (MQ=255) aCGCCTGAGGATGTTTTCCCAGCCAGGCCA‑GCGCCTGTGATACGTCCGGGATCAAATTGCCCTCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAATTAGCATAACTGTAATGGTGACCATATGTGCAGGCCTACAATTAGTGCCACCACATCATGCCCt < 2:3943302/150‑1 (MQ=255) cGCCAGAGGATTTTTTTCCAGCC‑GGCCAGGCGCCTGTGATACGCCGGGGATCAATTTGCCCTCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAATTAGCATAACTGTAATGGTGACCATATGTGCAGGCCTACAATTAGTGCCACCACATCATGCCCTg < 2:2277807/150‑1 (MQ=255) ccTGAGGATGTTTTTCCAGCCAGGCCA‑GCGCCTGTGATACGTCCGGGATCAAATTGACCTCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAATTAGCATAACTGTAATGGTGACCATATGTGCAGGCCTACAATTAGTGCCACCACATCATGCCCTGaa > 2:163744/1‑150 (MQ=255) gggggAGGTTTTCCCGTCCGGCCCA‑GCGCCTGTGATGCGGCCGGGATCAAATTGCCCCCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAATTAGCATAACTGTAATGGTGACCATATGTGCAGGCCTACAATTAGTGCCACCACATCATGCCCTGAACg < 2:4141127/147‑1 (MQ=255) ggATGTTTTTCCAGCCAGGCCA‑GCGCCTGTGATACGTCCGGGATCAAATTGACCTCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAATTAGCATAACTGTAATGGTGACCATATGTGCAGGCCTACAATTAGTGCCACCACATCATGCCCTGAACGGTc > 1:3902284/1‑150 (MQ=255) gATGTTTTTCCAGCCAGGCCA‑GCGCCTGTGATACGTCCGGGATCAAATTGCCCTCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAATTAGCATAACTGTAATGGTGACCATATGTGCAGGCCTACAATTAGTGCCACCACATCATGCCCTGAACGGTCg < 1:1279785/150‑1 (MQ=255) gATGTTTTCCCAGCCAGGCCA‑GCGCCTGTGATACGTCCGGGATCAAATTGCCCTCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAATTAGCATAACTGTAATGGTGACCATATGTGCAGGCCTACAATTAGTGCCACCACATCATGCCCTGAACGGTCg < 2:110154/150‑1 (MQ=255) aatttttttCCCGCCGGGCCA‑CCGCCTGTGATACGTCCGGGATAAAATTGACCTCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAATTAGCATAACTGTAATGGTGACCATATGTGCAGGCCTACAATTAGTGCCACCACATCATGCCCTGAACGGTCg < 2:2378489/146‑1 (MQ=255) tttttCCAGCCAGGCCA‑GCGCCTGTGATACGTCCGGGATCAAATTGACCTCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAATTAGCATAACTGTAATGGTGACCATATGTGCAGGCCTACAATTAGTGCCACCACATCATGCCCTGAACAGTCgctgc < 2:784687/150‑1 (MQ=255) ttttCCAGCCAGGCCA‑GCGCCTGTGATACGTCCGGGATCAAATTGACCTCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAATTAGCATAACTGTAATGGTGACCATATGTGCAGGCCTACAATTAGTGCCACCACATCATGCCCTGAACGGTCgctgct < 1:1468929/150‑1 (MQ=255) tttcCCACCCAGGCCA‑GCGCCTGTGATACGTCCGGGATCAAATTGCCCTCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAATTAGCATAACTGTAATGGTGACCATATGTGCAGGCCTACAATTAGTGCCACCACATCATGCCCTGAACGGTCgctgct < 2:4330651/150‑1 (MQ=255) cccagccagGCCA‑GCGCCTGTGATACGTCCGGGATAAAATTGCCCTCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAATTAGCATAACTGTAATGGTGACCATATGTGCAGGCCTACAATTAGTGCCACCACATCATGCCCTGAACGGTCGCTGctgca < 2:1044719/149‑1 (MQ=255) ccagccagGCGA‑GCCCCTGTGATACGGCCGGGATCAAATTGCCCCCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAATTAGCATAACTGTAATGGTGACCATATGTGCAGGCCTACAATTAGTGCCACCACATCATGCCCTGAACGGTCGCTGctgcaa < 2:748040/150‑1 (MQ=255) ccagccagGCCA‑GCGCCTGTGATACGTCCGGGATCAAATTGACCTCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAATTAGCATAACTGTAATGGTGACCATATGTGCAGGCCTACAATTAGTGCCACCACATCATGCCCTGAACGGTCGCTGctgcaa > 1:1862474/1‑150 (MQ=255) agccagGCCA‑GCGCCTGTGATACGTCCGGGATCAAATTGCCCTCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAATTAGCATAACTGTAATGGTGACCATATGTGCAGGCCTACAATTAGTGCCACCACATCATGCCCTGAACGGTCGCTGctgcaact < 1:3192385/150‑1 (MQ=255) gccaggcca‑gCGCCTGTGATACGTCCGGGATCAAATTGCCCTCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAATTAGCATAACTGTAATGGTGACCATATGTGCAGGCCTACAATTAGTGCCACCACATCATGCCCTGAACGGTCGCTGctgcaactg < 1:3842277/150‑1 (MQ=255) ccaggcca‑gCGCCTGTGATACGTCCGGGATCAAATTGACCTCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAATTAGCATAACTGTAATGGTGACCATATGTGCAGGCCTACAATTAGTGCCACCACATCATGCCCTGAACGGTCGCTGctgcaactgc > 1:2880199/1‑150 (MQ=255) caggcca‑gCGCCTGTGATACGTCCGGGATCAAATTGACCTCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAATTAGCATAACTGTAATGGTGACCATATGTGCAGGCCTACAATTAGTGCCACCACATCATGCCCTGAACGGTCGCTGctgcaactgca > 2:1459124/1‑150 (MQ=255) aggcca‑gCGCCTGTGATACGTCCGGGATCAAATTGACCTCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAATTAGCATAACTGTAATGGTGACCATATGTGCAGGCCTACAATTAGTGCCACCACATCATGCCCTGAACGGTCGCTGctgcaactgcaa > 2:2205345/1‑150 (MQ=255) cca‑gCGCCTGTGATACGTCCGGGATCAAATTGACCTCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAATTAGCATAACTGTAATGGTGACCATATGTGCAGGCCTACAATTAGTGCCACCACATCATGCCCTGAACGGTCGCTGCTGCAACTGCAACAt > 1:123989/1‑150 (MQ=255) cca‑gCGCCTGTGATACGTCCGGGATCAAATTGACCTCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAATTAGCATAACTGTAATGGTGACCATATGTGCAGGCCTACAATTAGTGCCACCACATCATGCCCTGAACGGTCGCTGCTGCAACTGCAACAt > 2:2519848/1‑150 (MQ=255) cca‑gCGCCTGTGATACGTCCGGGATCAAATTGACCTCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAATTAGCATAACTGTAATGGTGACCATATGTGCAGGCCTACAATTAGTGCCACCACATCATGCCCTGAACGGTCGCTGCTGCAACTGCAACAt > 1:1059731/1‑150 (MQ=255) cca‑gCGCCTGTGATACGTCCGGGATCAAATTGACCTCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAATTAGCATAACTGTAATGGTGACCATATGTGCAGGCCTACAATTAGTGCCACCACATCATGCCCTGAACGGTCGCTGCTGCAACTGCAACAt < 1:3276039/150‑1 (MQ=255) cca‑gCGCCTGTGATACGTCCGGGATCAAATTGACCTCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAATTAGCATAACTGTAATGGTGACCATATGTGCAGGCCTACAATTAGTGCCACCACATCATGCCCTGAACGGTCGCTGCTGCAACTGCAACAt > 1:4167810/1‑150 (MQ=255) a‑gCGCCTGTGATACGTCCGGGATCAAATTGACCTCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAATTAGCATAACTGTAATGGTGACCATATGTGCAGGCCTACAATTAGTGCCACCACATCATGCCCTGAACGGTCGCTGCTGCAACTGCAACATAg > 1:1214965/1‑150 (MQ=255) a‑gCGCCTGTGATACGTCCGGGATCAAATTGACCTCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAATTAGCATAACTGTAATGGTGACCATATGTGCAGGCCTACAATTAGTGCCACCACATCATGCCCTGAACGGTCGCTGCTGCAACTGCAACATAg > 2:1219259/1‑150 (MQ=255) gcgcCTGTGATACGTCCGGGATCAAATTGACCTCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAATTAGCATAACTGTAATGGTGACCATATGTGCAGGCCTACAATTAGTGCCACCACATCATGCCCTGAACGGTCGCTGCTGCAACTGCAACATAGc > 2:2055198/1‑150 (MQ=255) gcgcCTGTGATACGTCCGGGATCAAATTGACCTCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAATTAGCATAACTGTAATGGTGACCATATGTGCAGGCCTACAATTAGTGCCACCACATCATGCCCTGAACGGTCGCTGCTGCAACTGCAACATAGc < 1:1782157/150‑1 (MQ=255) ccTGTGATACGTCCGGGATCAAATTGACCTCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAATTAGCATAACTGTAATGGTGACCATATGTGCAGGCCTACAATTAGTGCCACCACATCATGCCCTGAACGGTCGCTGCTGCAACTGCAACATAGCGTa > 1:626377/1‑150 (MQ=255) tgtgATACGTCCGGGATCAAATTGCCCTCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAATTAGCATAACTGTAATGGTGACCATATGTGCAGGCCTACAATTAGTGCCACCACATCATGCCCTGAACGGTCGCTGCTGCAACTGCAACATAGCGTAAc < 1:1163639/150‑1 (MQ=255) tgtgATACGTCCGGGATCAAATTGACCTCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAATTAGCATAACTGTAATGGTGACCATATGTGCAGGCCTACAATTAGTGCCACCACATCATGCCCTGAACGGTCGCTGCTGCAACTGCAACATAGCGTAAc < 1:3391640/150‑1 (MQ=255) tgtgATACGTCCGGGATCAAATTGACCTCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAATTAGCATAACTGTAATGGTGACCATATGTGCAGGCCTACAATTAGTGCCACCACATCATGCCCTGAACGGTCGCTGCTGCAACTGCAACATAGCGTAAc < 1:3729479/150‑1 (MQ=255) gtgATACGTCCGGGATCAAATTGCCCTCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAATTAGCATAACTGTAATGGTGACCATATGTGCAGGCCTACAATTAGTGCCACCACATCATGCCCTGAACGGTCGCTGCTGCAACTGCAACATAGCGTAACg < 1:913846/150‑1 (MQ=255) aTACGTCCGGGATCAAATTGCCCTCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAATTAGCATAACTGTAATGGTGACCATATGTGCAGGCCTACAATTAGTGCCACCACATCATGCCCTGAACGGTCGCTGCTGCAACTGCAACATAGCGTAACGCtt < 2:2826727/150‑1 (MQ=255) aTACGTCCGGGATCAAATTGCCCTCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAATTAGCATAACTGTAATGGTGACCATATGTGCAGGCCTACAATTAGTGCCACCACATCATGCCCTGAACGGTCGCTGCTGCAACTGCAACATAGCGTAACGCtt < 1:4349222/150‑1 (MQ=255) aTACGTCCGGGATAAAATTGACCTCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAATTAGCATAACTGTAATGGTGACCATATGTGCAGGCCTACAATTAGTGCCACCACATCATGCCCTGAACGGTCGCTGCTGCAACTGCAACATAGCGTAACGCtt < 2:1241618/150‑1 (MQ=255) tACGTCCGGGATCAAATTGCCCTCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAATTAGCATAACTGTAATGGTGACCATATGTGCAGGCCTACAATTAGTGCCACCACATCATGCCCTGAACGGTCGCTGCTGCAACTGCAACATAGCGTAACGCttt < 1:1984710/150‑1 (MQ=255) gTCCGGGATCAAATTGACCTCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAATTAGCATAACTGTAATGGTGACCATATGTGCAGGCCTACAATTAGTGCCACCACATCATGCCCTGAACGGTCGCTGCTGCAACTGCAACATAGCGTAACGCTTTAcc > 1:3129068/1‑150 (MQ=255) ccGGGATCAAATTGACCTCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAATTAGCATAACTGTAATGGTGACCATATGTGCAGGCCTACAATTAGTGCCACCACATCATGCCCTGAACGGTCGCTGCTGCAACTGCAACATAGCGTAACGCTTTACCaa > 1:2081818/1‑150 (MQ=255) cGGGCTCAAATTGCCCTCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAATTAGCATAACTGTAATGGTGACCATATGTGCAGGCCTACAATTAGTGCCACCACATCATGCCCTGAACGGTCGCTGCTGCAACTGCAACATAGCGTAACGCTTTACCAAg < 1:956541/150‑1 (MQ=255) ggATCAATTGGCCTTCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAATTAGCATAACTGTAATGGTGACCATATGTGCAGGCCTACAATTAGTGCCACCACATCATGCCCTGAACGGTCGCTGCTGCAACTGCAACATAGCGTAACGCTTTACCAAGGc < 1:1606600/150‑1 (MQ=255) ggATCAAATTGACCTCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAATTAGCATAACTGTAATGGTGACCATATGTGCAGGCCTACAATTAGTGCCACCACATCATGCCCTGAACGGTCGCTGCTGCAACTGCAACATAGCGTAACGCTTTACCAAGGc > 1:848911/1‑150 (MQ=255) ggATCAAATTGACCTCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAATTAGCATAACTGTAATGGTGACCATATGTGCAGGCCTACAATTAGTGCCACCACATCATGCCCTGAACGGTCGCTGCTGCAACTGCAACATAGCGTAACGCTTTACCAAGGc > 1:717345/1‑150 (MQ=255) aTCAAATTGCCCTCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAATTAGCATAACTGTAATGGTGACCATATGTGCAGGCCTACAATTAGTGCCACCACATCATGCCCTGAACGGTCGCTGCTGCAACTGCAACATAGCGTAACGCTTTACCAAGGcac < 1:3602562/150‑1 (MQ=255) aTCAAATTGACCTCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAATTAGCATAACTGTAATGGTGACCATATGTGCAGGCCTACAATTAGTGCCACCACATCATGCCCTGAACGGTCGCTGCTGCAACTGCAACATAGCGTAACGCTTTACCAAGGcac > 1:2183741/1‑150 (MQ=255) taaatttGACCTCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAATTAGCATAACTGTAATGGTGACCATATGTGCAGGCCTACAATTAGTGCCACCACATCATGCCCTGAACGGTCGCTGCTGCAACTGCAACATAGCGTAACGCTTTACCAAGGcaca < 2:3200502/145‑1 (MQ=255) aaaTTGCCCTCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAATTAGCATAACTGTAATGGTGACCATATGTGCAGGCCTACAATTAGTGCCACCACATCATGCCCTGAACGGTCGCTGCTGCAACTGCAACATAGCGTAACGCTTTACCAAGGCACaaa < 2:488199/150‑1 (MQ=255) aaTTGCCCTCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAATTAGCATAACTGTAATGGTGACCATATGTGCAGGCCTACAATTAGTGCCACCACATCATGCCCTGAACGGTCGCTGCTGCAACTGCAACATAGCGTAACGCTTTACCAAGGCACaaaa < 2:3867945/150‑1 (MQ=255) aTTGACCTCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAATTAGCATAACTGTAATGGTGACCATATGTGCAGGCCTACAATTAGTGCCACCACATCATGCCCTGAACGGTCGCTGCTGCAACTGCAACATAGCGTAACGCTTTACCAAGGCACaaaaa > 1:2672223/1‑150 (MQ=255) gACCTCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAATTAGCATAACTGTAATGGTGACCATATGTGCAGGCCTACAATTAGTGCCACCACATCATGCCCTGAACGGTCGCTGCTGCAACTGCAACATAGCGTAACGCTTTACCAAGGCACaaaaaaaa < 1:611524/150‑1 (MQ=255) aCCTCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAATTAGCATAACTGTAATGGTGACCATATGTGCAGGCCTACAATTAGTGCCACCACATCATGCCCTGAACGGTCGCTGCTGCAACTGCAACATAGCGTAACGCTTTACCAAGGCACAAAAAAAAg < 2:642917/150‑1 (MQ=255) | CTAATGCTTCAGGATGACCTGTTGTTGCCAGTGTGCCATCAGCATTAACACGCAAAGTTTCGCGCTCCAGCCCACGCTGTATCCCCTTTAACGCCTGAGGATGTTTTTCCAGCCAGGCCA‑GCGCCTGTGATACGTCCGGGATCAAATTGACCTCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAATTAGCATAACTGTAATGGTGACCATATGTGCAGGCCTACAATTAGTGCCACCACATCATGCCCTGAACGGTCGCTGCTGCAACTGCAACATAGCGTAACGCTTTACCAAGGCACAAAAAAAAG > AP012306/2326830‑2327128 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |