New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | AP012306 | = 1628011 | 377 (1.170) | 6 (0.020) | 6/274 | 18.2 | 1.7% | coding (287/741 nt) | yebC | conserved protein |
? | AP012306 | = 1627999 | 347 (1.170) | coding (299/741 nt) | yebC | conserved protein | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 377 total aligned reads displayed.
GCCTTTCTCGAAGGAGATCACGCCTTTTTTGCTGAACAGATAGGCAACGGAACCATCAGTACCGAGGTTACCGCCACATTTGCTAAATGCATGACGCACTTCAGCAACGGTACGGTTGCGGTTGTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCGCCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCACACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCATGTTGTTAGACAGTGCTTTATCCACCGCCGCACGCAGACGCGGG > AP012306/1627863‑1628160 | ccTTTCTCGAAGGAGATCACGCCTTTTTTGCTGAACAGATAGGCAACGGAACCATCAGTACCGAGGTTACCGCCACATTTGCTAAATGCATGACGCACTTCAGCAACGGTACGGTTGCGGTTGTCAGACAGACATTCAATCATGATtgcc > 2:3728818/1‑150 (MQ=255) tttCTCGAAGGAGATCACGCCTTTTTTGCTGAACAGATAGGCAACGGAACCATCAGTACCGAGGTTACCGCCACATTTGCTAAATGCATGACGCACTTCAGCAACGGTACAGTTGCGGTTGTCAGACAGACATTCAATCATGATtgccgt > 2:1092290/1‑150 (MQ=255) ttCTCGAAGGAGATCACGCCTTTTTTGCTAAACAGATAGGCAACGGAACCATCAGTACCGAGGTTACCGCCACATTTGCTAAATGCATGACGCACTTCAGCAACGGTACGGTTGCGGTTGTCAGACAGACATTCAATCATGATtgccgtg < 2:17158/150‑1 (MQ=255) ctcGAAGGAGATCACGCCTTTTTTGCTGAACAGATAGGCAACGGACCCATCAGTACCGAGGTTACCGCCACATTTGCTAAATGCATGACGCACTTCAGCAACGGTACGGTTGCGGTTGTCAGACAGACATTCAATCATGATtgccgtgcc < 1:819376/150‑1 (MQ=255) tcGAAGGAGATCACGCCTTTTTTGCTGAACAGATAGGCAACGGAACCATCAGTACCGAGGTTACCGCCACATTTGCTAAATGCATGACGCACTTCAGCAACGGTACGGTTGCGGTTGTCAGACAGACATTCAATCATGATtgccgtgccg < 1:1113800/150‑1 (MQ=255) tcGAAGGAGATCACGCCTTTTTTGCTAAACAGATAGGCAACGGAACCATCAGTACCGAGGTTACCGCCACATTTGCTAAATGCATGACGCACTTCAGCAACGGTACGGTTGCGGTTGTCAGACAGACATTCAATCATGATtgccgtgccg < 2:1311472/150‑1 (MQ=255) aaGGAGATCACGCCTTTTTTGCTGAACAGATAGGCAACGGAACCATCAGTACCGAGGTTACCGCCACATTTGCTAAATGCATGACGCACTTCAGCAACGGTACGGTTGCGGTTGTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCGCCa > 2:4080924/1‑150 (MQ=255) aGGAGATCACGCCTTTTTTGCTGAACAGATAGGCAACGGAACCATCAGTACCGAGGTTACCGCCACATTTGCTAAATGCATGACGCACTTCAGCAACGGTACGGTTGCGGTTGTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCGCCAg > 2:38284/1‑150 (MQ=255) tCACGCCTTTTTTGCTGAACAGATAGGCAACGGAACCATCAGTACCGAGGTTACCGCCACATTTGCTAAATGCATGACGCACTTCAGCAACGGTACGGTTGCGGTTGTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCGCCAGGACCGt > 2:1178352/1‑150 (MQ=255) tCACGCCTTTTTTGCTGAACAGATAGGCAACGGAACCATCAGTACCGAGGTTACCGCCACATTTGCTAAATGCATGACGCACTTCAGCAACGGTACGGTTGCGGTTGTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCGCCAGGACCGt > 1:222258/1‑150 (MQ=255) ttttttgGCTGAACAGTGGGGCAAGGGACCCATCATTACGGAGGTTACCGCCACATTTGCTAAATGCATGACGCACTTCAGCAACGGTACGGTTGCGGTTGTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCGCCAGGACCGTAACCtt < 1:948247/149‑1 (MQ=255) cTTTTTTGCTGAACAGATAGGCAACGGAACCATCAGTACCGAGGTTACCGCCACATTTGCTAAATGCATGACGCACTTCAGCAACGGTACGGTTGCGGTTGTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCGCCAGGACCGTAACCtt > 1:2454257/1‑150 (MQ=255) ttttttGCTGAACAGATAGGCAACGGAACCATCAGTACCGAGGTTACCGCCACATTTGCTAAATGCATGACGCACTTCAGCAACGGTACGGTTGCGGTTGTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCGCCAGGACCGTAACCTTc > 1:191888/1‑150 (MQ=255) ttttttGCTAAACAGAGAGCCAACGAACCCATCAGTCCGGAGGTTACCGCCACATTTGCTAAATGCATGACGCACTTCAGCAACGGTACGGTTGCGGTTGTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCGCCAGGACCGTAACCTTc < 2:251102/150‑1 (MQ=255) tttttGCTGAACAGATAGGCAACGGAACCATCAGTACCGAGGTTACCGCCACATTTGCTAAATGCATGACGCACTTCAGCAACGGTACGGTTGCGGTTGTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCGCCAGGACCGTAACCTTCg > 2:2747631/1‑150 (MQ=255) tttttGCTGAACAGATAGGCAACGGAACCATCAGTACCGAGGTTACCGCCACATTTGCTAAATGCATGACGCACTTCAGCAACGGTACGGTTGCGGTTGTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCGCCAGGACCGTAACCTTCg > 2:340145/1‑150 (MQ=255) ttttGCTGAACAGATAGGCAACGGACCCATCAGTCCCGAGGTTACCGCCACATTTGCTAAATGCATGACGCACTTCAGCAACGGTACGGTTGCGGTTGTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCGCCAGGACCGTAACCTTCGt < 1:2520205/150‑1 (MQ=255) tGCTGAACAGATAGGCAACGGAACCATCAGTACCGAGGTTACCGCCACATTTGCTAAATGCATGACGCACTTCAGCAACGGTACGGTTGCGGTTGTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCGCCAGGACCGTAACCTTCGTAga > 2:2015579/1‑150 (MQ=255) 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ggCAACGGAACCATCAGTACCGAGGTTACCGCCACATTTGCTAAATGCATGACGCACTTCAGCAACGGTACGGTTGCGGTTGTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCGCCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCAt > 2:3925085/1‑150 (MQ=255) ggCAACGGAACCATCAGTACCGAGGTTACCGCCACATTTGCTAAATGCATGACGCACTTCAGCAACGGTACGGTTGCGGTTGTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCGCCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCAt > 2:330949/1‑150 (MQ=255) ggCAACGGAACCATCAGTACCGAGGTTACCGCCACATTTGCTAAATGCATGACGCACTTCAGCAACGGTACGGTTGCGGTTGTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCGCCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCAt > 1:2737179/1‑150 (MQ=255) ggAACCATCAGTACGGGGGTTCCCGCCACATTTGCTAAATGCATGACGCACTTCAGCAACGGTACGGTTGCGGTTGTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCGCCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGc < 1:1000624/150‑1 (MQ=255) gAACCATCAGTACCGAGGTTACCGCCACATTTGCTAAATGCATGACGCACTTCAGCAACGGTACGGTTGCGGTTGTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCGCCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGca > 1:2701806/1‑150 (MQ=255) aaCCATCAGTACCGAGGTTACCGCCACATTTGCTAAATGCATGACGCACTTCAGCAACGGTACGGTTGCGGTTGTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCGCCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGcat < 2:2668943/150‑1 (MQ=255) aCCATCAGTACCGAGGTTACCGCCACATTTGCTAAATGCATGACGCACTTCAGCAACGGTACGGTTGCGGTTGTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCGCCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGcatc < 1:233728/150‑1 (MQ=255) cATCAGTCCCGAGGTTACCGCCACATTTGCTAAATGCATGACGCACTTCAGCAACGGTACGGTTGCGGTTGTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCGCCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGcatcat < 1:4186148/150‑1 (MQ=255) aTCAGTACCGAGGTTACCGCCACATTTGCTAAATGCATGACGCACTTCAGCAACGGTACGGTTGCGGTTGTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCGCCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGcatcatc > 1:1672447/1‑150 (MQ=255) gTACCGAGGTTACCGCCACATTTGCTAAATGCATGACGCACTTCAGCAACGGTACGGTTGCGGTTGTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCGCCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCAtcatcatca < 1:3047670/150‑1 (MQ=255) aCCGAGGTTACCGCCACATTTGCTAAATGCATGACGCACTTCAGCAACGGTACGGTTGCGGTTGTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCGCCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCAcc > 1:2647897/1‑150 (MQ=255) aCCGAGGTTACCGCCACATTTGCTAAATGCATGACGCACTTCAGCAACGGTACGGTTGCGGTTGTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCGCCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCAcc > 1:4168225/1‑150 (MQ=255) agAGGGTACCCCCCCATTTTCTAAATGCATGAAGCACCTCAGCAACGGGACGGGTGCGGGTGTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCGCCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGGTTTCATGTTTTCATCATCATCAcccc > 2:662015/2‑148 (MQ=255) gAGGTTACCGCCACATTTGCTAAATGCATGACGCACTTCAGCAACGGTACGGTTGCGGTTGTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCGCCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGcc > 2:1566778/1‑150 (MQ=255) gTTACCGCCACATTTGCTAAATGCATGACGCACTTCAGCAACGGTACGGTTGCGGTTGTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCGCCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCcac < 1:3909955/150‑1 (MQ=255) 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acggtTGCGGTTGTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCGCCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCACACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCATgttgtt > 1:2130777/1‑150 (MQ=255) ggttgcggttgTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCGCCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCACACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCATGTTGTTAg > 1:1222761/1‑150 (MQ=255) ggttgcggttgTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCGCCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCACACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCATGTTGTTAg > 2:3113866/1‑150 (MQ=255) tgcggttgTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCGCCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCACACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCATGTTGTTAGACa > 2:1438304/1‑150 (MQ=255) ggttgTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCGCCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCACACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCATGTTGTTAGACAGTg > 1:3300673/1‑150 (MQ=255) ggttgTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCGCCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCACACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCATGTTGTTAGACAGTg > 2:3614247/1‑150 (MQ=255) ttgTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCGCCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTCTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCACACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCATGTTGTTAGACAGTGCt > 2:3230084/1‑150 (MQ=255) tgTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCGCCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCGTCATCACCGCCCACACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCATGTTGTTAGACAGTGCtt < 2:1229160/150‑1 (MQ=255) tgTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCGCCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCACACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCATGTTGTTAGACAGTGCtt > 2:1987447/1‑150 (MQ=255) cagacagaCATTCAATCATGATTGCCGTGCCGCCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCACACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCATGTTGTTAGACAGTGCTTTAt < 2:3685116/150‑1 (MQ=255) agacagacATTCAATCATGATTGCCGTGCCGCCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCACACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCATGTTGTTAGACAGTGCTTTATc < 1:1021009/150‑1 (MQ=255) gacagacaTTCAATCATGATTGCCGTGCCGCCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCACACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCATGTTGTTAGACAGTGCTTTATcc > 2:449248/1‑150 (MQ=255) agacaTTCAATCATGATTGCCGTGCCGCCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCACACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCATGTTGTTAGACAGTGCTTTATCCAcc > 2:3584661/1‑150 (MQ=255) gacaTTCAATCATGATTGCCGTGCCGCCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCACACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCATGTTGTTAGACAGTGCTTTATCCAccg > 1:1295191/1‑150 (MQ=255) caTTCAATCATGATTGCCGTGCCGCCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCACACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCATGTTGTTAGACAGTGCTTTATCCAccgcc > 1:1245261/1‑150 (MQ=255) caTTCAATCATGATTGCCGTGCCGCCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCACACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCATGTTGTTAGACAGTGCTTTATCCAccgcc > 2:2770252/1‑150 (MQ=255) aTTCAATCATGATTGCCGTGCCGCCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCACACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCATGTTGTTAGACAGTGCTTTATCCAccgccg > 2:1838197/1‑150 (MQ=255) cAATCATGATTGCCGTGCCGCCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCACACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCATGTTGTTAGACAGTGCTTTATCCACCGCcgcac > 1:1473182/1‑150 (MQ=255) cAATCATGATTGCCGTGCCGCCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCACACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCATGTTGTTAGACAGTGCTTTATCCACCGCcgcac > 2:598769/1‑150 (MQ=255) aTCATGATTGCCGTGCCGCCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCACACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCATGTTGTTAGACAGTGCTTTATCCACCGCcgcacgc > 1:504317/1‑150 (MQ=255) aTCATGATTGCCGTGCCGCCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCACACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCATGTTGTTAGACAGTGCTTTATCCACCGCcgcacgc > 2:3201690/1‑150 (MQ=255) cATGATTGCCGTGCCGCCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTCCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCACACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCATGTTGTTAGACAGTGCTTTATCCACCGCCGCACGCAg < 1:9295/150‑1 (MQ=255) | GCCTTTCTCGAAGGAGATCACGCCTTTTTTGCTGAACAGATAGGCAACGGAACCATCAGTACCGAGGTTACCGCCACATTTGCTAAATGCATGACGCACTTCAGCAACGGTACGGTTGCGGTTGTCAGACAGACATTCAATCATGATTGCCGTGCCGCCAGGACCGTAACCTTCGTAGATGATGGTTTCCATGTTTGCATCATCATCACCGCCCACACCACGTGCAATTGCGCGGTTCAGTGTGTCACGGGTCATGTTGTTAGACAGTGCTTTATCCACCGCCGCACGCAGACGCGGG > AP012306/1627863‑1628160 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |