| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | AP012306 | 3,617,867 | C→A | P1102Q (CCG→CAG) | rpoC → | RNA polymerase, beta prime subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | AP012306 | 3,617,867 | 0 | C | A | 99.5% | 805.6 / ‑4.2 | 205 | P1102Q (CCG→CAG) | rpoC | RNA polymerase, beta prime subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base A (90/114); minor base G (1/0); total (91/114) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.44e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.18e-01 | |||||||||||
Only 100 of 207 total aligned reads displayed.
TGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTGGTGACACCCTGGCGCGTATTCCGCAGGAATCCGGCGGTACCAAGGACATCACCGGTGGTCTGCCGCGCGTTGCGGACCTGTTCGAAGCACGTCGTCC > AP012306/3617720‑3618011 | gACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCAggg < 1:3136746/150‑1 (MQ=255) aCCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCAGGGt < 2:151749/150‑1 (MQ=255) ccGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCAGGGTa < 2:1449675/150‑1 (MQ=255) gtctgtctTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCAGGGTAAAg > 1:1873823/1‑150 (MQ=255) ctgtctTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCAGGGTAAAGCg < 2:415055/150‑1 (MQ=255) gtctTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCAGGGTAAAGCGAt > 1:3219460/1‑150 (MQ=255) ttCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCAGGGTAAAGCGATTGt < 2:4013361/150‑1 (MQ=255) ttCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTGCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTGCCTGCAGGGTAAAGCGATTGt < 2:1954479/150‑1 (MQ=255) cGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCAGGGTAAAGCGATTGTTc < 1:1105484/150‑1 (MQ=255) gtggtTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCAGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTg < 2:224024/150‑1 (MQ=255) tggtTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCAGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTgg > 2:3663492/1‑150 (MQ=255) ggtTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCAGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGa < 1:3182844/150‑1 (MQ=255) ttCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCAGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAg > 2:447842/1‑150 (MQ=255) ttCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCAGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAg < 1:2136094/150‑1 (MQ=255) tCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCAGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGa < 1:3951233/150‑1 (MQ=255) tCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCAGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGa > 2:810280/1‑150 (MQ=255) cTGGATTCCGCAGAACGTACCGGAGGTGGTAAAGCTCTGCGTCCGGCGCTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGGCGTTCTGATCCCAGGTCCCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCAGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGAt < 2:283049/150‑1 (MQ=255) cTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCAGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGAt < 2:4194285/150‑1 (MQ=255) ggATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATTCCAGCGCAGTACTTCCTGCAGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATgg > 2:2918690/1‑150 (MQ=255) gATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCAGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGc < 2:2116060/150‑1 (MQ=255) gCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCAGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAg < 1:3505269/150‑1 (MQ=255) gAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGCTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCAGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATc < 2:3913894/150‑1 (MQ=255) aaCGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCAGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCa > 2:1917911/1‑150 (MQ=255) aCGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCAGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAg < 1:2847606/150‑1 (MQ=255) gTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCAGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGct < 2:3877741/150‑1 (MQ=255) aCCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCAGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGctct < 1:2263408/150‑1 (MQ=255) aCCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCAGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGctct > 1:1682547/1‑150 (MQ=255) aCCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCAGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGctct > 2:2986837/1‑150 (MQ=255) ccGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCAGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTg < 2:763013/150‑1 (MQ=255) cGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCAGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTgg < 1:2191801/150‑1 (MQ=255) cAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCAGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTGGTg < 2:3730670/150‑1 (MQ=255) cAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCAGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTGGTg < 1:1584680/150‑1 (MQ=255) ggtggtAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCAGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTGGTGac > 1:4092279/1‑150 (MQ=255) gtggtAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCAGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTGGTGaca < 2:1788772/150‑1 (MQ=255) tggtAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCAGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTGGTGacac > 2:3076444/1‑150 (MQ=255) tggtAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCAGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTGGTGacac < 1:1794072/150‑1 (MQ=255) aaaGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCAGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTGGTGACACCCTg < 1:1041510/150‑1 (MQ=255) aaaGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCAGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTGGTGACACCCTg < 2:503005/150‑1 (MQ=255) aGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCAGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTGGTGACACCCTGgc < 1:3098020/150‑1 (MQ=255) gATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCAGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTGGTGACACCCTGgcg < 1:3937744/150‑1 (MQ=255) gATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCAGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTGGTGACACCCTGgcg < 2:842993/150‑1 (MQ=255) cGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCAGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTGGTGACACCCTGGCGCGTAtt < 1:3237050/150‑1 (MQ=255) cGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCAGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTGGTGACACCCTGGCGCGTATTCCGc < 1:1394778/150‑1 (MQ=255) aaaaTCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCAGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTGGTGACACCCTGGCGCGTATTCCGCAGGAATcc < 1:976419/150‑1 (MQ=255) aaaaTCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCAGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTGGTGACACCCTGGAGCGTATTCCGCAGGAATcc > 2:1039432/1‑150 (MQ=255) aaaTCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCAGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTGGTGACACCCTGGCGCGTATTCCGCAGGAATCcg < 1:2969643/150‑1 (MQ=255) aaTCGTTGATGCTCAGTGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTCCTTCCTGCAGGCTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGCTCAGCTCTGGTGACACCCTGGCGCGTATTCCGCAGGAATCcgg < 2:3103091/150‑1 (MQ=255) tCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCAGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTGGTGACACCCTGGCGCGTATTCCGCAGGAATCcggcg > 2:3338982/1‑150 (MQ=255) tCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCAGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTGGTGACACCCTGGCGCGTATTCCGCAGGAATCcggcg > 2:919365/1‑150 (MQ=255) cGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCAGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTGGTGACACCCTGGCGCGTATTCCGCAGGAATCcggcgg > 2:2388194/1‑150 (MQ=255) gTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCAGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTGGTGACACCCTGGCGCGTATTCGGCAGGAATCCGGCGGt > 2:3985786/1‑150 (MQ=255) gTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCAGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTGGTGACACCCTGGCGCGTATTCCGCAGGAATCCGGCGGt > 1:4105090/1‑150 (MQ=255) gATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCAGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTGGTGACACCCTGGCGCGTATTCCGCAGGAATCCGGCGGTAcc < 1:3033472/150‑1 (MQ=255) aTGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCAGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTGGTGACACCCTGGCGCGTATTCCGCAGGAATCCGGCGGTACCa < 1:828793/150‑1 (MQ=255) aTGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCAGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTGGTGACACCCTGGCGCGTATTCCGCAGGAATCCGGCGGTACCa < 1:367277/150‑1 (MQ=255) aTGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCAGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTGGTGACACCCTGGCGCGTATTCCGCAGGAATCCGGCGGTACCa > 1:551554/1‑150 (MQ=255) cTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCAGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTGGTGACACCCTGGCGCGTATTCCGCAGGAATCCGGCGGTACCAAgg > 2:405581/1‑150 (MQ=255) tCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCAGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTGGTGACACCCTGGCGCGTATTCCGCAGGAATCCGGCGGTACCAAGGa < 1:666200/150‑1 (MQ=255) tCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCAGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTGGTGACACCCTGGCGCGTATTCCGCAGGAATCCGGCGGTACCAAGGa > 2:1821270/1‑150 (MQ=255) aGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCAGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTGGTGACACCCTGGCGCGTATTCCGCAGGAATCCGGCGGTACCAAGGACa > 1:246090/1‑150 (MQ=255) gggTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCAGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTGGTGACACCCTGGCGCGTATTCCGCAGGAATCCGGCGGTACCAAGGACAt > 2:1274247/1‑150 (MQ=255) ggTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCAGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTGGTGACACCCTGGCGCGTATTCCGCAGGAATCCGGCGGTACCAAGGACATc < 1:775337/150‑1 (MQ=255) gTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCAGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTGGTGACACCCTGGCGCGTATTCCGCAGGAATCCGGCGGTACCAAGGACATCa > 1:1942376/1‑150 (MQ=255) aaCGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCAGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTGGTGACACCCTGGCGCGTATTCCGCAGGAATCCGGCGGTACCAAGGACATCAcc > 2:2053390/1‑150 (MQ=255) gacgTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCGGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTGGTGACACCCTGGCGCGTATTCCGCAGGAATCCGGCGGTACCAAGGACATCACCggt > 1:2307269/1‑150 (MQ=255) gacgTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCAGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTGGTGACACCCTGGCGCGTATTCCGCAGGAATCCGGCGGTACCAAGGACATCACCggt > 2:2195925/1‑150 (MQ=255) gacgTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCAGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTGGTGACACCCTGGCGCGTATTCCGCAGGAATCCGGCGGTACCAAGGACATCACCggt > 1:4053080/1‑150 (MQ=255) acgTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCAGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTGGTGACACCCTGGCGCGTATTCCGCAGGAATCCGGCGGTACCAAGGACATCACCggtg > 2:2444683/1‑150 (MQ=255) cgTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCAGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTGGTGACACCCTGGCGCGTATTCCGCAGGAATCCGGCGGTACCAAGGACATCACCggtgg > 2:1820430/1‑150 (MQ=255) gTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCAGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTGGTGACACCCTGGCGCGTATTCCGCAGGAATCCGGCGGTACCAAGGACATCACCggtggt < 1:1643899/150‑1 (MQ=255) gTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCAGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTGGTGACACCCTGGCGCGTATTCCGCAGGAATCCGGCGGTACCAAGGACATCACCggtggt < 2:1765683/150‑1 (MQ=255) tCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCAGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTGGTGACACCCTGGCGCGTATTCCGCAGGAATCCGGCGGTACCAAGGACATCACCGGTGGTCt < 2:4111915/150‑1 (MQ=255) tCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCAGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTGGTGACACCCTGGCGCGTATTCCGCAGGAATCCGGCGGTACCAAGGACATCACCGGTGGTCt < 2:3527715/150‑1 (MQ=255) tCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCAGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTGGTGACACCCTGGCGCGTATTCCGCAGGAATCCGGCGGTACCAAGGACATCACCGGTGGTCt > 1:4259710/1‑150 (MQ=255) cTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCAGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTGGTGACACCCTGGCGCGTATTCCGCAGGAATCCGGCGGTACCAAGGACATCACCGGTGGTCTg < 1:2753919/150‑1 (MQ=255) tGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCAGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTGGTGACACCCTGGCGCGTATTCCGCAGGAATCCGGCGGTACCAAGGACATCACCGGTGGTCTGc < 2:489149/150‑1 (MQ=255) tGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCAGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTGGTGACACCCTGGCGCGTATTCCGCAGGAATCCGGCGGTACCAAGGACATCACCGGTGGTCTGc > 2:522503/1‑150 (MQ=255) gATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCAGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTGGTGACACCCTGGCGCGTATTCCGCAGGAATCCGGCGGTACCAAGGACATCACCGGTGGTCTGcc > 1:1182958/1‑150 (MQ=255) gATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCAGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTGGTGACACCCTGGCGCGTATTCCGCAGGAATCCGGCGGTACCAAGGACATCACCGGTGGTCTGcc > 1:1981122/1‑150 (MQ=255) aTCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCAGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTGGTGACACCCTGGCGCGTATTCCGCAGGAATCCGGCGGTACCAAGGACATCACCGGTGGTCTGCcg < 1:1353217/150‑1 (MQ=255) aTCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCAGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTGGTGACACCCTGGCGCGTATTCCGCAGGAATCCGGCGGTACCAAGGACATCACCGGTGGTCTGCcg > 1:387383/1‑150 (MQ=255) cccAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCAGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTGGTGACACCCTGGCGCGTATTCCGCAGGAATCCGGCGGTACCAAGGACATCACCGGTGGTCTGCcgcg < 2:633828/150‑1 (MQ=255) ccAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCAGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTGGTGACACCCTGGCGCGTATTCCGCAGGAATCCGGCGGTACCAAGGACATCACCGGTGGTCTGCcgcgc > 2:3818389/1‑150 (MQ=255) cAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCAGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTGGTGACACCCTGGCGCGTATTCTGCAGGAATCCGGCGGTACCAAGGACATCACCGGTGGTCTGCcgcgcg > 2:4223960/1‑150 (MQ=255) ggTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCAGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTGGTGACACCCTGGCGCGTATTCCGCAGGAATCCGGCGGTACCAAGGACATCACCGGTGGTCTGCCGCGCGtt > 2:2308278/1‑150 (MQ=255) gTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCAGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTGGTGACACCCTGGCGCGTATTCCGCAGGAATCCGGCGGTACCAAGGACATCACCGGTGGTCTGCCGCGCGTTg < 1:1516072/150‑1 (MQ=255) cGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCAGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTGGTGACACCCTGGCGCGTATTCCGCAGGAATCCGGCGGTACCAAGGACATCACCGGTGGTCTGCCGCGCGTTGCGGa > 1:1832192/1‑150 (MQ=255) gATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCAGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTGGTGACACCCTGGCGCGTATTCCGCAGGAATCCGGCGGTACCAAGGACATCACCGGTGGTCTGCCGCGCGTTGCGGAc < 1:1531123/150‑1 (MQ=255) gATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCAGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTGGTGACACCCTGGCGCGTATTCCGCAGGAATCCGGCGGTACCAAGGACATCACCGGTGGTCTGCCGCGCGTTGCGGAc > 1:3802743/1‑150 (MQ=255) gATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCAGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTGGTGACACCCTGGCGCGTATTCCGCAGGAATCCGGCGGTACCAAGGACATCACCGGTGGTCTGCCGCGCGTTGCGGAc < 1:41828/150‑1 (MQ=255) tatGCCAGCGCAGTACTTCCTGCAGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTGGTGACACCCTGGCGCGTATTCCGCAGGAATCCGGCGGTACCAAGGACATCACCGGTGGTCTGCCGCGCGTTGCGGACCt < 2:691100/150‑1 (MQ=255) atGCCAGCGCAGTACTTCCTGCAGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTGGTGACACCCTGGCGCGTATTCCGCAGGAATCCGGCGGTACCAAGGACATCACCGGTGGTCTGCCGCGCGTTGCGGACCTg < 1:2105354/150‑1 (MQ=255) atGCCAGCGCAGTACTTCCTGCAGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTGGTGACACCCTGGCGCGTATTCCGCAGGAATCCGGCGGTACCAAGGACATCACCGGTGGTCTGCCGCGCGTTGCGGACCTg < 2:4250131/150‑1 (MQ=255) gCCAGCGCAGTACTTCCTGCAGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTGGTGACACCCTGGCGCGTATTCCGCAGGAATCCGGCGGTACCAAGGACATCACCGGTGGTCTGCCGCGCGTTGCGGACCTGtt > 2:2767654/1‑150 (MQ=255) ccAGCGCAGTACTTCCTGCAGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTGGTGACACCCTGGCGCGTATTCCGCAGGAATCCGGCGGTACCAAGGACATCACCGGTGGTCTGCCGCGCGTTGCGGACCTGTTc > 1:2113534/1‑150 (MQ=255) cAGCGCAGTACTTCCTGCAGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTGGTGACACCCTGGCGCGTATTCCGCAGGAATCCGGCGGTACCAAGGACATCACCGGTGGTCTGCCGCGCGTTGCGGACCTGTTCg > 2:2576219/1‑150 (MQ=255) cAGCGCAGTACTTCCTGCAGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTGGTGACACCCTGGCGCGTATTCCGCAGGAATCCGGCGGTACCAAGGACATCACCGGTGGTCTGCCGCGCGTTGCGGACCTGTTCg < 2:1607986/150‑1 (MQ=255) cgcAGTACTTCCTGCAGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTGGTGACACCCTGGCGCGTATTCCGCAGGAATCCGGCGGTACCAAGGACATCACCGGTGGTCTGCCGCGCGTTGCGGACCTGTTCTAAg < 2:1148397/150‑1 (MQ=255) gTACTTCCTGCAGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTGGTGACACCCTGGCGCGTATTCCGCAGGAATCCGGCGGTACCAAGGACATCACCGGTGGTCTGCCGCGCGTTGCGGACCTGTTCGAAGCAcg < 1:3430976/150‑1 (MQ=255) ccTGCAGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTGGTGACACCCTGGCGCGTATTCCGCAGGAATCCGGCGGTACCAAGGACATCACCGGTGGTCTGCCGCGCGTTGCGGACCTGTTCGAAGCACGTCGTcc > 2:3632490/1‑150 (MQ=255) | TGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTGGTGACACCCTGGCGCGTATTCCGCAGGAATCCGGCGGTACCAAGGACATCACCGGTGGTCTGCCGCGCGTTGCGGACCTGTTCGAAGCACGTCGTCC > AP012306/3617720‑3618011 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |