New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | AP012306 | = 215372 | NA (NA) | noncoding (753/2905 nt) | rrlH | 23S ribosomal RNA (rrlH) | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. |
Only 100 of 198 total aligned reads displayed.
TATTCTGTAGCAAGGTTAACCGAATAGGGGAGCCGAAGGGAAACCGAGTCTTAACTGGGCGTTAAGTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCCGGTGATCTAGCCATGGGCAGGTTGAAGGTTGGGTAACACTAACTGGAGGACCGAACCGACTAAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AP012306/215211‑215364 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ctaatTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCCAACCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAACGCCCAGTTAAGACTCGGTTTCCCTTCGGCTCCCCTATTCGGTTAACC < AP012306/215372‑215224 aATTCTGGAGCAAGGTTAACCGAATAGGGGAGCCGAAGGGAAACCGAGTCTTAACTGGGCGTTAAGTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCCGGTGATCTGGCCATGGGCAGGTTGAAGGTTGGGTAACACTAACTGGAGGACCGAACCGAC < 2:1015451/149‑1 TATTCTGTAGCAAGGTTAACCGAATAGGGGAGCCGAAGGGAAACCGAGTCTTAACTGGGCGTTAAGTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCCGGTGATCTAGCCATGGGCAGGTTGAAGGTTGGGTAACACTAACTGGAGGACCGAACCGAC > 1:3195299/1‑150 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2:1896660/1‑150 ATTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCCAACCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAACGCCCAGTTAAGACTCGGTTTCCCTTCGGCTCCCCTATTCGGTTAAC < 1:636666/150‑1 ATTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCCAACCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAACGCCCAGTTAAGACTCGGTTTCCCTTCGGCTCCCCTATTCGGTTAAC > 1:1248123/1‑150 ATTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCCAACCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAACGCCCAGTTAAGACTCGGTTTCCCTTCGGCTCCCCTATTCGGTTAAC < 1:1600643/150‑1 ATTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCCAACCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAACGCCCAGTTAAGACTCGGTTTCCCTTCGGCTCCCCTATTCGGTTAAC > 1:1072286/1‑150 ATTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCCAACCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAACGCCCAGTTAAGACTCGGTTTCCCTTCGGCTCCCCTATTCGGTTAAC < 1:2395822/150‑1 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1:2527182/150‑1 TTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCCAACCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAACGCCCAGTTAAGACTCGGTTTCCCTTCGGCTCCCCTATTCGGTTAACC < 2:2271680/150‑1 TTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCCAACCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAACGCCCAGTTAAGACTCGGTTTCCCTTCGGCTCCCCTATTCGGTTAACC > 1:901918/1‑150 TTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCCAACCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAACGCCCAGTTAAGACTCGGTTTCCCTTCGGCTCCCCTATTCGGTTAACC < 2:2296475/150‑1 TTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCCAACCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAACGCCCAGTTAAGACTCGGTTTCCCTTCGGCTCCCCTATTCGGTTAACC > 2:2482952/1‑150 TATTCTGTAGCAAGGTTAACCGAATAGGGGAGCCGAAGGGAAACCGAGTCTTAACTGGGCGTTAAGTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCCGGTGATCTAGCCATGGGCAGGTTGAAGGTTGGGTAACACTAACTGGAGGACCGAACCGACTAAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AP012306/215211‑215364 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ctaatTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCCAACCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAACGCCCAGTTAAGACTCGGTTTCCCTTCGGCTCCCCTATTCGGTTAACC < AP012306/215372‑215224 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |