| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AP012306 | = 2498245 | 490 (1.500) | 6 (0.020) | 6/284 | 20.2 | 1.3% | coding (175/633 nt) | yqeH | conserved protein with bipartite regulator domain |
| ? | AP012306 | = 2498272 | 450 (1.450) | coding (202/633 nt) | yqeH | conserved protein with bipartite regulator domain | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 475 total aligned reads displayed.
ATTGCCAAATAATGCCAGAAGAGTCACCGCGTTTGCAGTATTGCGCAAACTCGTGTTTTTGTATGTGGCCCGAAGAAAGTTCATATTTTAATCGTGGTGTGGTAGAAGGTATCTTAACAAAAAACCACAATGCGAGATTAAGCGGATATATTTTTGTCGATTTTTCAGTAAGTTTTTTACGTCTATTCCTTGAAAAAGACTGGATTGACTATCTTGCAAGTACTGACATGGGGATTGTTTTAGTCAGCGACCGCAATATGCAATCGTTAGCTAATTACTGGCGAAAACACAACTCAGCA > AP012306/2498123‑2498421 | aTTGCCAAATAATGCCAGAAGAGTCACCGCGTTTGCAGTATTGCGCAAACTCGTGTTTTTGTATGTGGCCCGAAGAAAGTTCATATTTTAATCGTGGTGTGGTAGAAGGTATCTTAACAAAAAACCACAATGCGAGATTAAGCGGatata < 2:3378396/150‑1 (MQ=255) ttGCCAAATAATGCCAGAAGAGTCACCGCGTTTGCAGTATTGCGCAAACTCGTGTTTTTGTATGTGGCCCGAAGAAAGTTCATATTTTAATCGTGGTGTGGTAGAAGGTATCTTAACAAAAAACCACAATGCGAGATTAAGCGGatatat < 1:2815098/150‑1 (MQ=255) tGCCAAATAATGCCAGAAGAGTCACCGCGTTTGCAGTATTGCGCAAACTCGTGTTTTTGTATGTGGCCCGAAGAAAGTTCATATTTTAATCGTGGTGTGGTAGAAGGTATCTTAACAAAAAACCACAATGCGAGATTAAGCGGATATAtt > 1:2090931/1‑150 (MQ=255) ccAAATAATGCCAGAAGAGTCACCGCGTTTGCAGTATTGCGCAAACTCGTGTTTTTGTATGTGGCCCGAAGAAAGTTCATATTTTAATCGTGGTGTGGTAGAAGGTATCTTAACAAAAAACCACAATGCGAGATTAAGCGGATATAtttt < 1:3394252/150‑1 (MQ=255) cAAATAATGCCAGAAGAGTCACCGCGTTTGCAGTATTGCGCAAACTCGTGTTTTTGTATGTGGCCCGAAGAAAGTTCATATTTTAATCGTGGTGTGGTAGAAGGTATCTTAACAAAAAACCACAATGCGAGATTAAGCGGATATAttttt < 1:763114/150‑1 (MQ=255) aaaTAATGCCAGAAGAGTCACCGCGTTTGCAGTATTGCGCAAACTCGTGTTTTTGTATGTGGCCCGAAGAAAGTTCATATTTTAATCGTGGTGTGGTAGAAGGTATCTTAACAAAAAACCACAATGCGAGATTAAGCGGATATATTTTTg > 2:1535533/1‑150 (MQ=255) aataatGCCAGAAGAGTCACCGCGTTTGCAGTATTGCGCAAACTCGTGTTTTTGTATGTGGCCCGAAGAAAGTTCATATTTTAATCGTGGTGTGGTAGAAGGTATCTTAACAAAAAACCACAATGCGAGATTAAGCGGATATATTTTTGt < 2:3013427/150‑1 (MQ=255) aataatGCCAGAAGAGTCACCGCGTTTGCAGTATTGCGCAAACTCGTGTTTTTGTATGTGGCCCGAAGAAAGTTCATATTTTAATCGTGGTGTGGTAGAAGGTATCTTAACAAAAAACCACAATGCGAGATTAAGCGGATATATTTTTGt > 1:98664/1‑150 (MQ=255) aataatGCCAGAAGAGTCACCGCGTTTGCAGTATTGCGCAAACTCGTGTTTTTGTATGTGGCCCGAAGAAAGTTCATATTTTAATCGTGGTGTGGTAGAAGGTATCTTAACAAAAAACCACAATGCGAGATTAAGCGGATATATTTTTGt < 1:4268365/150‑1 (MQ=255) taatGCCAGAAGAGTCACCGCGTTTGCAGTATTGCGCAAACTCGTGTTTTTGTATGTGGCCCGAAGAAAGTTCATATTTTAATCGTGGTGTGGTAGAAGGTATCTTAACAAAAAACCACAATGCGAGATTAAGCGGATATATTTTTGTCg > 1:2960089/1‑150 (MQ=255) taatGCCAGAAGAGTCACCGCGTTTGCAGTATTGCGCAAACTCGTGTTTTTGTATGTGGCCCGAAGAAAGTTCATATTTTAATCGTGGTGTGGTAGAAGGTATCTTAACAAAAAACCACAATCCGAGATTAAGCGGATATATTTTTGTCg > 1:931260/1‑150 (MQ=255) aatGCCAGAAGAGTCACCGCGTTTGCAGTATTGCGCAAACTCGTGTTTTTGTATGTGGCCCGAAGAAAGTTCATATTTTAATCGTGGTGTGGTAGAAGGTATCTTAACAAAAAACCACAATGCGAGATTAAGCGGATATATTTTTGTCGa > 1:4201461/1‑150 (MQ=255) atGCCAGAAGAGTCACCGCGTTTGCAGTATTGCGCAAACTCGTGTTTTTGTATGTGGCCCGAAGAAAGTTCATATTTTAATCGTGGTGTGGTAGAAGGTATCTTAACAAAAAACCACAATGCGAGATTAAGCGGATATATTTTTGTCGAt < 1:2443875/150‑1 (MQ=255) 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< 1:3341697/150‑1 (MQ=255) aTGCGAGATTAAGCGGATATATTTTTGTCGATTTTTCAGTAAGTTTTTTACGTCTATTCCTTGAAAAAGACTGGATTGACTATCTTGCAAGTACTGACATGGGGATTGTTTTAGTCAGCGACCGCAATATGCAATCGTTAGCTAATTACt > 1:4117626/1‑150 (MQ=255) gCGAGATTAAGCGGATATATTTTTGTCGATTTTTCAGTAAGTTTTTTACGTCTATTCCTTGAAAAAGACTGGATTGACTATCTTGCAAGTACTGACATGGGGATTGTTTTAGTCAGCGACCGCAATATGCAATCGTTAGCTAATTACTgg < 2:2773910/150‑1 (MQ=255) cGAGATTAAGCGGATATATTTTTGTCGATTTTTCAGTAAGTTTTTTACGTCTATTCCTTGAAAAAGACTGGATTGACTATCTTGCAAGTACTGACATGGGGATTGTTTTAGTCAGCGACCGCAATATGCAATCGTTAGCTAATTACTGGc < 1:304557/150‑1 (MQ=255) gagaTTAAGCGGATATATTTTTGTCGATTTTTCAGTAAGTTTTTTACGTCTATTCCTTGAAAAAGACTGGATTGACTATCTTGCAAGTACTGACATGGGGATTGTTTTAGTCAGCGACCGCAATATGCAATCGTTAGCTAATTACTGGCg < 1:1310718/150‑1 (MQ=255) tAAGCGGATATATTTTTGTCGATTTTTCAGTAAGTTTTTTACGTCTATTCCTTGAAAAAGACTGGATTGACTATCTTGCAAGTACTGACATGGGGATTGTTTTAGTCAGCGACCGCAATATGCAATCGTTAGCTAATTACTGGCGAAAac > 2:2174774/1‑150 (MQ=255) tAAGCGGATATATTTTTGTCGATTTTTCAGTAAGTTTTTTACGTCTATTCCTTGAAAAAGACTGGATTGACTATCTTGCAAGTACTGACATGGGGATTGTTTTAGTCAGCGACCGCAATATGCAATCGTTAGCTAATTACTGGCGAAAac > 1:2655301/1‑150 (MQ=255) tAAGCGGATATATTTTTGTCGATTTTTCAGTAAGTTTTTTACGTCTATTCCTTGAAAAAGACTGGATTGACTATCTTGCAAGTACTGACATGGGGATTGTTTTAGTCAGCGACCGCAATATGAAATCGTTAGCTAATTACTGGCGAAAac > 2:3215329/1‑150 (MQ=255) gCGGATATATTTTTGTCGATTTTTCAGTAAGTTTTTTACGTCTATTCCTTGAAAAAGACTGGATTGACTATCTTGCAAGTACTGACATGGGGATTGTTTTAGTCAGCGACCGCAATATGCAATCGTTAGCTAATTACTGGCGAAAAcaca < 2:2695590/150‑1 (MQ=255) ggATATATTTTTGTCGATTTTTCAGTAAGTTTTTTACGTCTATTCCTTGAAAAAGACTGGATTGACTATCTTGCAAGTACTGACATGGGGATTGTTTTAGTCAGCGACCGCAATATGCAATCGTTAGCTAATTACTGGCGAAAACACAAc > 1:3709083/1‑150 (MQ=255) ggATATATTTTTGTCGATTTTTCAGTAAGTTTTTTACGTCTATTCCTTGAAAAAGACTGGATTGACTATCTTGCAAGTACTGACATGGGGATTGTTTTAGTCAGCGACCGCAATATGCAATCGTTAGCTAATTACTGGCGAAAACACAAc > 1:64300/1‑150 (MQ=255) gATATATTTTTGTCGATTTTTCAGTAAGTTTTTTACGTCTATTCCTTGAAAAAGACTGGATTGACTATCTTGCAAGTACTGACATGGGGATTGTTTTAGTCAGCGACCGCAATATGCAATCGTTAGCTAATTACTGGCGAAAACACAACt < 1:1649992/150‑1 (MQ=255) | ATTGCCAAATAATGCCAGAAGAGTCACCGCGTTTGCAGTATTGCGCAAACTCGTGTTTTTGTATGTGGCCCGAAGAAAGTTCATATTTTAATCGTGGTGTGGTAGAAGGTATCTTAACAAAAAACCACAATGCGAGATTAAGCGGATATATTTTTGTCGATTTTTCAGTAAGTTTTTTACGTCTATTCCTTGAAAAAGACTGGATTGACTATCTTGCAAGTACTGACATGGGGATTGTTTTAGTCAGCGACCGCAATATGCAATCGTTAGCTAATTACTGGCGAAAACACAACTCAGCA > AP012306/2498123‑2498421 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |