Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | AP012306 | 3,361,618 | 0 | G | . | 25.0% | 857.3 / 293.5 | 285 | coding (1090/1869 nt) | trkD | potassium transporter |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (112/101); new base . (34/37); total (147/138) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.97e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.91e-01 | |||||||||||
Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 309 total aligned reads displayed.
AGGCGGTACGTCTGGGATATTTGTCGCCGATGCGCATTATTCACACCTCCGAAATGGAGTCAGGGCAAATCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGTCAGAACTGGCACTGGAATAAGTATTTTGTTGCGCTGATCCTGATTGCTTTCCTTTGTGTCGATATTCCATTGTTCACC > AP012306/3361469‑3361767 | aGGCGGTACGTCTGGGATATTTGTCGCCGATGCGCATTATTCACACCTCCGAAATGGAGTCAGGGCAAATCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTgg > 2:4421410/1‑150 (MQ=255) cGGTACGTCTGGGATATTTGTCGCCGATGCGCATTATTCACACCTCCGAAATGGAGTCAGGGCAAATCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTggcgg > 2:3786979/1‑150 (MQ=255) ggTACGTCTGGGATATTTGTCGCCGATGCGCATTATTCACACCTCCGAAATGGAGTCAGGGCAAATCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTggcggc > 2:2038545/1‑150 (MQ=255) gTACGTCTGGGATATTTGTCGCCGATGCGCATTATTCACACCTCCGAAATGGAGTCAGGGCAAATCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTggcggcg > 1:4318827/1‑150 (MQ=255) tCTGGGATATTTGTCGCCGATGCGCATTATTCACACCTCCGAAATGGAGTCAGGGCAAATCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTa < 2:807402/150‑1 (MQ=255) atatTTGTCGCCGATGCGCATTATTCACACCTCCGAAATGGAGTCAGGGCAAATCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGAt > 2:296278/1‑150 (MQ=255) atatTTGTCGCCGATGCGCATTATTCACACCTCCGAAATGGAGTCAGGGCAAATCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGAt < 1:1981610/150‑1 (MQ=255) tatTTGTCGCCGATGCGCATTATTCACACCTCCGAAATGGAGTCAGGGCAACTCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGATCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTAGGGGAtt > 2:2375445/1‑150 (MQ=255) tttGTCGCCGATGCGCATTATTCACACCTCCGAAATGGAGTCAGGGCAAATCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGc < 2:1117512/150‑1 (MQ=255) tttGTCGCCGATGCGCATTATTCACACCTCCGAAATGGAGTCAGGGCAAATCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGc < 2:3735961/150‑1 (MQ=255) tttGTCGCCGATGCGCATTATTCACACCTCCGAAATGGAGTCAGGGCAAATCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCATGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGc > 2:1692274/1‑150 (MQ=255) ttGTCGCCGATGCGCATTATTCACACCTCCGAAATGGAGTCAGGGCAAATCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCg > 2:1682033/1‑150 (MQ=255) tGTCGCCGATGCGCATTATTCACACCTCCGAAATGGAGTCAGGGCAAATCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCgg > 2:283431/1‑150 (MQ=255) tGTCGCCGATGCGCATTATTCACACCTCCGAAATGGAGTCAGGGCAAATCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCT‑‑‑GGCGGCGTACGGGATTGCGGTGa > 1:3441139/1‑150 (MQ=255) gTCGCCGATGCGCATTATTCACACCTCCGAAATGGAGTCAGGGCAAATCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGt < 1:505670/150‑1 (MQ=255) gTCGCCGATGCGCATTATTCACACCTCCGAAATGGAGTCAGGGCAAATCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCT‑‑‑GGCGGCGTACGGGATTGCGGTGAc > 2:121837/1‑150 (MQ=255) gCCGATGCGCATTATTCACACCTCCGAAATGGAGTCAGGGCAAATCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGAc > 1:2274748/1‑150 (MQ=255) ccGATGCGCATTATTCACACCTCCGAAATGGAGTCAGGGCAAATCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGAcc > 2:3195141/1‑150 (MQ=255) tGCGCATTATTCACACCTCCGAAATGGAGTCAGGGCAAATCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCT‑‑‑GGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCa < 2:1414369/150‑1 (MQ=255) cgcATTATTCACACCTCCGAAATGGAGTCAGGGCAAATCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAAcc > 1:300855/1‑150 (MQ=255) cATTATTCACACCTCCGAAATGGAGTCAGGGCAAATCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCAt < 1:3724136/150‑1 (MQ=255) attattCACACCTCCGAAATGGAGTCAGGGCAAATCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCT‑‑‑GGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTg > 2:1511031/1‑150 (MQ=255) attattCACACCTCCGAAATGGAGTCAGGGCAAATCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCT‑‑‑GGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTg > 1:1017792/1‑150 (MQ=255) tattCACACCTCCGAAATGGAGTCAGGGCAAATCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGt > 1:2709061/1‑150 (MQ=255) attCACACCTCCGAAATGGAGTCAGGGCAAATCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTg > 1:2612509/1‑150 (MQ=255) tCACACCTCCGAAATGGAGTCAGGGCAAATCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCT‑‑‑GGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGAc < 1:1837003/150‑1 (MQ=255) tccTCCGAAATGGAGTCAGGGCAAATCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCT‑‑‑GGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCt < 1:3340971/149‑1 (MQ=255) cGAAATGGAGTCAGGGCAAATCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTAt > 1:970465/1‑150 (MQ=255) gAAATGGAGTCAGGGCAAATCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTAtt > 2:2083151/1‑150 (MQ=255) aaaTGGAGTCAGGGCAAATCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATtc > 2:613566/1‑150 (MQ=255) aTGGAGTCAGGGCAAATCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATtctc > 2:4075340/1‑150 (MQ=255) ggAGTCAGGGCAAATCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCT‑‑‑GGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGAc > 2:3370413/1‑150 (MQ=255) tCAGGGCAAATCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCT‑‑‑GGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTAcc < 2:1255609/150‑1 (MQ=255) aGGGCAAATCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTAc > 1:3365295/1‑150 (MQ=255) gggCAAATCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTAcc < 1:719256/150‑1 (MQ=255) ggCAAATCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCg > 2:4235336/1‑150 (MQ=255) cAAATCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTg < 1:2635569/150‑1 (MQ=255) aaTCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGc < 1:2317607/150‑1 (MQ=255) aaTCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGc > 1:2964530/1‑150 (MQ=255) aaTCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGc > 2:2116258/1‑150 (MQ=255) aTCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCa < 2:3286478/150‑1 (MQ=255) tCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCAc > 1:1945227/1‑150 (MQ=255) tataTTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGt < 1:3901595/150‑1 (MQ=255) atatTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTAGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGGCCGGAACCATGGGGCTGACGTCTATTTTCTCGACTACCGTGGGACGTc > 2:3126972/1‑150 (MQ=255) ccGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGTCAGAAc < 1:1698615/150‑1 (MQ=255) cGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGTCAGAACt < 1:3573050/150‑1 (MQ=255) gTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGTCAGAACTg > 1:3993772/1‑150 (MQ=255) gTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGTCAGAACTg < 2:3930999/150‑1 (MQ=255) gTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCATGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCT‑‑‑GGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGTCAGAACTGGCa < 1:3637386/150‑1 (MQ=255) tttGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGTCAGAACTgg > 1:3180993/1‑150 (MQ=255) tgtgAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCT‑‑‑GGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGTCAGAACTGGCACTg > 2:2544833/1‑150 (MQ=255) tgtgAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCT‑‑‑GGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGTCAGAACTGGCACTg > 2:2893109/1‑150 (MQ=255) tgAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGTCAGAACTGGCACt < 1:1380377/150‑1 (MQ=255) aCTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGTCAGAACTGGCACTGGa < 2:2187170/150‑1 (MQ=255) cTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGTCAGAACTGGCACTGGaa > 2:3824023/1‑150 (MQ=255) cTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGTCAGAACTGGCACTGGaa > 2:3072724/1‑150 (MQ=255) tGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGTCAGAACTGGCACTGGAAt > 2:100495/1‑150 (MQ=255) ggATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGTCAGAACTGGCACTGGAATa < 1:3857498/150‑1 (MQ=255) aTGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGTCAGAACTGGCACTGGAATAAg < 1:2176596/150‑1 (MQ=255) gCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGTCAGAACTGGCACTGGAATAAGTa > 1:1423306/1‑150 (MQ=255) ctATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCT‑‑‑GGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGTCAGAACTGGCACTGGAATAAGTATTttgt > 1:1219902/1‑150 (MQ=255) tATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGTCAGAACTGGCACTGGAATAAGTAtttt < 2:41515/150‑1 (MQ=255) aTGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGTCAGAACTGGCACTGGAATAAGTATTttg > 1:4008097/1‑150 (MQ=255) 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gtgattgtCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGTCAGAACTGGCACTGGAATAAGTATTTTGTTGCGCTGATCCTGAtt < 2:1036028/150‑1 (MQ=255) gtgattgtCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGTCAGAACTGGCACTGGAATAAGTATTTTGTTGCGCTGATCCTGAtt < 1:920482/150‑1 (MQ=255) tgattgtCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGTCAGAACTGGCACTGGAATAAGTATTTTGTTGCGCTGATCCTGATTg < 1:1162434/150‑1 (MQ=255) gattgtCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCT‑‑‑GGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGTCAGAACTGGCACTGGAATAAGTATTTTGTTGCGCTGATCCTGATTGCttt < 1:2812869/150‑1 (MQ=255) ttgtCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCT‑‑‑GGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGTCAGAACTGGCACTGGAATAAGTATTTTGTTGCGCTGATCCTGATTGCTTTcc < 2:3350357/150‑1 (MQ=255) tgtCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCT‑‑‑GGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGTCAGAACTGGCACTGGAATAAGTATTTTGTTGCGCTGATCCTGATTGCTTTCCt > 2:643814/1‑150 (MQ=255) cAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGTCAGAACTGGCACTGGAATAAGTATTTTGTTGCGCTGATCCTGATTGCTTTCCt > 2:2940646/1‑150 (MQ=255) gCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGTCAGAACTGGCACTGGAATAAGTAtt < 2:2727882/120‑1 (MQ=255) cTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTGCCGTGGCACGTCAGAACTGGCACTGGAATAAGTATTTTGTTGCGCTGATCCTGATTGCTTTCCTTtg < 1:4405122/150‑1 (MQ=255) cTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGTCAGAACTGGCACTGGAATAAGTATTTTGTTGCGCTGATCCTGATTGCTTTCCTTtg > 2:3168649/1‑150 (MQ=255) cTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGTCAGAACTGGCACTGGAATAAGTATTTTGTTGCGCTGATCCTGATTGCTTTCCTTtg < 1:2440850/150‑1 (MQ=255) cTTTGAGCACTCCAGCAACCT‑‑‑GGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGTCAGAACTGGCACTGGAATAAGTATTTTGTTGCGCTGATCCTGATTGCTTTCCTTTgtgt > 2:3469035/1‑150 (MQ=255) tttGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGTCAGAACTGGCACTGGAATAAGTATTTTGTTGCGCTGATCCTGATTGCTTTCCTTtgt > 2:2460180/1‑150 (MQ=255) tttGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGTCAGAACTGGCACTGGAATAAGTATTTTGTTGCGCTGATCCTGATTGCTTTCCTTtgt < 2:1838596/150‑1 (MQ=255) aGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGTCAGAACTGGCACTGGAATAAGTATTTTGTTGCGCTGATCCTGATTGCTTTCCTTTGTGTCg > 1:2421280/1‑150 (MQ=255) aCTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGTCAGAACTGGCACTGGAATAAGTATTTTGTTGCGCTGATCCTGATTGCTTTCCTTTgtgt < 1:1327407/145‑1 (MQ=255) aCTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGTCAGAACTGGCACTGGAATAAGTATTTTGTTGCGCTGATCCTGATTGCTTTCCTTTgtgt > 2:1327407/1‑145 (MQ=255) cTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGTCAGAACTGGCACTGGAATAAGTATTTTGTTGCGCTGATCCTGATTGCTTTCCTTTGTGTCGatat > 1:324224/1‑150 (MQ=255) ccAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGTCAGAACTGGCACTGGAATAAGTATTTTGTTGCGCTGATCCTGATTGCTTTCCTTTGTGTCGATATTc > 1:4231345/1‑150 (MQ=255) ccAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGTCAGAACTGGCACTGGAATAAGTATTTTGTTGCGCTGATCCTGATTGCTTTCCTTTGTGTCGATATTc < 1:801169/150‑1 (MQ=255) 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tGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGTCAGAACTGGCACTGGAATAAGTATTTTGTTGCGCTGATCCTGATTGCTTTCCTTTGTGTCGATATTCCATTGTTCa < 1:1467905/150‑1 (MQ=255) ggcggcggcGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGGGGCACGTCAGAACTGGCACTGGAATAAGTATTTTGTTGCGCTGATCCTGATTGCTTTCCTTTGTGTCGATATTCCATTGTTCAc > 2:2861129/1‑150 (MQ=255) | AGGCGGTACGTCTGGGATATTTGTCGCCGATGCGCATTATTCACACCTCCGAAATGGAGTCAGGGCAAATCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGTCAGAACTGGCACTGGAATAAGTATTTTGTTGCGCTGATCCTGATTGCTTTCCTTTGTGTCGATATTCCATTGTTCACC > AP012306/3361469‑3361767 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |