| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AP012306 | 644102 = | 466 (1.440) | 26 (0.080) +GG |
7/294 | 18.4 | 6.0% | noncoding (1/76 nt) | lysZ | tRNA‑Lys |
| ? | AP012306 | = 2073420 | 365 (1.130) | noncoding (76/76 nt) | valU | tRNA‑Val | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
TTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTC‑GAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < AP012306/644250‑644102‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCCCGCTGTGTGGAGTCGCATTATAGGGAGAGTTCAAAATGAGTCAACGCATTTTCTAAAGAAATTGTTCGTTCG < AP012306/2073420‑2073272 || TTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTC‑GAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCG > 1:202363/1‑150 TCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTC‑GAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGG > 2:2742151/1‑150 TCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTC‑GAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGtacg > 2:4094726/1‑146 CCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTC‑GAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGGAGGGGGGT > 2:18028/1‑150 CGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTC‑GAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGGTGGTGGGTGATca > 2:114364/1‑148 gattttaAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTC‑GACCCTGCGACAATTTGATTAAAAGTCAACTGCTCTCCCAACTGAGCTAACGCCCGGGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAG < 2:339177/143‑1 ACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTC‑GAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTTTAAGGGAGGGGCTCTCCCAGC > 2:4251471/1‑150 taaAAATTGGTGGTTCTTGAAGGATTC‑GACCCTGCGACAAATTGATTAAAATCAAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGCCCCGGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGA < 2:2557564/147‑1 TTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTC‑GAACCTGCGACCAATTGATAAAAAGTCAACTGCTCTCCCAACTGAGCTAACGCCCCGGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAG < 2:1518142/150‑1 AATTGGGGGGTCGTGCAGGATTC‑GAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTA < 1:1151570/150‑1 AATGGGTGGGTCGTGCAGGTTTC‑GACCCTGCGACAAATTGATAAAAAGTCAACTGCTCTACCACCTGAGCTAACGCCCGGGTGGTGGGTGATGAGGGGACCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTA < 2:2078048/150‑1 TGGTGGGTCGTGCAGGATTC‑GAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATC > 1:3279894/1‑150 TGGTGGGTCGTGCAGGATTC‑GAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATC > 1:3225982/1‑150 TGGTGGGTCGTGCAGGATTC‑GAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATC > 1:3053344/1‑150 TGGTGGGTCGTGCAGGATTC‑GAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACGCCTCTACCACCGGACCTAACGACCCGGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATC < 2:1748885/150‑1 GGTGGGTCGTGCAGGATTC‑GAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCA > 1:1909196/1‑150 GGTGGGTCGTGCA‑GATTCGGACCCTGCGACCATTGAATAAAAAGTCAACTGCTCTCCAAACTGACCTAACGCCCGGGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCA < 2:3951349/150‑1 GTGGGTCGTGCAGGATTC‑GAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCAC > 1:1509800/1‑150 GTGGGTCGTGCAGAATTC‑GATCCCCCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGCCCCGGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCAC < 2:2511956/150‑1 TGGGTCGTGCAGGATTC‑GACCCTGCGCCCAATTGATAAAAAGCCACCTGCTCTCCCAACTGAGCAACCGCCCGGGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACC < 2:1915539/150‑1 TGGGTCGTGCAGGATTC‑GACCCTGCGACAAATTGATAAAAAGTCAACTGCTCTCCCACCTGACCTACCGCCCGGGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACC < 2:3311819/150‑1 GGGTCGTGCAGGATTC‑GAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGGTGGTGGGTGATGTCGGGATTGAACCACCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGTTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCC > 2:165318/1‑150 GGGTCGTGCAGGATTC‑GAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCC > 1:4251006/1‑150 AGGATTC‑GAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACC < 1:2227432/90‑1 AGGATTC‑GAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACC > 2:2227432/1‑90 ATTC‑GAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGGTGGTGGGTGATGACGGG > 1:1474088/1‑79 ATTC‑GAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGGTGGTGGGTGATGACGGG < 2:1474088/79‑1 ACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGGTGGTGGGTGATGACGGGAT > 2:3809590/1‑75 ACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGGTGGTGGGTGATGACGGGAT < 1:3809590/75‑1 aggaGGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCCCGCTGTGTGGAGTCGCATTATAGGGAGAGTTCAAAATGAGTCAACGCATTTTCTAAAGAAATTGTTC < 2:1234022/146‑1 aggaGGTGGGGGGTGAGGCGGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCCCGCTGTGTGGAGTCGCATTATAGGGAGAGTTCAAAATGAGTCAACGCATTTTCTAAAGAAATTGTTC < 2:4353159/146‑1 ggaGGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCCCGCTGTGTGGAGTCGCATTATAGGGAGAGTTCAAAATGAGTCAACGCATTTTCTAAAGAAATTGTTCG < 2:2740070/147‑1 gaGGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCCCGCTGTGTGGAGTCGCATTATAGGGAGAGTTCAAAATGAGTCAACGCATTTTCTAAAGAAATTGTTCGT < 2:1437007/148‑1 aaGGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCCCGCTGTGTGGAGTCGCATTATAGGGAGAGTTCAAAATGAGTCAACGCATTTTCTAAAGAAATTGTTCGT < 2:2848082/148‑1 atGTGGGGGGTGAGGACGGGATAGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCCCGCTGTGTGGAGTCGCATTATAGGGAGAGTTCAAAATGAGTCAACGCATTTTCTAAAGAAATTGTTCGTT < 2:1052495/148‑1 GTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCCCGCTGTGTGGAGTCGCATTATAGGGAGAGTTCAAAATGAGTCAACGCATTTTCTAAAGAAATTGTTCGTTCG < 2:2489037/150‑1 || TTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTC‑GAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < AP012306/644250‑644102‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCCCGCTGTGTGGAGTCGCATTATAGGGAGAGTTCAAAATGAGTCAACGCATTTTCTAAAGAAATTGTTCGTTCG < AP012306/2073420‑2073272 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |