Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | AP012306 | 1,226,557 | 0 | A | G | 29.4% | 358.0 / 86.2 | 180 | G55G (GGA→GGG) | ydcU | predicted spermidine/putrescine transporter subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (16/111); new base G (53/0); total (69/111) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.23e-31 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 209 total aligned reads displayed.
GCAATCACCTTCACGTCCAGGTCTGGGTAAGGTGTCCGGTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCA‑GGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCGGAACTGACGCTGGCGAATATCCGTGCGCTGTTTAATCCGGCGAATTACGACATCATTCTCCGCACGCTGACTATGGCTGTGGCAGTCACTATCGCCAGCGCCATTCTGGC > AP012306/1226410‑1226706 | gCAATCACCTTCACGTCCAGGTCTGGGTAAGGTGTCCGGTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCA‑GGGAtt < 2:1894390/150‑1 (MQ=255) cAATCACCTTCACGTCCAGGTCTGGGTAAGGTGTCCGGTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCA‑GGGGttt > 2:548268/1‑150 (MQ=255) cAATCACCTTCACGTCCAGGTCTGGGTAAGGTGTCCGGTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCA‑GGGAttt < 1:3200709/150‑1 (MQ=255) aTCACCTTCACGTCCAGGTCTGGGTAAGGTGTCCGGTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCA‑GGGAttttt > 1:5217/1‑149 (MQ=255) aTCACCTTCACGTCCAGGTCTGGGTAAGGTGTCCGGTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCA‑GGGATTTta < 2:3033177/150‑1 (MQ=255) cACCTTCACGTCCAGGTCTGGGTAAGGTGTCCGGTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCA‑GGGGttttttt > 2:3124/1‑147 (MQ=255) ccTTCACGTCCAGGTCTGGGTAAGGTGTCCGGTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCA‑GGGATTTTATACt < 1:3708726/150‑1 (MQ=255) cTTCACGTCCAGGTCTGGGTAAGGTGTCCGGTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCA‑GGGGTTTTTTAAtt > 1:2605737/1‑150 (MQ=255) tCACGTCCAGGTCTGGGTAAGGTGTCCGGTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCA‑GGGGTTTTTTACtttt > 1:1068883/1‑150 (MQ=255) cACGTCCAGGTCTGGGTAAGGTGTCCGGTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCA‑GGGATTTTTTAAttttt > 1:3395840/1‑149 (MQ=255) cACGTCCAGGTCTGGGTAAGGTGTCCGGTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCA‑GGGATTTTATACTTTTg < 2:3625423/150‑1 (MQ=255) cACGTCCAGGTCTGGGTAAGGTGTCCGGTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCA‑GGGATTTTATACTTTTg < 1:2169644/150‑1 (MQ=255) aCGTCCAGGTCTGGGTAAGGTGTCCGGTTTCTTCTGGCATAATCCTGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCA‑GGGATTTTATACTTTTGa < 2:2051393/150‑1 (MQ=255) aCGTCCAGGTCTGGGTAAGGTGTCCGGTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCA‑GGGGGTTTTTACtttttt > 2:4490960/1‑148 (MQ=255) cGTCCAGGTCTGGGTAAGGTGTCCGGTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCA‑GGGATTTTATACTTTTGAc < 2:1839135/150‑1 (MQ=255) gTCCAGGTCTGGGTAAGGTGTCCGGTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCA‑GGGATTTTATACTTTTGACg < 1:376813/150‑1 (MQ=255) tCCAGGTCTGGGTAAGGTGTCCGGTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTTCTGCTGCTTGTCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACGCTGTTATGGCC‑GGGATTTTATACTTTTGACGa < 2:3482959/150‑1 (MQ=255) tCCAGGTCTGGGTAAGGTGTCCGGTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCA‑GGGGTTTTTTTCttttttcga > 2:675026/1‑145 (MQ=255) tCCAGGTCTGGGTAAGGTGTCCGGTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCA‑GGGGCTTTATTCttttttcgg > 2:2665876/1‑145 (MQ=255) cAGGTCTGGGTAAGGTGTCCGGTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCA‑GGGATTTTATACTTTTGACGAtt < 1:1909367/150‑1 (MQ=255) aGGTCTGGGTAAGGTGTCCGGTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCA‑GGGATTTTATACTTTTGACGAttt < 2:4530425/150‑1 (MQ=255) ggTCTGGGTAAGGTGTCCGGTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCA‑GGGGGTTTTTTCTTTTTACGAtttt > 2:336896/1‑149 (MQ=255) gTCTGGGTAAGGTGTCCGGTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCA‑GGGATTTTATACTTTTGACGATTTCa < 1:1645988/150‑1 (MQ=255) gTCTGGGGAAGGGGTCCGGTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCGGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGGTGACGCTGTTATGGCA‑GGGGTTTTATTATTTTGTCGAtttta > 2:776987/1‑148 (MQ=255) tCTGGGTAAGGTGTCCGGTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCA‑GGGGGTTTTTACTTTTTTCGATTTTAc > 2:4085480/1‑150 (MQ=255) cTGGGTAAGGTGTCCGGTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCA‑GGGGTTTTTTTCTTTTTACGGTTTTAcc > 2:4126403/1‑150 (MQ=255) cTGGGTAAGGTGTCCGGTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCA‑GGGAGTTTATACTTTTGACGATTTCAcc > 1:3037607/1‑150 (MQ=255) tGGGTAAGGTGTCCGGTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCA‑GGGGTTTTTTACTTTTTACGATTTCACCa > 1:1788151/1‑150 (MQ=255) tGGGTAAGGTGTCCGGTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCA‑GGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCa < 1:1235880/150‑1 (MQ=255) ggTAAGGTGTCCGGTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCA‑GGGGTTTTTTACTTTTTTCGATTTTACCATg > 2:2120444/1‑150 (MQ=255) tAAGGTGTCCGGTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCA‑GGGGTTTTATAATTTTTACGATTTTACCATGTc > 1:4461913/1‑150 (MQ=255) aGGTGTCCGGTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCA‑GGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCgg < 2:1183604/150‑1 (MQ=255) gtgtCCGGTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCA‑GGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTa < 1:605688/150‑1 (MQ=255) 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tAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCA‑GGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCGGAACTGACGCTGGc < 1:2730980/150‑1 (MQ=255) aaTCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCA‑GGGGTTTTTTTCTTTTTTCGATTTTACCCTTTCGGTAAAGCCGGGACTGACGcctgcg > 2:1769232/1‑145 (MQ=255) aaTCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCA‑GGGGTTTTTTACTTTTTTCGATTTTACCCTGTCGGTAACGCCGGGACTGTCGCTGGCg > 2:2475987/1‑150 (MQ=255) ggggctggggctGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCA‑GGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCGGAACTGACGCTGGCGAatat < 1:625401/150‑1 (MQ=255) ctggggctgTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCA‑GGGGTTTTATACTTTTTACGATTTTACCATGTCGGTAACGCCCGAACTGACGCTGGCGAATATTCGt > 1:2788065/1‑150 (MQ=255) ctggggctgTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCA‑GGGGTTTTATACTTTTTACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCGGAACTGACGCTGGCGAATATCCGt > 1:3144271/1‑150 (MQ=255) ctggggctgTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCA‑GGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCGGAACTGACGCTGGCGAATATCCGt < 1:1448546/150‑1 (MQ=255) ctggggctgTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCA‑GGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCGGAACTGACGCTGGCGAATATCCGt < 1:2881138/150‑1 (MQ=255) tggggctgTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCA‑GGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCGGAACTGACGCTGGCGAATATCCGTg < 1:249688/150‑1 (MQ=255) tggggctgTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCA‑GGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCGGAACTGACGCTGGCGAATATCCGTg < 2:1586585/150‑1 (MQ=255) ggggctgTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCA‑GGGGGTTTATAGTTTTGACGATTTTACCATGGCGGGAAAGACGGGACAGAGGCTGGGGAataagcgggc > 2:750900/1‑143 (MQ=255) gctgTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCA‑GGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCGGAACTGACGCTGGCGAATATCCGTGCGCt < 1:152510/150‑1 (MQ=255) ctttttttGCTTCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCA‑GGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCGGAACTGACGCTGGCGAATATCCGTGCGCTg < 2:1118420/147‑1 (MQ=255) ctgTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCA‑GGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCGGAACTGACGCTGGCGAATATCCGTGCGCTg < 2:852514/150‑1 (MQ=255) gTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCA‑GGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCGGAACTGACGCTGGCGAATATCCGTGCGCTGtt < 2:1878653/150‑1 (MQ=255) 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tCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCA‑GGGGTTTTTTACTTTTTACGATTTTACCATGTCGGGAACGCCGGAACTGACGCTGGCGAATATCCGTGCGCTGTTTTATCCGGCGAATTACGACATCATTCTCCCCCCGCCGACTa > 2:3731547/1‑150 (MQ=255) tCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCA‑GGGATTTTTTACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCGGAACTGACGCTGGCGAATATCCGTGCGCTGTTTAATCCGGCGAATTACGACATCATTCTCCGCACGCTGACTa > 1:323422/1‑150 (MQ=255) tCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCA‑GGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCGGAACTGACGCTGGCGAATATCCGTGCGCTGTTTAATCCGGCGAATTACGACATCATTCTCCGCACGCTGACTa < 2:1167193/150‑1 (MQ=255) tCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCA‑GGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCGGAACTGACGCTGGCGAATATCCGTGCGCTGTTTAATCCGGCGAATTACGACATCATTCTCCGCACGCTGACTa < 1:2272447/150‑1 (MQ=255) tATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCA‑GGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCGGAACTGACGCTGGCGAATATCCGTGCGCTGTTTAATCCGGCGAATTACGACATCATTCTCCGCACGCTGACTATg < 2:1022052/150‑1 (MQ=255) aTTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCA‑GGGGTTTTTTACTTTTTTCGATTTTACCCTGTCGGTAACGCCGGGACTGACGCTGGGGAATATTCCTGCGCTGTTTTATCCGGCGAATTACGACATCATTCTCCGCCCGCTGGCTAttg > 2:278036/1‑148 (MQ=255) tttCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCA‑GGGGTTTTTTACTTTTTTCGATTTTACCCTGTCGGTAAAGCCCGGAATGACGCCGGGGAATATCCGCTGGCCGTTTTATTCGGCGAAATAAGGCATTATTCTCCGCCCCCTGACTATGGc > 2:2112945/1‑150 (MQ=255) ttCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCA‑GGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCGGAACTGACGCTGGCGAATATCCGTGCGCTGTTTAATCCGGCGAATTACGACATCATTCTCCGCACGCTGACTATGGCt < 1:2335838/150‑1 (MQ=255) cGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCA‑GGGGTTTTTTACTTTTTACGATTTTACCCTGTCGGTAACGCCCGGACTGACGCTGGGGAATATCCGTGCGCTGTTTTATCCCGCGAAATACGACATCATTTTCCGCCCGCTGACTATGGCtgt > 2:3522025/1‑150 (MQ=255) cTCGCTGCTGACACTGTTATGGCA‑GGGGTTTTTTACTTTTTTCGGTTTCACCATGTCGGGAACGCCGGAACTTACGCTGGGGGATATCCGTGCGCTGTTTAATCCGGCGAATTACGACATCATTCTCCGCACGCTGCCTATTGCTGTGGc > 2:1387919/1‑150 (MQ=255) cGCTGCTGACACTGTTATGGCA‑GGGATTTTTTACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCGGAACTGACGCTGGCGAATATCCGTGCGCTGTTTAATCCGGCGAATTACGACATCATTCTCCGCACGCTGACTATGGCTGTGGCAg > 1:3294437/1‑150 (MQ=255) gACACTGTTATGGCA‑GGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCGGAACTGACGCTGGCGAATATCCGTGCGCTGTTTAATCCGGCGAATTACGACATCATTCTCCGCACGCTGACTATGGCTGTGGCAGTCACTAt < 1:4042971/150‑1 (MQ=255) gACACTGTTATGGCA‑GGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCGGAACTGACGCTGGCGAATATCCGTGCGCTGTTTAATCCGGCGAATTACGACATCATTCTCCGCACGCTGACTATGGCTGTGGCAGTCACTAt < 1:2599181/150‑1 (MQ=255) gACACTGTTATGGCA‑GGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCGGAACTGACGCTGGCGAATATCCGTGCGCTGTTTAATCCGGCGAATTACGACATCATTCTCCGCACGCTGACTATGGCTGTGGCAGTCACTAt < 1:1395856/150‑1 (MQ=255) acTGTTATGGCA‑GGGGTTTTATACTTTTTACGATTTTACCCTGTCGGTAACGCCGGAACTGACGCTGGCGAATATCCGTGCGCTGTTTTATCCGGCGAATTACGACATCATTCTCCGCACGCTGACTATGGCTGTGGCAGGCACTATCGc > 2:1509615/1‑150 (MQ=255) cTGTTATGGCA‑GGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCGGAACTGACGCTGGCGAATATCCGTGCGCTGTTTAATCCGGCGAATTACGACATCATTCTCCGCACGCTGACTATGGCTGTGGCAGTCACTATCGcc < 1:1627495/150‑1 (MQ=255) tATGGCA‑GGGGTTTTTTACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCGGGACTGACGCTGGCGAATATCCGTGCGCTGTTTTATCCGGCGAATTACGACATCATTTTCCGCACCCTGACTATGGCGGGGGCAGTCACTATCACCcgcg > 2:2734091/1‑150 (MQ=255) aTGGCA‑GGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCGGAACTGACGCTGGCGAATATCCGTGCGCTGTTTAATCCGGCGAATTACGACATCATTCTCCGCACGCTGACTATGGCTGTGGCAGTCACTATCGCCAgcgc < 2:2361552/150‑1 (MQ=255) tGGCA‑GGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCGGAACTGACGCTGGCGAATATCCGTGCGCTGTTTAATCCGGCGAATTACGACATCATTCTCCGCACGCTGACTATGGCTGTGGCAGTCACTATCGCCAGCGcc < 1:821966/150‑1 (MQ=255) tGGCA‑GGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCGGAACTGACGCTGGCGAATATCCGTGCGCTGTTTAATCCGGCGAATTACGACATCATTCTCCGCACGCTGACTATGGCTGTGGCAGTCACTATCGCCAGCGcc > 1:3867151/1‑150 (MQ=255) cA‑GGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCGGAACTGACGCTGGCGAATATCCGTGCGCTGTTTAATCCGGCGAATTACGACATCATTCTCCGCACGCTGACTATGGCTGTGGCAGTCACTATCGCCAGCGCCAtt > 1:11846/1‑150 (MQ=255) ggATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCGGAACTGACGCTGGCGAATATCCGTGCGCTGTTTAATCCGGCGAATTACGACATCATTCTCCGCACGCTGACTATGGCTGTGGCAGTCACTATCGCCAGCGCCATTCTg > 1:4435391/1‑150 (MQ=255) | GCAATCACCTTCACGTCCAGGTCTGGGTAAGGTGTCCGGTTTCTTCTGGCATAATCCGGGGCTGGGGCTGTTTTTACTGCTGCTTGGCCCGCTAATGTGGTTTGGCATTGTCTATTTCGGCTCGCTGCTGACACTGTTATGGCA‑GGGATTTTATACTTTTGACGATTTCACCATGTCGGTAACGCCGGAACTGACGCTGGCGAATATCCGTGCGCTGTTTAATCCGGCGAATTACGACATCATTCTCCGCACGCTGACTATGGCTGTGGCAGTCACTATCGCCAGCGCCATTCTGGC > AP012306/1226410‑1226706 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |