| Predicted mutation | ||||||
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| ? | AP012306 | 162221 = | 0 (0.000) | intergenic (+132/+242) | mrcB/hemL | fused glycosyl transferase and transpeptidase/glutamate‑1‑semialdehyde aminotransferase | |||||
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ATGTTTGGTAGTAATTAACATCTAAGCGTGAAATACCGGATGGCGAGTTGCCATCCGGTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AP012306/162072‑162220‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GAACCCGCCAGCGTTTCGAATATTATCTTATCTTTATAATAATCATTCTCGTTTACGTTATCATTCACTTTACATCAGAGATATACCATTCCATATAACGGCCCTGTACGCCTGGACGGATAAAGCGTTTACGCGACAACGGATGCCC > AP012306/162221‑162368 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| TGTTTGGTAGTAATTAACATCTAAGCGTGAAATACCGGATGGCGAGTTGCCATCCGGTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCCT > 1:881500/1‑150 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2:2019991/150‑1 TTGCGTACCGCTTGCCTGTAAGACTCAATGTAAGCCGTGCCAAAATATGATGGCTAGGACGAGCTAGAACCCGCCAGCGTTTCGAATATTATCTTATCTTTATAATAATCATTCTCGTTTACGTTATCATTCACTTTACATCAGAGATAT < 1:760995/150‑1 CGTACCGCTTGCCTGTAAGACTCAATGTAAGCCGTGCCAAAATATGATGGCTAGGACGAGCTAGAACCCGCCAGCGTTTCGAATATTATCTTATCTTTATAATAATCATTCTCGTTTACGTTATCATTCACTTTACATCAGAGATATACC < 1:3506033/150‑1 CGTACCGCTTGCCTGTAAGACTCAATGTAAGCCGTGCCAAAATATGATGGCTAGGACGAGCTAGAACCCGCCAGCGTTTCGAATATTATCTTATCTTTATAATAATCATTCTCGTTTACGTTATCATTCACTTTACATCAGAGATATACC < 1:8458/150‑1 GTACCGCTTGCCTGTAAGACTCAATGTAAGCCGTGCCAAAATATGATGGCTAGGACGAGCTAGAACCCGCCAGCGTTTCGAATATTATCTTATCTTTATAATAATCATTCTCGTTTACGTTATCATTCACTTTACATCAGAGATATACCA > 1:1701425/1‑150 CCTGTAAGACTAAATGTAAGCCGTGCAAAAATATGATGGCTAGGACGAGCTAGACCCCGCCAGCGTTTCGAATATTATCTTATCTTTATAATAATCATTCTCGTTTACGTTATCATTCACTTTACATCAGAGATATACCATTCCATATAA < 1:953655/150‑1 TCAATGTAAGCCGTGCAAAAATATGATGGCTAGGACGAGCTAGAACCCGCCAGCGTTTCGAATAATATCTTATCTTTATAATAATCATTCTCGTTTACGTTATCATTCACTTTACATCAGAGATATACCATTCCATATAACGGCCCTGTA < 1:994196/150‑1 AAGCCGTGCCAAAATATGATGGCTAGGACGAGCTAGAACCCGCCAGCGTTTCGAATATTATCTTATCTTTATAATAATCATTCTCGTTTACGTTATCATTCACTTTACATCAGAGATATACCATTCCATATAACGGCCCTGTACGCCTGG < 1:2453122/150‑1 AAGCCGTGCAAAAATATGATGGCTAGGACGAGCTAGAACCCGCCAGCGTTTCGAATATTATCTTATCTTTATAATAATCATTCTCGTTTACGTTATCATTCACTTTACATCAGAGATATACCATTCCATATAACGGCCCTGTACGCCTGG < 2:1856419/150‑1 gcgGTGCAAAAATATGATGGCTAGGACGAGCTAGACCCCGCCAGCGTTTCGAATATTATCTTATCTTTATAATAATCATTCTCGTTTACGTTATCATTCACTTTACATCAGAGATATACCATTCCATATAACGGCCCTGTACGCCTGGAC < 2:2971691/147‑1 CGTGCCAAAATATGATGGCTAGGACGAGCTAGAACCCGCCAGCGTTTCGAATATTATCTTATCTTTATAATAATCATTCTCGTTTACGTTATCATTCACTTTACATCAGAGATATACCATTCCATATAACGGCCCTGTACGCCTGGACGG > 1:1856085/1‑150 AAAATATGATGGCTAGGACGAGCTAGAACCCGCCAGCGTTTCGAATATTATCTTATCTTTATAATAATCATTCTCGTTTACGTTATCATTCACTTTACATCAGAGATATACCATTCCATATAACGGCCCTGTACGCCTGGACGGATAAAG > 1:3043552/1‑150 CTAGGAGGAGTTAAAACCCGCCAGCGTTTCGAATATTATCTTATCTTTATAATAATCATTCTCGTTTACGTTATCATTCACTTTACATCAGAGATATACCATTCCATATAACGGCCCTGTACGCCTGGACGGATAAAGCGTTTACGCGAC < 2:919641/150‑1 CTAGGACGAGCTAGAACCCGCCAGCGTTTCGAATATTATCTTATCTTTATAATAATCATTCTCGTTTACGTTATCATTCACTTTACATCAGAGATATACCATTCCATATAACGGCCCTGTACGCCTGGACGGATAAAGCGTTTACGCGAC > 2:1817216/1‑150 TAGGACGAGCTAGAACCCGCCAGCGTTTCGAATATTATCTTATCTTTATAATAATCATTCTCGTTTACGTTATCATTCACTTTACATCAGAGATATACCATTCCATATAACGGCCCTGTACGCCTGGACGGATAAAGCGTTTACGCGACA > 1:1023275/1‑150 GGACGAGCTAGAACCCGCCAGCGTTTCGAATATTATCTTATCTTTATAATAATCATTCTCGTTTACGTTATCATTCACTTTACATCAGAGATATACCATTCCATATAACGGCCCTGTACGCCTGGACGGATAAAGCGTTTACGCGACAAC < 1:661150/150‑1 gtGCTAGAACCCGCCAGCGTTTCGAATATTATCTTATCTTTATAATAATCATTCTCGTTTACGTTATCATTCACTTTACATCAGAGATATACCATTCCATATAACGGCCCTGTACGCCTGGACGGATAAAGCGTTTACGCGACAACGGAT < 1:3816123/148‑1 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ATGTTTGGTAGTAATTAACATCTAAGCGTGAAATACCGGATGGCGAGTTGCCATCCGGTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AP012306/162072‑162220‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GAACCCGCCAGCGTTTCGAATATTATCTTATCTTTATAATAATCATTCTCGTTTACGTTATCATTCACTTTACATCAGAGATATACCATTCCATATAACGGCCCTGTACGCCTGGACGGATAAAGCGTTTACGCGACAACGGATGCCC > AP012306/162221‑162368 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |