Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | AP012306 | 3,361,619 | 0 | C | . | 24.9% | 861.1 / 295.5 | 285 | coding (1091/1869 nt) | trkD | potassium transporter |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (113/101); new base . (34/37); total (147/138) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.96e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.65e-01 | |||||||||||
Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 307 total aligned reads displayed.
GCGGTACGTCTGGGATATTTGTCGCCGATGCGCATTATTCACACCTCCGAAATGGAGTCAGGGCAAATCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGTCAGAACTGGCACTGGAATAAGTATTTTGTTGCGCTGATCCTGATTGCTTTCCTTTGTGTCGATATTCCATTGTTCACC > AP012306/3361471‑3361767 | gCGGTACGTCTGGGATATTTGTCGCCGATGCGCATTATTCACACCTCCGAAATGGAGTCAGGGCAAATCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTggcg < 2:2910044/150‑1 (MQ=255) gTACGTCTGGGATATTTGTCGCCGATGCGCATTATTCACACCTCCGAAATGGAGTCAGGGCAAATCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTggcggcg > 1:4318827/1‑150 (MQ=255) gTCTGGGATATTTGTCGCCGATGCGCATTATTCACACCTCCGAAATGGAGTCAGGGCAAATCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTggcggcgtacg < 2:166061/150‑5 (MQ=255) tCTGGGATATTTGTCGCCGATGCGCATTATTCACACCTCCGAAATGGAGTCAGGGCAAATCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTa < 2:807402/150‑1 (MQ=255) tGGGATATTTGTCGCCGATGCGCATTATTCACACCTCCGAAATGGAGTCAGGGCAAATCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTggcggcgtacggga > 1:362733/1‑143 (MQ=255) atatTTGTCGCCGATGCGCATTATTCACACCTCCGAAATGGAGTCAGGGCAAATCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGAt < 1:1981610/150‑1 (MQ=255) tGTCGCCGATGCGCATTATTCACACCTCCGAAATGGAGTCAGGGCAAATCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCgg > 1:2916195/1‑150 (MQ=255) tGTCGCCGATGCGCATTATTCACACCTCCGAAATGGAGTCAGGGCAAATCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCT‑‑‑GGCGGCGTACGGGATTGCGGTGa > 1:3441139/1‑150 (MQ=255) gATGCGCATTATTCACACCTCCGAAATGGAGTCAGGGCAAATCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCgg < 1:919058/150‑1 (MQ=255) aTGCGCATTATTCACACCTCCGAAATGGAGTCAGGGCAAATCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGa > 1:3967778/1‑150 (MQ=255) gcgcATTATTCACCCCTCCGAAATGGAGTCAGGGCAAATCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCT‑‑‑GGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCAt < 2:1439028/150‑1 (MQ=255) gcATTATTCACACCTCCGAAATGGAGTCAGGGCAAATCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCa > 1:779533/1‑150 (MQ=255) attattCACACCTCCGAAATGGAGTCAGGGCAAATCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCT‑‑‑GGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTg < 2:1095366/150‑1 (MQ=255) attattCACACCTCCGAAATGGAGTCAGGGCAAATCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCT‑‑‑GGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTg > 1:1017792/1‑150 (MQ=255) attattCACACCTCCGAAATGGAGTCAGGGCAAATCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGATTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGCCCGGAACCATg > 2:1144952/1‑150 (MQ=255) tattCACACCTCCGAAATGGAGTCAGGGCAAATCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGt > 1:2709061/1‑150 (MQ=255) tattCACACCTCCGAAATGGAGTCAGGGCAAATCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGt > 2:2849934/1‑150 (MQ=255) tattCACACCTCCGAAATGGAGTCAGGGCAAATCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCT‑‑‑GGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCt < 1:3932522/150‑1 (MQ=255) attCACACCTCCGAAATGGAGTCAGGGCAAATCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTg > 1:2612509/1‑150 (MQ=255) ttCACACCTCCGAAATGGAGTCAGGGCAAATCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGc > 2:245269/1‑150 (MQ=255) tCACACCTCCGAAATGGAGTCAGGGCAAATCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCT‑‑‑GGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGAc < 1:1837003/150‑1 (MQ=255) cacCTCCGAAATGGAGTCAGGGCAAATCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGACGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGAc > 2:2610298/1‑150 (MQ=255) tccTCCGAAATGGAGTCAGGGCAAATCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCT‑‑‑GGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCt < 1:3340971/149‑1 (MQ=255) ccTCCGAAATGGAGTCAGGGCAAATCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGt < 1:3803383/150‑1 (MQ=255) tCCGAAATGGAGTCAGGGCAAATCTATATTCCGTTTGTGAACCGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCT‑‑‑GGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTAtt < 2:311138/150‑1 (MQ=255) cGAAATGGAGTCAGGGCAAATCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTAt > 2:1288195/1‑150 (MQ=255) aaaTGGAGTCAGGGCAAATCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATtc > 2:613566/1‑150 (MQ=255) aaaTGGAGTCAGGGCAAATCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATtc > 2:4302797/1‑150 (MQ=255) aaaTGGAGTCAGGGCAAATCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATtc > 1:4002211/1‑150 (MQ=255) aaTGGAGTCAGGGCAAATCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCT‑‑‑GGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATtctctc < 2:2087329/150‑1 (MQ=255) ggAGTCAGGGCAAATCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCT‑‑‑GGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGAc > 1:484948/1‑150 (MQ=255) tCAGGGCAAATCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCT‑‑‑GGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTAcc > 1:3886505/1‑150 (MQ=255) cAGGGCAAATCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCT‑‑‑GGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCg > 2:4231897/1‑150 (MQ=255) aGGGCAAATCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTAc > 1:3365295/1‑150 (MQ=255) ggCAAATCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCT‑‑‑GGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTgg > 1:696668/1‑150 (MQ=255) cAAATCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTg < 1:2635569/150‑1 (MQ=255) tCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCAc > 1:1945227/1‑150 (MQ=255) tataTTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGt > 1:3711687/1‑150 (MQ=255) atatTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGTc > 2:1944922/1‑150 (MQ=255) tatTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGTCa > 2:2962373/1‑150 (MQ=255) atTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGTCAg > 2:1804232/1‑150 (MQ=255) atTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCT‑‑‑GGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGTCAGAAc < 2:2152175/150‑1 (MQ=255) atTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCT‑‑‑GGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGTCAGAAc > 1:2853884/1‑150 (MQ=255) 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tgAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGTCAGAACTGGCACt < 1:1380377/150‑1 (MQ=255) tgAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGTCAGAACTGGCACt > 2:318905/1‑150 (MQ=255) tgAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGTCAGAACTGGCACt > 1:4224635/1‑150 (MQ=255) gAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCT‑‑‑GGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGTCAGAACTGGCACTGGaa < 1:2175300/150‑1 (MQ=255) cTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGTCAGAACTGGCACTGGaa > 2:3824023/1‑150 (MQ=255) 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ctATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCT‑‑‑GGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGTCAGAACTGGCACTGGAATAAGTATTttgt > 1:1219902/1‑150 (MQ=255) aTGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGTCAGAACTGGCACTGGAATAAGTATTttg > 1:3205249/1‑150 (MQ=255) gTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCT‑‑‑GGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGTCAGAACTGGCACTGGAATAAGTATTTTGTTgcg > 2:656617/1‑150 (MQ=255) cgcgGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGTCAGAACTGGCACTGGAATAAGTATTTTGTTgc > 2:3159680/1‑150 (MQ=255) cgcgGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAACAACCT‑‑‑GGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGTCAGAACTGGCACTGGAATAAGTATTTTGTTGCGCt < 1:2751759/150‑1 (MQ=255) 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ttgtgattgtCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGTCAGAACTGGCACTGGAATAAGTATTTTGTTGCGCTGATCCTGa < 2:2880376/150‑1 (MQ=255) tgattgtCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGTCAGAACTGGCACTGGAATAAGTATTTTGTTGCGCTGATCCTGATTg < 1:1162434/150‑1 (MQ=255) gattgtCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCT‑‑‑GGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGTCAGAACTGGCACTGGAATAAGTATTTTGTTGCGCTGATCCTGATTGCttt < 1:2812869/150‑1 (MQ=255) tgtCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCT‑‑‑GGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGTCAGAACTGGCACTGGAATAAGTATTTTGTTGCGCTGATCCTGATTGCTTTCCt > 2:643814/1‑150 (MQ=255) tgtCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCT‑‑‑GGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGTCAGAACTGGCACTGGAATAAGTATTTTGTTGCGCTGATCCTGATTGCTTTCCt < 1:985900/150‑1 (MQ=255) gtCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGTCAGAACTGGCACTGGAATAAGTATTTTGTTGCGCTGATCCTGATTGCTTTc > 2:1013312/1‑150 (MQ=255) aGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGTCAGAACTGGCACTGGAATAAGTATTTTGTTGCGCTGATCCTGATTGCTTTCCtt > 2:4134276/1‑150 (MQ=255) gCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGTCAGAACTGGCACTGGAATAAGTATTTTGTTGCGCTGATCCTGATTGCTTTCCttt < 2:3406272/150‑1 (MQ=255) cTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTGCCGTGGCACGTCAGAACTGGCACTGGAATAAGTATTTTGTTGCGCTGATCCTGATTGCTTTCCTTtg < 1:4405122/150‑1 (MQ=255) cTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTAGCGTGGCACGTCAGAACTGGCACTGGAATAAGTATTTTGTTGCGCTGATCCTGATTGCTTTCCTTtg < 2:3337404/150‑1 (MQ=255) cTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGTCAGAACTGGCACTGGAATAAGTATTTTGTTGCGCTGATCCTGATTGCTTTCCTTtg < 1:2440850/150‑1 (MQ=255) ttGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGTCAGAACTGGCACTGGAATAAGTATTTTGTTGCGCTGATCCTGATTGCTTTCCTTtgtg > 1:3006217/1‑150 (MQ=255) ttGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGTCAGAACTGGCACTGGAATAAGTATTTTGTTGCGCTGATCCTGATTGCTTTCCTTtgtg < 1:4112033/150‑1 (MQ=255) ttGAGCACTCCAGCAACCT‑‑‑GGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGTCAGAACTGGCACTGGAATAAGTATTTTGTTGCGCTGATCCTGATTGCTTTCCTTTGTGTCg < 2:1234292/150‑1 (MQ=255) tGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGTCAGAACTGGCACTGGAATAAGTATTTTGTTGCGCTGATCCTGATTGCTTTCCTTTgtgt < 2:3579098/150‑1 (MQ=255) aGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGTCAGAACTGGCACTGGAATAAGTATTTTGTTGCGCTGATCCTGATTGCTTTCCTTTGTGTCg > 1:2421280/1‑150 (MQ=255) aCTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGTCAGAACTGGCACTGGAATAAGTATTTTGTTGCGCTGATCCTGATTGCTTTCCTTTgtgt < 1:1327407/145‑1 (MQ=255) aCTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGTCAGAACTGGCACTGGAATAAGTATTTTGTTGCGCTGATCCTGATTGCTTTCCTTTGTGTCGata > 1:958733/1‑150 (MQ=255) tCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGTCAGAACTGGCACTGGAATAAGTATTTTGTTGCGCTGATCCTGATTGCTTTCCTTTGTGTCGATAtt > 2:3748208/1‑150 (MQ=255) aGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGTCAGAACTGGCACTGGAATAAGTATTTTGTTGCGCTGATCCTGATTGCTTTCCTTTGTGTCGATATTCCa < 1:2595072/150‑1 (MQ=255) gCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGTCAGAACTGGCACTGGAATAAGTATTTTGTTGCGCTGATCCTGATTGCTTTCCTTTGTGTCGATATTCCAt < 1:1603663/150‑1 (MQ=255) gCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGTCAGAACTGGCACTGGAATAAGCATTTTGTTGCGCTGATCCTGATTGCTTTCCTTTGTGTCGATATTCCAt > 2:4033049/1‑150 (MQ=255) cAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGTCAGAACTGGCACTGGAATAAGTATTTTGTTGCGCTGATCCTGATTGCTTTCCTTTGTGTCGATATTCCAtt < 2:1689103/150‑1 (MQ=255) aaCCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGTCAGAACTGGCACTGGAATAAGTATTTTGTTGCGCTGATCCTGATTGCTTTCCTTTGTGTCGATATTCCATTg < 2:134847/150‑1 (MQ=255) ccTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGTCAGAACTGGCACTGGTATAAGTATTTTGTTGCGCTGATCCTGATTGCTTTCCTTTGTGTCGATATTCCATTGtt < 2:3809763/150‑1 (MQ=255) tGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGTCAGAACTGGCACTGGAATAAGTATTTTGTTGCGCTGATCCTGATTGCTTTCCTTTGTGTCGATATTCCATTGTTCa < 1:1467905/150‑1 (MQ=255) ggcggcggcGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGTCAGAACTGGCACTGGAATAAGTATTTTGTTGCGCTGATCCTGATTGCTTTCCTTTGTGTCGATATTCCATTGTTCAc > 2:3067224/1‑150 (MQ=255) | GCGGTACGTCTGGGATATTTGTCGCCGATGCGCATTATTCACACCTCCGAAATGGAGTCAGGGCAAATCTATATTCCGTTTGTGAACTGGATGCTCTATGTCGCGGTCGTGATTGTGATTGTCAGCTTTGAGCACTCCAGCAACCTGGCGGCGGCGTACGGGATTGCGGTGACCGGAACCATGGTGCTGACGTCTATTCTCTCGACTACCGTGGCACGTCAGAACTGGCACTGGAATAAGTATTTTGTTGCGCTGATCCTGATTGCTTTCCTTTGTGTCGATATTCCATTGTTCACC > AP012306/3361471‑3361767 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |