New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AP012306 | = 3503491 | 311 (1.050) | 7 (0.020) | 7/298 | 22.3 | 2.2% | coding (540/897 nt) | yihV | predicted sugar kinase |
? | AP012306 | = 3503507 | 326 (1.100) | coding (556/897 nt) | yihV | predicted sugar kinase | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 311 total aligned reads displayed.
ATGTTGTGCTGGCAGATGTACGCTGGCACGACGGCGCTAAAAAAGCCTTCACCCTGGCCCGTCAGGCGGGTGTGATGACCGTTCTGGACGGGGACATTACGCCGCAGGATATCAGTGAGCTGGTGGCATTAAGCGATCACGCGGCCTTTTCAGAACCGGGTCTGGCGCGCTTAACGGGCGTGAAAGAGATGGCCAGTGCGCTAAAACAGGCACAAACGCTCACAAATGGTCATGTCTATGTGACCCAGGGTAGCGCAGGCTGCGACTGGCTGGAAAATGGTGGGCGTCAGCATCAACC > AP012306/3503343‑3503640 | tgttgtGCTGGCAGATGTACGCTGGCACGACGGCGCTAAAAAAGCCTTCACCCTGGCCCGTCAGGCGGGTGTGATGACCGTTCTGGACGGGGACATTACGCCGCAGGATATCAGTGAGCTGGTGGCATTAAGCGATCACGCGGCCTTTTc > 1:3352561/1‑150 (MQ=255) tgttgtGCTGGCAGATGTACGCTGGCACGACGGCGCTAAAAAAGCCTTCACCCTGGCCCGTCAGGCGGGTGTGATGACCGTTCTGGACGGGGACATTACGCCGCAGGATATCAGTGAGCTGGTGGCATTAAGCGATCACGCGGCCTTTTc > 1:1285047/1‑150 (MQ=255) gttgtGCTGGCAGATGTACGCTGGCACGACGGCGCTAAAAAAGCCTTCACCCTGGCCCGTCAGGCGGGTGTGATGACCGTTCTGGACGGGGACATTACGCCGCAGGATATCAGTGAGCTGGTGGCATTAAGCGATCACGCGGCCTTTTCa < 2:1496153/150‑1 (MQ=255) gCTGGCAGATGTACGCTGGCACGACGGCGCTAAAAAAGCCTTCACCCTGGCCCGTCAGGCGGGTGTGATGACCGTTCTGGACGGGGACATTACGCCGCAGGATATCAGTGAGCTGGTGGCATTAAGCGATCACGCGGCCTTTTCAGAAcc > 2:1576135/1‑150 (MQ=255) gCAGATGTACGCTGGCACGACGGCGCTAAAAAAGCCTTCACCCTGGCCCGTCAGGCGGGTGTGATGACCGTTCTGGACGGGGACATTACGCCGCAGGATATCAGTGAGCTGGTGGCATTAAGCGATCACGCGGCCTTTTCAGAACCGGGt > 1:1632532/1‑150 (MQ=255) cAGATGTACGCTGGCACGACGGCGCTAAAAAAGCCTTCACCCTGGCCCGTCAGGCGGGTGTGATGACCGTTCTGGACGGGGACATTACGCCGCAGGATATCAGTGAGCTGGTGGCATTAAGCGATCACGCGGCCTTTTCAGAACCGGGTc > 1:1045082/1‑150 (MQ=255) gATGTACGCTGGCACGACGGCGCTAAAAAAGCCTTCACCCTGGCCCGTCAGGCGGGTGTGATGACCGTTCTGGACGGGGACATTACGCCGCAGGATATCAGTGAGCTGGTGGCATTAAGCGATCACGCGGCCTTTTCAGAACCGGGTCTg < 2:17757/150‑1 (MQ=255) tGTACGCTGGCACGACGGCGCTAAAAAAGCCTTCACCCTGGCCCGTCAGGCGGGTGTGATGACCGTTCTGGACGGGGACATTACGCCGCAGGATATCAGTGAGCTGGTGGCATTAAGCGATCACGCGGCCTTTTCAGAACCGGGTCTGgc > 1:845518/1‑150 (MQ=255) gTACGCTGGCACGACGGCGCTAAAAAAGCCTTCACCCTGGCCCGTCAGGCGGGTGTGATGACCGTTCTGGACGGGGACATTACGCCGCAGGATATCAGTGAGCTGGTGGCATTAAGCGATCACGCGGCCTTTTCAGAACCGGGTCTGgcg > 2:2916386/1‑150 (MQ=255) aCGCTGGCACGACGGCGCTAAAAAAGCCTTCACCCTGGCCCGTCAGGCGGGTGTGATGACCGTTCTGGACGGGGACATTACGCCGCAGGATATCAGTGAGCTGGTGGCATTAAGCGATCACGCGGCCTTTTCAGAACCGGGTCTGgcgcg < 2:2938688/150‑1 (MQ=255) ggCACGACGGCGCTAAAAAAGCCTTCACCCTGGCCCGTCAGGCGGGTGTGATGACCGTTCTGGACGGGGACATTACGCCGCAGGATATCAGTGAGCTGGTGGCATTAAGCGATCACGCGGCCTTTTCAGAACCGGGTCTGGCGCGCTTaa < 1:1576258/150‑1 (MQ=255) ggCACGACGGCGCTAAAAAAGCCTTCACCCTGGCCCGTCAGGCGGGTGTGATGACCGTTCTGGACGGGGACATTACGCCGCAGGATATCAGTGAGCTGGTGGCATTAAGCGATCACGCGGCCTTTTCAGAACCGGGTCTGGCGCGCTTaa < 1:1818590/150‑1 (MQ=255) gCACGACGGCGCTAAAAAAGCCTTCACCCTGGCCCGTCAGGCGGGTGTGATGACCGTTCTGGACGGGGACATTACGCCGCAGGATATCAGTGAGCTGGTGGCATTAAGCGATCACGCGGCCTTTTCAGAACCGGGTCTGGCGCGCTTAAc < 1:1986627/150‑1 (MQ=255) cACGACGGCGCTAAAAAAGCCTTCACCCTGGCCCGTCAGGCGGGTGTGATGACCGTTCTGGACGGGGACATTACGCCGCAGGATATCAGTGAGCTGGTGGCATTAAGCGATCACGCGGCCTTTTCAGAACCGGGTCTGGCGCGCTTAACg < 2:1708414/150‑1 (MQ=255) acgacgGCGCTAAAAAAGCCTTCACCCTGGCCCGTCAGGCGGGTGTGATGACCGTTCTGGACGGGGACATTACGCCGCAGGATATCAGTGAGCTGGTGGCATTAAGCGATCACGCGGCCTTTTCAGAACCGGGTCTGGCGCGCTTAACgg < 2:1000768/150‑1 (MQ=255) acgacgGCGCTAAAAAAGCCTTCACCCTGGCCCGTCAGGCGGGTGGGATGACCGTTCTGGACGGGGACATTACGCCGCAGGATATCAGTGAGCTGGTGGCATTAAGCGATCACGCGGCCTTTTCAGAACCGGGTCTGGCGCGCTTAACgg > 2:88676/1‑150 (MQ=255) gacgGCGCTAAAAAAGCCTTCACCCTGGCCCGTCAGGCGGGTGTGATGACCGTTCTGGACGGGGACATTACGCCGCAGGATATCAGTGAGCTGGTGGCATTAAGCGATCACGCGGCCTTTTCAGAACCGGGTCTGGCGCGCTTAACGGGc > 2:168536/1‑150 (MQ=255) cgGCGCTAAAAAAGCCTTCACCCTGGCCCGTCAGGCGGGTGTGATGACCGTTCTGGACGGGGACATTACGCCGCAGGATATCAGTGAGCTGGTGGCATTAAGCGATCACGCGGCCTTTTCAGAACCGGGTCTGGCGCGCTTAACGGGCGt < 2:1938415/150‑1 (MQ=255) cgcTAAAAAAGCCTTCACCCTGGCCCGTCAGGCGGGTGTGATGACCGTTCTGGACGGGGACATTACGCCGCAGGATATCAGTGAGCTGGTGGCATTAAGCGATCACGCGGCCTTTTCAGAACCGGGTCTGGCGCGCTTAACGGGCGTGaa < 1:23238/150‑1 (MQ=255) cTAAAAAAGCCTTCACCCTGGCCCGTCAGGCGGGTGTGATGACCGTTCTGGACGGGGACATTACGCCGCAGGATATCAGTGAGCTGGTGGCATTAAGCGATCACGCGGCCTTTTCAGAACCGGGTCTGGCGCGCTTAACGGGCGTGAAag < 1:1235749/150‑1 (MQ=255) aaaaaaGCCTTCACCCTGGCCCGTCAGGCGGGTGTGATGACCGTTCTGGACGGGGACATTACGCCGCAGGATATCAGTGAGCTGGTGGCATTAAGCGATCACGCGGCCTTTTCAGAACCGGGTCTGGCGCGCTTAACGGGCGTGAAagag < 1:2367798/150‑1 (MQ=255) aaaaaaGCCTTCACCCTGGCCCGTCAGGCGGGTGTGATGACCGTTCTGGACGGGGACATTACGCCGCAGGATATCAGTGAGCTGGTGGCATTAAGCGATCACGCGGCCTTTTCAGAACCGGGTCTGGCGCGCTTAACGGGCGTGAAagag > 2:2891677/1‑150 (MQ=255) aGCCTTCACCCTGGCCCGTCAGGCGGGTGTGATGACCGTTCTGGACGGGGACATTACGCCGCAGGATATCAGTGAGCTGGTGGCATTAAGCGATCACGCGGCCTTTTCAGAACCGGGTCTGGCGCGCTTAACGGGCGTGAAAGAGATGGc < 1:1767246/150‑1 (MQ=255) ccTTCACCCTGGCCCGTCAGGCGGGTGTGATGACCGTTCTGGACGGGGACATTACGCCGCAGGATATCAGTGAGCTGGTGGCATTAAGCGATCACGCGGCCTTTTCAGAACCGGGTCTGGCGCGCTTAACGGGCGTGAAAGAGATGGCCa < 1:890981/150‑1 (MQ=255) ttCACCCTGGCCCGTCAGGCGGGTGTGATGACCGTTCTGGACGGGGACATTACGCCGCAGGATATCAGTGAGCTGGTGGCATTAAGCGATCACGCGGCCTTTTCAGAACCGGGTCTGGCGCGCTTAACGGGCGTGAAAGAGATGGCCAGt < 1:1734112/150‑1 (MQ=255) ttCACCCTGGCCCGTCAGGCGGGTGTGATGACCGTTCTGGACGGGGACATTACGCCGCAGGATATCAGTGAGCTGGTGGCATTAAGCGATCACGCGGCCTTTTCAGAACCGGGTCTGGCGCGCTTAACGGGCGTGAAAGAGATGGCCAGt < 1:4011563/150‑1 (MQ=255) tCACCCTGGCCCGTCAGGCGGGTGTGATGACCGTTCTGGACGGGGACATTACGCCGCAGGATATCAGTGAGCTGGTGGCATTAAGCGATCACGCGGCCTTTTCAGAACCGGGTCTGGCGCGCTTAACGGGCGTGAAAGAGATGGCCAGTg > 2:3487242/1‑150 (MQ=255) ccTGGCCCGTCAGGCGGGTGTGATGACCGTTCTGGACGGGGACATTACGCCGCAGGATATCAGTGAGCTGGTGGCATTAAGCGATCACGCGGCCTTTTCAGAACCGGGTCTGGCGCGCTTAACGGGCGTGAAAGAGATGGCCAGTGCGCt > 1:720442/1‑150 (MQ=255) cttgCCCGTCAGGCGGGTGTGATGACCGTTCTGGACGGGGACATTACGCCGCAGGATATCAGTGAGCTGGTGGCATTAAGCGATCACGCGGCCTTTTCAGAACCGGGTCTGGCGCGCTTAACGGGCGTGAAAGAGATGGCCAGTGCGCTa > 1:2171030/4‑150 (MQ=255) cTGGCCCGTCAGGCGGGTGTGATGACCGTTCTGGACGGGGACATTACGCCGCAGGATATCAGTGAGCTGGTGGCATTAAGCGATCACGCGGCCTTTTCAGAACCGGGTCTGGCGCGCTTAACGGGCGTGAAAGAGATGGCCAGTGCGCTa > 2:3576178/1‑150 (MQ=255) cccGTCAGGCGGGTGTGATGACCGTTCTGGACGGGGACATTACGCCGCAGGATATCAGTGAGCTGGTGGCATTAAGCGATCACGCGGCCTTTTCAGAACCGGGTCTGGCGCGCTTAACGGGCGTGAAAGAGATGGCCAGTGCGCTAAAAc < 2:1401797/150‑1 (MQ=255) ccGTCAGGCGGGTGTGATGACCGTTCTGGACGGGGACATTACGCCGCAGGATATCAGTGAGCTGGTGGCATTAAGCGATCACGCGGCCTTTTCAGAACCGGGTCTGGCGCGCTTAACGGGCGTGAAAGAGATGGCCAGTGCGCTAAAACa > 1:2450674/1‑150 (MQ=255) gTCAGGCGGGTGTGATGACCGTTCTGGACGGGGACATTACGCCGCAGGATATCAGTGAGCTGGTGGCATTAAGCGATCACGCGGCCTTTTCAGAACCGGGTCTGGCGCGCTTAACGGGCGTGAAAGAGATGGCCAGTGCGCTAAAACAgg > 2:2353827/1‑150 (MQ=255) gTCAGGCGGGTGTGATGACCGTTCTGGACGGGGACATTACGCCGCAGGATATCAGTGAGCTGGTGGCATTAAGCGATCACGCGGCCTTTTCAGAACCGGGTCTGGCGCGCTTAACGGGCGTGAAAGAGATGGCCAGTGCGCTAAAACAgg < 2:1445977/150‑1 (MQ=255) tCAGGCGGGTGTGATGACCGTTCTGGACGGGGACATTACGCCGCAGGATATCAGTGAGCTGGTGGCATTAAGCGATCACGCGGCCTTTTCAGAACCGGGTCTGGCGCGCTTAACGGGCGTGAAAGAGATGGCCAGTGCGCTAAAACAGGc < 1:964175/150‑1 (MQ=255) tCAGGCGGGTGTGATGACCGTTCTGGACGGGGACATTACGCCGCAGGATATCAGTGAGCTGGTGGCATTAAGCGATCACGCGGCCTTTTCAGAACCGGGTCTGGCGCGCTTAACGGGCGTGAAAGAGATGGCCAGTGCGCTAAAACAGGc < 2:2557634/150‑1 (MQ=255) tCAGGCGGGTGTGATGACCGTTCTGGACGGGGACATTACGCCGCAGGATATCAGTGAGCTGGTGGCATTAAGCGATCACGCGGCCTTTTCAGAACCGGGTCTGGCGCGCTTAACGGGCGTGAAAGAGATGGCCAGTGCGCTAAAACAGGc > 2:2766545/1‑150 (MQ=255) cAGGCGGGTGTGATGACCGTTCTGGACGGGGACATTACGCCGCAGGATATCAGTGAGCTGGTGGCATTAAGCGATCACGCGGCCTTTTCAGAACCGGGTCTGGCGCGCTTAACGGGCGTGAAAGAGATGGCCAGTGCGCTAAAACAGGca < 2:1821969/150‑1 (MQ=255) aGGCGGGTGTGATGACCGTTCTGGACGGGGACATTACGCCGCAGGATATCAGTGAGCTGGTGGCATTAAGCGATCACGCGGCCTTTTCAGAACCGGGTCTGGCGCGCTTAACGGGCGTGAAAGAGATGGCCAGTGCGCTAAAACAGGcac < 1:3486019/150‑1 (MQ=255) cGGGTGTGATGACCGTTCTGGACGGGGACATTACGCCGCAGGATATCAGTGAGCTGGTGGCATTAAGCGATCACGCGGCCTTTTCAGAACCGGGTCTGGCGCGCTTAACGGGCGTGAAAGAGATGGCCAGTGCGCTAAAACAGGCACaaa < 1:3559251/150‑1 (MQ=255) gggTGTGATGACCGTTCTGGACGGGGACATTACGCCGCAGGATATCAGTGAGCTGGTGGCATTAAGCGATCACGCGGCCTTTTCAGAACCGGGTCTGGCGCGCTTAACGGGCGTGAAAGAGATGGCCAGTGCGCTAAAACAGGCACAAAc < 1:438028/150‑1 (MQ=255) gggTGTGATGACCGTTCTGGACGGGGACATTACGCCGCAGGATATCAGTGAGCTGGTGGCATTAAGCGATCACGCGGCCTTTTCAGAACCGGGTCTGGCGCGCTTAACGGGCGTGAAAGAGATGGCCAGTGCGCTAAAACAGGCACAAAc < 2:2297606/150‑1 (MQ=255) aCCGTTCTGGACGGGGACATTACGCCGCAGGATATCAGTGAGCTGGTGGCATTAAGCGATCACGCGGCCTTTTCAGAACCGGGTCTGGCGCGCTTAACGGGCGTGAAAGAGATGGCCAGTGCGCTAAAACAGGCACAAACGCTCACAAAt > 2:622504/1‑150 (MQ=255) cGTTCTGGACGGGGACATTACGCCGCAGGATATCAGTGAGCTGGTGGCATTAAGCGATCACGCGGCCTTTTCAGAACCGGGTCTGGCGCGCTTAACGGGCGTGAAAGAGATGGCCAGTGCGCTAAAACAGGCACAAACGCTCACAAATgg < 1:3022269/150‑1 (MQ=255) gTTCTGGACGGGGACATTACGCCGCAGGATATCAGTGAGCTGGTGGCATTAAGCGATCACGCGGCCTTTTCAGAACCGGGTCTGGCGCGCTTAACGGGCGTGAAAGAGATGGCCAGTGCGCTAAAACAGGCACAAACGCTCACAAATGGt < 2:1619913/150‑1 (MQ=255) gTTCTGGACGGGGACATTACGCCGCAGGATATCAGTGAGCTGGTGGCATTAAGCGATCACGCGGCCTTTTCAGAACCGGGTCTGGCGCGCTTAACGGGCGTGAAAGAGATGGCCAGTGCGCTAAAACAGGCACAAACGCTCACAAATGGt > 2:800574/1‑150 (MQ=255) gTTCTGGACGGGGACATTACGCCGCAGGATATCAGTGAGCTGGTGGCATTAAGCGATCACGCGGCCTTTTCAGAACCGGGTCTGGCGCGCTTAACGGGCGTGAAAGAGATGGCCAGTGCGCTAAAACAGGCACAAACGCTCACAAATGGt < 2:1058160/150‑1 (MQ=255) gTTCTGGACGGGGACATTACGCCGCAGGATATCAGTGAGCTGGTGGCATTAAGCGATCACGCGGCCTTTTCAGAACCGGGTCTGGCGCGCTTAACGGGCGTGAAAGAGATGGCCAGTGCGCTAAAACAGGCACAAACGCTCACAAATGGt < 2:561839/150‑1 (MQ=255) ttCTGGACGGGGACATTACGCCGCAGGATATCAGTGAGCTGGTGGCATTAAGCGATCACGCGGCCTTTTCAGAACCGGGTCTGGCGCGCTTAACGGGCGTGAAAGAGATGGCCAGTGCGCTAAAACAGGCACAAACGCTCACAAATGGTc < 1:2863724/150‑1 (MQ=255) cTGGACGGGGACATTACGCCGCAGGATATCAGTGAGCTGGTGGCATTAAGCGATCACGCGGCCTTTTCAGAACCGGGTCTGGCGCGCTTAACGGGCGTGAAAGAGATGGCCAGTGCGCTAAAACAGGCACAAACGCTCACAAATGGTCAt < 1:36871/150‑1 (MQ=255) cTGGACGGGGACATTACGCCGCAGGATATCAGTGAGCTGGTGGCATTAAGCGATCACGCGGCCTTTTCAGAACCGGGTCTGGCGCGCTTAACGGGCGTGAAAGAGATGGCCAGTGCGCTAAAACAGGCACAAACGCTCACAAATGGTCAt < 1:2260012/150‑1 (MQ=255) tGGACGGGGACATTACGCCGCAGGATATCAGTGAGCTGGTGGCATTAAGCGATCACGCGGCCTTTTCAGAACCGGGTCTGGCGCGCTTAACGGGCGTGAAAGAGATGGCCAGTGCGCTAAAACAGGCACAAACGCTCACAAATGGTCATg > 1:1113113/1‑150 (MQ=255) ggACGGGGACATTACGCCGCAGGATATCAGTGAGCTGGTGGCATTAAGCGATCACGCGGCCTTTTCAGAACCGGGTCTGGCGCGCTTAACGGGCGTGAAAGAGATGGCCAGTGCGCTAAAACAGGCACAAACGCTCACAAATGGTCATGt < 2:327258/150‑1 (MQ=255) gACGGGGACATTACGCCGCAGGATATCAGTGAGCTGGTGGCATTAAGCGATCACGCGGCCTTTTCAGAACCGGGTCTGGCGCGCTTAACGGGCGTGAAAGAGATGGCCAGTGCGCTAAAACAGGCACAAACGCTCACAAATGGTCATGTc > 1:2959415/1‑150 (MQ=255) aCGGGGACATTACGCCGCAGGATATCAGTGAGCTGGTGGCATTAAGCGATCACGCGGCCTTTTCAGAACCGGGTCTGGCGCGCTTAACGGGCGTGAAAGAGATGGCCAGTGCGCTAAAACAGGCACAAACGCTCACAAATGGTCATGTCt < 1:599302/150‑1 (MQ=255) cGGGGACATTACGCCGCAGGATATCAGTGAGCTGGTGGCATTAAGCGATCACGCGGCCTTTTCAGAACCGGGTCTGGCGCGCTTAACGGGCGTGAAAGAGATGGCCAGTGCGCTAAAACAGGCACAAACGCTCACAAATGGTCATGTCTa < 2:2076111/150‑1 (MQ=255) ggACATTACGCCGCAGGATATCAGTGAGCTGGTGGCATTAAGCGATCACGCGGCCTTTTCAGAACCGGGTCTGGCGCGCTTAACGGGCGTGAAAGAGATGGCCAGTGCGCTAAAACAGGCACAAACGCTCACAAATGGTCATGTCTAtgt < 1:1158617/150‑1 (MQ=255) cATTACGCCGCAGGATATCAGTGAGCTGGTGGCATTAAGCGATCACGCGGCCTTTTCAGAACCGGGTCTGGCGCGCTTAACGGGCGTGAAAGAGATGGCCAGTGCGCTAAAACAGGCACAAACGCTCACAAATGGTCATGTCTATGTGAc > 2:2456959/1‑150 (MQ=255) aTTACGCCGCAGGATATCAGTGAGCTGGTGGCATTAAGCGATCACGCGGCCTTTTCAGAACCGGCTCTCGCGCGCTTAACCGGCGTCAAAGAGATGGCCAGTGCGCTAAAACATGCACAAACGCTCACAAATGGTCATGTCTATGTGAcc < 2:3031488/150‑1 (MQ=255) ttACGCCGCAGGATATCAGTGAGCTGGTGGCATTAAGCGATCACGCGGCCTTTTCAGAACCGGGTCTGGCGCGCTTAACGGGCGTGAAAGAGATGGCCAGTGCGCTAAAACAGGCACAAACGCTCACAAATGGTCATGTCTATGTGAccc > 1:650510/1‑150 (MQ=255) cgccgcAGGATATCAGTGAGCTGGTGGCATTAAGCGATCACGCGGCCTTTTCAGAACCGGGTCTGGCGCGCTTAACGGGCGTGAAAGAGATGGCCAGTGCGCTAAAACAGGCACAAACGCTCACAAATGGTCATGTCTATGTGACCCAgg < 1:2088238/150‑1 (MQ=255) gccgcAGGATATCAGTGAGCTGGTGGCATTAAGCGATCACGCGGCCTTTTCAGAACCGGGTCTGGCGCGCTTAACGGGCGTGAAAGAGATGGCCAGTGCGCTAAAACAGGCACAAACGCTCACAAATGGTCATGTCTATGTGACCCAggg < 2:1188236/150‑1 (MQ=255) cAGGATATCAGTGAGCTGGTGGCATTAAGCGATCACGCGGCCTTTTCAGAACCGGGTCTGGCGCGCTTAACGGGCGTGAAAGAGATGGCCAGTGCGCTAAAACAGGCACAAACGCTCACAAATGGTCATGTCTATGTGACCCAGGGTAgc < 2:2245374/150‑1 (MQ=255) 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atatCAGTGAGCTGGTGGCATTAAGCGATCACGCGGCCTTTTCAGAACCGGGTCTGGCGCGCTTAACGGGCGTGAAAGAGATGGCCAGTGCGCTAAAACAGGCACAAACGCTCACAAATGGTCATGTCTATGTGACCCAGGGTAGCGCAg > 1:1440864/1‑150 (MQ=255) atatCAGTGAGCTGGTGGCATTAAGCGATCACGCGGCCTTTTCAGAACCGGGTCTGGCGCGCTTAACGGGCGTGAAAGAGATGGCCAGTGCGCTAAAACAGGCACAAACGCTCACAAATGGTCATGTCTATGTGACCCAGGGTAGCGCAg < 2:411927/150‑1 (MQ=255) atCAGTGAGCTGGTGGCATTAAGCGATCACGCGGCCTTTTCAGAACCGGGTCTGGCGCGCTTAACGGGCGTGAAAGAGATGGCCAGTGCGCTAAAACAGGCACAAACGCTCACAAATGGTCATGTCTATGTGACCCAGGGTAGCGCAGGc > 1:3146359/1‑150 (MQ=255) atCAGTGAGCTGGTGGCATTAAGCGATCACGCGGCCTTTTCAGAACCGGGTCTGGCGCGCTTAACGGGCGTGAAAGAGATGGCCAGTGCGCTAAAACAGGCACAAACGCTCACAAATGGTCATGTCTATGTGACCCAGGGTAGCGCAGGc > 2:2725008/1‑150 (MQ=255) atCAGTGAGCTGGTGGCATTAAGCGATCACGCGGCCTTTTCAGAACCGGGTCTGGCGCGCTTAACGGGCGTGAAAGAGATGGCCAGTGCGCTAAAACAGGCACAAACGCTCACAAATGGTCATGTCTATGTGACCCAGGGTAGCGCAGGc < 1:2523820/150‑1 (MQ=255) tCAGTGAGCTGGTGGCATTAAGCGATCACGCGGCCTTTTCAGAACCGGGTCTGGCGCGCTTAACGGGCGTGAAAGAGATGGCCAGTGCGCTAAAACAGGCACAAACGCTCACAAATGGTCATGTCTATGTGACCCAGGGTAGCGCAGGCt < 2:704104/150‑1 (MQ=255) tCAGTGAGCTGGTGGCATTAAGCGATCACGCGGCCTTTTCAGAACCGGGTCTGGCGCGCTTAACGGGCGTGAAAGAGATGGCCAGTGCGCTAAAACAGGCACAAACGCTCACAAATGGTCATGTCTATGTGACCCAGGGTAGCGCAGGCt < 2:64040/150‑1 (MQ=255) cAGTGAGCTGGTGGCATTAAGCGATCACGCGGCCTTTTCAGAACCGGGTCTGGCGCGCTTAACGGGCGTGAAAGAGATGGCCAGTGCGCTAAAACAGGCACAAACGCTCACAAATGGTCATGTCTATGTGACCCAGGGTAGCGCAGGCTg < 1:3929858/150‑1 (MQ=255) cAGTGAGCTGGTGGCATTAAGCGATCACGCGGCCTTTTCAGAACCGGGTCTGGCGCGCTTAACGGGCGTGAAAGAGATGGCCAGTGCGCTAAAACAGGCACAAACGCTCACAAATGGTCATGTCTATGTGACCCAGGGTAGCGCAGGCTg < 2:376723/150‑1 (MQ=255) aGCTGGTGGCATTAAGCGATCACGCGGCCTTTTCAGAACCGGGTCTGGCGCGCTTAACGGGCGTGAAAGAGATGGCCAGTGCGCTAAAACAGGCACAAACGCTCACAAATGGTCATGTCTATGTGACCCAGGGTAGCGCAGGCTGCGAct < 1:185812/150‑1 (MQ=255) cTGGTGGCATTAAGCGATCACGCGGCCTTTTCAGAACCGGGTCTGGCGCGCTTAACGGGCGTGAAAGAGATGGCCAGTGCGCTAAAACAGGCACAAACGCTCACAAATGGTCATGTCTATGTGACCCAGGGTAGCGCAGGCTGCGActgg < 2:510204/150‑1 (MQ=255) tggtggCATTAAGCGATCACGCGGCCTTTTCAGAACCGGGTCTGGCGCGCTTAACGGGCGTGAAAGAGATGGCCAGTGCGCTAAAACAGGCACAAACGCTCACAAATGGTCATGTCTATGTGACCCAGGGTAGCGCAGGCTGCGActggc > 2:3719406/1‑150 (MQ=255) tggtggCATTAAGCGATCACGCGGCCTTTTCAGAACCGGGTCTGGCGCGCTTAACGGGCGTGAAAGAGATGGCCAGTGCGCTAAAACAGGCACAAACGCTCACAAATGGTCATGTCTATGTGACCCAGGGTAGCGCAGGCTGCGActggc > 1:2231021/1‑150 (MQ=255) ggtggCATTAAGCGATCACGCGGCCTTTTCAGAACCGGGTCTGGCGCGCTTAACGGGCGTGAAAGAGATGGCCAGTGCGCTAAAACAGGCACAAACGCTCACAAATGGTCATGTCTATGTGACCCAGGGTAGCGCAGGCTGCGActggct < 2:2396140/150‑1 (MQ=255) ggtggCATTAAGCGATCACGCGGCCTTTTCAGAACCGGGTCTGGCGCGCTTAACGGGCGTGAAAGAGATGGCCAGTGCGCTAAAACAGGCACAAACGCTCACAAATGGTCATGTCTATGTGACCCAGGGTAGCGCAGGCTGCGActggct > 2:3820779/1‑150 (MQ=255) cATTAAGCGATCACGCGGCCTTTTCAGAACCGGGTCTGGCGCGCTTAACGGGCGTGAAAGAGATGGCCAGTGCGCTAAAACAGGCACAAACGCTCACAAATGGTCATGTCTATGTGACCCAGGGTAGCGCAGGCTGCGACTGGCTGGaaa < 2:3146129/150‑1 (MQ=255) ttAAGCGATCACGCGGCCTTTTCAGAACCGGGTCTGGCGCGCTTAACGGGCGTGAAAGAGATGGCCAGTGCGCTAAAACAGGCACAAACGCTCACAAATGGTCATGTCTATGTGACCCAGGGTAGCGCAGGCTGCGACTGGCTGGAAAAt > 1:2723500/1‑150 (MQ=255) aGCGATCACGCGGCCTTTTCAGAACCGGGTCTGGCGCGCTTAACGGGCGTGAAAGAGATGGCCAGTGCGCTAAAACAGGCACAAACGCTCACAAATGGTCATGTCTATGTGACCCAGGGTAGCGCAGGCTGCGACTGGCTGGAAAAtggt < 2:3390057/150‑1 (MQ=255) aTCACGCGGCCTTTTCAGAACCGGGTCTGGCGCGCTTAACGGGCGTGAAAGAGATGGCCAGTGCGCTAAAACAGGCACAAACGCTCACAAATGGTCATGTCTATGTGACCCAGGGTAGCGCAGGCTGCGACTGGCTGGAAAATGGTGGGc < 2:2520016/150‑1 (MQ=255) aTCACGCGGCCTTTTCAGAACCGGGTCTGGCGCGCTTAACGGGCGTGAAAGAGATGGCCAGTGCGCTAAAACAGGCACAAACGCTCACAAATGGTCATGTCTATGTGACCCAGGGTAGCGCAGGCTGCGACTGGCTGGAAAATGGTGGGc < 2:2129750/150‑1 (MQ=255) tCACGCGGCCTTTTCAGAACCGGGTCTGGCGCGCTTAACGGGCGTGAAAGAGATGGCCAGTGCGCTAAAACAGGCACAAACGCTCACAAATGGTCATGTCTATGTGACCCAGGGTAGCGCAGGCTGCGACTGGCTGGAAAATGGTGGGCg > 2:3563164/1‑150 (MQ=255) aCGCGGCCTTTTCAGAACCGGGTCTGGCGCGCTTAACGGGCGTGAAAGAGATGGCCAGTGCGCTAAAACAGGCACAAACGCTCACAAATGGTCATGTCTATGTGACCCAGGGTAGCGCAGGCTGCGACTGGCTGGAAAATGGTGGGCGTc < 1:3229238/150‑1 (MQ=255) cgcgGCCTTTTCAGAACCGGGTCTGGCGCGCTTAACGGGCGTGAAAGAGATGGCCAGTGCGCTAAAACAGGCACAAACGCTCACAAATGGTCATGTCTATGTGACCCAGGGTAGCGCAGGCTGCGACTGGCTGGAAAATGGTGGGCGTCa < 1:3279430/150‑1 (MQ=255) cgcgGCCTTTTCAGAACCGGGTCTGGCGCGCTTAACGGGCGTGAAAGAGATGGCCAGTGCGCTAAAACAGGCACAAACGCTCACAAATGGTCATGTCTATGTGACCCAGGGTAGCGCAGGCTGCGACTGGCTGGAAAATGGTGGGCGTCa < 2:262828/150‑1 (MQ=255) cgcgGCCTTTTCAGAACCGGGTCTGGCGCGCTTAACGGGCGTGAAAGAGATGGCCAGTGCGCTAAAACAGGCACAAACGCTCACAAATGGTCATGTCTATGTGACCCAGGGTAGCGCAGGCTGCGACTGGCTGGAAAATGGTGGGCGTCa < 1:3396148/150‑1 (MQ=255) ggCCTTTTCAGATCCGGGTCTGGCGCGCTTAACGGGCGTGAAAGAGATGGCCAGTGCGCTAAAACAGGCACAAACGCTCACAAATGGTCATGTCGATGTGACCCAGGGTAGCGCAGGCTGCGACTGGCTGGAAAATGGTGGGCGTCAGCa < 2:361844/150‑1 (MQ=255) gCCTTTTCAGAACCGGGTCTGGCGCGCTTAACGGGCGTGAAAGAGATGGCCAGTGCGCTAAAACAGGCACAAACGCTCACAAATGGTCATGTCTATGTGACCCAGGGTAGCGCAGGCTGCGACTGGCTGGAAAATGGTGGGCGTCAGCAt < 2:1870928/150‑1 (MQ=255) gCCTTTTCAGAACCGGGTCTGGCGCGCTTAACGGGCGTGAAAGAGATGGCCAGTGCGCTAAAACAGGCACAAACGCTCACAAATGGTCATGTCTATGTGACCCAGGGTAGCGCAGGCTGCGACTGGCTGGAAAATGGTGGGCGTCAGCAt < 2:153179/150‑1 (MQ=255) gCCTTTTCAGAACCGGGTCTGGCGCGCTTAACGGGCGTGAAAGAGATGGCCAGTGCGCTAAAACAGGCACAAACGCTCACAAATGGTCATGTCTATGTGACCCAGGGTAGCGCAGGCTGCGACTGGCTGGAAAATGGTGGGCGTCAGCAt < 1:361073/150‑1 (MQ=255) cTTTTCAGAACCGGGTCTGGCGCGCTTAACGGGCGTGAAAGAGATGGCCAGTGCGCTAAAACAGGCACAAACGCTCACAAATGGTCATGTCTATGTGACCCAGGGTAGCGCAGGCTGCGACTGGCTGGAAAATGGTGGGCGTCAGCATCa > 1:3801609/1‑150 (MQ=255) ttCAGAACCGGGTCTGGCGCGCTTAACGGGCGTGAAAGAGATGGCCAGTGCGCTAAAACAGGCACAAACGCTCACAAATGGTCATGTCTATGTGACCCAGGGTAGCGCAGGCTGCGACTGGCTGGAAAATGGTGGGCGTCAGCATCAAcc < 2:3300839/150‑1 (MQ=255) ttCAGAACCGGGTCTGGCGCGCTTAACGGGCGTGAAAGAGATGGCCAGTGCGCTAAAACAGGCACAAACGCTCACAAATGGTCATGTCTATGTGACCCAGGGTAGCGCAGGCTGCGACTGGCTGGAAAATGGTGGGCGTCAGCATCAAcc < 2:2605247/150‑1 (MQ=255) | ATGTTGTGCTGGCAGATGTACGCTGGCACGACGGCGCTAAAAAAGCCTTCACCCTGGCCCGTCAGGCGGGTGTGATGACCGTTCTGGACGGGGACATTACGCCGCAGGATATCAGTGAGCTGGTGGCATTAAGCGATCACGCGGCCTTTTCAGAACCGGGTCTGGCGCGCTTAACGGGCGTGAAAGAGATGGCCAGTGCGCTAAAACAGGCACAAACGCTCACAAATGGTCATGTCTATGTGACCCAGGGTAGCGCAGGCTGCGACTGGCTGGAAAATGGTGGGCGTCAGCATCAACC > AP012306/3503343‑3503640 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |