| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AP012306 | 164617 = | 366 (1.140) | 7 (0.020) | 7/288 | 13.3 | 1.8% | coding (650/1422 nt) | clcA | chloride channel, voltage‑gated |
| ? | AP012306 | 164657 = | 414 (1.330) | coding (690/1422 nt) | clcA | chloride channel, voltage‑gated | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 428 total aligned reads displayed.
GGTGCTGCTGCGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCGATTAAAGCGGTATTTATTGGTGTCATTATGTCGACCATTATGTACCGGATTTTTAATCATGAAGTTGCGTTGATTGACGTCGGTAAACTTTCTGATGCGCCGCTTAATACGCTGTGGCTTTATCTGATCCTCGGTATTATTTTTGGCATTTTCGGCCCTATTTTTAATAAATGGGTGCTGGGGATGCAGGATTTGCT > AP012306/164508‑164806 | ggTGCTGCTGCGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCGATTAAAGCGGTATTTATTGGTGTCATTATGTCGACCATTATGTACCgg < 2:1986916/150‑1 (MQ=255) ctgctgcGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCGATTAAAGCGGTATTTATTGGTGTCATTATGTCGACCATTATGTACCGGAttt < 1:3469156/150‑1 (MQ=255) ctgctgcGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCGATTAAAGCGGTATTTATTGGTGTCATTATGTCGACCATTATGTACCGGAttt < 2:1956611/150‑1 (MQ=255) gctgcGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGGATTTTTTTTTTTTTCGAAGAGATGCGGCCGCAGGTTTGCTATACGTTAATTTCGCTTAAAGCGGGATTTTTTGGTGTCATTATGTCGACCCTTATGTACCGGAttttt > 2:3860288/1‑150 (MQ=255) gcGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCGATTAAAGCGGTATTTATTGGTGTCATTATGTCGACCATTATGTACCGGATTTTTAAt < 1:3133196/150‑1 (MQ=255) ggggCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCGATTAAAGCGGTATTTATTGGTGTCATTATGTCGACCATTATGTACCGGATTTTTAATCa < 2:525827/150‑1 (MQ=255) gctggctgCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCGATTAAAGCGGTATTTATTGGTGTCATTATGTCGACCATTATGTACCGGATTTTTAATCATGa < 2:1606055/150‑1 (MQ=255) ggctgCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCGATTAAAGCGGTATTTATTGGTGTCATTATGTCGACCATTATGTACCGGATTTTTAATCATGAAGt < 2:1528448/150‑1 (MQ=255) gCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGTATTTTTTTTTTTATCGAAGAGATGCGTCCGCTGTTTCGCTATACGTTTATTTTGGTTTAAACGGTATTTTTTGGTGTTATTATTTTGTCCATTATTTACCGGATTTTTAATCTTGAAGTTgtg > 2:1736279/1‑148 (MQ=255) gCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCGATTAAAGCGGTATTTATTGGTGTCATTATGTCGACCATTATGTACCGGATTTTTAATCATGAAGTTGCg < 1:4212068/150‑1 (MQ=255) ttAACGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCGATTAAAGCGGTATTTATTGGTGTCATTATGTCGACCATTATGTACCGGATTTTTAATCATGAAGTTGCGttgattg < 1:189945/150‑1 (MQ=255) gcTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCGATTAAAGCGGTATTTATTGGTGTCATTATGTCGACCATTATGTACCGGATTTTTAATCATGAAGTTGCGTTGATTGACGTCGGTaa < 2:628206/150‑1 (MQ=255) tGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCGATTAAAGCGGTATTTATTGGTGTCATTATGTCGACCATTATGTACCGGATTTTTAATCATGAAGTTGCGTTGATTGACGTCGGTAAAc < 2:2579555/150‑1 (MQ=255) tGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAAAGAAGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCGATTAAAGCGGGATTTATTGGTGTCATTATGTCGACCCTTATGTACCGGATTTTTAATCATGAAGTTGCGTTGATTGACGTCGGTAAAc > 1:2586403/1‑150 (MQ=255) gggTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCGATTAAAGCGGTATTTATTGGTGTCATTATGTCGACCATTATGTACCGGATTTTTAATCATGAAGTTGCGTTGATTGACGTCGGTAAACTTTc > 2:4007895/1‑150 (MQ=255) tgttGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCGATTAAAGCGGTATTTATTGGTGTCATTATGTCGACCATTATGTACCGGATTTTTAATCATGAAGTTGCGTTGATTGACGTCGGTAAACTTTCTGATg < 2:3519231/148‑1 (MQ=255) tttGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCGATTAAAGCGGTATTTATTGGTGTCATTATGTCGACCATTATGTACCGGATTTTTAATCATGAAGTTGCGTTGATTGACGTCGGTAAACTTTCTGATgc < 1:3348840/150‑1 (MQ=255) tGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCGATTAAAGCGGTATTTATTGGTGTCATTATGTCGACCATTATGTACCGGATTTTTAATCATGAAGTTGCGTTGATTGACGTCGGTAAACTTTCTGATgcgc > 1:1411457/1‑150 (MQ=255) gTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCGATTAAAGCGGTATTTACTGGTGTCATTATGTCGACCATTATGTACCGGATTTTTAATCATGAAGTTGCGTTGATTGACGTCGGTAAACTTTCTGATGcgcc < 1:2473334/150‑1 (MQ=255) ttattaTCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCGATTAAAGCGGTATTTATTGGTGTCATTATGTCGACCATTATGTACTGGATTTTTAATCATGAAGTTGCGTTGATTGACGTCGGTAAACTTTCTGATGcgccgc > 1:2261777/1‑150 (MQ=255) tattatCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCGATTAAAGCGGTATTTATTGGTGTCATTATGTCGACCATTATGTACCGGATTTTTAATCATGAAGTTGCGTTGATTGACGTCGGTAAACTTTCTGATGCGCCGCt < 2:3626156/150‑1 (MQ=255) ttatCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCGATTAAAGCGGTATTTATTGGTGTCATTATGTCGACCATTATGTACCGGATTTTTAATCATGAAGTTGCGTTGATTGACGTCGGTAAACTTTCTGATGCGCCGCTTa > 1:1692135/1‑150 (MQ=255) tatCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCGATTAAAGCGGTATTTATTGGTGTCATTATGTCGACCATTATGTACCGGATTTTTAATCATGAAGTTGCGTTGATTGACGTCGGTAAACTTTCTGATGCGCCGCTTaa < 1:2418320/150‑1 (MQ=255) tatCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCGATTAAAGCGGTATTTATTGGTGTCATTATGTCGACCATTATGTACCGGATTTTTAATCATGAAGTTGCGTTGATTGACGTCGGTAAACTTTCTGATGCGCCGCTTaa < 2:1720503/150‑1 (MQ=255) atCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCGATTAAAGCGGTATTTATTGGTGTCATTATGTCGACCATTATGTACCGGATTTTTAATCATGAAGTTGCGTTGATTGACGTCGGTAAACTTTCTGATGCGCCGCTTAAt > 2:2297377/1‑150 (MQ=255) tCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCGATTAAAGCGGTATTTATTGGTGTCATTATGTCGACCATTATGTACCGGATTTTTAATCATGAAGTTGCGTTGATTGACGTCGGTAAACTTTCTGATGCGCCGCTTAATa < 1:1789684/150‑1 (MQ=255) cGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCGATTAAAGCGGTATTTATTGGTGTCATTATGTCGACCATTATGTACCGGATTTTTAATCATGAAGTTGCGTTGATTGACGTCGGTAAACTTTCTGATGCGCCGCTTAATAc > 1:3803619/1‑150 (MQ=255) cGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCGATTAAAGCGGTATTTATTGGTGTCATTATGTCGACCATTATGTACCGGATTTTTAATCATGAAGTTGCGTTGATTGACGTCGGTAAACTTTCTGATGCGCCGCTTAATAc < 2:1185895/150‑1 (MQ=255) cGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCGATTAAAGCGGTATTTATTGGTGTCATTATGTCGACCATTATGTACCGGATTTTTAATCATGAAGTTGCGTTGATTGACGTCGGTAAACTTTCTGATGCGCCGCTTAATAc < 2:75619/150‑1 (MQ=255) gAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCGATTAAAGCGGTATTTATTGGTGTCATTATGTCGACCATTATGTACCGGATTTTTAATCATGAAGTTGCGTTGATTGACGTCGGTAAACTTTCTGATGCGCCGCTTAATACg > 1:3182559/1‑150 (MQ=255) agagATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCGATTAAGGCGGTATTTATTGGTGTCATTATGTCGACCATTATGTACCGGATTTTTAATCATGAAGTTGCGTTGATTGACGTCGGTAAACTTTCTGATGCGCCGCTTAATACGCt < 2:3770467/150‑1 (MQ=255) gagaTGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCGATTAAAGCGGTATTTATTGGTGTCATTATGTCGACCATTATGTACCGGATTTTTAATCATGAAGTTGCGTTGATTGACGTCGGTAAACTTTCTGATGCGCCGCTTAATACGCtg < 1:577351/150‑1 (MQ=255) agaTGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCGATTAAAGCGGTATTTATTGGTGTCATTATGTCGACCATTATGTACCGGATTTTTAATCATGAAGTTGCGTTGATTGACGTCGGTAAACTTTCTGATGCGCCGCTTAATACGCtgt > 1:435266/1‑150 (MQ=255) aTGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCGATTAAAGCGGTATTTATTGGTGTCATTATGTCGACCATTATGTACCGGATTTTTAATCATGAAGTTGCGTTGATTGACGTCGGTAAACTTTCTGATGCGCCGCTTAATACGCTGTgg > 2:2171780/1‑150 (MQ=255) cGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCGATTAAAGCGGTATTTATTGGTGTCATTATGTCGACCATTATGTACCGGATTTTTAATCATGAAGTTGCGTTGATTGACGTCGGTAAACTTTCTGATGCGCCGCTTAATACGCTGTGGCtt < 2:1366087/150‑1 (MQ=255) gTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCGATTAAAGCGGTATTTATTGGTGTCATTATGTCGACCATTATGTACCGGATTTTTAATCATGAAGTTGCGTTGATTGACGTCGGTAAACTTTCTGATGCGCCGCTTAATACGCTGTGGCttt > 1:3214641/1‑150 (MQ=255) gTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCGATTAAAGCGGTATTTATTGGTGTCATTATGTCGACCATTATGTACCGGATTTTTAATCATGAAGTTGCGTTGATTGACGTCGGTAAACTTTCTGATGCGCCGCTTAATACGCTGTGGCttt > 1:1479083/1‑150 (MQ=255) tCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCGATTAAAGCGGTATTTATTGGTGTCATTATGTCGACCATTATGTACCGGATTTTTAATCATGAAGTTGCGTTGATTGACGTCGGTAAACTTTCTGATGCGCCGCTTAATACGCTGTGGCTTTa > 2:1478901/1‑150 (MQ=255) ccGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCGATTAAAGCGGTATTTATTGGTGTCATTATGTCGACCATTATGTACCGGATTTTTAATCATGAAGTTGCGTTGATTGACGTCGGTAAACTTTCTGATGCGCCGCTTAATACGCTGTGGCTTTAt < 1:1938833/150‑1 (MQ=255) ccGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCGATTAAAGCGGTATTTATTGGTGTCATTATGTCGACCATTATGTACCGGATTTTTAATCATGAAGTTGCGTTGATTGACGTCGGTAAACTTTCTGATGCGCCGCTTAATACGCTGTGGCTTTAt < 1:1623241/150‑1 (MQ=255) gCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCGATTAAAGCGGTATTTATTGGTGTCATTATGTCGACCATTATGTACCGGATTTTTAATCATGAAGTTGCGTTGATTGACGTCGGTAAACTTTCTGATGCGCCGCTTAATACGCTGTGGCTTTATCt > 1:992093/1‑150 (MQ=255) aGTTTCGCTATACGTTAATTTCGATTAAAGCGGTATTTATTGGTGTCATTATGTCGACCATTATGTACCGGATTTTTAATCATGAAGTTGCGTTGATTGACGTCGGTAAACTTTCTGATGCGCCGCTTAATACGCTGTGGCTTTATCTGa > 2:2363181/1‑150 (MQ=255) aGTTTCGCTATACGTTAATTTCGATTAAAGCGGTATTTATTGGTGTCATTATGTCGACCATTATGTACCGGATTTTTAATCATGAAGTTGCGTTGATTGACGTCGGTAAACTTTCTGATGCGCCGCTTAATACGCTGTGGCTTTATCTGa < 1:1844003/150‑1 (MQ=255) ttCGCTATACGTTAATTTCGATTAAAGCGGTATTTATTGGTGTCATTATGTCGACCATTATGTACCGGATTTTTAATCATGAAGTTGCGTTGATTGACGTCGGTAAACTTTCTGATGCGCCGCTTAATACGCTGTGGCTTTATCTGATcc < 2:1071642/150‑1 (MQ=255) cGCTATACGTTAATTTCGATTAAAGCGGTATTTATTGGTGTCATTATGTCGACCATTATGTACCGGATTTTTAATCATGAAGTTGCGTTGATTGACGTCGGTAAACTTTCTGATGCGCCGCTTAATACGCTGTGGCTTTATCTGATCCTc > 2:847629/1‑150 (MQ=255) gCTATACGTTAATTTCGATTAAAGCGGTATTTATTGGTGTCATTATGTCGACCATTATGTACCGGATTTTTAATCATGAAGTTGCGTTGATTGACGTCGGTAAACTTTCTGATGCGCCGCTTAATACGCTGTGGCTTTATATGATCCTCg > 1:1583769/1‑150 (MQ=255) cTATACGTTAATTTCGATTAAAGCGGTATTTATTGGTGTCATTATGTCGACCATTATGTACCGGATTTTTAATCATGAAGTTGCGTTGATTGACGTCGGTAAACTTTCTGATGCGCCGCTTAATACGCTGTGGCTTTATCTGATCCTCgg < 2:4153678/150‑1 (MQ=255) cTATACGTTAATTTCGATTAAAGCGGTATTTATTGGTGTCATTATGTCGACCATTATGTACCGGATTTTTAATCATGAAGTTGCGTTGATTGACGTCGGTAAACTTTCTGATGCGCCGCTTAATACGCTGTGGCTTTATCTGATCCTCgg > 1:1067745/1‑150 (MQ=255) cTATACGTTAATTTCGATTAAAGCGGTATTTATTGGTGTCATTATGTCGACCATTATGTACCGGATTTTTAATCATGAAGTTGCGTTGATTGACGTCGGTAAACTTTCTGATGCGCCGCTTAATACGCTGTGGCTTTATCTGATCCTCgg < 1:370285/150‑1 (MQ=255) ataCGTTAATTTCGATTAAAGCGGTATTTATTGGTGTCATTATGTCGACCATTATGTACCGGATTTTTAATCATGAAGTTGCGTTGATTGACGTCGGTAAACTTTCTGATGCGCCGCTTAATACGCTGTGGCTTTATCTGATCCTCGGta > 2:2049361/1‑150 (MQ=255) ataCGTTAATTTCGATTAAAGCGGTATTTATTGGTGTCATTATGTCGACCATTATGTACCGGATTTTTAATCATGAAGTTGCGTTGATTGACGTCGGTAAACTTTCTGATGCGCCGCTTAATACGCTGTGGCTTTATCTGATCCTCGGta > 1:3642697/1‑150 (MQ=255) taCGTTAATTTCGATTAAAGCGGTATTTATTGGTGTCATTATGTCGACCATTATGTACCGGATTTTTAATCATGAAGTTGCGTTGATTGACGTCGGTAAACTTTCTGATGCGCCGCTTAATACGCTGTGGCTTTATCTGATCCTCGGtat > 1:2397115/1‑150 (MQ=255) aCGTTAATTTCGATTAAAGCGGTATTTATTGGTGTCATTATGTCGACCATTATGTACCGGATTTTTAATCATGAAGTTGCGTTGATTGACGTCGGTAAACTTTCTGATGCGCCGCTTAATACGCTGTGGCTTTATCTGATCCTCGGtatt < 1:1540184/150‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |