New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AP012306 | = 2153226 | 218 (0.740) | 8 (0.030) | 8/294 | 17.9 | 3.6% | coding (683/1581 nt) | hyfF | hydrogenase 4, membrane subunit |
? | AP012306 | = 2153240 | 219 (0.750) | coding (697/1581 nt) | hyfF | hydrogenase 4, membrane subunit | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 226 total aligned reads displayed.
CCGTGCTGGTATACGCCAACGCCGCCAGCGTTATGCCGCAGGCAGAAATGGCGATATTCTGGAGCGAGGTTCTTAAGCAATCGTCCTTGCTTGACCCAACATTAATGCTGTTGGCCTTTGTGTTTTTGCTAATTGGCTTTGGTACCAAAACCGGGCTATTTCCCATGCACGCCTGGCTGCCGGATGCTCACAGTGAAGCGCCGAGTCCGGTCAGCGCCCTGCTCTCCGCCGTATTGCTGAACTGCGCGCTGTTGGTGCTGATTCGCTATTACATCATTATTTGCCAAGCCATCGGCAGC > AP012306/2153091‑2153389 | ccGTGCTGGTATACGCCAACGCCGCCAGCGTTATGCCGCAGGCAGAAATGGCGATATTCTGGAGCGAGGTTCTTAAGCAATCGTCCTTGCTTGACCCAACATTAATGCTGTTGGCCTTTGTGTTTTTGCTAATTGGCTTTGGTACCaaaa > 2:3758157/1‑150 (MQ=255) cGTGCTGGTATACGCCAACGCCGCCAGCGTTATGCCGCAGGCAGAAATGGCGATATTCTGGAGCGAGGTTCTTAAGCAATCGTCCTTGCTTGACCCAACATTAATGCTGTTGGCCTTTGTGTTTTTGCTAATTGGCTTTGGTACCAAAAc > 2:3063604/1‑150 (MQ=255) cGTGCTGGTATACGCCAACGCCGCCAGCGTTATGCCGCAGGCAGAAATGGCGATATTCTGGAGCGAGGTTCTTAAGCAATCGTCCTTGCTTGACCCAACATTAATGCTGTTGGCCTTTGTGTTTTTGCTAATTGGCTTTGGTACCAAAAc < 1:3012454/150‑1 (MQ=255) gCTGGTATACGCCAACGCCGCCAGCGTTATGCCGCAGGCAGAAATGGCGATATTCTGGAGCGAGGTTCTTAAGCAATCGTCCTTGCTTGACCCAACATTAATGCTGTTGGCCTTTGTGTTTTTGCTAATTGGCTTTGGTACCAAAACCgg < 2:2779873/150‑1 (MQ=255) gCTGGTATACGCCAACGCCGCCAGCGTTATGCCGCAGGCAGAAATGGCGATATTCTGGAGCGAGGTTCTTAAGCAATCGTCCTTGCTTGACCCAACATTAATGCTGTTGGCCTTTGTGTTTTTGCTAATTGGCTTTGGTACCAAAACCgg < 2:1124163/150‑1 (MQ=255) gTATACGCCAACGCCGCCAGCGTTATGCCGCAGGCAGAAATGGCGATATTCTGGAGCGAGGTTCTTAAGCAATCGTCCTTGCTTGACCCAACATTAATGCTGTTGGCCTTTGTGTTTTTGCTAATTGGCTTTGGTACCAAAACCGGGCTa < 2:2025686/150‑1 (MQ=255) gCCAACGCCGCCAGCGTTATGCCGCAGGCAGAAATGGCGATATTCTGGAGCGAGGTTCTTAAGCAATCGTCCTTGCTTGACCCAACATTAATGCTGTTGGCCTTTGTGTTTTTGCTAATTGGCTTTGGTACCAAAACCGGGCTATTTccc > 1:883764/1‑150 (MQ=255) ccAACGCCGCCAGCGTTATGCCGCAGGCAGAAATGGCGATATTCTGGAGCGAGGTTCTTAAGCAATCGTCCTTGCTTGACCCAACATTAATGCTGTTGGCCTTTGTGTTTTTGCTAATTGGCTTTGGTACCAAAACCGGGCTATTTCCCa < 2:2280250/150‑1 (MQ=255) ccAACGCCGCCAGCGTTATGCCGCAGGCAGAAATGGCGATATTCTGGAGCGAGGTTCTTAAGCAATCGTCCTTGCTTGACCCAACATTAATGCTGTTGGCCTTTGTGTTTTTGCTAATTGGCTTTGGTACCAAAACCGGGCTATTTCCCa < 1:1544420/150‑1 (MQ=255) aaCGCCGCCAGCGTTATGCCGCAGGCAGAAATGGCGATATTCTGGAGCGAGGTTCTTAAGCAATCGTCCTTGCTTGACCCAACATTAATGCTGTTGGCCTTTGTGTTTTTGCTAATTGGCTTTGGTACCAAAACCGGGCTATTTCCCATg < 1:1293702/150‑1 (MQ=255) aCGCCGCCAGCGTTATGCCGCAGGCAGAAATGGCGATATTCTGGAGCGAGGTTCTTAAGCAATCGTCCTTGCTTGACCCAACATTAATGCTGTTGGCCTTTGTGTTTTTGCTAATTGGCTTTGGTACCAAAACCGGGCTATTTCCCATGc > 1:2606693/1‑150 (MQ=255) cgccAGCGTTATGCCGCAGGCAGAAATGGCGATATTCTGGAGCGAGGTTCTTAAGCAATCGTCCTTGCTTGACCCAACATTAATGCTGTTGGCCTTTGTGTTTTTGCTAATTGGCTTTGGTACCAAAACCGGGCTATTTCCCATGCACGc > 2:1244330/1‑150 (MQ=255) cAGCGTTATGCCGCAGGCAGAAATGGCGATATTCTGGAGCGAGGTTCTTAAGCAATCGTCCTTGCTTGACCCAACATTAATGCTGTTGGCCTTTGTGTTTTTGCTAATTGGCTTTGGTACCAAAACCGGGCTATTTCCCATGCACGCCTg < 1:1910979/150‑1 (MQ=255) cAGCGTTATGCCGCAGGCAGAAATGGCGATATTCTGGAGCGAGGTTCTTAAGCAATCGTCCTTGCTTGACCCAACATTAATGCTGTTGGCCTTTGTGTTTTTGCTAATTGGCTTTGGTACCAAAACCGGGCTATTTCCCATGCACGCCTg > 1:2650168/1‑150 (MQ=255) gTTATGCCGCAGGCAGAAATGGCGATATTCTGGAGCGAGGTTCTTAAGCAATCGTCCTTGCTTGACCCAACATTAATGCTGTTGGCCTTTGTGTTTTTGCTAATTGGCTTTGGTACCAAAACCGGGCTATTTCTCATGCACGCCTGGCTg > 1:1704507/1‑150 (MQ=255) ccGCAGGCAGAAATGGCGATATTCTGGAGCGAGGTTCTTAAGCAATCGTCCTTGCTTGACCCAACATTAATGCTGTTGGCCTTTGTGTTTTTGCTAATTGGCTTTGGTACCAAAACCGGGCTATTTCCCATGCACGCCTGGCTGCCGGAt > 2:3972685/1‑150 (MQ=255) aggcagAAATGGCGATATTCTGGAGCGAGGTTCTTAAGCAATCGTCCTTGCTTGACCCAACATTAATGCTGTTGGCCTTTGTGTTTTTGCTAATTGGCTTTGGTACCAAAACCGGGCTATTTCCCATGCACGCCTGGCTGCCGGATGCTc < 1:983453/150‑1 (MQ=255) cagAAATGGCGATATTCTGGAGCGAGGTTCTTAAGCAATCGTCCTTGCTTGACCCAACATTAATGCTGTTGGCCTTTGTGTTTTTGCTAATTGGCTTTGGTACCAAAACCGGGCTATTTCCCATGCACGCCTGGCTGCCGGATGCTcaca > 2:1387751/1‑150 (MQ=255) aTGGCGATATTCTGGAGCGAGGTTCTTAAGCAATCGTCCTTGCTTGACCCAACATTAATGCTGTTGGCCTTTGTGTTTTTGCTAATTGGCTTTGGTACCAAAACCGGGCTATTTCCCATGCACGCCTGGCTGCCGGATGCTCACAGTGaa > 1:1317869/1‑150 (MQ=255) gCGATATTCTGGAGCGAGGTTCTTAAGCAATCGTCCTTGCTTGACCCAACATTAATGCTGTTGGCCTTTGTGTTTTTGCTAATTGGCTTTGGTACCAAAACCGGGCTATTTCCCATGCACGCCTGGCTGCCGGATGCTCACAGTGAAgcg > 2:2945976/1‑150 (MQ=255) cGATATTCTGGAGCGAGGTTCTTAAGCAATCGTCCTTGCTTGACCCAACATTAATGCTGTTGGCCTTTGTGTTTTTGCTAATTGGCTTTGGTACCAAAACCGGGCTATTTCCCATGCACGCCTGGCTGCCGGATGCTCACAGTGAAgcgc > 1:3563547/1‑150 (MQ=255) cGATATTCTGGAGCGAGGTTCTTAAGCAATCGTCCTTGCTTGACCCAACATTAATGCTGTTGGCCTTTGTGTTTTTGCTAATTGGCTTTGGTACCAAAACCGGGCTATTTCCCATGCACGCCTGGCTGCCGGATGCTCACAGTGAAgcgc > 1:3101291/1‑150 (MQ=255) atTCTGGAGCGAGGTTCTTAAGCAATCGTCCTTGCGTGACCCAACATTAATGCTGTTGGCCTTTGTGTTTTTGCTAATTGGCTTTGGTACCAAAACCGGGCTATTTCCCATGCACGCCTGGCTGCCGGATGCTCACAGTGAAGCGCCGAg < 2:51310/150‑1 (MQ=255) 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aGCGAGGTTCTTAAGCAATCGTCCTTGCTTGACCCAACATTAATGCTGTTGGCCTTTGTGTTTTTGCTAATTGGCTTTGGTACCAAAACCGGGCTATTTCCCATGCACGCCTGGCTGCCGGATGCTCACAGTGAAGCGCCGAGTCCGGTc > 2:3025293/1‑150 (MQ=255) gTTCTTAAGCAATCGTCCTTGCTTGACCCAACATTAATGCTGTTGGCCTTTGTGTTTTTGCTAATTGGCTTTGGTACCAAAACCGGGCTATTTCCCATGCACGCCTGGCTGCCGGATGCTCACAGTGAAGCGCCGAGTCCGGTCAGCGcc > 2:1995587/1‑150 (MQ=255) ttCTTAAGCAATCGTCCTTGCTTGACCCAACATTAATGCTGTTGGCCTTTGTGTTTTTGCTAATTGGCTTTGGTACCAAAACCGGGCTATTTCCCATGCACGCCTGGCTGCCGGATGCTCACAGTGAAGCGCCGAGTCCGGTCAGCGccc > 1:732244/1‑150 (MQ=255) cTTAAGCAATCGTCCTTGCTTGACCCAACATTAATGCTGTTGGCCTTTGTTTTTTTGCTAATTGGCTTTGGTACCAAAACCGGGCTATTTCCCATGCACGCCTGGCTGCCGGATGCTCACAGTGAAGCGCCGAGTCCGGTCAGCGCCCTg < 2:1540517/150‑1 (MQ=255) aGCAATCGTCCTTGCTTGACCCAACATTAATGCTGTTGGCCTTTGTGTTTTTGCTAATTGGCTTTGGTACCAAAACCGGGCTATTTCCCATGCACGCCTGGCTGCCGGATGCTCACAGTGAAGCGCCGAGTCCGGTCAGCGCCCTGctct > 2:1016352/1‑150 (MQ=255) aaTCGTCCTTGCTTGACCCAACATTAATGCTGTTGGCCTTTGTGTTTTTGCTAATTGGCTTTGGTACCAAAACCGGTCTATTTCCCATGCACGCCTGGCTGCCGGATGCTCACAGTTAAACGCCGAGTCCGGTCAGCGCCCTGCTCTccg > 1:1091542/1‑150 (MQ=255) aTCGTCCTTGCTTGACCCAACATTAATGCTGTTGGCCTTTGTGTTTTTGCTAATTGGCTTTGGTACCAAAACCGGGCTATTTCCCATGCACGCCTGGCTGCCGGATGCTCACAGTGAAGCGCCGAGTCCGGTCAGCGCCCTGCTCTccgc > 1:1376427/1‑150 (MQ=255) aTCGTCCTTGCTTGACCCAACATTAATGCTGTTGGCCTTTGTGTTTTTGCTAATTGGCTTTGGTACCAAAACCGGGCTATTTCCCATGCACGCCTGGCTGCCGGATGCTCACAGTGAAGCGCCGAGTCCGGTCAGCGCCCTGCTCTccgc > 1:2264041/1‑150 (MQ=255) aTCGTCCTTGCTTGACCCAACATTAATGCTGTTGGCCTTTGTGTTTTTGCTAATTGGCTTTGGTACCAAAACCGGGCTATTTCCCATGCACGCCTGGCTGCCGGATGCTCACAGTGAAGCGCCGAGTCCGGTCAGCGCCCTGCTCTccgc < 2:2185848/150‑1 (MQ=255) tCCTTGCTTGACCCAACATTAATGCTGTTGGCCTTTGTGTTTTTGCTAATTGGCTTTGGTACCAAAACCGGGCTATTTCCCATGCACGCCTGGCTGCCGGATGCTCACAGTGAAGCGCCGAGTCCGGTCAGCGCCCTGCTCTCCGCCGTa > 2:3009330/1‑150 (MQ=255) 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cTAATTGGCTTTGGTACCAAAACCGGGCTATTTCCCATGCACGCCTGGCTGCCGGATGCTCACAGTGAAGCGCCGAGTCCGGTCAGCGCCCTGCTCTCCGCCGTATTGCTGAACTGCGCGCTGTTGGTGCTGATTCGCTATTACATCatt > 1:1177021/1‑150 (MQ=255) tAATTGGCTTTGGTACCAAAACCGGGCTATTTCCCATGCACGCCTGGCTGCCGGATGCTCACAGTGAAGCGCCGAGTCCGGTCAGCGCCCTGCTCTCCGCCGTATTGCTGAACTGCGCGCTGTTGGTGCTGATTCGCTATTACATCatta < 2:1976294/150‑1 (MQ=255) aaTTGGCTTTGGTACCAAAACCGGGCTATTTCCCATGCACGCCTGGCTGCCGGATGCTCACAGTGAAGCGCCGAGTCCGGTCAGCGCCCTGCTCTCCGCCGTATTGCTGAACTGCGCGCTGTTGGTGCTGATTCGCTATTACATCattat < 2:3382840/150‑1 (MQ=255) aaTTGGCTTTGGTACCAAAACCGGGCTATTTCCCATGCACGCCTGGCTGCCGGATGCTCACAGTGAAGCGCCGAGTCCGGTCAGCGCCCTGCTCTCCGCCGTATTGCTGAACTGCGCGCTGTTGGTGCTGATTCGCTATTACATCattat > 2:3370475/1‑150 (MQ=255) aaTTGGCTTTGGTACCAAAACCGGGCTATTTCCCATGCACGCCTGGCTGCCGGATGCTCACAGTGAAGCGCCGAGTCCGGTCAGCGCCCTGCTCTCCGCCGTATTGCTGAACTGCGCGCTGTTGGTGCTGATTCGCTATTACATCattat > 1:1503293/1‑150 (MQ=255) aaTTGGCTTTGGTACCAAAACCGGGCTATTTCCCATGCACGCCTGGCTGCCGGATGCTCACAGTGAAGCGCCGAGTCCGGTCAGCGCCCTGCTCTCCGCCGTATTGCTGAACTGCGCGCTGTTGGTGCTGATTCGCTATTACATCattat < 2:487893/150‑1 (MQ=255) aTTGGCTTTGGTACCAAAACCGGGCTATTTCCCATGCACGCCTGGCTGCCGGATGCTCACAGTGAAGCGCCGAGTCCGGTCAGCGCCCTGCTCTCCGCCGTATTGCTGAACTGCGCGCTGTTGGTGCTGATTCGCTATTACATCattatt < 2:1960611/150‑1 (MQ=255) ttGGCTTTGGTACCAAAACCGGGCTATTTCCCATGCACGCCTGGCTGCCGGATGCTCACAGTGAAGCGCCGAGTCCGGTCAGCGCCCTGCTCTCCGCCGTATTGCTGAACTGCGCGCTGTTGGTGCTGATTCGCTATTACATCATTAttt < 2:2556756/150‑1 (MQ=255) cTTTGGTACCAAAACCGGGCTATTTCCCATGCACGCCTGGCTGCCGGATGCTCACAGTGAAGCGCCGAGTCCGGTCAGCGCCCTGCTCTCCGCCGTATTGCTGAACTGCGCGCTGTTGGTGCTGATTCGCTATTACATCATTATTTGCCa < 1:2847378/150‑1 (MQ=255) cTTTGGTACCAAAACCGGGCTATTTCCCATGCACGCCTGGCTGCCGGATGCTCACAGTGAAGCGCCGAGTCCGGTCAGCGCCCTGCTCTCCGCCGTATTGCTGAACTGCGCGCTGTTGGTGCTGATTCGCTATTACATCATTATTTGCCa < 1:313785/150‑1 (MQ=255) tttGGTACCAAAACCGGGCTATTTCCCATGCACGCCTGGCTGCCGGATGCTCACAGTGAAGCGCCGAGTCCGGTCAGCGCCCTGCTCTCCGCCGTATTGCTGAACTGCGCGCTGTTGGTGCTGATTCGCTATTACATCATTATTTGCCaa > 1:3333962/1‑150 (MQ=255) tGGTACCAAAACCGGGCTATTTCCCATGCACGCCTGGCTGCCGGATGCTCACAGTGAAGCGCCGAGTCCGGTCAGCGCCCTGCTCTCCGCCGTATTGCTGAACTGCGCGCTGTTGGTGCTGATTCGCTATTACATCATTATTTGCCAAGc < 2:609682/150‑1 (MQ=255) tGGTACCAAAACCGGGCTATTTCCCATGCACGCCTGGCTGCCGGATGCTCACAGTGAAGCGCCGAGTCCGGTCAGCGCCCTGCTCTCCGCCGTATTGCTGAACTGCGCGCTGTTGGTGCTGATTCGCTATTACATCATTATTTGCCAAGc < 1:610225/150‑1 (MQ=255) ggTACCAAAACCGGGCTATTTCCCATGCACGCCTGGCTGCCGGATGCTCACAGTGAAGCGCCGAGTCCGGTCAGCGCCCTGCTCTCCGCCGTATTGCTGAACTGCGCGCTGTTGGTGCTGATTCGCTATTACATCATTATTTGCCAAGcc < 2:3644/150‑1 (MQ=255) gTACCAAAACCGGGCTATTTCCCATGCACGCCTGGCTGCCGGATGCTCACAGTGAAGCGCCGAGTCCGGTCAGCCCCCTGCTCTCCGCCGTATTGCTGAACTGCGCGCTGTTGGTGCTGATTCGCTATTACATCATTATTTGCCAAGCCa < 2:213575/150‑1 (MQ=255) tACCAAAACCGGGCTATTTCCCATGCACGCCTGGCTGCCGGATGCTCACAGTGAAGCGCCGAGTCCGGTCAGCGCCCTGCTCTCCGCCGTATTGCTGAACTGCGCGCTGTTGGTGCTGATTCGCTATTACATCATTATTTGCCAAGCCAt < 2:1681291/150‑1 (MQ=255) tACCAAAACCGGGCTATTTCCCATGCACGCCTGGCTGCCGGATGCTCACAGTGAAGCGCCGAGTCCGGTCAGCGCCCTGCTCTCCGCCGTATTGCTGAACTGCGCGCTGTTGGTGCTGATTCGCTATTACATCATTATTTGCCAAGCCAt > 1:1042386/1‑150 (MQ=255) aCCAAAACCGGGCTATTTCCCATGCACGCCTGGCTGCCGGATGCTCACAGTGAAGCGCCGAGTCCGGTCAGCGCCCTGCTCTCCGCCGTATTGCTGAACTGCGCGCTGTTGGTGCTGATTCGCTATTACATCATTATTTGCCAAGCCATc < 1:2808751/150‑1 (MQ=255) ccAAAACCGGGCTATTTCCCATGCACGCCTGGCTGCCGGATGCTCACAGTGAAGCGCCGAGTCCGGTCAGCGCCCTGCTCTCCGCCGTATTGCTGAACTGCGCGCTGTTGGTGCTGATTCGCTATTACATCATTATTTGCCAAGCCATCg > 1:255690/1‑150 (MQ=255) aaaaCCGGGCTATTTCCCATGCACGCCTGGCTGCCGGATGCTCACAGTGAAGCGCCGAGTCCGGTCAGCGCCCTGCTCTCCGCCGTATTGCTGAACTGCGCGCTGTTGGTGCTGATTCGCTATTACATCATTATTTGCCAAGCCATCGGc < 1:2829617/150‑1 (MQ=255) 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aCCGGGCTATTTCCCATGCACGCCTGGCTGCCGGATGCTCACAGTGAAGCGCCGAGTCCGGTCAGCGCCCTGCTCTCCGCCGTATTGCTGAACTGCGCGCTGTTGGTGCTGATTCGCTATTACATCATTATTTGCCAAGCCATCGGCAGc < 2:3508569/150‑1 (MQ=255) aCCGGGCTATTTCCCATGCACGCCTGGCTGCCGGATGCTCACAGTGAAGCGCCGAGTCCGGTCAGCGCCCTGCTCTCCGCCGTATTGCTGAACTGCGCGCTGTTGGTGCTGATTCGCTATTACATCATTATTTGCCAAGCCATCGGCAGc < 1:1622977/150‑1 (MQ=255) | CCGTGCTGGTATACGCCAACGCCGCCAGCGTTATGCCGCAGGCAGAAATGGCGATATTCTGGAGCGAGGTTCTTAAGCAATCGTCCTTGCTTGACCCAACATTAATGCTGTTGGCCTTTGTGTTTTTGCTAATTGGCTTTGGTACCAAAACCGGGCTATTTCCCATGCACGCCTGGCTGCCGGATGCTCACAGTGAAGCGCCGAGTCCGGTCAGCGCCCTGCTCTCCGCCGTATTGCTGAACTGCGCGCTGTTGGTGCTGATTCGCTATTACATCATTATTTGCCAAGCCATCGGCAGC > AP012306/2153091‑2153389 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |