New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 366 total aligned reads displayed.
GTTATTGCTTCTCCGGATGCAATGCGCGTTGTTGGCCAGCTGGGCCAGGTTCTGGGTCCGCGCGGCCTGATGCCAAACCCGAAAGTGGGTACTGTAACACCGAACGTTGCTGAAGCGGTTAAAAACGCTAAAGCTGGCCAGGTTCGTTACCGTAACGACAAAAACGGCATCATCCACACCACCATCGGTAAAGTGGACTTTGACGCTGACAAACTGAAAGAAAACCTGGAAGCTCTGCTGGTTGCGCTGAAAAAAGCAAAACCGACTCAGGCGAAAGGCGTGTACATCAAGAAAGTTAG > AP012306/3608431‑3608729 | gttATTGCTTCTCCGGATGCAATGCGCGTTGTTGGCCAGCTGGGCCAGGTTCTGGGTCCGCGCGGCCTGATGCCAAACCCGAAAGTGGGTACTGTAACACCGAACGTTGCTGAAGCGGTTAAAAACGCTAAAGCTGGCCAGGTTCGTTAc > 1:3452518/1‑150 (MQ=255) gttATTGCTTCTCCGGATGCAATGCGCGTTGTTGGCCAGCTGGGCCAGGTTCTGGGTCCGCGCGGCCTGATGCCAAACCCGAAAGTGGGTACTGTAACACCGAACGTTGCTGAAGCGGGTAAAAACGCTAAAGCTGGGCAGGGTCGTTAc > 2:3161392/1‑150 (MQ=255) ttATTGCTTCTCCGGATGCAATGCGCGTTGTTGGCCAGCTGGGCCAGGTTCTGGGTCCGCGCGGCCTGATGCCAAACCCGAAAGTGGGTACTGTAACACCGAACGTTGCTGAAGCGGTTAAAAACGCTAAAGCTGGCCAGGTTCGTTAcc < 1:2878797/150‑1 (MQ=255) 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aaaaCGCTAAAGCTGGCCAGGTTCGTTACCGTAACGACAAAAACGGCATCATCCACACCACCATCGGTAAAGTGGACTTTGACGCTGACAAACTGAAAGAAAACCTGGAAGCTCTGCTGGTTGCGCTGAAAAAAGCAAAACCGACTCAgg > 2:1028527/1‑150 (MQ=255) aaaaCGCTAAAGCTGGCCAGGTTCGTTACCGTAACGACAAAAACGGCATCATCCACACCACCATCGGTAAAGTGGACTTTGACGCTGACAAACTGAAAGAAAACCTGGAAGCTCTGCTGGTTGCGCTGAAAAAAGCAAAACCGACTCAgg < 2:2240272/150‑1 (MQ=255) aaaCGCTAAGGCTGGCCAGGTTCGTTACCGTAACGACAAAAACGGCATCATCCACACCACCATCGGTAAAGTGGACTTTGACGCTGACAAACTGAAAGAAAACCTGGAAGCTCTGCTGGTTGCGCTGAAAAAAGCAAAACCGACTCAGGc < 1:982700/150‑1 (MQ=255) aaaCGCTAAATCTGGCCAGGTTCGTTACCGTAACGACAAAAACGGCATCATCCACACCACCATCGGTAAAGTGGACTTTGACGCTGACAAACTGAAAGAAAACCTGGAAGCTCTGCTGGTTGCGCTGAAAAAAGCAAAACCGACTCa < 2:1774971/147‑1 (MQ=255) aaCGCTAAAGCTGGCCAGGTTCGTTACCGTAACGACAAAAACGGCATCATCCACACCACCATCGGTAAAGTGGGCTTTGACGCTGACAAACTGAAAGAAAACCTGGAAGCTCTGCTGGTTGCGCTGAAAAAAGCAAAACCGACTCAGGCg > 2:2359875/1‑150 (MQ=255) gCTAAAGCTGGCCAGGTTCGTTACCGTAACGACAAAAACGGCATCATCCACACCACCATCGGTAAAGTGGACTTTGACGCTGACAAACTGAAAGAAAACCTGGAAGCTCTGCTGGTTGCGCTGAAAAAAGCAAAACCGACTCAGGCGaaa > 2:847332/1‑150 (MQ=255) gCTAAAGCTGGCCAGGTTCGTTACCGTAACGACAAAAACGGCATCATCCACACCACCATCGGTAAAGTGGACTTTGACGCTGACAAACTGAAAGAAAACCTGGAAGCTCTGCTGGTTGCGCTGAAAAAAGCAAAACCGACTCAGGCGaaa > 1:518806/1‑150 (MQ=255) cTAAAGCTGGCCAGGTTCGTTACCGTAACGACAAAAACGGCATCATCCACACCACCATCGGTAAAGTGGACTTTGACGCTGACAAACTGAAAGAAAACCTGGAAGCTCTGCTGGTTGCGCTGAAAAAAGCAAAACCGACTCAGGCGAAAg > 2:3114944/1‑150 (MQ=255) ggTTCGTTACCGTAACGACAAAACCGGCATCATCCACACCACCATCGGTAAAGTGGACTTTGACGCTGACAAACTGAAAGAAAACCTGGAAGCTCTGCTGGTTGCGCTGAAAAAAGCAAAACCGACTCAGGCGAAAGGCGTGTACATCaa < 1:892843/150‑1 (MQ=255) cGTTACCGTAACGACAAAAACGGCATCATCCACACCACCATCGGTAAAGTGGACTTTGACGCTGACAAACTGAAAGAAACCCTGGAAGCTCTGCTGGTTGCGCTGAAAAAAGCAAAACCGACTCAGGCGAAAGGCGTGTACATCAAGaaa < 1:1853554/150‑1 (MQ=255) cGTTACCGTAACGACAAAAACGGCATCATCCACACCACCATCGGTAAAGTGGACGTTGACGCTGACAAACTGAAAGAAAACCTGGAAGCTCTGCTGGTTGCGCTGAAAAAAGCAAAACCGACTCAGGCGAAAGGCGTGTACATCAAGaaa < 2:3920765/150‑1 (MQ=255) aCCGTAACGACAAAAACGGCATCATCCACACCACCATCGGTAAAGTGGACTTTGACGCTGACAAACTGAAAGAAAACCTGGAAGCTCTGCTGGTTGCGCTGAAAAAAGCAAAACCGACTCAGGCGAAAGGCGTGTACATCAAGAAAGTTa > 1:928711/1‑150 (MQ=255) | GTTATTGCTTCTCCGGATGCAATGCGCGTTGTTGGCCAGCTGGGCCAGGTTCTGGGTCCGCGCGGCCTGATGCCAAACCCGAAAGTGGGTACTGTAACACCGAACGTTGCTGAAGCGGTTAAAAACGCTAAAGCTGGCCAGGTTCGTTACCGTAACGACAAAAACGGCATCATCCACACCACCATCGGTAAAGTGGACTTTGACGCTGACAAACTGAAAGAAAACCTGGAAGCTCTGCTGGTTGCGCTGAAAAAAGCAAAACCGACTCAGGCGAAAGGCGTGTACATCAAGAAAGTTAG > AP012306/3608431‑3608729 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |