New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | AP012306 | 2876782 = | 283 (0.900) | 7 (0.020) | 7/274 | 23.0 | 2.6% | coding (1324/1452 nt) | panF | pantothenate:sodium symporter |
? | AP012306 | 2876794 = | 262 (0.910) | coding (1336/1452 nt) | panF | pantothenate:sodium symporter | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 262 total aligned reads displayed.
ATTTGTTGGCCTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCTTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTTGGCGGCGTGCTGTATGCCGTACTCGCGACGCTGAATATTCAGTACCTGGGCTTCCACCCTATCGTGCCCTCGTTACTACTAAGTTTGCTGGCTTTCCTGGTCGGAAACCGTTTCGGTACATCCGTCCCGCAAGCTACCGTTTTGACTACTGATAAATAAAGAGTTTTGCCATGCCTTG > AP012306/2876645‑2876929 | ttttGTGGGCCTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCTTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTTGGCGGCGTGCTGTATGCCGTACTCGCGACGCTGAATATTCAGt < 2:2071764/149‑1 (MQ=255) aTTTGTTGGCCTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCTTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTTGGCGGCGTGCTGTATGCCGTACTCGCGACGCTGAATATTCAGt > 2:3730228/1‑150 (MQ=255) ccTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCTTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTTGGCGGCGTGCTGTATGCCGTACTCGCGACGCTGAATATTCAGTACCTGGGCt < 2:1397370/150‑1 (MQ=255) cTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCTTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTTGGCGGCGTGCTGTATGCCGTACTCGCGACGCTGAATATTCAGTACCTGGGCtt > 1:3516664/1‑150 (MQ=255) cTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCTTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTTGGCGGCGTGCTGTATGCCGTACTCGCGACGCTGAATATTCAGTACCTGGGCtt > 1:298677/1‑150 (MQ=255) cTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCTTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTTGGCGGCGTGCTGTATGCCGTACTCGCGACGCTGAATATTCAGTACCTGGGCtt < 1:2904120/150‑1 (MQ=255) cTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCTTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTTGGCGGCGTGCTGTATGCCGTACTCGCGACGCTGAATATTCAGTACCTGGGCtt > 2:3442600/1‑150 (MQ=255) tCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCTTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTTGGCGGCGTGCTGTATGCCGTACTCGCGACGCTGAATATTCAGTACCTGGGCTTcc > 1:3916051/1‑150 (MQ=255) cGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCTTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTTGGCGGCGTGCTGTATGCCGTACTCGCGACGCTGAATATTCAGTACCTGGGCTTCCa < 2:3100871/150‑1 (MQ=255) gTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCTTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTTGGCGGCGTGCTGTATGCCGTACTCGCGACGCTGAATATTCAGTACCTGGGCTTCCAcc > 1:3770136/1‑150 (MQ=255) gggCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCTTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTTGGCGGCGTGCTGTATGCCGTACTCGCGACGCTGAATATTCAGTACCTGGGCTTCCACCCt > 2:3028031/1‑150 (MQ=255) tGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCTTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTTGGCGGCGTGCTGTATGCCGTACTCGCGACGCTGAATATTCAGTACCTGGGCTTCCACCCTATCg > 1:292719/1‑150 (MQ=255) tGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCTTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTTGGCGGCGTGCTGTATGCCGTACTCGCGACGCTGAATATTCAGTACCTGGGCTTCCACCCTATCg > 2:1209182/1‑150 (MQ=255) tGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCTTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTTGGCGGCGTGCTGTATGCCGTACTCGCGACGCTGAATATTCAGTACCTGGGCTTCCACCCTATCg > 1:4272770/1‑150 (MQ=255) ggAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCTTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTTGGCGGCGTGCTGTATGCCGTACTCGCGACGCTGAATATTCAGTACCTGGGCTTCCACCCTATCGt < 2:1123376/150‑1 (MQ=255) gAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCTTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTTGGCGGCGTGCTGTATGCCGTACTCGCGACGCTGAATATTCAGTACCTGGGCTTCCACCCTATCGTg > 1:1273455/1‑150 (MQ=255) aaGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCTTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTTGGCGGCGTGCTGTATGCCGTACTCGCGACGCTGAATATTCAGTACCTGGGCTTCCACCCTATCGTGc < 2:3530099/150‑1 (MQ=255) gTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCTTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTTGGCGGCGTGCTGTATGCCGTACTCGCGACGCTGAATATTCAGTACCTGGGCTTCCACCCTATCGTGCCCTCg > 2:618419/1‑150 (MQ=255) tttCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCTTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTTGGCGGCGTGCTGTATGCCGTACTCGCGACGCTGAATATTCAGTACCTGGGCTTCCACCCTATCGTGCCCTCGtt < 1:309406/150‑1 (MQ=255) 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tGGCGGCGTGCTGTATGCCGTACTCGCGACGCTGAATATTCAGTACCTGGGCTTCCACCCTATCGTGCCCTCGTTACTACTAAGTTTGCTGGCTTTCCTGGTCGGAAACCGTTTCGGTACATCCGTCCCGCAAGCTACCGTTTTGactac < 2:1798052/150‑1 (MQ=255) tGGCGGCGTGCTGTATGCCGTACTCGCGACGCTGAATATTCAGTACCTGGGCTTCCACCCTATCGTGCCCTCGTTACTACTAAGTTTGCTGGCTTTCCTGGTCGGAAACCGTTTCGGTACATCCGTCCCGCAAGCTACCGTTTTGactac > 1:144667/1‑150 (MQ=255) ggcggcGTGCTGTATGCCGTACTCGCGACGCTGAATATTCAGTACCTGGGCTTCCACCCTATCGTGCCCTCGTTACTACTAAGTTTGCTGGCTTTCCTGGTCGGAAACCGTTTCGGTACATCCGTCCCGCAAGCTACCGTTTTGactact > 1:2889596/1‑150 (MQ=255) cgTGCTGTATGCCGTACTCGCGACGCTGAATATTCAGTACCTGGGCTTCCACCCTATCGTGCCCTCGTTACTACTAAGTTTGCTGGCTTTCCTGGTCGGAAACCGTTTCGGTACATCCGTCCCGCAAGCTACCGTTTTGACTACTGataa < 2:1472468/150‑1 (MQ=255) cgTGCTGTATGCCGTACTCGCGACGCTGAATATTCAGTACCTGGGCTTCCACCCTATCGTGCCCTCGTTACTACTAAGTTTGCTGGCTTTCCTGGTCGGAAACCGTTTCGGTACATCCGTCCCGCAAGCTACCGTTTTGACTACTGataa > 2:640612/1‑150 (MQ=255) gTGCTGTATGCCGTACTCGCGACGCTGAATATTCAGTACCTGGGCTTCCACCCTATCGTGCCCTCGTTACTACTAAGTTTGCTGGCTTTCCTGGTCGGAAACCGTTTCGGTACATCCGTCCCGCAAGCTACCGTTTTGACTACTGataaa < 2:300573/150‑1 (MQ=255) gTGCTGTATGCCGTACTCGCGACGCTGAATATTCAGTACCTGGGCTTCCACCCTATCGTGCCCTCGTTACTACTAAGTTTGCTGGCTTTCCTGGTCGGAAACCGTTTCGGTACATCCGTCCCGCAAGCTACCGTTTTGACTACTGataaa > 1:1691504/1‑150 (MQ=255) tGCTGTATGCCGTACTCGCGACGCTGAATATTCAGTACCTGGGCTTCCGCCCTATCGTGCCCTCGTTACTACTAAGTTTGCTGGCTTTCCTGGTCGGAAACCGTTTCGGTACATCCGTCCCGCAAGCTACCGTTTTGACTACTGataaat < 2:1936444/150‑1 (MQ=255) tGCTGTATGCCGTACTCGCGACGCTGAATATTCAGTACCTGGGCTTCCACCCTATCGTGCCCTCGTTACTACTAAGTTTGCTGGCTTTCCTGGTCGGAAACCGTTTCGGTACATCCGTCCCGCAAGCTACCGTTTTGACTACTGataaat < 2:830198/150‑1 (MQ=255) cTGTATGCCGTACTCGCGACGCTGAATATTCAGTACCTGGGCTTCCACCCTATCGTGCCCTCGTTACTACTAAGTTTGCTGGCTTTCCTGGTCGGAAACCGTTTCGGTACATCCGTCCCGCAAGCTACCGTTTTGACTACTGataaataa < 1:2680363/150‑1 (MQ=255) tGTATGCCGTACTCGCGACGCTGAATATTCAGTACCTGGGCTTCCACCCTATCGTGCCCTCGTTACTACTAAGTTTGCTGGCTTTCCTGGTCGGAAACCGTTTCGGTACATCCGTCCCGCAAGCTACCGTTTTGACTACTGAtaaataaa < 2:84098/150‑1 (MQ=255) gTATGCCGTACTCGCGACGCTGAATATTCAGTACCTGGGCTTCCACCCTATCGTGCCCTCGTTACTACTAAGTTTGCTGGCTTTTCTGGTCGGAAACCGTTTCGGTACATCCGTCCCGCAAGCTACCGTTTTGACTACTGATAAATAAag > 1:2373362/1‑150 (MQ=255) gTATGCCGTACTCGCGACGCTGAATATTCAGTACCTGGGCTTCCAACCTATCGTGCCCTCGTTACTACTAAGTTTGCTGGCTTTCCTGGTCGGAAACCGTTTCGGTACATCCGTCCCGCAAGCTACCGTTTTGACTACTGATAAATAAag > 2:1315835/1‑150 (MQ=255) tATGCCGTACTCGCGACGCTGAATATTCAGTACCTGGGCTTCCACCCTATCGTGCCCTCGTTACTACTAAGTTTGCTGGCTTTCCTGGTCGGAAACCGTTTCGGTACATCCGTCCCGCAAGCTACCGTTTTGACTACTGATAAATAAaga < 1:2574014/150‑1 (MQ=255) tATGCCGTACTCGCGACGCTGAATATTCAGTACCTGGGCTTCCACCCTATCGTGCCCTCGTTACTACTAAGTTTGCTGGCTTTCCTGGTCGGAAACCGTTTCGGTACATCCGTCCCGCAAGCTACCGTTTTGACTACTGATAAATAAaga < 1:3381058/150‑1 (MQ=255) aTGCCGTACTCGCGACGCTGAATATTCAGTACCTGGGCTTCCACCCTATCGTGCCCTCGTTACTACTAAGTTTGCTGGCTTTCCTGGTCGGAAACCGTTTCGGTACATCCGTCCCGCAAGCTACCGTTTTGACTACTGATAAATAAagag < 1:2515921/150‑1 (MQ=255) tGCCGTACTCGCGACGCTGAATATTCAGTACCTGGGCTTCCACCCTATCGTGCCCTCGTTACTACTAAGTTTGCTGGCTTTCCTGGTCGGAAACCGTTTCGGTACATCCGTCCCGCAAGCTACCGTTTTGACTACTGATAAATAAAGAGt < 1:394279/150‑1 (MQ=255) gCCGTACTCGCGACGCTGAATATTCAGTACCTGGGCTTCCACCCTATCGTGCCCTCGTTACTACTAAGTTTGCTGGCTTTCCTGGTCGGAAACCGTTTCGGTACATCCGTCCCGCAAGCTACCGTTTTGACTACTGATAAATAAAGAGtt < 1:2167551/150‑1 (MQ=255) gCCGTACTCGCGACGCTGAATATTCAGTACCTGGGCTTCCACCCTATCGTGCCCTCGTTACTACTAAGTTTGCTGGCTTTCCTGGTCGGAAACCGTTTCGGTACATCCGTCCCGCAAGCTACCGTTTTGACTACTGATAAATAAAGAGtt > 2:1605298/1‑150 (MQ=255) gTACTCGCGACGCTGAATATTCAGTACCTGGGCTTCCACCCTATCGTGCCCTCGTTACTACTAAGTTTGCTGGCTTTCCTGGTCGGAAACCGTTTCGGTACATCCGTCCCGCAAGCTACCGTTTTGACTACTGATAAATAAAGAGTTTTg > 2:3552158/1‑150 (MQ=255) gTACTCGCGACGCTGAATATTCAGTACCTGGGCTTCCACCCTATCGTGCCCTCGTTACTACTAAGTTTGCTGGCTTTCCTGGTCGGAAACCGTTTCGGTACATCCGTCCCGCAAGCTACCGTTTTGACTACTGATAAATAAAGAGTTTTg > 2:4098174/1‑150 (MQ=255) gTACTCGCGACGCTGAATATTCAGTACCTGGGCTTCCACCCTATCGTGCCCTCGTTACTACTAAGTTTGCTGGCTTTCCTGGTCGGAAACCGTTTCGGTACATCCGTCCCGCAAGCTACCGTTTTGACTACTGATAAATAAAGAGTTTTg < 1:149447/150‑1 (MQ=255) aCTCGCGACGCTGAATATTCAGTACCTGGGCTTCCACCCTATCGTGCCCTCGTTACTACTAAGTTTGCTGGCTTTCCTGGTCGGAAACCGTTTCGGTACATCCGTCCCGCAAGCTACCGTTTTGACTACTGATAAATAAAGAGTTTTGcc > 2:316364/1‑150 (MQ=255) cgACGCTGAATATTCAGTACCTGGGCTTCCACCCTATCGTGCCCTCGTTACTACTAAGTTTGCTGGCTTTCCTGGTCGGAAACCGTTTCGGTACATCCGTCCCGCAAGCTACCGTTTTGACTACTGATAAATAAAGAGTTTTGCCATGcc < 2:933007/150‑1 (MQ=255) gACGCTGAATATTCAGTACCTGGGCTTCCACCCTATCGTGCCCTCGTTACTACTAAGTTTGCTGGCTTTCCTGGTCGGAAACCGTTTCGGTACATCCGTCCCGCAAGCTACCGTTTTGACTACTGATAAATAAAGAGTTTTGCCATGCCt < 1:3016180/150‑1 (MQ=255) cGCTGAATATTCAGTACCTGGGCTTCCACCCTATCGTGCCCTCGTTACTACTAAGTTTGCTGGCTTTCCTGGTCGGAAACCGTTTCGGTACATCCGTCCCGCAAGCTACCGTTTTGACTACTGATAAATAAAGAGTTTTGCCATGCCTTg > 2:2253469/1‑150 (MQ=255) | ATTTGTTGGCCTTCGGTGGGCTGGAAGCCGTTTTCCTGTGGCCGCTGGTGCTGGGTCTTTACTGGGAACGCGCCAACGCCAAAGGCGCGCTAAGTGCGATGATCGTTGGCGGCGTGCTGTATGCCGTACTCGCGACGCTGAATATTCAGTACCTGGGCTTCCACCCTATCGTGCCCTCGTTACTACTAAGTTTGCTGGCTTTCCTGGTCGGAAACCGTTTCGGTACATCCGTCCCGCAAGCTACCGTTTTGACTACTGATAAATAAAGAGTTTTGCCATGCCTTG > AP012306/2876645‑2876929 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |