New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AP012306 | 1083750 = | 256 (0.820) | 10 (0.030) | 10/290 | 15.8 | 3.8% | coding (366/1392 nt) | narK | nitrate/nitrite transporter |
? | AP012306 | 1083769 = | 263 (0.870) | coding (385/1392 nt) | narK | nitrate/nitrite transporter | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 259 total aligned reads displayed.
CAGCTATTTATGTTGACTGCGCTGCCTTCGGTTTCTGGCGCGTTATTACGTGTTCCATACTCCTTTATGGTTCCTATCTTCGGTGGTCGTCGCTGGACGGCGTTCAGCACCGGTATTCTGATTATTCCTTGCGTCTGGCTGGGTTTTGCCGTGCAGGATACCTCCACGCCTTATAGCGTCTTCATCATCATCTCTCTGCTATGCGGCTTTGCTGGCGCGAACTTCGCATCCAGTATGGCAAACATCAGCTTCTTCTTTCCGAAACAGAAGCAGGGTGGCGCGCTGGGTCTGAATGGTGG > AP012306/1083601‑1083899 | aGCTATTTATGTTGACTGCGCTGCCTTCGGTTTCTGGCGCGTTATTACGTGTTCCATACTCCTTTATGGTTCCTATCTTGGGTGGTCGTGGCTGGTTGGCGTTCAGCACCGGTATTCTGATTATTCCTTGCGTCTGGCTGGGTTTTGCCg > 2:1315029/1‑150 (MQ=255) cTATTTATGTTGACTGCGCTGCCTTCGGTTTCTGGCGCGTTATTACGTGTTCCATACTCCTTTATGGTTCCTATCTTCGGTGGTCGTCGCTGGACGGCGTTCAGCACCGGTATTCTGATTATTCCTTGCGTCTGGCTGGGTTTTGCCGTg < 1:198836/150‑1 (MQ=255) tATTTATGTTGACTGCGCTGCCTTCGGTTTCTGGCGCGTTATTACGTGTTCCATACTCCTTTATGGTTCCTATCTTCGGTGGTCGTCGCTGGACGGCGTTCAGCACCGGTATTCTGATTATTCCTTGCGTCTGGCTGGGTTTTGCCGTGc < 1:1500601/150‑1 (MQ=255) aTTTATGTTGACTGCGCTGCCTTCGGTTTCTGGCGCGTTATTACGTGTTCCATACTCCTTTATGGTTCCTATCTTCGGTGGTCGTCGCTGGACGGCGTTCAGCACCGGTATTCTGATTATTCCTTGCGTCTGGCTGGGTTTTGCCGTGCa > 1:542651/1‑150 (MQ=255) aTTTATGTTGACTGCGCTGCCTTCGGTTTCTGGCGCGTTATTACGTGTTCCATACTCCTTTATGGTTCCTATCTTCGGGGGTCGTCGCTGGACGGCGTTCAGCACCGGTATTCTGATTATTCCTTGCGTCTGGCTGGGTTTTGCCGTGCa > 2:52221/1‑150 (MQ=255) ttATGTTGACTGCGCTGCCTTCGGTTTCTGGCGCGTTATTACGTGTTCCATACTCCTTTATGGTTCCTATCTTCGGTGGTCGTCGCTGGACGGCGTTCAGCACCGGTATTCTGATTATTCCTTGCGTCTGGCTGGGTTTTGCCGTGCAgg > 2:4174501/1‑150 (MQ=255) ttATGTTGACTGCGCTGCCTTCGGTTTCTGGCGCGTTATTACGTGTTCCATACTCCTTTATGGTTCCTATCTTCGGTGGTCGTCGCTGGACGGCGTTCAGCACCGGTATTCTGATTATTCCTTGCGTCTGGCTGGGTTTTGCCGTGCAgg < 2:3357863/150‑1 (MQ=255) tATGTTGACTGCGCTGCCTTCGGTTTCTGGCGCGTTATTACGTGTTCCATACTCCTTTATGGTTCCTATCTTCGGTGGTCGTCGCTGGACGGCGTTCAGCACCGGTATTCTGATTATTCCTTGCGTCTGGCTGGGTTTTGCCGTGCAGGa < 1:2443202/150‑1 (MQ=255) tGTTGACTGCGCTGCCTTCGGTTTCTGGCGCGTTATTACGTGTTCCATACTCCTTTATGGTTCCTATCTTCGGTGGTCGTCGCTGGACGGCGTTCAGCACCGGTATTCTGATTATTCCTTGCGTCTGGCTGGGTTTTGCCGTGCAGGATa < 1:1535690/150‑1 (MQ=255) gTTGACTGCGCTGCCTTCGGTTTCTGGCGCGTTATTACGTGTTCCATACTCCTTTATGGTTCCTATCTTCGGTGGTCGTCGCTGGTCGGCGTTCAGCACCGGTATTCTGATTATTCCTTGCGTCTGGCTGGGTTTTGCCGTGCAGGATAc > 2:1179921/1‑150 (MQ=255) gACTGCGCTGCCTTCGGTTTCTGGCGCGTTATTACGTGTTCCATACTCCTTTATGGTTCCTATCTTCGGTGGTCGTCGCTGGACGGCGTTCAGCACCGGTATTCTGATTATTCCTTGCGTCTGGCTGGGTTTTGCCGTGCAGGATACCTc > 1:3369297/1‑150 (MQ=255) cTGCCTTCGGTTTCTGGCGCGTTATTACGTGTTCCATACTCCTTTATGGTTCCTATCTTCGGTGGTCGTCGCTGGACGGCGTTCAGCACCGGTATTCTGATTATTCCTTGCGTCTGGCTGGGTTTTGCCGTGCAGGATACCTCCACGCCt < 2:1609504/150‑1 (MQ=255) cTGCCTTCGGTTTCTGGCGCGTTATTACGTGTTCCATACTCCTTTATGGTTCCTATCTTCGGTGGTCGTCGCTGGACGGCGTTCAGCACCGGTATTCTGATTATTCCTTGCGTCTGGCTGGGTTTTGCCGTGCAGGATACCTCCACGCCt > 2:2746295/1‑150 (MQ=255) gCCTTCGGTTTCTGGCGCGTTATTACGTGTTCCATACTCCTTTATGGTTCCTATCTTCGGTGGTCGTCGCTGGACGGCGTTCAGCACCGGTATTCTGATTATTCCTTGCGTCTGGCTGGGTTTTGCCGTGCAGGATACCTCCACGCCTta < 2:3906156/150‑1 (MQ=255) gCCTTCGGTTTCTGGCGCGTTATTACGTGTTCCATACTCCTTTATGGTTCCTATCTTCGGTGGTCGTCGCTGGACGGCGTTCAGCACCGGTATTCTGATTATTCCTTGCGTCTGGCTGGGTTTTGCCGTGCAGGATACCTCCACGCCTta < 1:2491714/150‑1 (MQ=255) ttCGGTTTCTGGCGCGTTATTACGTGTTCCATACTCCTTTATGGTTCCTATCTTCGGTGGTCGTCGCTGGACGGCGTTCAGCACCGGTATTCTGATTATTCCTTGCGTCTGGCTGGGTTTTGCCGTGCAGGATACCTCCACGCCTTATAg > 2:1137880/1‑150 (MQ=255) tCGGTTTCTGGCGCGATATTACGTGTACCATACTCCTTTATGGTTCCTATCTTCGGTCGTCGTCGCTGGACGGCGTTCAGCACCGGTATTCTGATTATTCCTTGCGTCTGGCTGGGTTTTGCCGTGCAGGATACCTCCACGCCTTATAGc < 2:3487667/150‑1 (MQ=255) ggTTTCTGGCGCGTTATTACGTGTTCCATACTCCTTTATGGTTCCTATCTTGGGGGGTGGTGGATGGATGGCGATAAGAACGGGGATTATGATTATTGGTTGCGTCTGGCTGGGTTTTGCGGTGCAGGATACCTCAACGCCTTATAGGGt > 2:3683519/1‑150 (MQ=255) gTTTCTGGCGCGTTATTACGTGTTCCATACTCCTTTATGGTTCCTATCTTCGGGGGTCGTCGCTGGACGGCGTTCAGCACCGGTATTCTGATTATTCCTTGCGTCTGGCTGGGTTTTGCCGTGCAGGATACCTCCACGCCTTATAGCGTc > 2:2537124/1‑150 (MQ=255) gTTTCTGGCGCGTTATTACGTGTTCCATACTCCTTTATGGTTCCTATCTTCGGGGGTCGCCGCTGGTCAGCATTCAGCACCGGTATTCTGATTATTCCTTGCGTCTGGCTGGGTTTTGCCGTGCAGGATACCTCCACGCCTTATAGCGTc > 2:799374/1‑150 (MQ=37) tCTGGCGCGTTATTACGTGTTCCATACTCCTTTATGGTTCCTATCTTCGGGGGTCGTCGCTGGACGGCGTTCAGCACCGGTATTCTGATTATTCCTTGCGTCTGGCTGGGTTTTGCCGTGCAGGATACCTCCACGCCTTATAGCGTCTtc > 2:667250/1‑150 (MQ=255) tGGCGCGTTATTACGTGTTCCATACTCCTTTATGGTTCCTATCTTCGGTGGTCGTCGCTGGACGGCGTTCAGCACCGGTATTCTGATTATTCCTTGCGTCTGGCTGGGTTTTGCCGTGCAGGATACCTCCACGCCTTATAGCGTCTtcat < 1:4104033/150‑1 (MQ=255) tGGCGCGTTATTACGTGTTCCATACTCCTTTATGGTTCCTATCTTCGGTGGTCGTCGCTGGACGGCGTTCAGCACCGGTATTCTGATTATTCCTTGCGTCTGGCTGGGTTTTGCCGTGCAGGATACCTCCACGCCTTATAGCGTCTtcat < 2:1705398/150‑1 (MQ=255) gcgcGTTATTACGTGTTCCATACTCCTTTATGGTTCCTATCTTCGGTGGTCGTCGCTGGACGGCGTTCAGCACCGGTATTCTGATTATTCCTTGCGTCTGGCTGGGTTTTGCCGTGCAGGATACCTCCACGCCTTATAGCGTCTtcatca < 2:4031765/150‑1 (MQ=255) cgcgTTATTACGTGTTCCATACTCCTTTATGGTTCCTATCTTCGGTGGTCGTCGCTGGACGGCGTTCAGCACCGGTATTCTGATTATTCCTTGCGTCTGGCTGGGTTTTGCCGTGCAGGATACCTCCACGCCTTATAGCGTCTtcatcat < 2:2339911/150‑1 (MQ=255) cgcgTTATTACGTGTTCCATACTCCTTTATGGTTCCTATCTTCGGTGGTCGTCGCTGGACGGCGTTCAGCACCGGTATTCTGATTATTCCTTGCGTCTGGCTGGGTTTTGCCGTGCAGGATACCTCCACGCCTTATAGCGTCTtcatcat < 1:431244/150‑1 (MQ=255) gcgTTATTACGTGTTCCATACTCCTTTATGGTTCCTATCTTCGGTGGTCGTCGCTGGACGGCGTTCAGCACCGGTATTCTGATTATTCCTTGCGTCTGGCTGGGTTTTGCCGTGCAGGATACCTCCACGCCTTATAGCGTCTtcatcatc < 1:2596595/150‑1 (MQ=255) gTTATTACGTGTTCCATACTCCTTTATGGTTCCTATCTTCGGGGGCCGCCGCTGGTTGGAATTCAGCACCGGTATTCTGATTATTCCTTGCGTCTGGCTGGGTTTTGCCGTGCAGGATACCTCCACGCCTTATAGCGTCTTcatcatcat > 2:1639091/1‑150 (MQ=37) tattaCGTGTTCCATACTCCTTTATGGTTCCTATCTTCGGTGGTCGTCGCTGGACGGCGTTCAGCACCGGTATTCTGATTATTCCTTGCGTCTGGCTGGGTTTTGCCGTGCAGGATACCTCCACGCCTTATAGCGTCTTCATCATCAtct < 1:1307643/150‑1 (MQ=255) tattaCGTGTTCCATACTCCTTTATGGTTCCTATCTTCGGTGGTCGTCGCTGGACGGCGTTCAGCACCGGTATTCTGATTATTCCTTGCGTCTGGCTGGGTTTTGCCGTGCAGGATACCTCCACGCCTTATAGCGTCTTCATCATCAtct < 1:3694532/150‑1 (MQ=255) attaCGTGTTCCATACTCCTTTATGGTTCCTATCTTCGGTGGTCGTCGCTGGACGGCGTTCAGCACCGGTATTCTGATTATTCCTTGCGTCTGGCTGGGTTTTGCCGTGCAGGATACCTCCACGCCTTATAGCGTCTTCATCATCAtctc < 2:1503012/150‑1 (MQ=255) aCGTGTTCCATACTCCTTTATGGTTCCTATCTTCGGTGGTCGTCGCTGGACGGCGTTCAGCACCGGTATTCTGATTATTCCTTGCGTCTGGCTGGGTTTTGCCGTGCAGGATACCTCCACGCCTTATAGCGTCTTCATCATCATctctct < 1:1063760/150‑1 (MQ=255) tgtTCCATACTCCTTTATGGTTCCTATCTTCGGTGGTCGTCGCTGGACGGCGTTCAGCACCGGTATTCTGATTATTCCTTGCGTCTGGCTGGGTTTTGCCGTGCAGGATACCTCCACGCCTTATAGCGTCTTCATCATCATCTCTCTGCt < 1:313037/150‑1 (MQ=255) tCCATACTCCTTTATGGTTCCTATCTTCGGTGGTCGTCGCTGGACGGCGTTCAGCACCGGTATTCTGATTATTCCTTGCGTCTGGCTGGGTTTTGCCGTGCAGGATACCTCCACGCCTTATAGCGTCTTCATCATCATCTCTCTGCTATg < 2:2883961/150‑1 (MQ=255) tCCATACTCCTTTATGGTTCCTATCTTCGGTGGTCGTCGCTGGACGGCGTTCAGCACCGGTATTCTGATTATTCCTTGCGTCTGGCTGGGTTTTGCCGTGCAGGATACCTCCACGCCTTATAGCGTCTTCATCATCATCTCTCTGCTATg < 2:2962723/150‑1 (MQ=255) tCCATACTCCTTTATGGTTCCTATCTTCGGTGGTCGTCGCTGGACGGCGTTCAGCACCGGTATTCTGATTATTCCTTGCGTCTGGCTGGGTTTTGCCGTGCAGGATACCTCCACGCCTTATAGCGTCTTCATCATCATCTCTCTGCTATg < 2:1286585/150‑1 (MQ=255) ccATACTCCTTTATGGTTCCTATCTTCGGGGGTCGTCGCTGGACAGAGATCAGCACCGGTATTCTGATTATTCCTTGCGTCTGGCTGGGTTTTGCCGTGCAGGATACCTCCACGCCTTATAGCGTCTTCATCATCATCTCTCTGCTATGc > 2:1647765/1‑150 (MQ=255) cTCCTTTATGGTTCCTATCTTCGGTGGTCGTCGCTGGACGGCGTTCAGCACCGGTATTCTGATTATTCCTTGCGTCTGGCTGGGTTTTGCCGTGCAGGATACCTCCACGCCTTATAGCGTCTTCATCATCATCTCTCTGCTATGCGGCtt < 2:1613533/150‑1 (MQ=255) tCCTTTATGGTTCCTATCTTCGGTGGTCGTCGCTGGACGGCGTTCAGCACCGGTATTCTGATTATTCCTTGCGTCTGGCTGGGTTTTGCCGTGCAGGATACCTCCACGCCTTATAGCGTCTTCATCATCATCTCTCTGCTATGCGGCttt > 2:2799256/1‑150 (MQ=255) ccTTTATGGTTCCTATCTTCGGTGGTCGTCGCTGGACGGCGTTCAGCACCGGTATTCTGATTATTCCTTGCGTCTGGCTGGGTTTTGCCGTGCAGGATACCTCCACGCCTTATAGCGTCTTCATCATCATCTCTCTgat < 1:2214902/139‑3 (MQ=255) ttATGGTTCCTATCTTCGGTGGTCGTCGCTGGACGGCGTTCAGCACCGGTATTCTGATTATTCCTTGCGTCTGGCTGGGTTTTGCCGTGCAGGATACCTCCACGCCTTATAGCGTCTTCATCATCATCTCTCTGCTATGCGGCTTTGCTg < 2:3094993/150‑1 (MQ=255) ttATGGTTCCTATCTTCGGGGGTCGTCGCTGGACGGAATACAGCACCGGTATTCTGATTATTCCTTGCGTCTGGCTGGGTTTTGCCATGCAGGATACCTCCACGCCTTATAGCGTCTTCATCATCATCTCTCTGCTATGCGGCTTTGCTg > 2:822733/1‑150 (MQ=255) aTGGTTCCTATCTTCGGTGGTCGTCGCTGGACGGCGTTCAGCACCGGTATTCTGATTATTCCTTGCGTCTGGCTGGGTTTTGCCGTGCAGGATACCTCCACGCCTTATAGCGTCTTCATCATCATCTCTCTGCTATGCGGCTTTGCTGgc < 1:274372/150‑1 (MQ=255) tCCTATCTTCGGTGGTCGTCGCTGGACGGCGTTCAGCACCGGTATTCTGATTATTCCTTGCGTCTTGCTGGGTTTTGCCGTGCAGGATACCTCCACGCCTTATAGCGTCTTCATCATCATCTCTCTGCTATGCGGCTTTGCTGGCGCGaa > 1:790305/1‑150 (MQ=255) tATCTTCGGTGGTCGTCGCTGGACGGCGTTCAGCACCGGTATTCTGATTATTCCTTGCGTCTGGCTGGGTTTTGCCGTGCAGGATACCTCCACGCCTTATAGCGTCTTCATCATCATCTCTCTGCTATGCGGCTTTGCTGGCGCGAACtt < 2:1055651/150‑1 (MQ=255) aTCTTCGGTGGTCGTCGCTGGACGGCGTTCAGCACCGGTATTCTGATTATTCCTTGCGTCTGGCTGGGTTTTGCCGTGCAGGATACCTCCACGCCTTATAGCGTCTTCATCATCATCTCTCTGCTATGCGGCTTTGCTGGCGCGAACTTc < 2:2055925/150‑1 (MQ=255) tCTTCGGTGGTCGTCGCTGGACGGCGTTCAGCACCGGTATTCTGATTATTCCTTGCGTCTGGCTGGGTTTTGCCGTGCAGGATACCTCCACGCCTTATAGCGTCTTCATCATCATCTCTCTGCTATGCGGCTTTGCTGGCGCGAACTTCg > 1:3573620/1‑150 (MQ=255) cTTCGGTGGTCGTCGCTGGACGGCGTTCAGCACCGGTATTCTGATTATTCCTTGCGTCTGGCTGGGTTTTGCCGTGCAGGATACCTCCACGCCTTATAGCGTCTTCATCATCATCTCTCTGCTATGCGGCTTTGCTGGCGCGAACTTCGc < 2:1875590/150‑1 (MQ=255) tCGGTGGCCGCCGCTGGACGGCGTTCAGCACCGGTATTCTGATTATTCCTTGCGTCTGGCTGGGTTTTGCCGTGCAGGATACCTCCACGCCTTATAGCGTCTTCATCATCATCTCTCTGCTATGCGGCTTTGCTGGCGCGAACTTCGCAt > 2:592344/1‑150 (MQ=255) ggtggtCGTCGCTGGACGGCGTTCAGCACCGGTATTCTGATTATTCCTTGCGTCTGGCTGGGTTTTGCCGTGCAGGATACCTCCACGCCTTATAGCGTCTTCATCATCATCTCTCTGCTATGCGGCTTTGCTGGCGCGAACTTCGCATcc < 1:719329/150‑1 (MQ=255) gtggtCGTCGCTGGACGGCGTTCAGCACCGGTATTCTGATTATTCCTTGCGTCTGGCTGGGTTTTGCCGTGCAGGATACCTCCACGCCTTATAGCGTCTTCATCATCATCTCTCTGCTATGCGGCTTTGCTGGCGCGAACTTCGCATCCa < 1:2583640/150‑1 (MQ=255) tggtCGTCGCTGGACGGCGTTCAGCACCGGTATTCTGATTATTCCTTGCGTCTGGCTGGGTTTTGCCGTGCAGGATACCTCCACGCCTTATAGCGTCTTCATCATCATCTCTCTGCTATGCGGCTTTGCTGGCGCGAACTTCGCATCCAg < 1:922091/150‑1 (MQ=255) tggtCGTCGCTGGACGGCGTTCAGCACCGGTATTCTGATTATTCCTTGCGTCTGGCTGGGTTTTGCCGTGCAGGATACCTCCACGCCTTATAGCGTCTTCATCATCATCTCTCTGCTATGCGGCTTTGCTGGCGCGAACTTCGCATCCAg < 2:2302535/150‑1 (MQ=255) tggtCGTCGCTGGACGGCGTTCAGCACCGGTATTCTGATTATTCCTTGCGTCTGGCTGGGTTTTGCCGTGCAGGATACCTCCACGCCTTATAGCGTCTTCATCATCATCTCTCTGCTATGCGGCTTTGCTGGCGCGAACTTCGCATCCAg < 2:4253431/150‑1 (MQ=255) ggtCGTCGCTGGACGGCGTTCAGCACCGGTATTCTGATTATTCCTTGCGTCTGGCTGGGTTTTGCCGTGCAGGATACCTCCACGCCTTATAGCGTCTTCATCATCATCTCTCTGCTATGCGGCTTTGCTGGCGCGAACTTCGCATCCAGt < 1:3305401/150‑1 (MQ=255) gttgtcgCTGGACGGCGTTCCGCACCGGTATTCTGATTATTCCTTGCGTCTGGCTGGGTTTTGCCGTGCAGGATACCTCCACGCCTTATAGCGTCTTCATCATCATCTCTCTGCTATGCGGCTTTGCTGGCGCGAACTTCGCATCCAGTa < 1:1221944/147‑1 (MQ=255) gtcgtcGCTGGACGGCGTTCAGCACCGGTATTCTGATTATTCCTTGCGTCTGGCTGGGTTTTGCCGTGCAGGATACCTCCACGCCTTATAGCGTCTTCATCATCATCTCTCTGCTATGCGGCTTTGCTGGCGCGAACTTCGCATCCAGTa > 1:394093/1‑150 (MQ=255) gtcgtcGCTGGACGGCGTTCAGCACCGGTATTCTGATTATTCCTTGCGTCTGGCTGGGTTTTGCCGTGCAGGATACCTCCACGCCTTATAGCGTCTTCATCATCATCTCTCTGCTATGCGGCTTTGCTGGCGCGAACTTCGCATCCAGTa < 1:2918856/150‑1 (MQ=255) cgtcgCTGGACGGCGTTCAGCACCGGTATTCTGATTATTCCTTGCGTCTGGCTGGGTTTTGCCGTGCAGGATACCTCCACGCCTTATAGCGTCTTCATCATCATCTCTCTGCTATGCGGCTTTGCTGGCGCGAACTTCGCATCCAGTATg < 1:2773592/150‑1 (MQ=255) gtcgCTGGACGGCGTTCAGCACCGGTATTCTGATTATTCCTTGCGTCTGGCTGGGTTTTGCCGTGCAGGATACCTCCACGCCTTATAGCGTCTTCATCATCATCTCTCTGCTATGCGGCTTTGCTGGCGCGAACTTCGCATCCAGTATgg < 1:3454378/150‑1 (MQ=255) gtcgCTGGACGGCGTTCAGCACCGGTATTCTGATTATTCCTTGCGTCTGGCTGGGTTTTGCCGTGCAGGATACCTCCACGCCTTATAGCGTCTTCATCATCATCTCTCTGCTATGCGGCTTTGCTGGCGCGAACTTCGCATCCAGTATgg > 1:1266595/1‑150 (MQ=255) gCTGGACGGCGTTCAGCACCGGTATTCTGCTTATTCCTTGCGTCTCGCTGGGGTTTGCAGTGCAGGATACCTCCACGCCTTATAGCATCTTCATCATCATCTCTCTGCTATGCGGCTTTGCTGGCGCGAACTTCGCATCCTGAATGGCaa > 2:2206336/1‑150 (MQ=255) gCTGGACGGCGTTCAGCACCGGTATTCTGATTATTCCTTGCGTCTGGCTGGGGTTTGCCGTGCAGGATACCTCCACGCCTTATAGCGTCTTCATCATCATCTCTCTGCTATGCGGCTTTGCTGGCGCGAACTTCGCATCCAGTATGGCaa > 2:1981300/1‑150 (MQ=255) 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cAGCACCGGTATTCTGATTATTCCTTGCGTCTGGCTGGGTTTTGCCGTGCAGGATACCTCCACGCCTTATAGCGTCTTCATCATCATCTCTCTGCTATGCGGCTTTGCTGGCGCGAACTTCGCATCCAGTATGGCAAACATCAGcttctt < 2:3820005/150‑1 (MQ=255) tATTCTGATTATTCCTTGCGTCTGGCTGGGTTTTGCCGTGCAGGATACCTCCACGCCTTATAGCGTCTTCATCATCATCTCTCTGCTATGCGGCTTTGCTGGCGCGAACTTCGCATCCAGTATGGCAAACATCAGCTTCTTCTTTCCGaa > 1:1667029/1‑150 (MQ=255) aTTCTGATTATTCCTTGCGTCTGGCTGGGTTTTGCCGTGCAGGATACCTCCACGCCTTATAGCGTCTTCATCATCATCTCTCTGCTATGCGGCTTTGCTGGCGCGAACTTCGCATCCAGTATGGCAAACATCAGCTTCTTCTTTCCGaaa < 1:1746257/150‑1 (MQ=255) ttCTGATTATTCCTTGCGTCTGGCTGGGTTTTGCCGTGCAGGATACCTCCACGCCTTATAGCGTCTTCATCATCATCTCTCTGCTATGCGGCTTTGCTGGCGCGAACTTCGCATCCAGTATGGCAAACATCAGCTTCTTCTTTCCGAAAc < 1:382294/150‑1 (MQ=255) tCTGATTATTCCTTGCGTCTGGCTGGGTTTTGCCGTGCAGGATACCTCCACGCCTTATAGCGTCTTCATCATCATCTCTCTGCTATGCGGCTTTGCTGGCGCGAACTTCGCATCCAGTATGGCAAACATCAGCTTCTTCTTTCCGAAACa < 1:1301710/150‑1 (MQ=255) tGATTATTCCTTGCGTCTGGCTGGGTTTTGCCGTGCAGGATACCTCCACGCCTTATAGCGTCTTCATCATCATCTCTCTGCTATGCGGCTTTGCTGGCGCGAACTTCGCATCCAGTATGGCAAACATCAGCTTCTTCTTTCCGAAACAGa > 2:2260771/1‑150 (MQ=255) gATTATTCCTTGCGTCTGGCTGGGTTTTGCCGTGCAGGATACCTCCACGCCTTATAGCGTCTTCATCATCATCTCTCTGCTATGCGGCTTTGCTGGCGCGAACTTCGCATCCAGTATGGCAAACATCAGCTTCTTCTTTCCGAAACAGaa < 1:1470657/150‑1 (MQ=255) gATTATTCCTTGCGTCTGGCTGGGTTTTGCCGTGCAGGATACCTCCACGCCTTATAGCGTCTTCATCATCATCTCTCTGCTATGCGGCTTTGCTGGCGCGAACTTCGCATCCAGTATGGCAAACATCAGCTTCTTCTTTCCGAAACAGaa < 1:1166383/150‑1 (MQ=255) gATTATTCCTTGCGTCTGGCTGGGTTTTGCCGTGCAGGATACCTCCACGCCTTATAGCGTCTTCATCATCATCTCTCTGCTATGCGGCTTTGCTGGCGCGAACTTCGCATCCAGTATGGCAAACATCAGCTTCTTCTTTCCGAAACAGaa < 1:909842/150‑1 (MQ=255) attattCCTTGCGTCTGGCTGGGTTTTGCCGTGCAGGATACCTCCACGCCTTATAGCGTCTTCATCATCATCTCTCTGCTATGCGGCTTTGCTGGCGCGAACTTCGCATCCAGTATGGCAAACATCAGCTTCTTCTTTCCGAAACAGAAg < 2:3623285/150‑1 (MQ=255) attattCCTTGCGTCTGGCTGGGTTTTGCCGTGCAGGATACCTCCACGCCTTATAGCGTCTTCATCATCATCTCTCTGCTATGCGGCTTTGCTGGCGCGAACTTCGCATCCAGTATGGCAAACATCAGCTTCTTCTTTCCGAAACAGAAg < 1:3912910/150‑1 (MQ=255) ttattCCTTGCGTCTGGCTGGGTTTTGCCGTGCAGGATACCTCCACGCCTTATAGCGTCTTCATCATCATCTCTCTGCTATGCGGCTTTGCTGGCGCGAACTTCGCATCCAGTATGGCAAACATCAGCTTCTTCTTTCCGAAACAGAAGc > 2:4138868/1‑150 (MQ=255) ttCCTTGCGTCTGGCTGGGTTTTGCCGTGCAGGATACCTCCACGCCTTATAGCGTCTTCATCATCATCTCTCTGCTATGCGGCTTTGCTGGCGCGAACTTCGCATCCAGTATGGCAAACATCAGCTTCTTCTTTCCGAAACAGAAGCAgg < 1:2029303/150‑1 (MQ=255) ttCCTTGCGTCTGGCTGGGTTTTGCCGTGCAGGATACCTCCACGCCTTATAGCGTCTTCATCATCATCTCTCTGCTATGCGGCTTTGCTGGCGCGAACTTCGCATCCAGTATGGCAAACATCAGCTTCTTCTTTCCGAAACAGAAGCAgg < 2:771831/150‑1 (MQ=255) ccTTGCGTCTGGCTGGGTTTTGCCGTGCAGGATACCTCCACGCCTTATAGCGTCTTCATCATCATCTCTCTGCTATGCGGCTTTGCTGGCGCGAACTTCGCATCCAGTATGGCAAACATCAGCTTCTTCTTTCCGAAACAGAAGCAGGGt > 1:3541549/1‑150 (MQ=255) cTTGCGTCTGGCTGGGTTTTGCCGTGCAGGATACCTCCACGCCTTATAGCGTCTTCATCATCATCTCTCTGCTATGCGGCTTTGCTGGCGCGAACTTCGCATCCAGTATGGCAAACATCAGCTTCTTCTTTCCGAAACAGAAGCAGGGTg > 2:2595798/1‑150 (MQ=255) tGCGTCTGGCTGGGTTTTGCCGTGCAGGATACCTCCACGCCTTATAGCGTCTTCATCATCATCTCTCTGCTATGCGGCTTTGCTGGCGCGAACTTCGCATCCAGTATGGCAAACATCAGCTTCTTCTTTCCGAAACAGAAGCAGGGTGgc < 2:4019194/150‑1 (MQ=255) cGTCTGGCTGGGTTTTGCCGTGCAGGATACCTCCACGCCTTATAGCGTCTTCATCATCATCTCTCTGCTATGCGGCTTTGCTGGCGCGAACTTCGCATCCAGTATGGCAAACATCAGCTTCTTCTTTCCGAAACAGAAGCAGGGTGgcgc > 1:4048834/1‑150 (MQ=255) cGTCTGGCTGGGTTTTGCCGTGCAGGATACCTCCACGCCTTATAGCGTCTACATCATCATCTCTCTGCTATGCGGCTTTGCTGGCGCGAACTTCGCATCCAGTATGGCAAACATCAGCTTCTTCTTTCCGAAACAGAAGCAGGGTGgcgc > 1:2391228/1‑150 (MQ=255) ctggGTTTTGCCGTGCAGGATACCTCCACGCCTTATAGCGTCTTCATCATCATCTCTCTGCTATGCGGCTTTGCTGGCGCGAACTTCGCATCCAGTATGGCAAACATCAGCTTCTTCTTTCCGAAACAGAAGCAGGGTGGCGCGCTGGGt < 1:1696660/150‑1 (MQ=255) tggGTTTTGCCGTGCAGGATACCTCCACGCCTTATAGCGTCTTCATCATCATCTCTCTGCTATGCGGCTTTGCTGGCGCGAACTTCGCATCCAGTATGGCAAACATCAGCTTCTTCTTTCCGAAACAGAAGCAGGGTGGCGCGCTGGGTc > 1:1829662/1‑150 (MQ=255) gggTTTTGCCGTGCAGGATACCTCCACGCCTTATAGCGTCTTCATCATCATCTCTCTGCTATGCGGCTTTGCTGGCGCGAACTTCGCATCCAGTATGGCAAACATCAGCTTCTTCTTTCCGAAACAGAAGCAGGGTGGCGCGCTGGGTCt < 1:2260655/150‑1 (MQ=255) ggTTTTGCCGTGCAGGATACCTCCACGCCTTATAGCGTCTTCATCATCATCTCTCTGCTATGCGGCTTTGCTGGCGCGAACTTCGCATCCAGTATGGCAAACATCAGCTTCTTCTTTCCGAAACAGAAGCAGGGTGGCGCGCTGGGTCTg < 1:2068561/150‑1 (MQ=255) ggTTTTGCCGTGCAGGATACCTCCACGCCTTATAGCGTCTTCATCATCATCTCTCTGCTATGCGGCTTTGCTGGCGCGAACTTCGCATCCAGTATGGCAAACATCAGCTTCTTCTTTCCGAAACAGAAGCAGGGTGGCGCGCTGGGTCTg > 2:194525/1‑150 (MQ=255) tataaggcGTGCAGGATACCTCCACGCCTTATAGCGTCTTCATCATCATCTCTCTGCTATGCGGCTTTGCTGGCGCGAACTTCGCATCCAGTATGGCAAACATCAGCTTCTTCTTTCCGAAACAGAAGCAGGGTGGCGCGCTGGGTCTGa < 1:3215779/143‑1 (MQ=255) tGCCGTGCAGGATACCTCCACGCCTTATAGCGTCTTCATCATCATCTCTCTGCTATGCGGCTTTGCTGGCGCGAACTTCGCATCCAGTATGGCAAACATCAGCTTCTTCTTTCCGAAACAGAAGCAGGGTGGCGCGCTGGGTCTGAAtgg < 2:2716582/150‑1 (MQ=255) ccGTGCAGGATACCTCCACGCCTTATAGCGTCTTCATCATCATCTCTCTGCTATGCGGCTTTGCTGGCGCGAACTTCGCATCCAGTATGGCAAACATCAGCTTCTTCTTTCCGAAACAGAAGCAGGGTGGCGCGCTGGGTCTGAAtggtg < 1:1177823/150‑1 (MQ=255) | CAGCTATTTATGTTGACTGCGCTGCCTTCGGTTTCTGGCGCGTTATTACGTGTTCCATACTCCTTTATGGTTCCTATCTTCGGTGGTCGTCGCTGGACGGCGTTCAGCACCGGTATTCTGATTATTCCTTGCGTCTGGCTGGGTTTTGCCGTGCAGGATACCTCCACGCCTTATAGCGTCTTCATCATCATCTCTCTGCTATGCGGCTTTGCTGGCGCGAACTTCGCATCCAGTATGGCAAACATCAGCTTCTTCTTTCCGAAACAGAAGCAGGGTGGCGCGCTGGGTCTGAATGGTGG > AP012306/1083601‑1083899 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |