New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AP012306 | = 3014868 | 331 (1.070) | 10 (0.040) | 10/274 | 25.3 | 3.2% | coding (930/1506 nt) | glpD | sn‑glycerol‑3‑phosphate dehydrogenase, aerobic, FAD/NAD(P)‑binding |
? | AP012306 | = 3014856 | 308 (1.080) | coding (918/1506 nt) | glpD | sn‑glycerol‑3‑phosphate dehydrogenase, aerobic, FAD/NAD(P)‑binding | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 311 total aligned reads displayed.
TTCGTGATCCCGTGGATGGACGAGTTTTCCATCATCGGCACTACCGATGTCGAGTACAAAGGCGATCCGAAAGCGGTGAAGATTGAAGAGAGTGAAATCAATTACCTGCTGAATGTGTATAACACGCACTTTAAAAAGCAGTTAAGCCGTGACGATATCGTCTGGACCTACTCCGGTGTGCGTCCGCTGTGTGATGATGAGTCCGACTCGCCGCAGGCTATTACCCGTGATTACACCCTTGATATTCATGATGAAAATGGCAAAGCACCGCTGCTGTCGGTATTCGGCGGTAAGCTGAC > AP012306/3014707‑3015005 | gatggaCGAGTTTTCCATCATCGGCACTACCGATGTCGAGTACAAAGGCGATCCGAAAGCGGTGAAGATTGAAGAGAGTGAAATCAATTACCTGCTGAATGTGTATAACACGCACTTTAAAAAGCAGTTAAGCCGTGACGATATCGTCTg > 1:3073331/1‑150 (MQ=255) gatggaCGAGTTTTCCATCATCGGCACTACCGATGTCGAGTACAAAGGCGATCCGAAAGCGGTGAAGATTGAAGAGAGTGAAATCAATTACCTGCTGAATGTGTATAACACGCACTTTAAAAAGCAGTTAAGCCGTGACGATATCGTCTg < 1:3356289/150‑1 (MQ=255) atggaCGAGTTTTCCATCATCGGCACTACCGATGTCGAGTACAAAGGCGATCCGAAAGCGGTGAAGATTGAAGAGAGTGAAATCAATTACCTGCTGAATGTGTATAACACGCACTTTAAAAAGCAGTTAAGCCGTGACGATATCGTCTgg < 2:3246969/150‑1 (MQ=255) tggaCGAGTTTTCCATCATCGGCACTACCGATGTCGAGTACAAAGGCGATCCGAAAGCGGTGAAGATTGAAGAGAGTGAAATCAATTACCTGCTGAATGTGTATAACACGCACTTTAAAAAGCAGTTAAGCCGTGACGATATCGTCTGGa > 2:822599/1‑150 (MQ=255) aCGAGTTTTCCATCATCGGCACTACCGATGTCGAGTACAAAGGCGATCCGAAAGCGGTGAAGATTGAAGAGAGTGAAATCAATTACCTGCTGAATGTGTATAACACGCACTTTAAAAAGCAGTTAAGCCGTGACGATATCGTCTGGACCt > 1:2869598/1‑150 (MQ=255) gAGTTTTCAATCATCGGCACTACCGATGTCGAGTACAAAGGCGATCCGAAAGCGGTGAAGATTGAAGAGAGTGAAATCAATTACCTGCTGAATGTGTATAACACGCACTTTAAAAAGCAGTTAAGCCGTGACGATATCGTCTGGACCTAc > 2:2685152/1‑150 (MQ=255) tttCCATCATCGGCACTACCGATGTCGAGTACAAAGGCGATCCGAAAGCGGTGAAGATTGAAGAGAGTGAAATCAATTACCTGCTGAATGTGTATAACACGCACTTTAAAAAGCAGTTAAGCCGTGACGATATCGTCTGGACCTACTCCg > 1:3537107/1‑150 (MQ=255) ttCCATCATCGGCACTACCGATGTCGAGTACAAAGGCGATCCGAAAGCGGTGAAGATTGAAGAGAGTGAAATCAATTACCTGCTGAATGTGTATAACACGCACTTTAAAAAGCAGTTAAGCCGTGACGATATCGTCTGGACCTACTCCgg > 1:506908/1‑150 (MQ=255) ttCCATCATCGGCACTACCGATGTCGAGTACAAAGGCGATCCGAAAGCGGTGAAGATTGAAGAGAGTGAAATCAATTACCTGCTGAATGTGTATAACACGCACTTTAAAAAGCAGTTAAGCCGTGACGATATCGTCTGGACCTACTCCgg > 1:1099874/1‑150 (MQ=255) tcatcGGCACTACCGATGTCGAGTACAAAGGCGATCCGAAAGCGGTGAAGATTGAAGAGAGTGAAATCAATTACCTGCTGAATGTGTATAACACGCACTTTAAAAAGCAGTTAAGCCGTGACGATATCGTCTGGACCTACTCCGGTGTGc < 1:1565285/150‑1 (MQ=255) catcGGCACTACCGATGTCGAGTACAAAGGCGATCCGAAAGCGGTGAAGATTGAAGAGAGTGAAATCAATTACCTGCTGAATGTGTATAACACGCACTTTAAAAAGCAGTTAAGCCGTGACGATATCGTCTGGACCTACTCCGGTGTGCg > 1:378052/1‑150 (MQ=255) cGGCACTACCGATGTCGAGTACAAAGGCGATCCGAAAGCGGTGAAGATTGAAGAGAGTGAAATCAATTACCTGCTGAATGTGTATAACACGCACTTTAAAAAGCAGTTAAGCCGTGACGATATCGTCTGGACCTACTCCGGTGTGCGTcc > 2:535162/1‑150 (MQ=255) gCACTACCGATGTCGAGTACAAAGGCGATCCGAAAGCGGTGAAGATTGAAGAGAGTGAAATCAATTACCTGCTGAATGTGTATAACACGCACTTTAAAAAGCAGTTAAGCCGTGACGATATCGTCTGGACCTACTCCGGTGTGCGTCCGc > 2:1395404/1‑150 (MQ=255) aCTACCGATGTCGAGTACAAAGGCGATCCGAAAGCGGTGAAGATTGAAGAGAGTGAAATCAATTACCTGCTGAATGTGTATAACACGCACTTTAAAAAGCAGTTAAGCCGTGACGATATCGTCTGGACCTACTCCGGTGTGCGTCCGCtg > 1:3139255/1‑150 (MQ=255) aCTACCGATGTCGAGTACAAAGGCGATCCGAAAGCGGTGAAGATTGAAGAGAGTGAAATCAATTACCTGCTGAATGTGTATAACACGCACTTTAAAAAGCAGTTAAGCCGTGACGATATCGTCTGGACCTACTCCGGTGTGCGTCCGCtg > 2:398302/1‑150 (MQ=255) aCTACCGATGTCGAGTACAAAGGCGATCCGAAAGCGGTGAAGATTGAAGAGAGTGAAATCAATTACCTGCTGAATGTGTATAACACGCACTTTAAAAAGCAGTTAAGCCGTGACGATATCGTCTGGACCTACTCCGGTGTGCGTCCGCtg < 2:3880068/150‑1 (MQ=255) cTACCGATGTCGAGTACAAAGGCGATCCGAAAGCGGTGAAGATTGAAGAGAGTGAAATCAATTACCTGCTGAATGTGTATAACACGCACTTTAAAAAGCAGTTAAGCCGTGACGATATCGTCTGGACCTACTCCGGTGTGCGTCCGCtgt > 2:1693194/1‑150 (MQ=255) tACCGATGTCGAGTACAAAGGCGATCCGAAAGCGGTGAAGATTGAAGAGAGTGAAATCAATTACCTGCTGAATGTGTATAACACGCACTTTAAAAAGCAGTTAAGCCGTGACGATATCGTCTGGACCTACTCCGGTGTGCGTCCGCtgtg > 1:1420510/1‑150 (MQ=255) aCCGATGTCGAGTACAAAGGCGATCCGAAAGCGGTGAAGATTGAAGAGAGTGAAATCAATTACCTGCTGAATGTGTATAACACGCACTTTAAAAAGCAGTTAAGCCGTGACGATATCGTCTGGACCTACTCCGGTGTGCGTCCGCtgtgt < 1:2455064/150‑1 (MQ=255) ccGATGTCGAGTACAAAGGCGATCCGAAAGCGGTGAAGATTGAAGAGAGTGAAATCAATTACCTGCTGAATGTGTATAACACGCACTTTAAAAAGCAGTTAAGCCGTGACGATATCGTCTGGACCTACTCCGGTGTGCGTCCGCtgtgtg < 2:4140047/150‑1 (MQ=255) gATGTCGAGTACAAAGGCGATCCGAAAGCGGTGAAGATTGAAGAGAGTGAAATCAATTACCTGCTGAATGTGTATAACACGCACTTTAAAAAGCAGTTAAGCCGTGACGATATCGTCTGGACCTACTCCGGTGTGCGTCCGCTGTGtgat > 2:1373948/1‑150 (MQ=255) tGTCGAGTACAAAGGCGATCCGAAAGCGGTGAAGATTGAAGAGAGTGAAATCAATTACCTGCTGAATGTGTATAACACGCACTTTAAAAAGCAGTTAAGCCGTGACGATATCGTCTGGACCTACTCAGGTGTGCGTCCGCTGTGtgatga < 1:132913/150‑1 (MQ=255) gTCGAGTACAAAGGCGATCCGAAAGCGGTGAAGATTGAAGAGAGTGAAATCAATTACCTGCTGAATGTGTATAACACGCACTTTAAAAAGCAGTTAAGCCGTGACGATATCGTCTGGACCTACTCCGGTGTGCGTCCGCTGTGtgatgat < 2:3450777/150‑1 (MQ=255) 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aCAAAGGCGATCCGAAAGCGGTGAAGATTGAAGAGAGTGAAATCAATTACCTGCTGAATGTGTATAACACGCACTTTAAAAAGCAGTTAAGCCGTGACGATATCGTCTGGACCTACTCCGGTGTGCGTCCGCTGTGTGATGATGAGTCCg > 1:2381854/1‑150 (MQ=255) cGATCCGAAAGCGGTGAAGATTGAAGAGAGTGAAATCAATTACCTGCTGAATGTGTATAACACGCACTTTAAAAAGCAGTTAAGCCGTGACGATATCGTCTGGACCTACTCCGGTGTGCGTCCGCTGTGTGATGATGAGTCCGACTcgcc > 2:3151203/1‑150 (MQ=255) cGATCCGAAAGCGGTGAAGATTGAAGAGAGTGAAATCAATTACCTGCTGAATGTGTATAACACGCACTTTAAAAAGCAGTTAAGCCGTGACGATATCGTCTGGACCTACTCCGGTGTGCGTCCGCTGTGTGATGATGAGTCCGACTcgcc > 2:1268563/1‑150 (MQ=255) ccGAAAGCGGTGAAGATTGAAGAGAGTGAAATCAATTACCTGCTGAATGTGTATAACACGCACTTTAAAAAGCAGTTAAGCCGTGACGATATCGTCTGGACCTACTCCGGTGTGCGTCCGCTGTGTGATGATGAGTCCGACTCGCCGCAg > 2:2222437/1‑150 (MQ=255) ccGAAAGCGGTGAAGATTGAAGAGAGTGAAATCAATTACCTGCTGAATGTGTATAACACGCACTTTAAAAAGCAGTTAAGCCGTGACGATATCGTCTGGACCTACTCCGGTGTGCGTCCGCTGTGTGATGATGAGTCCGACTCGCCGCAg > 1:1085289/1‑150 (MQ=255) 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gtATAACACGCACTTTAAAAAGCAGTTAAGCCGTGACGATATCGTCTGGACCTACTCCGGTGTGCGTCCGCTGTGTGATGATGAGTCCGACTCGCCGCAGGCTATTACCCGTGATTACACCCTTGATATTCATGATGAAAATGGCAAAGc > 1:3178214/1‑150 (MQ=255) tataACACGCACTTTAAAAAGCAGTTAAGCCGTGACGATATCGTCTGGACCTACTCCGGTGTGCGTCCGCTGTGTGATGATGAGTCCGACTCGCCGCAGGCTATTACCCGTGATTACACCCTTGATATTCATGATGAAAATGGCAAAGCa > 1:627809/1‑150 (MQ=255) aaCACGCACTTTAAAAAGCAGTTAAGCCGTGACGATATCGTCTGGACCTACTCCGGTGTGCGTCCGCTGTGTGATGATGAGTCCGACTCGCCGCAGGCTATTACCCGTGATTACACCCTTGATATTCATGATGAAAATGGCAAAGCACCg > 2:1738965/1‑150 (MQ=255) aaCACGCACTGTAAAAAGCAGTTAAGCCGTGACGATATCGTCTGGACCTACTCCGGTGTGCGTACGCTGTGTGATGATGAGTCCGACTCGCCGCAGGCTATTACCCGTGATTACACCCTTGATATTCATGATGAAAATGGCAAAGCACCg < 1:4155475/150‑1 (MQ=255) acGCACTTTAAAAAGCAGTTAAGCCGTGACGATATCGTCTGGACCTACTCCGGTGTGCGTCCGCTGTGTGATGATGAGTCCGACTCGCCGCAGGCTATTACCCGTGATTACACCCTTGATATTCATGATGAAAATGGCAAAGCACCgctg > 2:3320695/1‑150 (MQ=255) acGCACTTTAAAAAGCAGTTAAGCCGTGACGATATCGTCTGGACCTACTCCGGTGTGCGTCCGCTGTGTGATGATGAGTCCGACTCGCCGCAGGCTATTACCCGTGATTACACCCTTGATATTCATGATGAAAATGGCAAAGCACCgctg > 1:666616/1‑150 (MQ=255) gCACTTTAAAAAGCAGTTAAGCCGTGACGATATCGTCTGGACCTACTCCGGTGTGCGTCCGCTGTGTGATGATGAGTCCGACTCGCCGCAGGCTATTACCCGTGATTACACCCTTGATATTCATGATGAAAATGGCAAAGCACCgctgct > 1:461795/1‑150 (MQ=255) cACTTTAAAAAGCAGTTAAGCCGTGACGATATCGTCTGGACCTACTCCGGTGTGCGTCCGCTGTGTGATGATGAGTCCGACTCGCCGCAGGCTATTACCCGTGATTACACCCTTGATATTCATGATGAAAATGGCAAAGCACCGctgctg > 2:1631002/1‑150 (MQ=255) aCTTTAAAAAGCAGTTAAGCCGTGACGATATCGTCTGGACCTACTCCGGTGTGCGTCCGCTGTGTGATGATGAGTCCGACTCGCCGCAGGCTATTACCCGTGATTACACCCTTGATATTCATGATGAAAATGGCAAAGCACCGCTGCTGt < 1:3976087/150‑1 (MQ=255) cTTTAAAAAGCAGTTAAGCCGTGACGATATCGTCTGGACCTACTCCGGTGTGCGTCCGCTGTGTGATGATGAGTCCGACTCGCCGCAGGCTATTACCCGTGATTACACCCTTGATATTCATGATGAAAATGGCAAGGCACCGCTGCTGTc > 2:3006259/1‑150 (MQ=255) ttAAAAAGCAGTTAAGCCGTGACGATATCGTCTGGACCTACTCCGGTGTGCGTCCGCTGTGTGATGATGAGTCCGACTCGCCGCAGGCTATTACCCGTGATTACACCCTTGATATTCATGATGAAAATGGCAAAGCACCGCTGCTGTCgg > 1:1738181/1‑150 (MQ=255) tAAAAAGCAGTTAAGCCGTGACGATATCGTCTGGACCTACTCCGGTGTGCGTCCGCTGTGTGATGATGAGTCCGACTCGCCGCAGGCTATTACCCGTGATTACACCCTTGATATTCATGATGAAAATGGCAAAGCACCGCTGCTGTCGGt < 2:3694271/150‑1 (MQ=255) aaGCAGTTAAGCCGTGACGATATCGTCTGGACCTACTCCGGTGTGCGTCCGCTGTGTGATGATGAGTCCGACTCGCCGCAGGCTATTACCCGTGATTACACCCTTGATATTCATGATGAAAATGGCAAAGCACCGCTGCTGTCGGTATTc < 1:2108507/150‑1 (MQ=255) ggCAGTTAAGCGGTGACGATACCGTCTGGCCCTACTCCGGTGTGTGTCCGCTGTGTGATGATGAGCCCCACTCGCAGCAGGCTATTCCCCGTGATTACACCCTTGATATTCATGATGAAAAGGGCAAAGCTCCGCTGCTGTCGGTATTcg < 2:1016549/149‑1 (MQ=255) aGCAGTTAAGCCGTGACGATATCGTCTGGACCTACTCCGGTGTGCGTCCGCTGTGTGATGATGAGTCCGACTCGCCGCAGGCTATTACCCGTGATTACACCCTTGATATTCATGATGAAAATGGCAAAGCACCGCTGCTGTCGGTATTcg < 1:1881671/150‑1 (MQ=255) gCAGTTAAGCCGTGACGATATCGTCTGGACCTACTCCGGTGTGCGTCCGCTGTGTGATGATGAGTCCGACTCGCCGCAGGCTATTACCCGTGATTACACCCTTGATATTCATGATGAAAATGGCAAAGCACCGCTGCTGTCGGTATTcgg > 1:1026116/1‑150 (MQ=255) cAGTTAAGCCGTGACGATATCGTCTGGACCTACTCCGGTGTGCGTCCGCTGTGTGATGATGAGTCCGACTCGCCGCAGGCTATTACCCGTGATTACACCCTTGATATTCATGATGAAAATGGCAAAGCACCGCTGCTGTCGGTATTcggc > 2:3508663/1‑150 (MQ=255) cAGTTAAGCCGTGACGATATCGTCTGGACCTACTCCGGTGTGCGTCCGCTGTGTGATGATGAGTCCGACTCGCCGCAGGCTATTACCCGTGATTACACCCTTGATATTCATGATGAAAATGGCAAAGCACCGCTGCTGTCGGTATTcggc > 2:2489192/1‑150 (MQ=255) aGTTAAGCCGTGACGATATCGTCTGGACCTACTCCGGTGTGCGTCCGCTGTGTGATGATGAGTCCGACTCGCCGCAGGCTATTACCCGTGATTACACCCTTGATATTCATGATGAAAATGGCAAAGCACCGCTGCTGTCGGTATTcggcg > 1:3886561/1‑150 (MQ=255) aaGCCGTGACGATATCGTCTGGACCTACTCCGGTGTGCGTCCGCTGTGTGATGATGAGTCCGACTCGCCGCAGGCTATTACCCGTGATTACACCCTTGATATTCATGATGAAAATGGCAAAGCACCGCTGCTGTCGGTATTCGGCGGTaa < 2:3412733/150‑1 (MQ=255) aaGCCGTGACGATATCGTCTGGACCTACTCCGGTGTGCGTCCGCTGTGTGATGATGAGTCCGACTCGCCGCAGGCTATTACCCGTGATTACACCCTTGATATTCATGATGAAAATGGCAAAGCACCGCTGCTGTCGGTATTCGGCGGTaa > 1:789186/1‑150 (MQ=255) ccGTGACGATATCGTCTGGACCTACTCCGGTGTGCGTCCGCTGTGTGATGATGAGTCCGACTCGCCGCAGGCTATTACCCGTGATTACACCCTTGATATTCATGATGAAAATGGCAAAGCACCGCTGCTGTCGGTATTCGGCGGTAAGCt < 2:2590193/150‑1 (MQ=255) | TTCGTGATCCCGTGGATGGACGAGTTTTCCATCATCGGCACTACCGATGTCGAGTACAAAGGCGATCCGAAAGCGGTGAAGATTGAAGAGAGTGAAATCAATTACCTGCTGAATGTGTATAACACGCACTTTAAAAAGCAGTTAAGCCGTGACGATATCGTCTGGACCTACTCCGGTGTGCGTCCGCTGTGTGATGATGAGTCCGACTCGCCGCAGGCTATTACCCGTGATTACACCCTTGATATTCATGATGAAAATGGCAAAGCACCGCTGCTGTCGGTATTCGGCGGTAAGCTGAC > AP012306/3014707‑3015005 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |