Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
JC | AP012306 | 162,220 | +CTGTAAGACTCAATGTAAGCCGTGCCAAAATATGATGGCTAGGACGAGCTA | intergenic (+131/+243) | mrcB → / ← hemL | fused glycosyl transferase and transpeptidase/glutamate‑1‑semialdehyde aminotransferase |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AP012306 | = 162220 | 0 (0.000) | 298 (1.480) +CTGTAAGACTCAATGTAAGCCGTGCCAAAATATGATGGCTAGGACGAGCTA |
144/196 | 0.0 | 100% | intergenic (+131/+243) | mrcB/hemL | fused glycosyl transferase and transpeptidase/glutamate‑1‑semialdehyde aminotransferase |
? | AP012306 | 162221 = | 0 (0.000) | intergenic (+132/+242) | mrcB/hemL | fused glycosyl transferase and transpeptidase/glutamate‑1‑semialdehyde aminotransferase |
Only 100 of 412 total aligned reads displayed.
ATGTTTGGTAGTAATTAACATCTAAGCGTGAAATACCGGATGGCGAGTTGCCATCCGGTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCGAACCCGCCAGCGTTTCGAATATTATCTTATCTTTATAATAATCATTCTCGTTTACGTTATCATTCACTTTACATCAGAGATATACCATTCCATATAACGGCCCTGTACGCCTGGACGGATAAAGCGTTTACGCGACAACGGATGCCCG > AP012306/162072‑162369 | ttGGTAGTAATTAACATCTAAGCGTGAAATACCGGATGGCGAGTTGCCATCCGGTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCctgta < 1:3352171‑M1/150‑6 (MQ=255) gtagtaATTAACATCTAAGCGTGAAATACCGGATGGCGAGTTGCCATCCGGTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCctgtaaga > 1:1404484‑M1/1‑142 (MQ=255) gtaATTAACATCTAAGCGTGAAATACCGGATGGCGAGTTGCCATCCGGTAAAATAACATGCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCctgtaagactc < 2:3451283‑M1/150‑12 (MQ=255) taATTAACATCTAAGCGTGAAATACCGGATGGCGAGTTGCCATCCGGTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCctgtaagactca > 1:1724437‑M1/1‑138 (MQ=255) aaTTAACATCTAAGCGTGAAATACCGGATGGCGAGTTGCCATCCGGTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCctgtaagactcaa > 1:1921538‑M1/1‑137 (MQ=255) aTTAACATCTAAGCGTGAAATACCGGATGGCGAGTTGCCATCCGGTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCctgtaagactcaat > 1:1611373‑M1/1‑136 (MQ=255) ttAACATCTAAGCGTGAAATACCGGATGGCGAGTTGCCATCCGGTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCctgtaagactcaatg > 2:456667‑M1/1‑135 (MQ=255) tAACATCTAAGCGTGAAATACCGGATGGCGAGTTGCCATCCGGTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCctgtaagactcaatgt > 2:1679232‑M1/1‑134 (MQ=255) aaCATCTAAGCGTGAAATACCGGATGGCGAGTTGCCATCCGGTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCctgtaagactcaatgta > 1:1115174‑M1/1‑133 (MQ=255) aaCATCTAAGCGTGAAATACCGGATGGCGAGTTGCCATCCGGTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCACGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCctgtaagactcaatgta > 2:82072‑M1/1‑133 (MQ=255) tCTAAGCGTGAAATACCGGATGGCGAGTTGCCATCCGGTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCctgtaagactcaatgtaagcc < 2:1569359‑M1/150‑22 (MQ=255) aaGCGTGAAATACCGGATGGCGAGTTGCCATCCGGTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCctgtaagactcaatgtaagccgtg > 2:4023517‑M1/1‑126 (MQ=255) aGCGTGAAATACCGGATGGCGAGTTGCCATCCGGTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATTTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCctgtaagactcaatgtaagccgtgc > 2:1934025‑M1/1‑125 (MQ=255) aGCGTGAAATACCGGATGGCGAGTTGCCATCCGGTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCctgtaagactcaatgtaagccgtgc < 2:730458‑M1/150‑26 (MQ=255) gCGTGAAATACCGGATGGCGAGTTGCCATCCGGTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCctgtaagactcaatgtaagccgtgcc < 1:1179387‑M1/150‑27 (MQ=255) gTGAAATACCGGATGGCGAGTTGCCATCCGGTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCctgtaagactcaatgtaagccgtgccaa > 1:952498‑M1/1‑122 (MQ=255) tGAAATACCGGATGGCGAGTTGCCATCCGGTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCctgtaagactcaatgtaagccgtgccaaa > 1:2153083‑M1/1‑121 (MQ=255) aaTACCGGATGGCGAGTTGCCATCCGGTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCctgtaagactcaatgtaagccgtgccaaaata > 1:1976824‑M1/1‑118 (MQ=255) aTACCGGATGGCGAGTTGCCATCCGGTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCctgtaagactcaatgtaagccgtgccaaaatat > 1:1696632‑M1/1‑117 (MQ=255) gCGAGTTGCCATCCGGTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCctgtaagactcaatgtaagccgtgccaaaatatgatggctagg < 1:2302202‑M1/150‑44 (MQ=255) gCGAGTTGCCATCCGGTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCctgtaagactcaatgtaagccgtgccaaaatatgatggctagg < 1:1050227‑M1/150‑44 (MQ=255) gCGAGTTGCCATCCGGTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCctgtaagactcaatgtaagccgtgccaaaatatgatggctagg < 2:547659‑M1/150‑44 (MQ=255) gAGTTGCCATCCGGTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCctgtaagactcaatgtaagccgtgccaaaatatgatggctaggac > 1:2995824‑M1/1‑105 (MQ=255) aGTTGCCATCCGGTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCctgtaagactcaatgtaagccgtgccaaaatatgatggctaggacg > 1:1518266‑M1/1‑104 (MQ=255) cATCCGGTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCctgtaagactcaatgtaagccgtgccaaaatatgatggctaggacgagctag > 1:265220‑M1/1‑98 (MQ=255) tCCGGTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCctgtaagactcaatgtaagccgtgccaaaatatgatggctaggacgagctagaa < 2:1173196‑M1/150‑55 (MQ=255) ccGGTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCctgtaagactcaatgtaagccgtgccaaaatatgatggctaggacgagctagaac > 1:835704‑M1/1‑95 (MQ=255) cGGTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCctgtaagactcaatgtaagccgtgccaaaatatgatggctaggacgagctagaacc > 1:2116406‑M1/1‑94 (MQ=255) ggTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCctgtaagactcaatgtaagccgtgccaaaatatgatggctaggacgagctagaaccc < 2:2480325‑M1/150‑58 (MQ=255) aaaTAACATCCCATCTAAGATATTACCCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCctgtaagactcaatgtaagccgtgccaaaatatgatggctaggacgagctagaacccgcca < 2:942059‑M1/150‑62 (MQ=255) aaTAACATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCctgtaagactcaatgtaagccgtgccaaaatatgatggctaggacgagctagaacccgccag > 2:1720863‑M1/1‑88 (MQ=255) tAACATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCctgtaagactcaatgtaagccgtgccaaaatatgatggctaggacgagctagaacccgccagcg < 1:2063094‑M1/150‑65 (MQ=255) cATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCTTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCctgaaagactaaatgtaagccgtgcaaaaatatgatggctaggacgagctagatcccgccagcgttt < 2:2298196‑M1/150‑68 (MQ=255) cATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCctgtaagactcaatgtaagccgtgccaaaatatgatggctaggacgagctagaacccgccagcgttt < 2:1103774‑M1/150‑68 (MQ=255) aTCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCctgtaagactcaatgtaagccgtgccaaaatatgatggctaggacgagctagaacccgccagcgtttc < 1:122175‑M1/150‑69 (MQ=255) aTCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCctgtaagactcaatgtaagccgtgccaaaatatgatggctaggacgagctagaacccgccagcgtttc > 1:2531289‑M1/1‑82 (MQ=255) aTCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCctgtaagactcaatgtaagccgtgccaaaatatgatggctaggacgagctagaacccgccagcgtttc < 1:2928247‑M1/150‑69 (MQ=255) aTCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCctgtaagactcaatgtaagccgtgccaaaatatgatggctaggacgagctaaaccccgccagcgtttc < 2:775462‑M1/150‑69 (MQ=255) tCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCctgtaagactcaatgtaagccgtgccaaaatatgatggctaggacgagctagaacccgccagcgtttcgaatat > 1:587356‑M1/1‑76 (MQ=255) aGATATTAACCTTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCctgtaagactcaatgtaagccgggccaaaatataagggttaggacgacctagaccccgccagcgtttcgaatattatc < 2:4140265‑M1/150‑79 (MQ=255) gATATTACCCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCctgtaagactcaatgtaagccgtgccaaaatatgatggctaggacgagctagaacccgccagcgtttcgaatattatct < 1:1550606‑M1/150‑80 (MQ=255) gATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCctgtaagactcaatgtaagccgtgccaaaatatgatggctaggacgagctagaacccgccagcgtttcgaatattatct < 2:1433028‑M1/150‑80 (MQ=255) atatTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCctgtaagactcaatgtaagccgtgccaaaatatgatggctaggacgagctagaacccgccagcgtttcgaatattatctt < 1:557513‑M1/150‑81 (MQ=255) tatTACCCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCctgtaagactaaatgtaagccgtgccaaaatatgatggctaggacgagctagaacccgccagcgtttcgaatattatctta < 1:909131‑M1/150‑82 (MQ=255) atTACCCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCctgtaagactcaatgtaagccgtgcaaaaatatgatggctaggacgagctagaacccgccagcgtttcgaatattatcttat < 2:2525322‑M1/150‑83 (MQ=255) aaCCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCctgtaagactcaatgtaagccgtgccaaaatatgatggctaggacgagctagaacccgccagcgtttcgaatattatcttatctt > 1:2586988‑M1/1‑65 (MQ=255) aaCCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCctgtaagactcaatgtaagccgtgccaaaatatgatggctaggacgagctagaacccgccagcgtttcgaatattatcttatctt > 2:2180242‑M1/1‑65 (MQ=255) cccTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCctgtaagactcaatgtaagccgtgccaaaatatgatggctaggacgagctagaacccgccagcgtttcgaatattatcttatcttta < 2:1283143‑M1/150‑88 (MQ=255) ctttctttTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCctgtaagactcaatgtaagccgtgccaaaatatgatggctaggacgagctagaacccgccagcgtttcgaatattatcttatctttata < 2:3499432‑M1/150‑90 (MQ=255) ttctttTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCctgtaagactcaatgtaagccgtgccaaaatatgatggctaggacgagctagaacccgccagcgtttcgaatattatcttatctttataat > 1:1642302‑M1/1‑59 (MQ=255) tctttTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCctgtaagactcaatgtaagccgtgccaaaatatgatggctaggacgagctagaacccgccagcgtttcgaatattatcttatctttataata < 2:3782102‑M1/150‑93 (MQ=255) ttttCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCctgtaagactcaatgtaagccgtgccaaaatatgatggctaggacgagctagaacccgccagcgtttcgaatattatcttatctttataataat < 2:2438355‑M1/150‑95 (MQ=255) tttCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCATACCGCTTGCctgtaagactcaatgtaagccgtgccaaaatgtgatggctaggacgagctagaacccgccagcgtttcgaatattatcttatctttataataatc > 2:3203528‑M1/1‑55 (MQ=255) ttCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCctgtaagactcaatgtaagccgtgccaaaatatgatggctaggacgagctagaacccgccagcgtttcgaatattatcttatctttataataatca > 1:1310259‑M1/1‑54 (MQ=255) tCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCctgtaagactcaatgtaagccgtgccaaaatatgatggctaggacgagctagaacccgccagcgtttcgaatattatcttatctttataataatcat < 2:1813717‑M1/150‑98 (MQ=255) cATCTGGTTGTTTATTACCCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCctgtaagactcaatgtaagccgtgccaaaatatgatggctaggacgagctagaacccgccagcgtttcgaatattatcttatctttataataatcatt < 2:2920036‑M1/150‑99 (MQ=255) cATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCctgtaagactcaatgtaagccgtgccaaaatatgatggctaggacgagctagaacccgccagcgtttcgaatattatcttatctttataataatcatt > 2:2632288‑M1/1‑52 (MQ=255) aTCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCctgtaagactcaatgtaagccgtgccaaaatatgatggctaggacgagctagaacccgccagcgtttcgaatattatcttatctttataataatcattc < 1:3425984‑M1/150‑100 (MQ=255) aTCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCctgtaagactcaatgtaagccgtgccaaaatatgatggctaggacgagctagaacccgccagcgtttcgaatattatcttatctttataataatcattc < 2:2223284‑M1/150‑100 (MQ=255) tCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCctgtaagactcaatgtaagccgtgccaaaatatgatggctaggacgagctagaacccgccagcgtttcgaatattatcttatctttataataatcattct < 1:667247‑M1/150‑101 (MQ=255) tGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCctgtaagactcaatgtaagccgtgccaaaatatgatggctaggacgagctagaacccgccagcgtttcgaatattatcttatctttataataatcattctcg > 1:2446016‑M1/1‑48 (MQ=255) ggTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCctgtaagactcaatgtaagcggtgccaaaatatgagggctgggacgagctagaacccgccagcgtttcgaatattatcttatctttataataatcattctcgt < 2:686810‑M1/150‑104 (MQ=255) ggTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCctgtaagactcaatgtaagccgtgccaaaatatgatggctaggacgagctagaacccgccagcgtttcgaatattatcttatctttataataatcattctcgt > 2:3863555‑M1/1‑47 (MQ=255) gtttttTATTACCCCTTAAGGACCCCTCAGTTTGCGTCCCGCTTGCttgtaagactaaatgtaagccgtgcaaaaatatgtgggctaggacgagctagaccccgccagcgtttcgaatattatcttatctttataataatcattctcgtt < 2:3093543‑M1/150‑105 (MQ=255) gttgttTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCctgtaagactcaatgtaagccgtgccaaaatatgatggctaggacgagctagaacccgccagcgtttcgaatattatcttatctttataataatcattctcgtt > 1:3638371‑M1/1‑46 (MQ=255) ttattaACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCctgtaagactcaatgtaagccgtgccaaaatatgatggctaggacgagctagaacccgccagcgtttcgaatattatcttatctttataataatcattctcgtttacgt < 1:2327571‑M1/150‑110 (MQ=255) tattaACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCctgtaagactcaatgtaagccgtgccaaaatatgatggctaggacgagctagaacccgccagcgtttcgaatattatcttatctttataataatcattctcgtttacgtt < 1:4052388‑M1/150‑111 (MQ=255) attaACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCctgtaagactcaatgtaagccgtgccaaaatatgatggctaggacgagctagaacccgccagcgtttcgaatattatcttatctttataataatcattctcgtttacgtta > 1:427925‑M1/1‑39 (MQ=255) attaACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCctgtaagactcaatgtaagccgtgccaaaatatgatggctaggacgagctagaacccgccagcgtttcgaatattatcttatctttataataatcattctcgtttacgtta > 2:1048274‑M1/1‑39 (MQ=255) taACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCctgtaagactcaatgtaagccgtgccaaaatatgatggctaggacgagctagaacccgccagcgtttcgaatattatcttatctttataataatcattctcgtttacgttatc < 1:144272‑M1/150‑114 (MQ=255) aCCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCctgtaagactcaatgtaagccgtgccaaaatatgatggctaggacgagctagaacccgctagcgtttcgaatattatcttatctttataataatcattctcgtttacgttatcat < 1:3794862‑M1/150‑116 (MQ=255) aCCCTTAAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCctgtaagactcaatgtaagccgtgccaaaatatgatggctaggacgagctagaacccgccagcgtttcgaatattatcttatctttataataatcattctcgtttacgttatcat < 2:3005404‑M1/150‑116 (MQ=255) cccTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCctgtaagactcaatgtaagccgtgccaaaatatgatggctaggacgagctagaacccgccagcgtttcgaatattatcttatctttataataatcattctcgtttacgttatcatt < 1:3708593‑M1/150‑117 (MQ=255) cTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCctgtaagactcaatgtaagccgtgccaaaatatgatggctaggacgagctagaacccgccagcgtttcgaatattatcttatctttataataatcattctcgtttacgttatcattca > 2:3740154‑M1/1‑32 (MQ=255) ttCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCctgtaagactcaatgtaagccgtgccaaaatatgatggctaggacgagctagaacccgccagcgtttcgaatattatcttatctttataataatcattctcgtttacgttatcattcac > 1:1259528‑M1/1‑31 (MQ=255) tCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCctgtaagactcaatgtaagccgtgccaaaatatgatggctaggacgagctagaacccgccagcgtttcgaatattatcttatctttataataatcattctcgtttacgttatcattcact < 1:1822109‑M1/150‑121 (MQ=255) tCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCctgtaagactcaatgtaagccgtgccaaaatatgatggctaggacgagctagaacccgccagcgtttcgaatattatcttatctttataataatcattctcgtttacgttatcattcact < 2:2699974‑M1/150‑121 (MQ=255) cAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCctgtaagactcaatgtaagccgtgccaaaatatgatggctaggacgagctagaacccgccagcgtttcgaatattatcttatctttataataatcattctcgtttacgttatcattcactt > 2:2854166‑M1/1‑29 (MQ=255) gAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCctgtaagactcaatgtaagccgtgccaaaatatgatggctaggacgagctagaacccgccagcgtttcgaatattatcttatctttataataatcattctcgtttacgttatcattcactttac > 1:2850607‑M1/1‑26 (MQ=255) aaCGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCctgtaagactcaatgtaagccgtgccaaaatatgatggctaggacgagctagaacccgccagcgtttcgaatattatcttatctttataataatcattctcgtttacgttatcattcactttaca < 1:255960‑M1/150‑126 (MQ=255) cGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCctgtaagactcaatgtaagccgtgccaaaatatgatggctaggacgagctagaacccgccagcgtttcgaatattatcttatctttataataatcattctcgtttacgttatcattcactttacatc > 1:3605421‑M1/1‑23 (MQ=255) tCAGATTGCGTACCGCTTGCctgtaagactcaatgtaagccgtgccaaaatatgatggctaggacgagctagaacccgccagcgtttcgaatattatcttatctttataataatcattctcgtttacgttatcattcactttacatcaga > 1:1845971‑M1/1‑20 (MQ=255) cAGATTGCGTACCGCTTGCctgtaagactcaatgtaagccgtgccaaaatatgatggctaggacgagctagaacccgccagcgtttcgaatattatcttatctttataataatcattctcgtttacgttatcattcactttacatcagag < 1:3285657‑M1/150‑132 (MQ=255) cAGATTGCGTACCGCTTGCctgaaagactcaatgtaagccgtgccaaaatatgatggctaggacgagctagaccccgccagcgtttcgaatattatcttatctttataataatcattctcgtttacgttatcattcactttacatcagag < 2:2592634‑M1/150‑132 (MQ=255) aGATTGCGTACCGCTTGCctgtaagactcaatgtaagccgtgccaaaatatgatggctaggacgagctagaccccgccagcgtttcgaatattatcttatctttataataatcattctcgtttacgttatcattcactttacatcagaga < 2:2279048‑M1/150‑133 (MQ=255) gATTGCGTACCGCTTGCctgtaagactcaatgtaagccgtgccaaaatatgatggctaggacgagctagaacccgccagcgtttcgaatattatcttatctttataataatcattctcgtttacgttatcattcactttacatcagagat < 1:2794472‑M1/150‑134 (MQ=255) aTTGCGTCCCGCTGGCctgtaagactcaatgtaagccgtgccaaaatatgatggctaggacgagctagaacccgccagcgtttcgaatattatcttatctttataataatcattctcgtttacgttatcattcactttacatcagagata < 2:2348346‑M1/150‑135 (MQ=255) aTTGCGTACCGCTTGCctgtaagactcaatgtaagccgtgccaaaatatgatggctaggacgagctagaacccgccagcgtttcgaatattatcttatctttataataatcattctcgtttacgttatcattcactttacatcagagata > 2:1218093‑M1/1‑16 (MQ=255) aTTGCGTACCGCTTGCctgtaagactcaatgtaagccgtgccaaaatatgatggctaggacgagctagaacccgccagcgtttcgaatattatcttatctttataataatcattctcgtttacgttatcattcactttacatcagagata > 1:3961769‑M1/1‑16 (MQ=255) tGCGTACCGCTTGCctgtaagactcaatgtaagccgtgccaaaatatgatggctaggacgagctagaacccgccagcgtttcgaatattatcttatctttataataatcattctcgtttacgttatcattcactttacatcagagatata < 2:3639927‑M1/150‑137 (MQ=255) gCGTACCGCTTGCctgtaagactcaatttaagccgtgccaaaatatgatggctaggacgagctagaacccgccagcgtttcgaatattatcttatctttataataatcattctcgtttacgttatcattcactttacatcagagatatac < 2:303104‑M1/150‑138 (MQ=255) gTACCGCTTGCctgtaagactcaatgtaagccgtgccaaaatatgatggctaggacgagctagaacccgccagcgtttcgaatattatcttatctttataataatcattctcgtttacgttatcattcactttacatcagagatatacca > 1:3123064‑M1/1‑11 (MQ=255) aCCGCTTGCctgtaagactcaatgtaagccgtgccaaaatatgatggctaggacgagctagaacccgccagcgtttcgaatattatcttatctttataataatcattctcgtttacgttatcattcactttacatcagagatataccatt < 2:2030603‑M1/150‑142 (MQ=255) ccGCTTGCctgtaagactcaatgtaagccgtgccaaaatatgatggctaggacgagctagaacccgccagcgtttcgaatattatcttatctttataataatcattctcgtttacgttatcattcactttacatcagagatataccattc < 2:2819571‑M1/150‑143 (MQ=255) gCTTGCctgtaagactcaatgtaagccgtgccaaaatatgatggctaggacgagctagaacccgccagcgtttcgaatattatcttatctttataataatcattctcgtttacgttatcattcactttacatcagagatataccattcca < 1:3169794‑M1/150‑145 (MQ=255) gCTTGCctgtaagactcaatgtaagccgtgccaaaatatgatggctaggacgagctagaacccgccagcgtttcgaatattatcttatctttataataatcattctcgtttacgttatcattcactttacatcagagatataccattcca < 2:3252732‑M1/150‑145 (MQ=255) cTTGCctgtaagactcaatgtaagccgtgccaaaatatgatggctaggacgagctagaacccgccagcgtttcgaatattatcttatctttataataatcattctcgtttacgttatcattcactttacatcagagatataccattccat < 1:734625‑M1/150‑146 (MQ=255) tGCctgtaagactaaatgtaagccgtgccaaaatatgatggctaggacgagctagaacccgccagcgtttcgaatattatcttatctttataataatcattctcgtttacgttatcattcactttacatcagagatataccattccatat < 1:1378535‑M1/150‑148 (MQ=255) cctgtaagactcaatgtaagccgtgccaaaatatgatggctaggacgagttagaacccgccagcgtttcgaatattatcttatctttataataatcattctcgtttacgttatcattcactttacatcagagatataccattccatataa < 2:3437702‑M1/150‑150 (MQ=255) cctgtaagactcaatgaaagccgtgccaaaatatgatggctaggacgagctagaacccgccagcgtttcgaatattatcttatctttataataatcattctcgtttacgttatcattcactttacatcggagatataccattccatataa < 1:4124189‑M1/150‑150 (MQ=255) | ATGTTTGGTAGTAATTAACATCTAAGCGTGAAATACCGGATGGCGAGTTGCCATCCGGTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCGAACCCGCCAGCGTTTCGAATATTATCTTATCTTTATAATAATCATTCTCGTTTACGTTATCATTCACTTTACATCAGAGATATACCATTCCATATAACGGCCCTGTACGCCTGGACGGATAAAGCGTTTACGCGACAACGGATGCCCG > AP012306/162072‑162369 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |