| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | AP012306 | 87,679 | (GCG)4→3 | coding (1442‑1444/1767 nt) | ftsI → | transpeptidase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AP012306 | 87672 = | 1 (0.000) | 243 (0.810) | 159/278 | 0.4 | 99.6% | coding (1435/1767 nt) | ftsI | transpeptidase |
| ? | AP012306 | = 87668 | 1 (0.000) | coding (1431/1767 nt) | ftsI | transpeptidase | |||||
Only 100 of 269 total aligned reads displayed.
AACAACAACCAGCGCGAAGCGCGGCTGACTCGCAGGCGCAACGCCTGCGGTATAAGCAATATATTTATTGATGTAGCGACCGTCCGGCCCGACCTTTTTCGCGGTACCGGTTTTAATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < AP012306/87830‑87672‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cgccgccgccTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTGCGGACAATGGATTCCGGGAAGACACGTTCACCGGGAACCGGGGGGTCAACTTTGGTAATCGACAGTGGGCGATAAATGCCGTAGCTGCCGATAGTTGCGTAGACTCGCGCT < AP012306/87668‑87521 AACCAGCGCGAAGCGCGGCTGACTCGCAGGCGCAACGCCTGCGGTATAAGCAATATATTTATTGATGTAGCGACCGTCCGGCCCGACCTTTTTCGCGGTACCGGTTTTAATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCC < 1:2711023/150‑1 ACCAGCGCGAAGCGCGGCTGACTCGCAGGCGCAACGCCTGCGGTATAAGCAATATATTTATTGATGTAGCGACCGTCCGGCCCGACCTTTTTCGCGGTACCGGTTTTAATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCG > 1:3413386/1‑150 CCAGCGCGAAGCGCGGCTGACTCGCAGGCGCAACGCCTGCGGTATAAGCAATATATTTATTGATGTAGCGACCGTCCGGCCCGACCTTTTTCGCGGTACCGGTTTTAATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGC > 1:4358978/1‑150 CAGCGCGAAGCGCGGCTGACTCGCAGGCGCAACGCCTGCGGTATAAGCAATATATTTATTGATGTAGCGACCGTCCGGCCCGACCTTTTTCGCGGTACCGGTTTTAATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCC < 2:673256/150‑1 CGCGGCTGACTCGCAGGCGCAACGCCTGCGGTATAAGCAATATATTTATTGATGTAGCGACCGTCCGGCCCGACCTTTTTCGCGGTACCGGTTTTAATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCC < 2:2334268/150‑1 CGGCTGACTCGCAGGCGCAACGCCTGCGGTATAAGCAATATATTTATTGATGTAGCGACCGTCCGGCCCGACCTTTTTCGCGGTACCGGTTTTAATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCAC < 2:720471/150‑1 GGCTGACTCGCAGGCGCAACGCCTGCGGTATAAGCAATATATTTATTGATGTAGCGACCGTCCGGCCCGACCTTTTTCGCGGTACCGGTTTTAATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACG > 1:4286725/1‑150 CTCGCAGGCGCAACGCCTGCGGTATAAGCAATATATTTATTGATGTAGCGACCGTCCGGCCCGACCTTTTTCGCGGTACCGGTTTTAATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCC < 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1:2321836/1‑150 AAGCAATATATTTATTGATGTAGCGACCGTCCGGCCCGACCTTTTTCGCGGTACCGGTTTTAATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTGCGGACAA < 2:65551/150‑1 AAGCAATATATTTATTGATGTAGCGACCGTCCGGCCCGACCTTTTTCGCGGTACCGGTTTTAATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTGCGGACAA > 1:1382527/1‑150 AGCAATATATTTATTGATGTAGCGACCGTCCGGCCCGACCTTTTTCGCGGTACCGGTTTTAATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTGCGGACAAT > 2:2364300/1‑150 AGCAATATATTTATTGATGTAGCGACCGTCCGGCCCGACCTTTTTCGCGGTACCGGTTTTAATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTGCGGACAAT > 1:219431/1‑150 GCAATATATTTATTGATGTAGCGACCGTCCGGCCCGACCTTTTTCGCGGTACCGGTTTTAATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTGCGGACAATG > 2:109573/1‑150 CAATATATTTATTGATGTAGCGACCGTCCGGCCCGACCTTTTTCGCGGTACCGGTTTTAATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTGCGGACAATGG > 2:3424266/1‑150 ATATATTTATTGATGTAGCGACCGTCCGGCCCGACCTTTTTCGCGGTACCGGTTTTAATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTGCGGACAATGGAT < 1:714732/150‑1 ATATATTTATTGATGTAGCGACCGTCCGGCCCGACCTTTTTCGCGGTACCGGTTTTAATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTGCGGACAATGGAT > 1:2069456/1‑150 TATATTTATTGATGTAGCGACCGTCCGGCCCGACCTTTTTCGCGGTACCGGTTTTAATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTGCGGACAATGGATT < 1:556226/150‑1 TATATTTATTGATGTAGCGACCGTCCGGCCCGACCTTTTTCGCGGTACCGGTTTTAATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTGCGGACAATGGATT > 1:494467/1‑150 TATATTTATTGATGTAGCGACCGTCCGGCCCGACCTTTTTCGCGGTACCGGTTTTAATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTGCGGACAATGGATT < 1:375707/150‑1 ATATTTATTGATGTAGCGACCGTCCGGCCCGACCTTTTTCGCGGTACCGGTTTTAATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTGCGGACAATGGATTC < 2:1493453/150‑1 TATTTATTGATGTAGCGACCGTCCGGCCCGACCTTTTTCGCGGTACCGGTTTTAATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTGCGGACAATGGATTCC > 2:1147535/1‑150 TATTTATTGATGTAGCGACCGTCCGGCCCGACCTTTTTCGCGGTACCGGTTTTAATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTGCGGACAATGGATTCC < 1:4243033/150‑1 TTATTGATGTAGCGACCGTCCGGCCCGACCTTTTTCGCGGTACCGGTTTTAATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTGCGGACAATGGATTCCGGG > 1:2449794/1‑150 TTGATGTCGCGACCGTCCGGCCCGACCTTTTTCGCGGTACCGGTTTTAATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTGCGGACAATGGATTCCGGGAAG > 1:1663113/1‑150 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1:1757377/1‑150 GATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTGCGGACAATGGATTCCGGGAAGACACGTTCACCGGGAACCGGGGGGTCAACTTTGGTAATCGACAGTGGGCGATAAATGC > 2:2778931/1‑150 GATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTGCGGACAATGGATTCCGGGAAGACACGTTCACCGGGAACCGGGGGGTCAACTTTGGTAATCGACAGTGGGCGATAAATGC < 1:3075221/150‑1 TAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTGCGGACAATGGATTCCGGGAAGACACGTTCACCGGGAACCGGGGGGTCAACTTTGGTAATCGACAGTGGGCGATAAATGCCG < 2:2642129/150‑1 CCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTGCGGACAATGGATTCCGGGAAGACACGTTCACCGGGAACCGGGGGGTCAACTTTGGTAATCGACAGTGGGCGATAAATGCCGTAG > 1:4024323/1‑150 CCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTGCGGACAATGGATTCCGGGAAGACACGTTCACCGGGAACCGGGGGGTCAACTTTGGTAATCGACAGTGGGCGATAAATGCCGTAG > 2:1035609/1‑150 TTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTGCGGACAATGGATTCCGGGAAGACACGTTCACCGGGAACCGGGGGGTCAACTTTGGTAATCGACAGTGGGCGATAAATGCCGTAGCT < 2:415402/150‑1 TTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTGCGGACAATGGATTCCGGGAAGACACGTTCACCGGGAACCGGGGGGTCAACTTTGGTAATCGACAGTGGGCGATAAATGCCGTAGCT > 2:1294674/1‑150 TTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTGCGGACAATGGATTCCGGGAAGACACGTTCACCGGGAACCGGGGGGTCAACTTTGGTAATCGACAGTGGGCGATAAATGCCGTAGCTG > 2:516645/1‑150 TAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTGCGGACAATGGATTCCGGGAAGACACGTTCACCGGGAACCGGGGGGTCAACTTTGGTAATCGACAGTGGGCGATAAATGCCGTAGCTGC > 2:3209057/1‑150 ATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTGCGGACAATGGATTCCGGGAAGACACGTTCACCGGGAACCGGGGGGTCAACTTTGGTAATCGACAGTGGGCGATAAATGCCGTAGCTGCCG > 1:2856602/1‑150 CGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTGCGGACAATGGATTCCGGGAAGACACGTTCACCGGGAACCGGGGGGTCAATTTTGGTAATCGACAGTGGGCGATAAATGCCGTAGCTGCCGAT < 2:3953192/150‑1 GCCGCCTTCACGCCGCCGCTTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTGCGGACAATGGATTCCGGGAAGACACGTTCACCGGGAACCGGGGGGTCAACTTTGGTAATCGACAGTGGGCGATAAATGCCGTAGCTGCCGATA < 2:4195841/150‑1 GCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTGCGGACAATGGATTCCGGGAAGACACGTTCACCGGGAACCGGGGGGTCAACTTTGGTAATCGACAGTGGGCGATAAATGCCGTAGCTGCCGATA > 1:1989790/1‑150 GCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTGCGGACAATGGATTCCGGGAAGACACGTTCACCGGGAACCGGGGGGTCAACTTTGGTAATCGACAGTGGGCGATAAATGCCGTAGCTGCCGATAGTT > 1:1510942/1‑150 CCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTGCGGACAATGGATTCCGGGAAGACACGTTCACCGGGAACCGGGGGGTCAACTTTGGTAATCGACAGTGGGCGATAAATGCCGTAGCTGCCGATAGTTG > 1:1529312/1‑150 CCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTGCGGACAATGGATTCCGGGAAGACACGTTCACCGGGAACCGGGGGGTCAACTTTGGTAATCGACAGTGGGCGATAAATGCCGTAGCTGCCGATAGTTG < 2:1331295/150‑1 CCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTGCGGACAATGGATTCCGGGAAGACACGTTCACCGGGAACCGGGGGGTCAACTTTGGTAATCGACAGTGGGCGATAAATGCCGTAGCTGCCGATAGTTG < 2:2270016/150‑1 TTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTGCGGACAATGGATTCCGGGAAGACACGTTCACCGGGAACCGGGGGGTCAACTTTGGTAATCGACAGTGGGCGATAAATGCCGTAGCTGCCGATAGTTGCG > 1:3945733/1‑150 TCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTGCGGAAAATGGATTCCGGGAAGACACGTACACCGGGAACCGGGGGGTCAACTTTGGTAATCGACAGTGGGCGATAAATGCCGTAGCTGCCGATAGTTGCGT < 2:1400491/150‑1 CGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTGCGGACAATGGATTCCGGGAAGACACGTTCACCGGGAACCGGGGGGTCAACTTTGGTAATCGACAGTGGGCGATAAATGCCGTAGCTGCCGATAGTTGCGTAGACTC < 2:450440/150‑1 GCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTGCGGACAATGGATTCCGGGAAGACACGTTCACCGGGAACCGGGGGGTCAACTTTGGTAATCGACAGTGGGCGATAAATGCCGTAGCTGCCGATAGTTGCGTAGACTCG > 2:2061008/1‑150 CGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTGCGGACAATGGATTCCGGGAAGACACGTTCACCGGGAACCGGGGGGTCAACTTTGGTAATCGACAGTGGGCGATAAATGCCGTAGCTGCCGATAGTTGCGTAGACTCGCG < 1:3673572/150‑1 CGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTGCGGACAATGGATTCCGGGAAGACACGTTCACCGGGAACCGGGGGGTCAACTTTGGTAATCGACAGTGGGCGATAAATGCCGTAGCTGCCGATAGTTGCGTAGACTCGCG < 1:2362091/150‑1 CCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTGCGGACAATGGATTCCGGGAAGACACGTTCACCGGGAACCGGGGGGTCAACTTTGGTAATCGACAGTGGGCGATAAATGCCGTAGCTGCCGATAGTTGCGTAGACTCGCGCT < 2:3664165/150‑1 CCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTGCGGACAATGGATTCCGGGAAGACACGTTCACCGGGAACCGGGGGGTCAACTTTGGTAATCGACAGTGGGCGATAAATGCCGTAGCTGCCGATAGTTGCGTAGACTCGCGCT < 2:4252580/150‑1 CCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTGCGGACAATGGATTCCGGGAAGACACGTTCACCGGGAACCGGGGGGTCAACTTTGGTAATCGACAGTGGGCGATAAATGCCGTAGCTGCCGATAGTTGCGTAGACTCGCGCT > 1:3265530/1‑150 AACAACAACCAGCGCGAAGCGCGGCTGACTCGCAGGCGCAACGCCTGCGGTATAAGCAATATATTTATTGATGTAGCGACCGTCCGGCCCGACCTTTTTCGCGGTACCGGTTTTAATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < AP012306/87830‑87672‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cgccgccgccTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTGCGGACAATGGATTCCGGGAAGACACGTTCACCGGGAACCGGGGGGTCAACTTTGGTAATCGACAGTGGGCGATAAATGCCGTAGCTGCCGATAGTTGCGTAGACTCGCGCT < AP012306/87668‑87521 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |