New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | AP012306 | 228787 = | 737 (2.330) | coding (265/771 nt) | yafV | predicted C‑N hydrolase family amidase, NAD(P)‑binding | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 746 total aligned reads displayed.
CGGCAAAATACGCCAGCCGCGCCATTCCACAATCACTCGCGCATTGCCCGCTTTATAATGTAGATGCTCATCTGCCATGCGGAACAGATGACGCTTATCATAAAAATGTACCGTGCCGCCCGGCTCAACCAGCAAAAAGCGGTTAACCGAACCAGACTCCGTTTGTAATGCAACACTGCCTGCAATCAGCGCATTGCACTGCTGCGCCTTAGCTGTCATCCAGTTCACTACGTCATCTTGTGCTAGCGACGAAGCTGCCGCTTCCATGGCAAAGCCGCTGGTAAACATCTCCGGTAGAA > AP012306/228638‑228936 | cGGCAAAATACGCCAGCCGCGCCATTCCACAATCACTCGCGCATTGCCCGCTTTATAATGTAGATGCTCATCTGCCATGCGGAACAGATGACGCTTATCATAAAAATGTACCGTGCCGCCCGGCTCAACCAGCAAAAAGCGGTTAACCGa > 2:3406139/1‑150 (MQ=255) cGGAAAAATCCGCCAGCCGCGTAATTCCGCAATCGCTCGCAAATTGCCTGCTTTATAATGTAGAGGCTCATCTGCCAGGCGGAACAGATGACGCTTATCATAAAAATGTACCGTTCCGCCCGGCTCAACCCGCAAAAAGCGGTTAACCGa < 2:1600111/150‑1 (MQ=255) ggCAAAATACGCCAGCCGCGCCATTCCACAATCACTCGCGCATTGCCCGCTTTATAATGTAGATGCTCATCTGCCATGCGGAACAGATGACGCTTATCATAAAAATGTACCGTGCCGCCCGGCTCAACCAGCAAAAAGCGGTTAACCGaa > 1:2254520/1‑150 (MQ=255) aaaaTACGCCAGCCGCGCCATTCCACAATCACTCGCGCATTGCCCGCTTTATAATGTAGATGCTCATCTGCCATGCGGAACAGATGACGCTTATCATAAAAATGTACCGTGCCGCCCGGCTCAACCAGCAAAAAGCGGTTAACCGAACCa > 1:54740/1‑150 (MQ=255) aaaaTACGCCAGCCGCGCCATTCCACAATCACTCGCGCATTGCCCGCTTTATAATGTAGATGCTCATCTGCCATGCGGAACAGATGACGCTTATCATAAAAATGTACCGTGCCGCCCGGCTCAACCAGCAAAAAGCGGTTAACCGAACCa > 2:1805845/1‑150 (MQ=255) aaaaTACGCCAGCCGCGCCATTCCACAATCACTCGCGCATTGCCCGCTTTATAATGTAGATGCTCATCTGCCATGCGGAACAGATGACGCTTATCATAAAAATGTACCGTGCCGCCCGGCTCAACCAGCAAAAAGCGGTTAACCGAACCa > 2:484179/1‑150 (MQ=255) aaaaTACGCCAGCCGCGCCATTCCACAATCACTCGCGCATTGCCCGCTTTATAATGTAGATGCTCATCTGCCATGCGGAACAGATGACGCTTATCATAAAAATGTACCGTGCCGCCCGGCTCAACCAGCAAAAAGCGGTTAACCGAACCa < 2:2065519/150‑1 (MQ=255) aaaTACGCCAGCCGCGCCATTCCACAATCACTCGCGCATTGCCCGCTTTATAATGTAGATGCTCATCTGCCATGCGGAACAGATGACGCTTATCATAAAAATGTACCGTGCCGCCCGGCTCAACCAGCAAAAAGCGGTTAACCGAACCAg > 2:1882348/1‑150 (MQ=255) aaTACGCCAGCCGCGCCATTCCACAATCACTCGCGCATTGCCCGCTTTATAATGTAGATGCTCATCTGCCATGCGGAACAGATGACGCTTATCATAAAAATGTACCGTGCCGCCCGGCTCAACCAGCAAAAAGCGGTTAACCGAACCAGa < 2:1263044/150‑1 (MQ=255) aaTACGCCAGCCGCGCCATTCCACAATCACTCGCGCATTGCCCGCTTTATAATGTAGATGCTCATCTGCCATGCGGAACAGATGACGCTTATCATAAAAATGTACCGTGCCGCCCGGCTCAACCAGCAAAAAGCGGTTAACCGAACCAGa > 1:3913787/1‑150 (MQ=255) aCGCCAGCCGCGCCATTCCACAATCACTCGCGCATTGCCCGCTTTATAATGTAGATGCTCATCTGCCATGCGGAACAGATGACGCTTATCATAAAAATGTACCGTGCCGCCCGGCTCAACCAGCAAAAAGCGGTTAACCGAACCAGACTc < 2:2561757/150‑1 (MQ=255) cGCCAGCCGCGCCATTCCACAATCACTCGCGCATTGCCCGCTTTATAATGTAGATGCTCATCTGCCATGCGGAACAGATGACGCTTATCATAAAAATGTACCGTGCCGCCCGGCTCAACCAGCAAAAAGCGGTTAACCGAACCAGACTcc < 2:1991240/150‑1 (MQ=255) gCCAGCCGCGCCATTCCACAATCACTCGCGCATTGCCCGCTTTATAATGTAGATGCTCATCTGCCATGCGGAACAGATGACGCTTATCATAAAAATGTACCGTGCCGCCCGGCTCAACCAGCAAAAAGCGGTTAACCGAACCAGACTCCg < 1:2794015/150‑1 (MQ=255) 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aCCGTGCCGCCCGGCTCAACCAGCAAAAAGCGGTTAACCGAACCAGACTCCGTTTGTAATGCAACACTGCCTGCAATCAGCGCATTGCACTGCTGCGCCTTAGCTGTCATCCAGTTCACTACGTCATCTTGTGCTAGCGACGAAGCTGcc < 1:4312287/150‑1 (MQ=255) aCCGTGCCGCCCGGCTCAACCAGCAAAAAGCGGTTAACCGAACCAGACTCCGTTTGTAATGCAACACTGCCTGCAATCAGCGCATTGCACTGCTGCGCCTTAGCTGTCATCCAGTTCACTACGTCATCTTGTGCTAGCGACGAAGCTGcc > 1:1862387/1‑150 (MQ=255) cGTGCCGCCCGGCTCAACCAGCAAAAAGCGGTTAACCGAACCAGACTCCGTTTGTAATGCAACACTGCCTGCAATCAGCGCATTGCACTGCTGCGCCTTAGCTGTCATCCAGTTCACTACGTCATCTTGTGCTAGCGACGAAGCTGCCGc < 2:1287322/150‑1 (MQ=255) gccCGGCTCAACCAGCAAAAAGCGGTTAACCGAACCAGACTCCGTTTGTAATGCAACACTGCCTGCAATCAGCGCATTGCACTGCTGCGCCTTAGCTGTCATCCAGTTCACTACGTCATCTTGTGCTAGCGACGAAGCTGCCGCTTCCAt < 2:1470441/150‑1 (MQ=255) cccGGCTCAACCAGCAAAAAGCGGTTAACCGAACCAGACTCCGTTTGTAATGCAACACTGCCTGCAATCAGCGCATTGCACTGCTGCGCCTTAGCTGTCATCCAGTTCACTACGTCATCTTGTGCTAGCGACGAAGCTGCCGCTTCCATg > 1:4229362/1‑150 (MQ=255) cTCAACCAGCAAAAAGCGGTTAACCGAACCAGACTCCGTTTGTAATGCAACACTGCCTGCAATCAGCGCATTGCACTGCTGCGCCTTAGCTGTCATCCAGTTCACTACGTCATCTTGTGCTAGCGACGAAGCTGCCGCTTCCATGGCaaa > 2:4141770/1‑150 (MQ=255) tCAACCAGCAAAAAGCGGTTAACCGAACCAGACTCCGTTTGTAATGCAACACTGCCTGCAATCAGCGCATTGCACTGCTGCGCCTTAGCTGTCATCCAGTTCACTACGTCATCTTGTGCTAGCGACGAAGCTGCCGCTTCCATGGCAAAg > 2:3347756/1‑150 (MQ=255) cAACCAGCAAAAAGCGGTTAACCGAACCAGACTCCGTTTGTAATGCAACACTGCCTGCAATCAGCGCATTGCACTGCTGCGCCTTAGCTGTCATCCAGTTCACTACGTCATCTTGTGCTAGCGACGAAGCTGCCGCTTCCATGGCAAAGc < 2:2287956/150‑1 (MQ=255) aaCCAGCAAAAAGCGGTTAACCGAACCAGACTCCGTTTGTAATGCAACACTGCCTGCAATCAGCGCATTGCACTGCTGCGCCTTAGCTGTCATCCAGTTCACTACGTCATCTTGTGCTAGCGACGAAGCTGCCGCTTCCATGGCAAAGcc > 1:1122708/1‑150 (MQ=255) aGCAAAAAGCGGTTAACCGAACCAGACTCCGTTTGTAATGCAACACTGCCTGCAATCAGCGCATTGCACTGCTGCGCCTTAGCTGTCATCCAGTTCACTACGTCATCTTGTGCTAGCGACGAAGCTGCCGCTTCCATGGCAAAGCCGCTg > 1:3822977/1‑150 (MQ=255) aGCAAAAAGCGGTTAACCGAACCAGACTCCGTTTGTAATGCAACACTGCCTGCAATCAGCGCATTGCACTGCTGCGCCTTAGCTGTCATCCAGTTCACTACGTCATCTTGTGCTAGCGACGAAGCTGCCGCTTCCATGGCAAAGCCGCTg > 1:1180368/1‑150 (MQ=255) gCAAAAAGCGGTTAACCGAACCAGACTCCGTTTGTAATGCAACACTGCCTGCAATCAGCGCATTGCACTGCTGCGCCTTAGCTGTCATCCAGTTCACTACGTCATCTTGTGCTAGCGACGAAGCTGCCGCTTCCATGGCAAAGCCGCTgg < 1:2042499/150‑1 (MQ=255) cAAAAAGCGGTTAACCGAACCAGACTCCGTTTGTAATGCAACACTGCCTGCAATCAGCGCATTGCACTGCTGCGCCTTAGCTGTCATCCAGTTCACTACGTCATCTTGTGCTAGCGACGAAGCTGCCGCTTCCATGGCAAAGCCGCTGGt < 1:659008/150‑1 (MQ=255) aaaaaGCGGTTAACCGAACCAGACTCCGTTTGTAATGCAACACTGCCTGCAATCAGCGCATTGCACTGCTGCGCCTTAGCTGTCATCCAGTTCACTACGTCATCTTGTGCTAGCGACGAAGCTGCCGCTTCCATGGCAAAGCCGCTGGTa > 2:566502/1‑150 (MQ=255) aaaaGCGGTTAACCGAACCAGACTCCGTTTGTAATGCAACACTGCCTGCAATCAGCGCATTGCACTGCTGCGCCTTAGCTGTCATCCAGTTCACTACGTCATCTTGTGCTAGCGACGAAGCTGCCGCTTCCATGGCAAAGCCGCTGGTaa < 2:1089012/150‑1 (MQ=255) aaaGCGGTTAACCGAACCAGACTCCGTTTGTAATGCAACACTGCCTGCAATCAGCGCATTGCACTGCTGCGCCTTAGCTGTCATCCAGTTCACTACGTCATCTTGTGCTAGCGACGAAGCTGCCGCTTCCATGGCAAAGCCGCTGGTaaa < 2:360919/150‑1 (MQ=255) aaGCGGTTAACCGAACCAGACTCCGTTTGTAATGCAACACTGCCTGCAATCAGCGCATTGCACTGCTGCGCCTTAGCTGTCATCCAGTTCACTACGTCATCTTGTGCTAGCGACGAAGCTGCCGCTTCCATGGCAAAGCCGCTGGTAAAc > 2:1020385/1‑150 (MQ=255) aGCGGTTAACCGAACCAGACTCCGTTTGTAATGCAACACTGCCTGCAATCAGCGCATTGCACTGCTGCGCCTTAGCTGTCATCCAGTTCACTACGTCATCTTGTGCTAGCGACGAAGCTGCCGCTTCCATGGCAAAGCCGCTGGTAAACa > 2:4513521/1‑150 (MQ=255) gCGGTTAACCGAACCAGACTCCGTTTGTAATGCAACACTGCCTGCAATCAGCGCATTGCACTGCTGCGCCTTAGCTGTCATCCAGTTCACTACGTCATCTTGTGCTAGCGACGAAGCTGCCGCTTCCATGGCAAAGCCGCTGGTAAACAt < 2:737210/150‑1 (MQ=255) aaCCAGACTCCGTTTGTAATGCAACACTGCCTGCAATCAGCGCATTGCACTGCTGCGCCTTAGCTGTCATCCAGTTCACTACGTCATCTTGTGCTAGCGACGAAGCTGCCGCTTCCATGGCAAAGCCGCTGGTAAACATCTCCGGTAGaa > 1:3140788/1‑150 (MQ=255) aaCCAGACTCCGTTTGTAATGCAACACTGCCTGCAATCAGCGCATTGCACTGCTGCGCCTTAGCTGTCATCCAGTTCACTACGTCATCTTGTGCTAGCGACGAAGCTGCCGCTTCCATGGCAAAGCCGCTGGTAAACATCTCCGGTAGaa < 2:2781929/150‑1 (MQ=255) aaCCAGACTCCGTTTGTAATGCAACACTGCCTGCAATCAGCGCATTGCACTGCTGCGCCTTAGCTGTCATCCAGTTCACTACGTCATCTTGTGCTAGCGAAGAAGCTGCCGCTTCCATGGCAAAGCCGCTGGTAAACATCTCCGGTAGaa < 1:1458410/150‑1 (MQ=255) | CGGCAAAATACGCCAGCCGCGCCATTCCACAATCACTCGCGCATTGCCCGCTTTATAATGTAGATGCTCATCTGCCATGCGGAACAGATGACGCTTATCATAAAAATGTACCGTGCCGCCCGGCTCAACCAGCAAAAAGCGGTTAACCGAACCAGACTCCGTTTGTAATGCAACACTGCCTGCAATCAGCGCATTGCACTGCTGCGCCTTAGCTGTCATCCAGTTCACTACGTCATCTTGTGCTAGCGACGAAGCTGCCGCTTCCATGGCAAAGCCGCTGGTAAACATCTCCGGTAGAA > AP012306/228638‑228936 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |