| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| JC | AP012306 | 162,220 | +CTGTAAGACTCAATGTAAGCCGTGCCAAAATATGATGGCTAGGACGAGCTA | intergenic (+131/+243) | mrcB → / ← hemL | fused glycosyl transferase and transpeptidase/glutamate‑1‑semialdehyde aminotransferase |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | AP012306 | = 162220 | 0 (0.000) | 274 (1.290) +CTGTAAGACTCAATGTAAGCCGTGCCAAAATATGATGGCTAGGACGAGCTA |
150/196 | 0.0 | 100% | intergenic (+131/+243) | mrcB/hemL | fused glycosyl transferase and transpeptidase/glutamate‑1‑semialdehyde aminotransferase |
| ? | AP012306 | 162221 = | 0 (0.000) | intergenic (+132/+242) | mrcB/hemL | fused glycosyl transferase and transpeptidase/glutamate‑1‑semialdehyde aminotransferase | |||||
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GTTTGGTAGTAATTAACATCTAAGCGTGAAATACCGGATGGCGAGTTGCCATCCGGTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCGAACCCGCCAGCGTTTCGAATATTATCTTATCTTTATAATAATCATTCTCGTTTACGTTATCATTCACTTTACATCAGAGATATACCATTCCATATAACGGCCCTGTACGCCTGGACGGATAAAGCGTTTACGCGACAACGGATGCCCG > AP012306/162074‑162369 | tccggtaaaataacatcccatctaagatattaaccctttcttttcatctggttgtttattaacccttcaggaacgctcagattgcgtaccgcttgcctgtaagactcaatgtaagccgtgccaaaatatgatggctaggacgagctaGaa < 1:1066096‑M2/3‑1 (MQ=255)tccggtaaaataacatcccatctaagatattaaccctttcttttcatctggttgtttattaacccttcaggaacgctcagattgcgtaccgcttgcctgtaagactcaatgtaagccgtgccaaaatatgatggctaggacgagctaGaa < 1:1315817‑M2/3‑1 (MQ=255) gtaaaataacatcccatctaagatattaaccctttcttttcatctggttgtttattaacccttcaggaacgctcagattgcgtaccgcttgcctgtaagactcaatgtaagccgtgccaaaatatgatggctaggacgagctaGAACCCg < 1:3965935‑M2/7‑1 (MQ=255) 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attaaccctttcttttcatctggttgtttattaacccttcaggaacgctcagattgcgtaccgcttgcctgtaagactcaatgtaagccgtgccaaaatatgatggctaggacgagctaGAACCCGCCAGCGTTTCGAATAttatcttat > 2:330920‑M2/120‑150 (MQ=255) attaaccctttcttttcatctggttgtttattaacccttcaggaacgctcagattgcgtaccgcttgcctgtaagactcaatgtaagccgtgccaaaatatgatggctaggacgagctaGAACCCGCCAGCGTTTCGAATAttatcttat > 2:3118180‑M2/120‑150 (MQ=255) ttaaccctttcttttcatctggttgtttattaacccttcaggaacgctcagattgcgtaccgcttgcctgtaagactcaatgtaagccgtgccaaaatatgatggctaggacgagctaGAACCCGCCAGCGTTTCGAATAttatcttatc < 1:2326916‑M2/32‑1 (MQ=255) taaccctttcttttcatctggttgtttattaacccttcaggaacgctcagattgcgtaccgcttgcctgtaagactcaatgtaagccgtgccaaaatatgatggctaggacgagctaGAACCCGCCAGCGTTTCGAATATtatcttatct < 2:745552‑M2/33‑1 (MQ=255) taaccctttcttttcatctggttgtttattaacccttcaggaacgctcagattgcgtaccgcttgcctgtaagactcaatgtaagccgtgccaaaatatgatggctaggacgagctaGAACCCGCCAGCGTTTCGAATATtatcttatct > 2:2995503‑M2/118‑150 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |