New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AP012306 | 228777 = | 325 (1.040) | 8 (0.030) | 8/278 | 16.4 | 2.5% | coding (275/771 nt) | yafV | predicted C‑N hydrolase family amidase, NAD(P)‑binding |
? | AP012306 | 228787 = | 309 (1.060) | coding (265/771 nt) | yafV | predicted C‑N hydrolase family amidase, NAD(P)‑binding | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 325 total aligned reads displayed.
AGCACACCAGCGGCAAAATACGCCAGCCGCGCCATTCCACAATCACTCGCGCATTGCCCGCTTTATAATGTAGATGCTCATCTGCCATGCGGAACAGATGACGCTTATCATAAAAATGTACCGTGCCGCCCGGCTCAACCAGCAAAAAGCGGTTAACCGAACCAGACTCCGTTTGTAATGCAACACTGCCTGCAATCAGCGCATTGCACTGCTGCGCCTTAGCTGTCATCCAGTTCACTACGTCATCTTGTGCTAGCGACGAAGCTGCCGCTTCCATGGCAAAGCCGCTGGTAAACAT > AP012306/228628‑228925 | aGCACACCAGCGGCAAAATACGCCAGCCGCGCCATTCCACAATCACTCGCGCATTGCCCGCTTTATAATGTAGATGCTCATCTGCCATGCGGAACAGATGACGCTTATCATAAAAATGTACCGTGCCGCCCGGCTCAACCAGCAAAAAGc > 2:3284117/1‑150 (MQ=255) aGCACACCAGCGGCAAAATACGCCAGCCGCGCCATTCCACAATCACTCGCGCATTGCCCGCTTTATAATGTAGATGCTCATCTGCCATGCGGAACAGATGACGCTTATCATAAAAATGTACCGTGCCGCCCGGCTCAACCAGCAAAAAGc > 1:1182290/1‑150 (MQ=255) gCACACCAGCGGCAAAATACGCCAGCCGCGCCATTCCACAATCACTCGCGCATTGCCCGCTTTATAATGTAGATGCTCATCTGCCATGCGGAACAGATGACGCTTATCATAAAAATGTACCGTGCCGCCCGGCTCAACCAGCAAAAAGCg > 2:1503981/1‑150 (MQ=255) ccAGCGGCAAAATACGCCAGCCGCGCCATTCCACAATCACTCGCGCATTGCCCGCTTTATAATGTAGATGCTCATCTGCCATGCGGAACAGATGACGCTTATCATAAAAATGTACCGTGCCGCCCGGCTCAACCAGCAAAAAGCGGTTaa < 2:1697503/150‑1 (MQ=255) aGCGGCAAAATACGCCAGCCGCGCCATTCCACAATCACTCGCGCATTGCCCGCTTTATAATGTAGATGCTCATCTGCCATGCGGAACAGATGACGCTTATCATAAAAATGTACCGTGCCGCCCGGCTCAACCAGCAAAAAGCGGTTAAcc < 2:3645005/150‑1 (MQ=255) ggCAAAATACGCCAGCCGCGCCATTCCACAATCACTCGCGCATTGCCCGCTTTATAATGTAGATGCTCATCTGCCATGCGGAACAGATGACGCTTATCATAAAAATGTACCGTGCCGCCCGGCTCAACCAGCAAAAAGCGGTTAACCGaa < 2:1595875/150‑1 (MQ=255) gCAAAATACGCCAGCCGCGCCATTCCACAATCACTCGCGCATTGCCCGCTTTATAATGTAGATGCTCATCTGCCATGCGGAACAGATGACGCTTATCATAAAAATGTACCGTGCCGCCCGGCTCAACCAGCAAAAAGCGGTTAACCGAAc < 2:3505113/150‑1 (MQ=255) gCAAAATACGCCAGCCGCGCCATTCCACAATCACTCGCGCATTGCCCGCTTTATAATGTAGATGCTCATCTGCCATGCGGAACAGATGACGCTTATCATAAAAATGTACCGTGCCGCCCGGCTCAACCAGCAAAAAGCGGTTAACCGAAc > 1:282609/1‑150 (MQ=255) cAAAATACGCCAGCCGCGCCATTCCACAATCACTCGCGCATTGCCCGCTTTATAATGTAGATGCTCATCTGCCATGCGGAACAGATGACGCTTATCATAAAAATGTACCGTGCCGCCCGGCTCAACCAGCAAAAAGCGGTTAACCGAAcc < 1:4114249/150‑1 (MQ=255) aaaTACGCCAGCCGCGCCATTCCACAATCACTCGCGCATTGCCCGCTTTATAATGTAGATGCTCATCTGCCATGCGGAACAGATGACGCTTATCATAAAAATGTACCGTGCCGCCCGGCTCAACCAGCAAAAAGCGGTTAACCGAACCAg > 2:1646704/1‑150 (MQ=255) aaaTACGCCAGCCGCGCCATTCCACAATCACTCGCGCATTGCCCGCTTTATAATGTAGATGCTCATCTGCCATGCGGAACAGATGACGCTTATCATAAAAATGTACCGTGCCGCCCGGCTCAACCAGCAAAAAGCGGTTAACCGAACCAg > 2:639615/1‑150 (MQ=255) aaTACGCCAGCCGCGCCATTCCACAATCACTCGCGCATTGCCCGCTTTATAATGTAGATGCTCATCTGCCATGCGGAACAGATGACGCTTATCATAAAAATGTACCGTGCCGCCCGGCTCAACCAGCAAAAAGCGGTTAACCGAACCAGa < 2:483357/150‑1 (MQ=255) aTACGCCAGCCGCGCCATTCCACAATCACTCGCGCATTGCCCGCTTTATAATGTAGATGCTCATCTGCCATGCGGAACAGATGACGCTTATCATAAAAATGTACCGTGCCGCCCGGCTCAACCAGCAAAAAGCGGTTAACCGAACCAGAc > 2:3193995/1‑150 (MQ=255) aCGCCAGCCGCGCCATTCCACAATCACTCGCGCATTGCCCGCTTTATAATGTAGATGCTCATCTGCCATGCGGAACAGATGACGCTTATCATAAAAATGTACCGTGCCGCCCGGCTCAACCAGCAAAAAGCGGTTAACCGAACCAGACTc < 1:646947/150‑1 (MQ=255) aGCCGCGCCATTCCACAATCACTCGCGCATTGCCCGCTTTATAATGTAGATGCTCATCTGCCATGCGGAACAGATGACGCTTATCATAAAAATGTACCGTGCCGCCCGGCTCAACCAGCAAAAAGCGGTTAACCGAACCAGACTCCGttt > 2:2156940/1‑150 (MQ=255) aGCCGCGCCATTCCACAATCACTCGCGCATTGCCCGCTTTATAATGTAGATGCTCATCTGCCATGCGGAACAGATGACGCTTATCATAAAAATGTACCGTGCCGCCCGGCTCAACCAGCAAAAAGCGGTTAACCGAACCAGACTCCGttt < 1:3026421/150‑1 (MQ=255) ccGCGCCATTCCACAATCACTCGCGCATTGCCCGCTTTATAATGTAGATGCTCATCTGCCATGCGGAACAGATGACGCTTATCATAAAAATGTACCGTGCCGCCCGGCTCAACCAGCAAAAAGCGGTTAACCGAACCAGACTCCGTTTGt < 1:3727646/150‑1 (MQ=255) cgcCATTCCACAATCCCTCGCGCATTGCCCGCTTTATAATGTAGATGCTCATCTGCCATGCGGAATAGATGACGCTTATCAAAAAAATGTACCGTGCCCCCCGGCTCAACCAGCAAAAAGCGGTTAACCGAACCAGACTCCGTTTGTAAt < 2:3589241/150‑1 (MQ=255) cgcCATTCCACAATCACTCGCGCATTGCCCGCTTTATAATGTAGATGCTCATCTGCCATGCGGAACAGATGACGCTTATCATAAAAATGTACCGTGCCGCCCGGCTCAACCAGCAAAAAGCGGTTAACCGAACCAGACTCCGTTTGTAAt > 1:196273/1‑150 (MQ=255) gcCATTCCACAATCACTCGCGCATTGCCCGCTTTATAATGTAGATGCTCATCTGCCATGCGGAACAGATGACGCTTATCATAAAAATGTACCGTGCCGCCCGGCTCAACCAGCAAAAAGCGGTTAACCGAACCAGACTCCGTTTGTAATg < 2:1126149/150‑1 (MQ=255) ccATTCCACAATCACTCGCGCATTGCCCGCTTTATAATGTAGATGCTCATCTGCCATGCGGAACAGATGACGCTTATCATAAAAATGTACCGTGCCGCCCGGCTCAACCAGCAAAAAGCGGTTAACCGAACCAGACTCCGTTTGTAATGc > 1:3107754/1‑150 (MQ=255) cATTCCACAATCACTCGCGCATTGCCCGCTTTATAATGTAGATGCTCATCTGCCATGCGGAACAGATGACGCTTATCATAAAAATGTACCGTGCCGCCCGGCTCAACCAGCAAAAAGCGGTTAACCGAACCAGACTCCGTTTGTAATGCa > 2:629995/1‑150 (MQ=255) cATTCCACAATCACTCGCGCATTGCCCGCTTTATAATGTAGATGCTCATCTGCCATGCGGAACAGATGACGCTTATCATAAAAATGTACCGTGCCGCCCGGCTCAACCAGCAAAAAGCGGTTAACCGAACCAGACTCCGTTTGTAATGCa < 2:3069396/150‑1 (MQ=255) tCCACAATCACTCGCGCATTGCCCGCTTTATAATGTAGATGCTCATCTGCCATGCGGAACAGATGACGCTTATCATAAAAATGTACCGTGCCGCCCGGCTCAACCAGCAAAAAGCGGTTAACCGAACCAGCCTCCGTTTGTAATGCAaca < 2:4107909/150‑1 (MQ=255) ccACAATCACTCGCGCATTGCCCGCTTTATAATGTAGATGCTCATCTGCCATGCGGAACAGATGACGCTTATCATAAAAATGTACCGTGCCGCCCGGCTCAACCAGCAAAAAGCGGTTAACCGAACCAGACTCCGTTTGTAATGCAacac > 1:3830290/1‑150 (MQ=255) ccACAATCACTCGCGCATTGCCCGCTTTATAATGTAGATGCTCATCTGCCATGCGGAACAGATGACGCTTATCATAAAAATGTACCGTGCCGCCCGGCTCAACCAGCAAAAAGCGGTTAACCGAACCAGACTCCGTTTGTAATGCAacac < 1:737863/150‑1 (MQ=255) ccACAATCACTCGCGCATTGCCCGCTTTATAATGTAGATGCTCATCTGCCATGCGGAACAGATGACGCTTATCATAAAAATGTACCGTGCCGCCCGGCTCAACCAGCAAAAAGCGGTTAACCGAACCAGACTCCGTTTGTAATGCAacac > 2:714749/1‑150 (MQ=255) cacaATCACTCGCGCATTGCCCGCTTTATAATGTAGATGCTCATCTGCCATGCGGAACAGATGACGCTTATCATAAAAATGTACCGTGCCGCCCGGCTCAACCAGCAAAAAGCGGTTAACCGAACCAGACTCCGTTTGTAATGCAACAct < 2:252455/150‑1 (MQ=255) cacaATCACTCGCGCATTGCCCGCTTTATAATGTAGATGCTCATCTGCCATGCGGAACAGATGACGCTTATCATAAAAATGTACCGTGCCGCCCGGCTCAACCAGCAAAAAGCGGTTAACCGAACCAGACTCCGTTTGTAATGCAACAct < 2:132895/150‑1 (MQ=255) acaATCACTCGCGCATTGCCCGCTTTATAATGTAGATGCTCATCTGCCATGCGGAACAGATGACGCTTATCATAAAAATGTACCGTGCCGCCCGGCTCAACCAGCAAAAAGCGGTTAACCGAACCAGACTCCGTTTGTAATGCAACActg < 1:214999/150‑1 (MQ=255) aaTCACTCGCGCATTGCCCGCTTTATAATGTAGATGCTCATCTGCCATGCGGAACAGATGACGCTTATCATAAAAATGTACCGTGCCGCCCGGCTCAACCAGCAAAAAGCGGTTAACCGAACCAGACTCCGTTTGTAATGCAACActgcc > 2:4214504/1‑150 (MQ=255) tCACTCGCGCATTGCCCGCTTTATAATGTAGATGCTCATCTGCCATGCGGAACAGATGACGCTTATCATAAAAATGTACCGTGCCGCCCGGCTCAACCAGCAAAAAGCGGTTAACCGAACCAGACTCCGTTTGTAATGCAACActgcctg < 2:775481/150‑1 (MQ=255) tCACTCGCGCATTGCCCGCTTTATAATGTAGATGCTCATCTGCCATGCGGAACAGATGACGCTTATCATAAAAATGTACCGTGCCGCCCGGCTCAACCAGCAAAAAGCGGTTAACCGAACCAGACTCCGTTTGTAATGCAACActgcctg > 1:445696/1‑150 (MQ=255) 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tATCATAAAAATGTACCGTGCCGCCCGGCTCAACCAGCAAAAAGCGGTTAACCGAACCAGACTCCGTTTGTAATGCAACACTGCCTGCAATCAGCGCATTGCACTGCTGCGCCTTAGCTGTCATCCAGTTCACTACGTCATCTTGTGCTa < 1:1436646/150‑1 (MQ=255) aTCATAAAAATGTACCGTGCCGCCCGGCTCAACCAGCAAAAAGCGGTTAACCGAACCAGACTCCGTTTGTAATGCAACACTGCCTGCAATCAGCGCATTGCACTGCTGCGCCTTAGCTGTCATCCAGTTCACTACGTCATCTTGTGCTAg > 1:3339367/1‑150 (MQ=255) aaaaaTGTACCGTGCCGCCCGGCTCAACCAGCAAAAAGCGGTTAACCGAACCAGACTCCGTTTGTAATGCAACACTGCCTGCAATCAGCGCATTGCACTGCTGCGCCTTAGCTGTCATCCAGTTCACTACGTCATCTTGTGCTAGcgacg > 1:2804526/1‑150 (MQ=255) aaaTGTACCGTGCCGCCCGGCTCAACCAGCAAAAAGCGGTTAACCGAACCAGACTCCGTTTGTAATGCAACACTGCCTGCAATCAGCGCATTGCACTGCTGCGCCTTAGCTGTCATCCAGTTCACTACGTCATCTTGTGCTAGCGACGaa > 1:2869477/1‑150 (MQ=255) aaTGTACCGTGCCGCCCGGCTCAACCAGCAAAAAGCGGTTAACCGAACCAGACTCCGTTTGTAATGCAACACTGCCTGCAATCAGCGCATTGCACTGCTGCGCCTTAGCTGTCATCCAGTTCACTACGTCATCTTGTGCTAGCGACGAAg < 2:1810459/150‑1 (MQ=255) tGTACCGTGCCGCCCGGCTCAACCAGCAAAAAGCGGTTAACCGAACCAGACTCCGTTTGTAATGCAACACTGCCTGCAATCAGCGCATTGCACTGCTGCGCCTTAGCTGTCATCCAGTTCACTACGTCATCTTGTGCTAGCGACGAAGCt > 1:3237439/1‑150 (MQ=255) aCCGTGCCGCCCGGCTCAACCAGCAAAAAGCGGTTAACCGAACCAGACTCCGTTTGTAATGCAACACTGCCTGCAATCAGCGCATTGCACTGCTGCGCCTTAGCTGTCATCCAGTTCACTACGTCATCTTGTGCTAGCGACGAAGCTGcc > 1:272493/1‑150 (MQ=255) ccGTGCCGCCCGGCTCAACCAGCAAAAAGCGGTTAACCGAACCAGACTCCGTTTGTAATGCAACACTGCCTGCAATCAGCGCATTGCACTGCTGCGCCTTAGCTGTCATCCAGTTCACTACGTCATCTTGTGCTAGCGACGAAGCTGCCg > 2:1879225/1‑150 (MQ=255) ccgccCGGCTCAACCAGCAAAAAGCGGTTAACCGAACCAGACTCCGTTTGTAATGCAACACTGCCTGCAATCAGCGCATTGCACTGCTGCGCCTTAGCTGTCATCCAGTTCACTACGTCATCTTGTGCTAGCGACGAAGCTGCCGCTTcc > 2:2647660/1‑150 (MQ=255) ccgccCGGCTCAACCAGCAAAAAGCGGTTAACCGAACCAGACTCCGTTTGTAATGCAACACTGCCTGCAATCAGCGCATTGCACTGCTGCGCCTTAGCTGTCATCCAGTTCACTACGTCATCTTGTGCTAGCGACGAAGCTGCCGCTTcc > 2:1738668/1‑150 (MQ=255) gccCGGCTCAACCAGCAAAAAGCGGTTAACCGAACCAGACTCCGTTTGTAATGCAACACTGCCTGCAATCAGCGCATTGCACTGCTGCGCCTTAGCTGTCATCCAGTTCACTACGTCATCTTGTGCTAGCGACGAAGCTGCCGCTTCCAt > 2:808398/1‑150 (MQ=255) ggCTCAACCAGCAAAAAGCGGTTAACCGAACCAGACTCCGTTTGTAATGCAACACTGCCTGCAATCAGCGCATTGCACTGCTGCGCCTTAGCTGTCATCCAGTTCACTACGTCATCTTGTGCTAGCGACGAAGCTGCCGCTTCCATGGCa < 1:975403/150‑1 (MQ=255) aaCCAGCAAAAAGCGGTTAACCGAACCAGACTCCGTTTGTAATGCAACACTGCCTGCAATCAGTGCATTGCACTGCTGCGCCTTAGCTGTCATCCAGTTCACTACGTCATCTTGTGCTAGCGACGAAGCTGCCGCTTCCATGGCAAAGcc > 2:2839117/1‑150 (MQ=255) aaCCAGCAAAAAGCGGTTAACCGAACCAGACTCCGTTTGTAATGCAACACTGCCTGCAATCAGCGCATTGCACTGCTGCGCCTTAGCTGTCATCCAGTTCACTACGTCATCTTGTGCTAGCGACGAAGCTGCCGCTTCCATGGCAAAGcc > 1:1320267/1‑150 (MQ=255) aCCAGCAAAAAGCGGTTAACCGAACCAGACTCCGTTTGTAATGCAACACTGCCTGCAATCAGCGCATTGCACTGCTGCGCCTTAGCTGTCATCCAGTTCACTACGTCATCTTGTGCTAGCGACGAAGCTGCCGCTTCCATGGCAAAGCCg < 1:1651016/150‑1 (MQ=255) cAGCAAAAAGCGGTTAACCGAACCAGACTCCGTTTGTAATGCAACACTGCCTGCAATCAGCGCATTGCACTGCTGCGCCTTAGCTGTCATCCAGTTCACTACGTCATCTTGTGCTAGCGACGAAGCTGCCGCTTCCATGGCAAAGCCGCt > 1:401809/1‑150 (MQ=255) cAGCAAAAAGCGGTTAACCGAACCAGACTCCGTTTGTAATGCAACACTGCCTGCAATCAGCGCATTGCACTGCTGCGCCTTAGCTGTCATCCAGTTCACTACGTCATCTTGTGCTAGCGACGAAGCTGCCGCTTCCATGGCAAAGCCGCt > 2:2394935/1‑150 (MQ=255) aGCAAAAAGCGGTTAACCGAACCAGACTCCGTTTGTAATGCAACACTGCCTGCAATCAGCGCATTGCACTGCTGCGCCTTAGCTGTCATCCAGTTCACTACGTCATCTTGTGCTAGCGACGAAGCTGCCGCTTCCATGGCAAAGCCGCTg > 1:1705218/1‑150 (MQ=255) gCAAAAAGCGGTTAACCGAACCAGACTCCGTTTGTAATGCAACACTGCCTGCAATCAGCGCATTGCACTGCTGCGCCTTAGCTGTCATCCAGTTCACTACGTCATCTTGTGCTAGCGACGAAGCTGCCGCTTCCATGGCAAAGCCGCTgg < 1:355442/150‑1 (MQ=255) aaaGCGGTTAACCGAACCAGACCCCGTTTGTAATGCAACTCTGCCTGCAATCAGCGCATTGCACTGCTGCGCCTTAGCTGTCATCCAGTTCACTACGTCATCTTGGGCTAGCGACGAAGCTGCCGCTTCCATGGCAAAGCCGCTGGTaaa < 2:4246892/150‑1 (MQ=255) aGCGGTTAACCGAACCAGACTCCGTTTGTAATGCAACACTGCCTGCAATCAGCGCATTGCACTGCTGCGCCTTAGCTGTCATCCAGTTCACTACGTCATCTTGTGCTAGCGACGAAGCTGCCGCTTCCATGGCAAAGCCGCTGGTAAACa > 1:1124652/1‑150 (MQ=255) gCGGTTAACCGAACCAGACTCCGTTTGTAATGCAACACTGCCTGCAATCAGCGCATTGCACTGCTGCGCCTTAGCTGTCATCCAGTTCACTACGTCATCTTGTGCTAGCGACGAAGCTGCCGCTTCCATGGCAAAGCCGCTGGTAAACAt > 1:564848/1‑150 (MQ=255) | AGCACACCAGCGGCAAAATACGCCAGCCGCGCCATTCCACAATCACTCGCGCATTGCCCGCTTTATAATGTAGATGCTCATCTGCCATGCGGAACAGATGACGCTTATCATAAAAATGTACCGTGCCGCCCGGCTCAACCAGCAAAAAGCGGTTAACCGAACCAGACTCCGTTTGTAATGCAACACTGCCTGCAATCAGCGCATTGCACTGCTGCGCCTTAGCTGTCATCCAGTTCACTACGTCATCTTGTGCTAGCGACGAAGCTGCCGCTTCCATGGCAAAGCCGCTGGTAAACAT > AP012306/228628‑228925 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |