Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | AP012306 | 935,054 | 0 | G | T | 25.0% | 273.3 / 42.9 | 96 | intergenic (+24/‑1406) | putP/ycdO | proline:sodium symporter/conserved protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (16/56); new base T (24/0); total (40/56) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.41e-12 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 172 total aligned reads displayed.
GGCAGTATTGGGATTGTAGTGTTTAGTTTGCTGGGTAAAGCGCCGTCAGCGGCGATGCAAAAACGCTTTGCCGAGGCCGATGCGCACTATCATTCGGCTCCGCCGTCACGGTTGCAGGAAAGCTAAGGGACTTAGCCTGCGGC‑GGTTTTG‑TTTGGCTT‑CAGCAGCGGGTTGCG‑CT‑CCCTTAATGTG‑CCTCGCCATATAAATTGAATGGTGCAGGGAGCGCGCAGGGGGCGGCCAATCGCCGCCGCCCCCTGCTGTCCCGGCC‑TTCGGGGAACGCTTCAGCGATTTTGACGCCACCAACA > AP012306/934905‑935203 | gCAGTATTGGGATTGTAGTGTTTAGTTTGCTGGGTAAAGCGCCGTCAGCGGCGATGCAAAAACGCTTTGCCGAGGCCGATGCGCACTATCATTCGGCTCCGCCGTCACGGTTGCAGGAAAGCTAAGGGACTTAGCCTGCGGC‑GGTtttg‑t > 1:2577923/1‑150 (MQ=255) gCAGTATTGGGATTGTAGTGTTTAGTTTGCTGGGTAAAGCGCCGTCAGCGGCGATGCAAAAACGCTTTGCCGAGGCCGATGCGCACTATCATTCGGCTCCGCCGTCACGGTTGCAGGAAAGCTAAGGGACTTAGCCTGCGGC‑GGTtttg‑t < 1:2000630/150‑1 (MQ=255) cAGTATTGGGATTGTAGTGTTTAGTTTGCTGGGTAAAGCGCCGTCAGCGGCGATGCAAAAACGCTTTGCCGAGGCCGATGCGCACTATCATTCGGCTCCGCCGTCACGGTTGCAGGAAAGCTAAGGGACTTAGCCTGCGGC‑GGGtttt‑tt > 2:412691/1‑150 (MQ=255) aGTATTGGGATTGTAGTGTTTAGTTTGCTGGGTAAAGCGCCGTCAGCGGCGATGCAAAAACGCTTTGCCGAGGCCGATGCGCACTATCATTCGGCTCCGCCGTCACGGTTGCAGGAAAGCTAAGGGACTTAGCCTGCGGC‑GGgtttg‑ttt > 2:1083090/1‑150 (MQ=255) aGTATTGGGATTGTAGTGTTTAGTTTGCTGGGTAAAGCGCCGTCAGCGGCGATGCAAAAACGCTTTGCCGAGGCCGATGCGCACTATCATTCGGCTCCGCCGTCACGGTTGCAGGAAAGCTAAGGGACTTAGCCTGCGGC‑GGCtttg‑ttt > 2:193268/1‑150 (MQ=255) gTATTGGGATTGTAGTGTTTAGTTTGCTGGGTAAAGCGCCGTCAGCGGCGATGCAAAAACGCTTTGCCGAGGCCGATGCGCACTATCATTCGGCTCCGCCGTCACGGTTGCAGGAAAGCTAAGGGACTTAGCCTGCGGC‑GGttttt‑tttt > 1:3508682/1‑149 (MQ=255) gTATTGGGATTGTAGTGTTTAGTTTGCTGGGTAAAGCGCCGTCAGCGGCGATGCAAAAACGCTTTGCCGAGGCCGATGCGCACTATCATTCGGCTCCGCCGTCACGGTTGCAGGAAAGCTAAGGGACTTAGCCTGCGGC‑GGttttt‑tttt > 2:48766/1‑149 (MQ=255) gTATTGGGATTGTAGTGTTTAGTTTGCTGGGTAAAGCGCCGTCAGCGGCGATGCAAAAACGCTTTGCCGAGGCCGATGCGCACTATCATTCGGCTCCGCCGTCACGGTTGCAGGAAAGCTAAGGGACTTAGCCTGCGGC‑GGTtttt‑tttg > 2:2497688/1‑150 (MQ=255) tATTGGGATTGTAGTGTTTAGTTTGCTGGGTAAAGCGCCGTCAGCGGCGATGCAAAAACGCTTTGCCGAGGCCGATGCGCACTATCATTCGGCTCCGCCGTCACGGTTGCAGGAAAGCTAAGGGACTTAGCCTGCGGC‑GGttttt‑ttttg > 2:1651373/1‑148 (MQ=255) tATTGGGATTGTAGTGTTTAGTTTGCTGGGTAAAGCGCCGTCAGCGGCGATGCAAAAACGCTTTGCCGAGGCCGATGCGCACTATCATTCGGCTCCGCCGTCACGGTTGCAGGAAAGCTAAGGGACTTAGCCTGCGGC‑GGTtttg‑ttttg > 1:4031278/1‑148 (MQ=255) tATTGGGATTGTAGTGTTTAGTTTGCTGGGTAAAGCGCCGTCAGCGGCGATGCAAAAACGCTTTGCCGAGGCCGATGCGCACTATCATTCGGCTCCGCCGTCACGGTTGCAGGAAAGCTAAGGGACTTAGCCTGCGGC‑GGTTTTG‑TTTgg < 1:3664377/150‑1 (MQ=255) tATTGGGATTGTAGTGTTTAGTTTGCTGGGTAAAGCGCCGTCAGCGGCGATGCAAAAACGCTTTGCCGAGGCCGATGCGCACTATCATTCGGCTCCGCCGTCACGGTTGCAGGAAAGCTAAGGGACTTAGCCTGCGGC‑GGGtttt‑ttttg > 2:1034627/1‑148 (MQ=255) aTTGGGATTGTAGTGTTTAGTTTGCTGGGTAAAGCGCCGTCAGCGGCGATGCAAAAACGCTTTGCCGAGGCCGATGCGCACTATCATTCGGCTCCGCCGTCACGGTTGCAGGAAAGCTAAGGGACTTAGCCTGCGGC‑GGttttt‑tttttc > 1:3628786/1‑147 (MQ=255) aTTGGGATTGTAGTGTTTAGTTTGCTGGGTAAAGCGCCGTCAGCGGCGATGCAAAAACGCTTTGCCGAGGCCGATGCGCACTATCATTCGGCTCCGCCGTCACGGTTGCAGGAAAGCTAAGGGACTTAGCCTGCGGC‑GGCTTTG‑TTTTGc > 2:2106240/1‑150 (MQ=255) ttGGGATTGTAGTGTTTAGTTTGCTGGGTAAAGCGCCGTCAGCGGCGATGCAAAAACGCTTTGCCGAGGCCGATGCGCACTATCATTCGGCTCCGCCGTCACGGTTGCAGGAAAGCTAAGGGACTTAGCCTGCGGCGGGTTTTT‑TTTggt > 2:2060121/1‑149 (MQ=255) tGGGATTGTAGTGTTTAGTTTGCTGGGTAAAGCGCCGTCAGCGGCGATGCAAAAACGCTTTGCCGAGGCCGATGCGCACTATCATTCGGCTCCGCCGTCACGGTTGCAGGAAAGCTAAGGGACTTAGCCTGCGGC‑GGTATTT‑TTTGGCtt > 1:1458525/1‑150 (MQ=255) gggATTGTAGTGTTTAGTTTGCTGGGTAAAGCGCCGTCAGCGGCGATGCAAAAACGCTTTGCCGAGGCCGATGCGCACTATCATTCGGCTCCGCCGTCACGGTTGCAGGAAAGCTAAGGGACTTAGCCTGCGGCGGGTTTTT‑TTTGGttt > 1:2960287/1‑150 (MQ=255) gggATTGTAGTGTTTAGTTTGCTGGGTAAAGCGCCGTCAGCGGCGATGCAAAAACGCTTTGCCGAGGCCGATGCGCACTATCATTCGGCTCCGCCGTCACGGTTGCAGGAAAGCTAAGGGACTTAGCCTGCGGC‑GGCtttt‑ttttgtctc > 2:3325597/1‑144 (MQ=255) 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tAGTTTGCTGGGTAAAGCGCCGTCAGCGGCGATGCAAAAACGCTTTGCCGAGGCCGATGCGCACTATCATTCGGCTCCGCCGTCACGGTTGCAGGAAAGCTAAGGGACTTAGCCTGCGGC‑GGTTTTG‑TTTTGCTT‑CAGCAGCGGGGTgcg > 1:1287662/1‑150 (MQ=255) gTTTGCTGGGTAAAGCGCCGTCAGCGGCGATGCAAAAACGCTTTGCCGAGGCCGATGCGCACTATCATTCGGCTCCGCCGTCACGGTTGCAGGAAAGCTAAGGGACTTAGCCTGCGGC‑GGTTTTG‑TTTGGCTT‑CAGCAGCGGGTTGCG‑Ct < 1:41942/150‑1 (MQ=255) tttGCTGGGTAAAGCGCCGTCAGCGGCGATGCAAAAACGCTTTGCCGAGGCCGATGCGCACTATCATTCGGCTCCGCCGTCACGGTTGCAGGAAAGCTAAGGGACTTAGCCTGCGGC‑GGTTTTGTTTTGGCTT‑C‑TCCGCGGGTTGCG‑CT‑c > 1:1026072/1‑150 (MQ=255) tttGCTGGGTAAAGCGCCGTCAGCGGCGATGCAAAAACGCTTTGCCGAGGCCGATGCGCACTATCATTCGGCTCCGCCGTCACGGTTGCAGGAAAGCTAAGGGACTTAGCCTGCGGC‑GGTTTTG‑TTTGGCTT‑CAGCAGCGGGTTGCG‑CT‑c < 1:3839767/150‑1 (MQ=255) ttGCTGGGTAAAGCGCCGTCAGCGGCGATGCAAAAACGCTTTGCCGAGGCCGATGCGCACTATCATTCGGCTCCGCCGTCACGGTTGCAGGAAAGCTAAGGGACTTAGCCTGCGGC‑GGTTTTG‑TTTGGCTT‑CAGCAGCGGGTTGCG‑CT‑cc < 2:2272850/150‑1 (MQ=255) gCTGGGTAAAGCGCCGTCAGCGGCGATGCAAAAACGCTTTGCCGAGGCCGATGCGCACTATCATTCGGCTCCGCCGTCACGGTTGCAGGAAAGCTAAGGGACTTAGCCTGCGGC‑GGTTTTG‑TTTGGCTT‑CAGCAGCGGGTTGCG‑CT‑CCCt < 1:2214996/150‑1 (MQ=255) gCTGGGTAAAGCGCCGTCAGCGGCGATGCAAAAACGCTTTGCCGAGGCCGATGCGCACTATCATTCGGCTCCGCCGTCACGGTTGCAGGAAAGCTAAGGGACTTAGCCTGCGGC‑GGTTTTG‑TTTGGCTT‑CAGCAGCGGGTTGCG‑CT‑CCCt < 2:2616633/150‑1 (MQ=255) cTGGGTAAAGCGCCGTCAGCGGCGATGCAAAAACGCTTTGCCGAGGCCGATGCGCACTATCATTCGGCTCCGCCGTCACGGTTGCAGGAAAGCTAAGGGACTTAGCCTGCGGC‑GGGTTTT‑TTTTGGTT‑CAGCAGCCGGGTGGG‑CT‑cccct > 2:3978217/1‑148 (MQ=255) ggTAAAGCGCCGTCAGCGGCGATGCAAAAACGCTTTGCCGAGGCCGATGCGCACTATCATTCGGCTCCGCCGTCACGGTTGCAGGAAAGCTAAGGGACTTAGCCTGCGGC‑GGTTTTT‑TTTTGGTT‑CAGCAGCCGGGTGCG‑Cc‑ccccttat > 1:3981287/1‑145 (MQ=255) ggTAAAGCGCCGTCAGCGGCGATGCAAAAACGCTTTGCCGAGGCCGATGCGCACTATCATTCGGCTCCGCCGTCACGGTTGCAGGAAAGCTAAGGGACTTAGCCTGCGGC‑GGTTTTT‑TTTTGCTT‑CACCCGCGGGCTTCG‑CC‑CCCTTTAt > 1:1566308/1‑150 (MQ=255) ggTAAAGCGCCGTCAGCGGCGATGCAAAAACGCTTTGCCGAGGCCGATGCGCACTATCATTCGGCTCCGCCGTCACGGTTGCAGGAAAGCTAAGGGACTTAGCCTGCGGC‑GGTTTTT‑TTTGGATT‑TAACAGCGGGCGGCG‑CG‑CCCCTaaa > 2:2574725/1‑149 (MQ=255) aaaGCGCCGTCAGCGGCGATGCAAAAACGCTTTGCCGAGGCCGATGCGCACTATCATTCGGCTCCGCCGTCACGGTTGCAGGAAAGCTAAGGGACTTAGCCTGCGGC‑GGTTTTG‑TTTGGCTT‑CAGCAGCGGGTTGCG‑CT‑CCCTTAAtgtg < 1:1385932/150‑1 (MQ=255) aaGCGCCGTCAGCGGCGATGCAAAAACGCTTTGCCGAGGCCGATGCGCACTATCATTCGGCTCCGCCGTCACGGTTGCAGGAAAGCTAAGGGACTTAGCCTGCGGC‑GGGTTTT‑TTTGGGTT‑TCGCAGAGGGGTGGGCCC‑CCCTTAAttgg > 2:2598258/1‑147 (MQ=255) gcgcCGTCAGCGGCGATGCAAAAACGCTTTGCCGAGGCCGATGCGCACTATCATTCGGCTCCGCCGTCACGGTTGCAGGAAAGCTAAGGGACTTAGCCTGCGGC‑GGTTTTT‑TTTTGCTT‑CCGCAGCGGGGTTCG‑CT‑CCCCTTATGTG‑GCt > 1:3257896/1‑150 (MQ=255) gcCGTCAGCGGCGATGCAAAAACGCTTTGCCGAGGCCGATGCGCACTATCATTCGGCTCCGCCGTCACGGTTGCAGGAAAGCTAAGGGACTTAGCCTGCGGC‑GGGTTTT‑TTTGGGTT‑CAGCAGCGGGTTGTG‑CT‑CCCCTTATTTG‑GCTCg > 2:3787780/1‑150 (MQ=255) 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aCTATCATTCGGCTCCGCCGTCACGGTTGCAGGAAAGCTAAGGGACTTAGCCTGCGGC‑GGCTTTT‑TTTTGCTTCCACCACCGGGTGGCG‑C‑‑CCCTCTATGGGCCCTCCCCTTAAAAATTTATAGGGCCGGGGGGCGGGCGGGGGGGGGCCa > 2:1431633/1‑150 (MQ=255) tATCATTCGGCTCCGCCGTCACGGTTGCAGGAAAGCTAAGGGACTTAGCCTGCGGC‑GGTTTTG‑TTTGGCTT‑CAGCAGCGGGTTGCG‑CT‑CCCTTAATGTG‑CCTCGCCATATAAATTGAATGGTGCAGGGAGCGCGCAGGGGGCGGCCAATc < 1:3765959/150‑1 (MQ=255) tATCATTCGGCTCCGCCGTCACGGTTGCAGGAAAGCTAAGGGACTTAGCCTGCGGC‑GGGTTTT‑TTTTGCTT‑CCGCCGCGGGCTGTC‑CC‑CCCCTAATGTT‑GCTCCGCATAATAATTTAATGGTGCAGGGGGCGCGCAGGGGGCGGGCAATc > 2:2246163/1‑150 (MQ=255) aTCATTCGGCTCCGCCGTCACGGTTGCAGGAAAGCTAAGGGACTTAGCCTGCGGC‑GGCTTTG‑TTTTGGTT‑CAGCAGCGGGGTGCG‑CT‑CCCTTAATGTG‑CCTCGCCCTTTAAATTGAATGGTGTTGGGAGCGCGGGGCGGGCGGCCAACcg > 2:698428/1‑150 (MQ=255) ggCTCCGCCGTCACGGTTGCAGGAAAGCTAAGGGACTTAGCCTGCGGC‑GGGTTTT‑TTTGGCTT‑CAGCAGCGGGGTGCG‑CT‑CCCCTTATGTG‑CCTCCCCCTATAAATTTGATTGTGCGGGGGGGGCGCGGGGGGCGGCCAATccccccccc > 2:185754/1‑148 (MQ=255) cgccgTCACGGTTGCAGGAAAGCTAAGGGACTTAGCCTGCGGC‑GGTTTTT‑TTTTGCTT‑CCGCCGCGGGGTGCG‑CT‑CCCCTTATGTG‑CCTCCCCCTATAAAATTAATGGGGGCGGGGGCGCGCCGGGGGCGGCCCATCGCccccccccccc > 2:3532607/1‑149 (MQ=255) cgTCACGGTTGCAGGAAAGCTAAGGGACTTAGCCTGCGGC‑GGTTTTG‑TTTTGGTT‑CAGCAGCGGGGTGCG‑CTCCCCTTAAT‑TG‑GCCCGCCCTATAAATTGGAAGGGGGGGGGGGCGCGCCGGGGGCGGCCCATCGCccccccccccccct > 2:3252341/1‑146 (MQ=255) cGGTTGCAGGAAAGCTAAGGGACTTAGCCTGCGGC‑GGTTTTT‑TTTTGGTT‑CAGCAGCGGGGTTCG‑CC‑CCCCTAATTTT‑CCCCGCCCTAAAAATTTGAAGGTGCAGGGGGGGCGCCGGGGGGGGGCCAACCCCGCCCCCCCCCTCTGTccc > 2:3110417/1‑150 (MQ=255) cGGTTGCAGGAAAGCTAAGGGACTTAGCCTGCGGC‑GGTTTTT‑TTTTGCTT‑CAGCAGCGGGGTGGG‑CT‑CCCCTAATGTG‑CCTCGCCCTATAAAATTAATTGTGCAGGGGGCGCGCCGGGGGCGGGCCATCACCGCCCCCCCCCCCTTTccc > 2:578509/1‑150 (MQ=255) tGCAGGAAAGCTAAGGGACTTAGCCTGCGGC‑GGTTTTG‑TTTGGCTT‑CAGCAGCGGGTTGCG‑CT‑CCCTTAATGTG‑CCTCGCCATATAAATTGAATGGTGCAGGGAGCGCGCAGGGGGCGGCCAATCGCCGCCGCCCCCTGCTGTCCCGGcc < 1:3210694/150‑1 (MQ=255) cAGGAAAGCTAAGGGACTTAGCCTGCGGC‑GGTTTTG‑TTTGGCTT‑CAGCAGCGGGTTGCG‑CT‑CCCTTAATGTG‑CCTCGCCATATAAATTGAATGGTGCAGGGAGCGCGCAGGGGGCGGCCAATCGCCGCCGCCCCCTGCTGTCCCGGCC‑tt < 2:129534/150‑1 (MQ=255) gAAAGCTAAGGGACTTAGCCTGCGGC‑GGTTTTG‑TTTGGCTT‑CAGCAGCGGGTTGCG‑CT‑CCCTTAATGTG‑CCTCGCCATATAAATTGAATGGTGCAGGGAGCGCGCAGGGGGCGGCCAATCGCCGCCGCCCCCTGCTGTCCCGGCC‑TTCgg < 1:390277/150‑1 (MQ=255) aGCTAAGGGACTTAGCCTGCGGC‑GGTTTTG‑TTTGGCTT‑CAGCAGCGGGTTGCG‑CT‑CCCTTAATGTG‑CCTCGCCATATAAATTGAATGGTGCAGGGAGCGCGCAGGGGGCGGCCAATCGCCGCCGCCCCCTGCTGTCCCGGCC‑TTCGGGGa < 1:910659/150‑1 (MQ=255) aGCTAAGGGACTTAGCCTGCGGC‑GGTTTTG‑TTTGGCTT‑CAGCAGCGGGTTGCG‑CT‑CCCTTAATGTG‑CCTCGCCATATAAATTGAATGGTGCAGGGAGCGCGCAGGGGGCGGCCAATCGCCGCCGCCCCCTGCTGTCCCGGCC‑TTCGGGGa < 1:2316116/150‑1 (MQ=255) tAAGGGACTTAGCCTGCGGC‑GGTTTTT‑TTTGGCTT‑CAGCCGCGGGGTGTG‑CC‑CCCCTAATGTG‑CCCCGCCCTTTTAATTTTATGGGGGCGGGGGCGCGCAGGGGGGGGGCCAACCCCCCCCCCCCCCCCTCTCCCCGCCTTTCGGGGacg > 2:1115895/1‑148 (MQ=255) cTTAGCCTGCGGC‑GGTTTTG‑TTTGGCTT‑CAGCAGCGGGTTGCG‑CT‑CCCTTAATGTG‑CCTCGCCATATAAATTGAATGGTGCAGGGAGCGCGCAGGGGGCGGCCAATCGCCGCCGCCCCCTGCTGTCCCGGCC‑TTCGGGGAACGCTTCAGc < 1:2088421/150‑1 (MQ=255) ttAGCCTGCGGC‑GGTTTTG‑TTTGGCTT‑CAGCAGCGGGTTGCG‑CT‑CCCTTAATGTG‑CCTCGCCATATAAATTGAATGGTGCAGGGAGCGCGCAGGGGGCGGCCAATCGCCGCCGCCCCCTGCTGTCCCGGCC‑TTCGGGGAACGCTTCAGCg < 1:2229677/150‑1 (MQ=255) ccTGCGGC‑GGTTTTG‑TTTGGCTT‑CAGCAGCGGGTTGCG‑CT‑CCCTTAATGTG‑CCTCGCCATATAAATTGAATGGTGCAGGGAGCGCGCAGGGGGCGGCCAATCGCCGCCGCCCCCTGCTGTCCCGGCC‑TTCGGGGAACGCTTCAGCGAttt < 2:1308889/150‑1 (MQ=255) tGCGGC‑GGTTTTG‑TTTGGCTT‑CAGCAGCGGGTTGCG‑CT‑CCCTTAATGTG‑CCTCGCCATATAAATTGAATGGTGCAGGGAGCGCGCAGGGGGCGGCCAATCGCCGCCGCCCCCTGCTGTCCCGGCC‑TTCGGGGAACGCTTCAGCGATTTTg < 1:202376/150‑1 (MQ=255) gcggc‑gGTTTTG‑TTTGGCTT‑CAGCAGCGGGTTGCG‑CT‑CCCTTAATGTG‑CCTCGCCATATAAATTGAATGGTGCAGGGAGCGCGCAGGGGGCGGCCAATCGCCGCCGCCCCCTGCTGTCCCGGCC‑TTCGGGGAACGCTTCAGCGATTTTGa < 1:1901666/150‑1 (MQ=255) ggTTTTG‑TTTGGCTT‑CAGCAGCGGGTTGCG‑CT‑CCCTTAATGTG‑CCTCGCCATATAAATTGAATGGTGCAGGGAGCGCGCAGGGGGCGGCCAATCGCCGCCGCCCCCTGCTGTCCCGGCC‑TTCGGGGAACGCTTCAGCGATTTTGACGcca > 2:1748048/1‑150 (MQ=255) ggTTTTG‑TTTGGCTT‑CAGCAGCGGGTTGCG‑CT‑CCCTTAATGTG‑CCTCGCCATATAAATTGAATGGTGCAGGGAGCGCGCAGGGGGCGGCCAATCGCCGCCGCCCCCTGCTGTCCCGGCC‑TTCGGGGAACGCTTCAGCGATTTTGACGcca > 1:2874932/1‑150 (MQ=255) ggTTTTG‑TTTGGCTT‑CAGCAGCGGGTTGCG‑CT‑CCCTTAATGTG‑CCTCGCCATATAAATTGAATGGTGCAGGGAGCGCGCAGGGGGCGGCCAATCGCCGCCGCCCCCTGCTGTCCCGGCC‑TTCGGGGAACGCTTCAGCGATTTTGACGcca > 1:3644005/1‑150 (MQ=255) ggTTTTG‑TTTGGCTT‑CAGCAGCGGGTTGCG‑CT‑CCCTTAATGTG‑CCTCGCCATATAAATTGAATGGTGCAGGGAGCGCGCAGGGGGCGGCCAATCGCCGCCGCCCCCTGCTGTCCCGGCC‑TTCGGGGAACGCTTCAGCGATTTTGACGcca > 2:1342598/1‑150 (MQ=255) gTTTTG‑TTTGGCTT‑CAGCAGCGGGTTGCG‑CT‑CCCTTAATGTG‑CCTCGCCATATAAATTGAATGGTGCAGGGAGCGCGCAGGGGGCGGCCAATCGCCGCCGCCCCCTGCTGTCCCGGCC‑TTCGGGGAACGCTTCAGCGATTTTGACGccac > 1:286810/1‑150 (MQ=255) gTTTTG‑TTTGGCTT‑CAGCAGCGGGTTGCG‑CT‑CCCTTAATGTG‑CCTCGCCATATAAATTGAATGGTGCAGGGAGCGCGCAGGGGGCGGCCAATCGCCGCCGCCCCCTGCTGTCCCGGCC‑TTCGGGGAACGCTTCAGCGATTTTGACGccac < 1:1057597/150‑1 (MQ=255) ttttG‑TTTGGCTT‑CAGCAGCGGGTTGCG‑CT‑CCCTTAATGTG‑CCTCGCCATATAAATTGAATGGTGCAGGGAGCGCGCAGGGGGCGGCCAATCGCCGCCGCCCCCTGCTGTCCCGGCC‑TTCGGGGAACGCTTCAGCGATTTTGACGccacc > 1:3574287/1‑150 (MQ=255) | GGCAGTATTGGGATTGTAGTGTTTAGTTTGCTGGGTAAAGCGCCGTCAGCGGCGATGCAAAAACGCTTTGCCGAGGCCGATGCGCACTATCATTCGGCTCCGCCGTCACGGTTGCAGGAAAGCTAAGGGACTTAGCCTGCGGC‑GGTTTTG‑TTTGGCTT‑CAGCAGCGGGTTGCG‑CT‑CCCTTAATGTG‑CCTCGCCATATAAATTGAATGGTGCAGGGAGCGCGCAGGGGGCGGCCAATCGCCGCCGCCCCCTGCTGTCCCGGCC‑TTCGGGGAACGCTTCAGCGATTTTGACGCCACCAACA > AP012306/934905‑935203 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |