New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AP012306 | = 2262152 | 449 (1.430) | 7 (0.020) | 7/290 | 15.4 | 1.6% | intergenic (‑76/‑229) | yfiD/ung | pyruvate formate lyase subunit/uracil‑DNA‑glycosylase |
? | AP012306 | = 2262160 | 449 (1.470) | intergenic (‑84/‑221) | yfiD/ung | pyruvate formate lyase subunit/uracil‑DNA‑glycosylase | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 460 total aligned reads displayed.
CAGCAGCCAGAAAGAGTTCAGCAGATCGTCGTTAGCGGCTTTAGTAATCTGGATACCTGTAATCATGTGATGCCTCCCCGGCAAAATTATTTGATTTGTTCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGTAAAACCATTGTTGCTTGAGTGTATATATACTCCTCAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAATCAATAAAAACCACACATCAAGTATGGTCGCAAATGGATTTTATTGTTTTACATCAACTTATGCGGGTGTGAAATTTTACCAATTTACATTTTTTTGCACTCGTTTAAGTCTAAAA > AP012306/2262011‑2262309 | agcagcCAGAAAGAGTTCAGCAGATCGTCGTTAGCGGCTTTAGTAATCTGGATACCTGTAATCATGTGATGCCTCCCCGGCAAAATTATTTGATTTGTTCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGTAAAACCATTGTTGCTTGAGTGtatatata > 2:2628816/1‑150 (MQ=255) cagcCAGAAAGAGTTCAGCAGATCGTCGTTAGCGGCTTTAGTAATCTGGATACCTGTAATCATGTGATGCCTCCCCGGCAAAATTATTTGATTTGTTCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGTAAAACCATTGTTGCTTGAGTGTATATATAct < 2:4101336/150‑1 (MQ=255) ccAGAAAGAGTTCAGCAGATCGTCGTTAGCGGCTTTAGTAATCTGGATACCTGTAATCATGTGATGCCTCCCCGGCAAAATTATTTGATTTGTTCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGTAAAACCATTGTTGCTTGAGTGTATATATActcct < 2:2084656/150‑1 (MQ=255) cAGAAAGAGTTCAGCAGATCGTCGTTAGCGGCTTTAGTAATCTGGATACCTGTAATCATGTGATGCCTCCCCGGCAAAATTATTTGATTTGTTCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGTAAAACCATTGTTGCTTGAGTGTATATATActcctc < 1:4275589/150‑1 (MQ=255) cAGAAAGAGTTCAGCAGATCGTCGTTAGCGGCTTTAGTAATCTGGATACCTGTAATCATGTGATGCCTCCCCGGCAAAATTATTTGATTTGTTCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGTAAAACCATTGTTGCTTGAGTGTATATATActcctc > 2:2133036/1‑150 (MQ=255) aGAAAGAGTTCAGCAGATCGTCGTTAGCGGCTTTAGTAATCTGGATACCTGTAATCATGTGATGCCTCCCCGGCAAAATTATTTGATTTGTTCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGTAAAACCATTGTTGCTTGAGTGTATATATACTCCTCa > 2:3103206/1‑150 (MQ=255) agTTCAGCAGATCGTCGTTAGCGGCTTTAGTAATCTGGATACCTGTAATCATGTGATGCCTCCCCGGCAAAATTATTTGATTTGTTCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGTAAAACCATTGTTGCTTGAGTGTATATATACTCCTCAAACAcc < 2:795750/150‑1 (MQ=255) cagcagATCGTCGTTAGCGGCTTTAGTAATCTGGATACCTGTAATCATGTGATGCCTCCCCGGCAAAATTATTTGATTTGTTCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGTAAAACCATTGTTGCTTGAGTGTATATATACTCCTCAAACACCCTTg > 1:1087336/1‑150 (MQ=255) cagcagATCGTCGTTAGCGGCTTTAGTAATCTGGATACCTGTAATCATGTGATGCCTCCCCGGCAAAATTATTTGATTTGTTCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGTAAAACCATTGTTGCTTGAGTGTATATATACTCCTCAAACACCCTTg < 2:3514828/150‑1 (MQ=255) cagATCGTCGTTAGCGGCTTTAGTAATCTGGATACCTGTAATCATGTGATGCCTCCCCGGCAAAATTATTTGATTTGTTCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGTAAAACCATTGTTGCTTGAGTGTATATATACTCCTCAAACACCCTTGAAt > 1:831157/1‑150 (MQ=255) cgtcgtTAGCGGCTTTAGTAATCTGGATACCTGTAATCATGTGATGCCTCCCCGGCAAAATTATTTGATTTGTTCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGTAAAACCATTGTTGCTTGAGTGTATATATACTCCTCAAACACCCTTGAATCTTTg > 2:3795153/1‑150 (MQ=255) gtcgtTAGCGGCTTTAGTAATCTGGATACCTGTAATCATGTGATGCCTCCCCGGCAAAATTATTTGATTTGTTCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGTAAAACCATTGTTGCTTGAGTGTATATATACTCCTCAAACACCCTTGAATCTTTGa > 2:1541252/1‑150 (MQ=255) tcgtTAGCGGCTTTAGTAATCTGGATACCTGTAATCATGTGATGCCTCCCCGGCAAAATTATTTGATTTGTTCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGTAAAACCATTGTTGCTTGAGTGTATATATACTCCTCAAACACCCTTGAATCTTTGAt < 1:4152787/150‑1 (MQ=255) gCGGCTTTAGTAATCTGGATACCTGTAATCATGTGATGCCTCCCCGGCAAAATTATTTGATTTGTTCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGTAAAACCATTGTTGCTTGAGTGTATATATACTCCTCAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAAt < 1:3594181/150‑1 (MQ=255) gCTTTAGTAATCTGGATACCTGTAATCATGTGATGCCTCCCCGGCAAAATTATTTGATTTGTTCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGTAAAACCATTGTTGCTTGAGTGTATATATACTCCTCAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAATCaa < 1:2322765/150‑1 (MQ=255) tttAGTAATCTGGATACCTGTAATCATGTGATGCCTCCCCGGCAAAATTATTTGATTTGTTCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGTAAAACCATTGTTGCTTGAGTGTATATATACTCCTCAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAATCAATa < 1:2544666/150‑1 (MQ=255) ttAGTAATCTGGATACCTGTAATCATGTGATGCCTCCCCGGCAAAATTATTTGATTTGTTCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGTAAAACCATTGTTGCTTGAGTGTATATATACTCCTCAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAATCAATaa < 1:612163/150‑1 (MQ=255) ttAGTAATCTGGATACCTGTAATCATGTGATGCCTCCCCGGCAAAATTATTTGATTTGTTCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGTAAAACCATTGTTGCTTGAGTGTATATATACTCCTCAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAATCAATaa > 1:576103/1‑150 (MQ=255) tAGTAATCTGGATACCTGTAATCATGTGATGCCTCCCCGGCAAAATTATTTGATTTGTTCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGTAAAACCATTGTTGCTTGAGTGTATATATACTCCTCAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAATCAATaaa > 2:2299946/1‑150 (MQ=255) gTAATCTGGATACCTGTAATCATGTGATGCCTCCCCGGCAAAATTATTTGATTTGTTCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGTAAAACCATTGTTGCTTGAGTGTATATATACTCCTCAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAATCAATaaaaa > 1:3002490/1‑150 (MQ=255) tAATCTGGATACCTGTAATCATGTGATGCCTCCCCGGCAAAATTATTTGATTTGTTCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGTAAAACCATTGTTGCTTGAGTGTATATATACTCCTCAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAATCAATAAAAAc < 2:859000/150‑1 (MQ=255) tAATCTGGATACCTGTAATCATGTGATGCCTCCCCGGCAAAATTATTTGATTTGTTCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGTAAAACCATTGTTGCTTGAGTGTATATATACTCCTCAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAATCAATAAAAAc < 1:789166/150‑1 (MQ=255) aaTCTGGATACCTGTAATCATGTGATGCCTCCCCGGCAAAATTATTTGATTTGTTCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGTAAAACCATTGTTGCTTGAGTGTATATATACTCCTCAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAATCAATAAAAAcc < 2:2230089/150‑1 (MQ=255) aaTCTGGATACCTGTAATCATGTGATGCCTCCCCGGCAAAATTATTTGATTTGTTCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGTAAAACCATTGTTGCTTGAGTGTATATATACTCCTCAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAATCAATAAAAAcc > 1:728578/1‑150 (MQ=255) aTCTGGATACCTGTAATCATGTGATGCCTCCCCGGCAAAATTATTTGATTTGTTCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGTAAAACCATTGTTGCTTGAGTGTATATATACTCCTCAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAATCAATAAAAACca < 1:2589903/150‑1 (MQ=255) aTCTGGATACCTGTAATCATGTGATGCCTCCCCGGCAAAATTATTTGATTTGTTCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGTAAAACCATTGTTGCTTGAGTGTATATATACTCCTCAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAATCAATAAAAACca > 2:4015707/1‑150 (MQ=255) aTCTGGATACCTGTAATCATGTGATGCCTCCCCGGCAAAATTATTTGATTTGTTCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGTAAAACCATTGTTGCTTGAGTGTATATATACTCCTCAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAATCAATAAAAACca > 2:1345987/1‑150 (MQ=255) cTGGATACCTGTAATCATGTGATGCCTCCCCGGCAAAATTATTTGATTTGTTCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGTAAAACCATTGTTGCTTGAGTGTATATATACTCCTCAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAATCAATAAAAACcaca > 2:298148/1‑150 (MQ=255) tGGATACCTGTAATCATGTGATGCCTCCCCGGCAAAATTATTTGATTTGTTCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGTAAAACCATTGTTGCTTGAGTGTATATATACTCCTCAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAATCAATAAAAACcacac < 1:4098399/150‑1 (MQ=255) ggATACCTGTAATCATGTGATGCCTCCCCGGCAAAATTATTTGATTTGTTCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGTAAAACCATTGTTGCTTGAGTGTATATATACTCCTCAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAATCAATAAAAACcacaca > 2:930796/1‑150 (MQ=255) gATACCTGTAATCATGTGATGCCTCCCCGGCAAAATTATTTGATTTGTTCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGTAAAACCATTGTTGCTTGAGTGTATATATACTCCTCAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAATCAATAAAAACCACACAt < 1:3937925/150‑1 (MQ=255) gATACCTGTAATCATGTGATGCCTCCCCGGCAAAATTATTTGATTTGTTCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGTAAAACCATTGTTGCTTGAGTGTATATATACTCCTCAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAATCAATAAAAACCACACAt < 1:1203250/150‑1 (MQ=255) ccTGTAATCATGTGATGCCTCCCCGGCAAAATTATTTGATTTGTTCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGTAAAACCATTGTTGCTTGAGTGTATATATACTCCTCAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAATCAATAAAAACCACACATCAAg < 1:659064/150‑1 (MQ=255) 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gtATATATACTCCTCAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAATCAATAAAAACCACACATCAAGTATGGTCGCAAATGGATTTTATTGTTTTACATCAACTTATGCGGGTGTGAAATTTTACCAATTTACATTTTTTTGCACTCGTTTAAg < 2:1492059/150‑1 (MQ=255) tatatataCTCCTCAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAATCAATAAAAACCACACATCAAGTATGGTCGCAAATGGATTTTATTGTTTTACATCAACTTATGCGGGTGTGAAATTTTACCAATTTACATTTTTTTGCACTCGTTTAAGt > 2:3745562/1‑150 (MQ=255) atatataCTCCTCAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAATCAATAAAAACCACACATCAAGTATGGTCGCAAATGGATTTTATTGTTTTACATCAACTTATGCGGGTGTGAAATTTTACCAATTTACATTTTTTTGCACTCGTTTAAGTc < 1:1052065/150‑1 (MQ=255) atataCTCCTCAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAATCAATAAAAACCACACATCAAGTATGGTCGCAAATGGATTTTATTGTTTTACATCAACTTATGCGGGTGTGAAATTTTACCAATTTACATTTTTTTGCACTCGTTTAAGTCTa < 2:3388697/150‑1 (MQ=255) atataCTCCTCAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAATCAATAAAAACCACACATCAAGTATGGTCGCAAATGGATTTTATTGTTTTACATCAACTTATGCGGGTGTGAAATTTTACCAATTTACATTTTTTTGCACTCGTTTAAGTCTa < 2:2452298/150‑1 (MQ=255) ataCTCCTCAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAATCAATAAAAACCACACATCAAGTATGGTCGCAAATGGATTTTATTGTTTTACATCAACTTATGCGGGTGTGAAATTTTACCAATTTACATTTTTTTGCACTCGTTTAAGTCTaaa < 1:3714880/150‑1 (MQ=255) taCTCCTCAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAATCAATAAAAACCACACATCAAGTATGGTCGCAAATGGATTTTATTGTTTTACATCAACTTATGCGGGTGTGAAATTTTACCAATTTACATTTTTTTGCACTCGTTTAAGTCTaaaa > 2:3216337/1‑150 (MQ=255) | CAGCAGCCAGAAAGAGTTCAGCAGATCGTCGTTAGCGGCTTTAGTAATCTGGATACCTGTAATCATGTGATGCCTCCCCGGCAAAATTATTTGATTTGTTCAGCCTGTCGCGGCCAATTGGTAAAACCATTGTTGCTTGAGTGTATATATACTCCTCAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAATCAATAAAAACCACACATCAAGTATGGTCGCAAATGGATTTTATTGTTTTACATCAACTTATGCGGGTGTGAAATTTTACCAATTTACATTTTTTTGCACTCGTTTAAGTCTAAAA > AP012306/2262011‑2262309 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |