| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| JC | AP012306 | 162,220 | +CTGTAAGACTCAATGTAAGCCGTGCCAAAATATGATGGCTAGGACGAGCTA | intergenic (+131/+243) | mrcB → / ← hemL | fused glycosyl transferase and transpeptidase/glutamate‑1‑semialdehyde aminotransferase |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | AP012306 | = 162220 | 0 (0.000) | 306 (1.470) +CTGTAAGACTCAATGTAAGCCGTGCCAAAATATGATGGCTAGGACGAGCTA |
147/196 | 0.0 | 100% | intergenic (+131/+243) | mrcB/hemL | fused glycosyl transferase and transpeptidase/glutamate‑1‑semialdehyde aminotransferase |
| ? | AP012306 | 162221 = | 0 (0.000) | intergenic (+132/+242) | mrcB/hemL | fused glycosyl transferase and transpeptidase/glutamate‑1‑semialdehyde aminotransferase | |||||
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ATGTTTGGTAGTAATTAACATCTAAGCGTGAAATACCGGATGGCGAGTTGCCATCCGGTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCGAACCCGCCAGCGTTTCGAATATTATCTTATCTTTATAATAATCATTCTCGTTTACGTTATCATTCACTTTACATCAGAGATATACCATTCCATATAACGGCCCTGTACGCCTGGACGGATAAAGCGTTTACGCGACAACGGATGCCCG > AP012306/162072‑162369 | catccggtaaaataacatcccatctaagatattaaccctttcttttcatctggttgtttattaacccttcaggaacgctcagattgcgtaccgcttgcctgtaagactcaatgtaagccgtgccaaaatatgatggctaggacgagctag < 2:2430472‑M2/1‑1 (MQ=255) atccggtaaaataacatcccatctaagatattaaccctttcttttcatctggttgtttattaacccttcaggaacgctcagattgcgtaccgcttgcctgtaagactcaatgtaagccgtgccaaaatatgatggctaggacgagctaGa < 2:538025‑M2/2‑1 (MQ=255) atccggtaaaataacatcccatctaagatattaaccctttcttttcatctggttgtttattaacccttcaggaacgctcagattgcgtaccgcttgcctgtaagactcaatgtaagccgtgccaaaatatgatggctaggacgagctaGa > 1:2685913‑M2/149‑150 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |