New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | AP012306 | = 215364 | NA (NA) | 10 (0.030) | 10/288 | 17.0 | NA | noncoding (745/2905 nt) | rrlH | 23S ribosomal RNA (rrlH) |
? | AP012306 | = 215372 | NA (NA) | noncoding (753/2905 nt) | rrlH | 23S ribosomal RNA (rrlH) | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. |
Only 100 of 182 total aligned reads displayed.
TATTCTGTAGCAAGGTTAACCGAATAGGGGAGCCGAAGGGAAACCGAGTCTTAACTGGGCGTTAAGTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCCGGTGATCTAGCCATGGGCAGGTTGAAGGTTGGGTAACACTAACTGGAGGACCGAACCGACTAAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AP012306/215211‑215364 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ctaatTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCCAACCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAACGCCCAGTTAAGACTCGGTTTCCCTTCGGCTCCCCTATTCGGTTAACC < AP012306/215372‑215224 TATTCTGTAGCAAGGTTAACCGAATAGGGGAGCCGAAGGGAAACCGAGTCTTAACTGGGCGTTAAGTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCCGGTGATCTAGCCATGGGCAGGTTGAAGGTTGGGTAACACTAACTGGAGGACCGAACCGAC > 2:1208925/1‑150 TATTCTGTAGCAAGGTTAACCGAATAGGGGAGCCGAAGGGAAACCGAGTCTTAACTGGGCGTTAAGTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCCGGTGATCTAGCCATGGGCAGGTTGAAGGTTGGGTAACACTAACTGGAGGACCGAACCGAC > 1:1074817/1‑150 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2:3523802/150‑1 TTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCCAACCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAACGCCCAGTTAAGACTCGGTTTCCCTTCGGCTCCCCTATTCGGTTAACC > 1:3596855/1‑150 TTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCCAACCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAACGCCCAGTTAAGACTCGGTTTCCCTTCGGCTCCCCTATTCGGTTAACC < 2:2711988/150‑1 TTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCCAACCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAACGCCCAGTTAAGACTCGGTTTCCCTTCGGCTCCCCTATTCGGTTAACC > 1:6946/1‑150 TTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCCAACCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAACGCCCAGTTAAGACTCGGTTTCCCTTCGGCTCCCCTATTCGGTTAACC > 2:1366571/1‑150 TATTCTGTAGCAAGGTTAACCGAATAGGGGAGCCGAAGGGAAACCGAGTCTTAACTGGGCGTTAAGTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCCGGTGATCTAGCCATGGGCAGGTTGAAGGTTGGGTAACACTAACTGGAGGACCGAACCGACTAAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AP012306/215211‑215364 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ctaatTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCCAACCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAACGCCCAGTTAAGACTCGGTTTCCCTTCGGCTCCCCTATTCGGTTAACC < AP012306/215372‑215224 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |