New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AP012306 | = 1092512 | 416 (1.340) | 17 (0.060) | 14/258 | 14.6 | 5.0% | intergenic (+100/+3) | ychS/tpr | predicted protein/predicted protamine‑like protein |
? | AP012306 | 1092985 = | 289 (1.080) | noncoding (66/85 nt) | tyrT | tRNA‑Tyr | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 356 total aligned reads displayed.
GGGCCGTTGCCTGTGGCAACGTTCTCTCGCTTTCGCTCGAATCGAACCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCTCCCTTATCGGGAAGCGGGGCGCATCATATCAAATGACGCGCCGCTGTAAAGTGTTA > AP012306/1092836‑1093134 | gggCCGTTGCCTGTGGCAACGTTCTCTCGCTTTCGCTCGAATCGAACCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTc < 1:1396379/150‑1 (MQ=255) gggCCGTTGCCTGTGGCAACGTTCTCTCGCTTTCGCTCGAATCGAACCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTc < 2:3107673/150‑1 (MQ=255) gTTGCCTGTGGCAACGTTCTCTCGCTTTCGCTCGAATCGAACCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAAcc > 1:1955445/1‑150 (MQ=255) tGCCTGTGGCAACGTTCTCTCGCTTTCGCTCGAATCGAACCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCtt < 1:1294032/150‑1 (MQ=255) tGCCTGTGGCAACGTTCTCTCGCTTTCGCTCGAATCGAACCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCtt < 1:1614593/150‑1 (MQ=255) ccTGTGGCAACGTTCTCTCGCTGTCGCTCGAATCGAACCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTACAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCg < 2:697249/150‑1 (MQ=255) cTGTGGCAACGTTCTCTCGCTTTCGCTCGAATCGAACCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGa < 1:1671659/150‑1 (MQ=255) gtgGCAACGTTCTCTCGCTTTCGCTCGAATCGAACCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAg > 1:3160721/1‑150 (MQ=255) tgGCAACGTTCTCTCGCTTTCGCTCGAATCGAACCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGt > 1:2543433/1‑150 (MQ=255) ggCAACGTTCTCTCGCTTTCGCTCGAATCGAACCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTc > 2:2490433/1‑150 (MQ=255) aCGTTCTCTCGCTTTCGCTCGAATCGAACCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATg < 1:1025743/150‑1 (MQ=255) cGTTCTCTCGCTTTCGCTCGAATCGAACCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGa > 1:480190/1‑150 (MQ=255) cGTTCTCTCGCTTTCGCTCGAATCGAACCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGa < 1:1860602/150‑1 (MQ=255) cGTTCTCTCGCTTTCGCTCGAATCGAACCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGa < 2:3982006/150‑1 (MQ=255) gTTCTCTCGCTTTCGCTCGAATCGAACCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGAc < 2:2843673/150‑1 (MQ=255) gTTCTCTCGCTTTCGCTCGAATCGAACCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGAc > 1:134056/1‑150 (MQ=255) ttCTCTCGCTTTCGCTCGAATCGAACCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACg < 1:4004112/150‑1 (MQ=255) tctcGCTTTCGCTCGAATCGAACCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCa > 2:2228945/1‑150 (MQ=255) ctcGCTTTCGCTCGAATCGAACCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAg > 2:2293046/1‑150 (MQ=255) tcGCTTTCGCTCGAATCGAACCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGa < 1:3664567/150‑1 (MQ=255) gCTTTCGCTCGAATCGAACCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGAtt > 2:1888823/1‑150 (MQ=255) ttCGCTCGAATCGAACCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTAc < 2:3677502/150‑1 (MQ=255) acGCTCGAGTCGAACCGTAGACGAAGCTTCTCCTCCTCCCCCGATGAGTGCAAACTGTCACAATCTCCCCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACa < 2:1052664/149‑1 (MQ=37) cTCGAATCGAACCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTc > 2:1423214/1‑150 (MQ=255) cgaatcgaaCCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTg > 2:4057051/1‑150 (MQ=255) aatcgaaCCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCt > 1:1817690/1‑150 (MQ=255) aatcgaaCCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCt > 2:3412229/1‑150 (MQ=255) atcgaaCCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTc > 1:766149/1‑150 (MQ=255) atcgaaCCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTc > 1:2714842/1‑150 (MQ=255) tcgaaCCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACAGCAGATTTACAGTCTGCTcc > 2:299893/1‑150 (MQ=255) gaaCCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCt > 2:2414545/1‑150 (MQ=255) gaaCCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCt > 2:2063189/1‑150 (MQ=255) gaaCCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCt < 1:363105/150‑1 (MQ=255) aaCCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCtt < 2:1132635/150‑1 (MQ=255) aaCCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCtt > 1:1966799/1‑150 (MQ=255) aaCCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCtt < 1:4124157/150‑1 (MQ=255) aCCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCttt < 1:3053872/150‑1 (MQ=255) aCCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCttt < 1:547698/150‑1 (MQ=255) ccTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTg < 1:3186122/150‑1 (MQ=255) ccTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGGGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTg > 2:1477901/1‑150 (MQ=255) ttAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGc < 1:3951458/150‑1 (MQ=255) ttAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGc > 2:3650078/1‑150 (MQ=255) tAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGcc > 2:1771771/1‑150 (MQ=255) gAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCg < 1:2731307/150‑1 (MQ=255) gAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCg > 1:2895185/1‑150 (MQ=255) aGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCggg < 1:3735352/150‑1 (MQ=255) ttCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAAc > 2:1025921/1‑150 (MQ=255) ttCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAAc > 1:3788126/1‑150 (MQ=255) aCCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCccac < 1:1560050/150‑1 (MQ=255) cccTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCccacc > 1:3588920/1‑150 (MQ=255) cccTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCccacc < 1:3300975/150‑1 (MQ=255) cccTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCACTTTGGCCGCTCGGGAACCccacc < 1:3824325/150‑1 (MQ=255) tCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACgg > 1:3464333/1‑150 (MQ=255) tGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCttt > 2:3234476/1‑150 (MQ=255) tGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCttt > 2:809372/1‑150 (MQ=255) tttCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTgg < 1:2224147/150‑1 (MQ=255) tCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGcc > 2:3025389/1‑150 (MQ=255) tccagctcACCGAAGTTACCCCATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTg < 2:2553616/145‑1 (MQ=255) 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gtgAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCTCCCTTATCGGGAAGCGGGGCGCATCatat < 2:1340280/150‑1 (MQ=255) aaagtgaTGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCTCCCTTATCGGGAAGCGGGGCGCATCATATc < 2:572392/144‑1 (MQ=255) aaTTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCTCCCTTATCGGGAAGCGGGGCGCATCATATCaa > 1:1072869/1‑150 (MQ=255) ttATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCTCCCTTATCGGGAAGCGGGGCGCATCATATCAAAt > 1:2130448/1‑150 (MQ=255) ttATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCTCCCTTATCGGGAAGCGGGGCGCATCATATCAAAt < 2:3179940/150‑1 (MQ=255) ggtggtggGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCTCCCTTATCGGGAAGCGGGGCGCATCATATCAAATGAcg < 1:2780311/150‑1 (MQ=255) tggtggGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCTCCCTTATCGGGAAGCGGGGCGCATCATATCAAATGAcgcg > 1:1199230/1‑150 (MQ=255) ggtggGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCTCCCTTATCGGGAAGCGGGGCGCATCATATCAAATGACgcgc < 2:2704675/150‑1 (MQ=255) ggtggGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCTCCCTTATCGGGAAGCGGGGCGCATCATATCAAATGACgcgc > 2:443328/1‑150 (MQ=255) ggggAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCTCCCTTATCGGGAAGCGGGGCGCATCATATCAAATGACGCGCCGCt > 1:3016235/1‑150 (MQ=255) ggAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCTCCCTTATCGGGAAGCGGGGCGCATCATATCAAATGACGCGCCGCTGt < 2:331152/150‑1 (MQ=255) ggAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCTCCCTTATCGGGAAGCGGGGCGCATCATATCAAATGACGCGCCGCTGt < 2:1688621/150‑1 (MQ=255) gAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCTCCCTTATCGGGAAGCGGGGCGCATCATATCAAATGACGCGCCGCTGTa > 2:2881256/1‑150 (MQ=255) gAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCTCCCTTATCGGGAAGCGGGGCGCATCATATCAAATGACGCGCCGCTGTa < 1:649930/150‑1 (MQ=255) aaGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCTCCCTTATCGGGAAGCGGGGCGCATCATATCAAATGACGCGCCGCTGTaa < 1:3140129/150‑1 (MQ=255) aGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCTCCCTTATCGGGAAGCGGGGCGCATCATATCAAATGACGCGCCGCTGTaaa < 2:3876746/150‑1 (MQ=255) ggATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCTCCCTTATCGGGAAGCGGGGCGCATCATATCAAATGACGCGCCGCTGTAAAg < 1:876656/150‑1 (MQ=255) ggATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCTCCCTTATCGGGAAGCGGGGCGCATCATATCAAATGACGCGCCGCTGTAAAg > 1:4052055/1‑150 (MQ=255) ggATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCTCCCTTATCGGGAAGCGGGGCGCATCATATCAAATGACGCGCCGCTGTAAAg < 1:687386/150‑1 (MQ=255) ggATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCTCCCTTATCGGGAAGCGGGGCGCATCATATCAAATGACGCGCCGCTGTAAAg < 2:76916/150‑1 (MQ=255) aTTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCTCCCTTATCGGGAAGCGGGGCGCATCATATCAAATGACGCGCCGCTGTAAAgtg > 1:709362/1‑150 (MQ=255) ttCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCTCCCTTATCGGGAAGCGGGGCGCATCATATCAAATGACGCGCCGCTGTAAAgtgt < 1:3094011/150‑1 (MQ=255) | GGGCCGTTGCCTGTGGCAACGTTCTCTCGCTTTCGCTCGAATCGAACCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCTCCCTTATCGGGAAGCGGGGCGCATCATATCAAATGACGCGCCGCTGTAAAGTGTTA > AP012306/1092836‑1093134 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |