Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | AP012306 | 3,361,617 | 0 | G | . | 25.0% | 851.1 / 293.5 | 285 | coding (1089/1869 nt) | trkD | potassium transporter |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (112/101); new base . (34/37); total (147/138) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.97e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.63e-01 | |||||||||||
Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 309 total aligned reads displayed.
CAGGCGGTACGTCTGGGATATTTGTCGCCGATGCGCATTATTCACACCTCCGAAATGGAGTCAGGGCAAATCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGTCAGAACTGGCACTGGAATAAGTATTTTGTTGCGCTGATCCTGATTGCTTTCCTTTGTGTCGATATTCCATTGTTCAC > AP012306/3361468‑3361766 | aGGCGGTACGTCTGGGATATTTGTCGCCGATGCGCATTATTCACACCTCCGAAATGGAGTCAGGGCAAATCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTgg > 2:4421410/1‑150 (MQ=255) cGGTACGTCTGGGATATTTGTCGCCGATGCGCATTATTCACACCTCCGAAATGGAGTCAGGGCAAATCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTggcgg > 2:3786979/1‑150 (MQ=255) ggTACGTCTGGGATATTTGTCGCCGATGCGCATTATTCACACCTCCGAAATGGAGTCAGGGCAAATCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTggcggc > 2:2038545/1‑150 (MQ=255) tCTGGGATATTTGTCGCCGATGCGCATTATTCACACCTCCGAAATGGAGTCAGGGCAAATCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTa < 2:807402/150‑1 (MQ=255) atatTTGTCGCCGATGCGCATTATTCACACCTCCGAAATGGAGTCAGGGCAAATCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGAt < 1:1981610/150‑1 (MQ=255) atatTTGTCGCCGATGCGCATTATTCACACCTCCGAAATGGAGTCAGGGCAAATCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGAt > 2:296278/1‑150 (MQ=255) tatTTGTCGCCGATGCGCATTATTCACACCTCCGAAATGGAGTCAGGGCAACTCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGATCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTAGGGGAtt > 2:2375445/1‑150 (MQ=255) tatTTGTCGCCGATGCGCATTATTCACACCTCCGAAATGGAGTCAGGGCAAATCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGAtt > 2:1226512/1‑150 (MQ=255) tttGTCGCCGATGCGCATTATTCACACCTCCGAAATGGAGTCAGGGCAAATCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGc < 2:3735961/150‑1 (MQ=255) tttGTCGCCGATGCGCATTATTCACACCTCCGAAATGGAGTCAGGGCAAATCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCATGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGc > 2:1692274/1‑150 (MQ=255) ttGTCGCCGATGCGCATTATTCACACCTCCGAAATGGAGTCAGGGCAAATCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCg > 2:1682033/1‑150 (MQ=255) tGTCGCCGATGCGCATTATTCACACCTCCGAAATGGAGTCAGGGCAAATCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCgg > 2:283431/1‑150 (MQ=255) tCGCCGATGCGCATTATTCACACCTCCGAAATGGAGTCAGGGCAAATCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTg < 1:3960457/150‑1 (MQ=255) gCCGATGCGCATTATTCACACCTCCGAAATGGAGTCAGGGCAAATCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGAc > 1:2274748/1‑150 (MQ=255) gCCGATGCGCATTATTCACACCTCCGAAATGGAGTCAGGGCAAATCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGAc > 1:3998803/1‑150 (MQ=255) ccGATGCGCATTATTCACACCTCCGAAATGGAGTCAGGGCAAATCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGAcc > 2:3195141/1‑150 (MQ=255) tGCGCATTATTCACACCTCCGAAATGGAGTCAGGGCAAATCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCT‑‑‑GGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCa < 2:1414369/150‑1 (MQ=255) cgcATTATTCACACCTCCGAAATGGAGTCAGGGCAAATCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCT‑‑‑GGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATg < 2:1266246/150‑1 (MQ=255) attattCACACCTCCGAAATGGAGTCAGGGCAAATCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCT‑‑‑GGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTg > 1:1017792/1‑150 (MQ=255) attattCACACCTCCGAAATGGAGTCAGGGCAAATCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCT‑‑‑GGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTg > 2:1511031/1‑150 (MQ=255) ttCACACCTCCGAAATGGAGTCAGGGCAAATCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGc > 1:902148/1‑150 (MQ=255) tCACACCTCCGAAATGGAGTCAGGGCAAATCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCT‑‑‑GGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGAc > 1:3862927/1‑150 (MQ=255) tCACACCTCCGAAATGGAGTCAGGGCAAATCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCT‑‑‑GGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGAc < 1:1837003/150‑1 (MQ=255) cacaCCTCCGAAATGGAGTCAGGGCAAATCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTg < 1:2894822/150‑1 (MQ=255) cacCTCCGAAATGGAGTCAGGGCAAATCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGAc < 1:2669053/150‑1 (MQ=255) ccTCCGAAATGGAGTCAGGGCAAATCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGt > 1:3579747/1‑150 (MQ=255) gAAATGGAGTCAGGGCAAATCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTAtt > 2:2083151/1‑150 (MQ=255) aaaTGGAGTCAGGGCAAATCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATtc > 2:613566/1‑150 (MQ=255) aaTGGAGTCAGGGCAAATCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCT‑‑‑GGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATtctctc > 2:1138724/1‑150 (MQ=255) aTGGAGTCAGGGCAAATCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATtctc > 2:4075340/1‑150 (MQ=255) ggAGTCAGGGCAAATCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCT‑‑‑GGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGAc > 2:3370413/1‑150 (MQ=255) gAGTCAGGGCAAATCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTTACGTCTATTCTCTCg > 1:250363/1‑150 (MQ=255) gTCAGGGCAAATCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGAc < 1:3709588/150‑1 (MQ=255) 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tataTTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGt > 1:975638/1‑150 (MQ=255) atatTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTAGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGGCCGGAACCATGGGGCTGACGTCTATTTTCTCGACTACCGTGGGACGTc > 2:3126972/1‑150 (MQ=255) ccGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTTAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGTCAGAAc > 1:2724610/1‑150 (MQ=255) ccGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGTCAGAAc < 1:1698615/150‑1 (MQ=255) gTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGTCAGAACTg < 2:3930999/150‑1 (MQ=255) 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ggTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGTCAGAACTGGCACTGGAATAAGTATTTTGTTGCGCt > 1:3758700/1‑150 (MQ=255) gtgattgtgattGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGAGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGTCAGAACTGGCACTGGAATAAGTATTTTGTTGCGCTGATc > 2:466925/1‑150 (MQ=255) tgattgtgattgTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGTCAGAACTGGCACTGGAATAAGTATTTTGTTGCGCTGATcc < 2:515480/150‑1 (MQ=255) tgtgattgtCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGTCAGAACTGGCACTGGAATAAGTATTTTGTTGCGCTGATCCTGAt < 1:301255/150‑1 (MQ=255) tgattgtCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGTCAGAACTGGCACTGGAATAAGTATTTTGTTGCGCTGATCCTGATTg < 1:1162434/150‑1 (MQ=255) tgattgtCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCT‑‑‑GGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGTCAGAACTGGCACTGGAATAAGTATTTTGTTGCGCTGATCCTGATTGCtt < 1:77795/150‑1 (MQ=255) ttgtCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCT‑‑‑GGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGTCAGAACTGGCACTGGAATAAGTATTTTGTTGCGCTGATCCTGATTGCTTTcc > 2:1068196/1‑150 (MQ=255) ttgtCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCT‑‑‑GGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGTCAGAACTGGCACTGGAATAAGTATTTTGTTGCGCTGATCCTGATTGCTTTcc < 2:3350357/150‑1 (MQ=255) tgtCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCT‑‑‑GGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGTCAGAACTGGCACTGGAATAAGTATTTTGTTGCGCTGATCCTGATTGCTTTCCt > 2:643814/1‑150 (MQ=255) cAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGTCAGAACTGGCACTGGAATAAGTATTTTGTTGCGCTGATCCTGATTGCTTTCCt > 2:2940646/1‑150 (MQ=255) gCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGTCAGAACTGGCACTGGAATAAGTAtt < 2:2727882/120‑1 (MQ=255) cTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGTCAGAACTGGCACTGGAATAAGTATTTTGTTGCGCTGATCCTGATTGCTTTCCTTtg > 2:3168649/1‑150 (MQ=255) cTTTGAGCACTCCAGCAACCT‑‑‑GGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGTCAGAACTGGCACTGGAATAAGTATTTTGTTGCGCTGATCCTGATTGCTTTCCTTTgtgt > 2:3469035/1‑150 (MQ=255) tttGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGTCAGAACTGGCACTGGAATAAGTATTTTGTTGCGCTGATCCTGATTGCTTTCCTTtgt < 2:1838596/150‑1 (MQ=255) tttGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGTCAGAACTGGCACTGGAATAAGTATTTTGTTGCGCTGATCCTGATTGCTTTCCTTtgt > 2:2460180/1‑150 (MQ=255) gAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGTCAGAACTGGCACTGGAATAAGTATTTTGTTGCGCTGATCCTGATTGCTTTCATTTGTGTc < 1:2798875/150‑1 (MQ=255) aGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGTCAGAACTGGCACTGGAATAAGTATTTTGTTGCGCTGATCCTGATTGCTTTCCTTTGTGTCg > 1:2421280/1‑150 (MQ=255) aCTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGTCAGAACTGGCACTGGAATAAGTATTTTGTTGCGCTGATCCTGATTGCTTTCCTTTgtgt < 1:1327407/145‑1 (MQ=255) aCTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGTCAGAACTGGCACTGGAATAAGTATTTTGTTGCGCTGATCCTGATTGCTTTCCTTTgtgt > 2:1327407/1‑145 (MQ=255) aCTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGTCAGAACTGGCACTGGAATAAGTATTTTGTTGCGCTGATCCTGATTGCTTTCCTTTGTGTCGata > 1:2829605/1‑150 (MQ=255) tCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGTCAGAACTGGCACTGGAATAAGTATTTTGTTGCGCTGATCCTGATTGCTTTCCTTTGTGTCGATAtt < 1:2978729/150‑1 (MQ=255) tCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGTCAGAACTGGCACTGGAATAAGTATTTTGTTGCGCTGATCCTGATTGCTTTCCTTTGTGTCGATAtt < 1:3915770/150‑1 (MQ=255) aGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGTCAGAACTGGCACTGGAATAAGTATTTTGTTGCGCTGATCCTGATTGCTTTCCTTTGTGTCGATATTCCa < 2:3599692/150‑1 (MQ=255) gCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGTCAGAACTGGCACTGGAATAAGTATTTTGTTGCGCTGATCCTGATTGCTTTCCTTTGTGTCGATATTCCAt < 1:1603663/150‑1 (MQ=255) ccTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGTCAGAACTGGCACTGGTATAAGTATTTTGTTGCGCTGATCCTGATTGCTTTCCTTTGTGTCGATATTCCATTGtt < 2:3809763/150‑1 (MQ=255) tGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGTCAGAACTGGCACTGGAATAAGTATTTTGTTGCGCTGATCCTGATTGCTTTCCTTTGTGTCGATATTCCATTGTTCa < 1:1467905/150‑1 (MQ=255) ggcggcggcGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGGGGCACGTCAGAACTGGCACTGGAATAAGTATTTTGTTGCGCTGATCCTGATTGCTTTCCTTTGTGTCGATATTCCATTGTTCAc > 2:2861129/1‑150 (MQ=255) | CAGGCGGTACGTCTGGGATATTTGTCGCCGATGCGCATTATTCACACCTCCGAAATGGAGTCAGGGCAAATCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGTCAGAACTGGCACTGGAATAAGTATTTTGTTGCGCTGATCCTGATTGCTTTCCTTTGTGTCGATATTCCATTGTTCAC > AP012306/3361468‑3361766 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |